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Molecular characterization and docking dynamics simulation prediction of cytosolic OASTL switch cysteine and mimosine expression in Leucaena leucocephala

  • Harun-Ur-Rashid, Md.;Masakazu, Fukuta;Amzad Hossain, Md.;Oku, Hirosuke;Iwasaki, Hironori;Oogai, Shigeki;Anai, Toyoaki
    • 한국작물학회:학술대회논문집
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    • 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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    • pp.36-36
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    • 2017
  • Out of twenty common protein amino acids, there are many kinds of non protein amino acids (NPAAs) that exist as secondary metabolites and exert ecological functions in plants. Mimosine (Mim), one of those NPAAs derived from L. leucocephala acts as an iron chelator and reversely block mammalian cell cycle at G1/S phases. Cysteine (Cys) is decisive for protein and glutathione that acts as an indispensable sulfur grantor for methionine and many other sulfur-containing secondary products. Cys biosynthesis includes consecutive two steps using two enzymes-serine acetyl transferase (SAT) and O-acetylserine (thiol)lyase (OASTL) and appeared in plant cytosol, chloroplast, and mitochondria. In the first step, the acetylation of the ${\beta}$-hydroxyl of L-serine by acetyl-CoA in the existence of SAT and finally, OASTL triggers ${\alpha}$, ${\beta}$-elimination of acetate from OAS and bind $H_2S$ to catalyze the synthesis of Cys. Mimosine synthase, one of the isozymes of the OASTLs, is able to synthesize Mim with 3-hydroxy-4-pyridone (3H4P) instead of $H_2S$ for Cys in the last step. Thus, the aim of this study was to clone and characterize the cytosolic (Cy) OASTL gene from L. leucocephala, express the recombinant OASTL in Escherichia coli, purify it, do enzyme kinetic analysis, perform docking dynamics simulation analysis between the receptor and the ligands and compare its performance between Cys and Mim synthesis. Cy-OASTL was obtained through both directional degenerate primers corresponding to conserved amino acid region among plant Cys synthase family and the purified protein was 34.3KDa. After cleaving the GST-tag, Cy-OASTL was observed to form mimosine with 3H4P and OAS. The optimum Cys and Mim reaction pH and temperature were 7.5 and $40^{\circ}C$, and 8.0 and $35^{\circ}C$ respectively. Michaelis constant (Km) values of OAS from Cys were higher than the OAS from Mim. Inter fragment interaction energy (IFIE) of substrate OAS-Cy-OASTL complex model showed that Lys, Thr81, Thr77 and Gln150 demonstrated higher attraction force for Cys but 3H4P-mimosine synthase-OAS intermediate complex showed that Gly230, Tyr227, Ala231, Gly228 and Gly232 might provide higher attraction energy for the Mim. It may be concluded that Cy-OASTL demonstrates a dual role in biosynthesis both Cys and Mim and extending the knowledge on the biochemical regulatory mechanism of mimosine and cysteine.

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국제기능장애 건강분류: 아동 청소년 버전을 이용한 개별화교육지원팀 중재목표 분석 및 개별화교육계획 구성원으로서 작업치료사의 필요성: 체계적 고찰 (Analysis of Individualized Education Support Team Intervention Objectives Using International Classification of Functioning, Disability and Health-Children and Youth Version and the Necessity of Occupational Therapists as IEP Members: A Systematic Review)

  • 윤소현;안현서;김인혜;박혜연
    • 재활치료과학
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    • 제12권4호
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    • pp.23-37
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    • 2023
  • 목적 : 본 연구에서는 국제기능장애 건강분류: 아동 청소년 버전(International Classification of Functioning, Disability and Health-Children and Youth version, ICF-CY) 프레임워크를 활용하여 개별화교육계획(individualized education plan, IEP) 협력적 팀 중재에 대해 체계적으로 고찰하고자 한다. 이를 통해 국내에서 IEP 협력적 팀 중재 속 작업치료사의 전문적인 영역을 마련하는 데 근거를 만들고, 개별화교육계획에서 협력적 팀 접근 중재의 목표를 통해 전문가로서 작업치료사의 역할에 대한 기반을 마련하고자 한다. 연구방법 : EBSCOhost, ProQuest, Web of Science를 통하여 2013년 1월부터 2023년 2월까지의 국외 논문을 검색하였다. 국외 검색어에는 "Special education", "Individualized education plan (IEP)", "IEP process", "IEP implementation", "Occupational therapy"를 사용하였다. 2차 분류를 통해 최종 10편의 연구를 분석하였다. 결과 : 분석 대상 연구의 근거 수준은 무작위 실험설계 연구가 가장 많았고, 중재 대상은 자폐성 장애가 가장 많았으며, 중재 방법은 환경 개선이 가장 많이 적용되었다. ICF-CY를 이용한 IEP 협력적 팀 중재의 목표 분석을 통해 활동에 관하여 5편, 참여와 관련하여 4편, 신체 구조 및 신체 기능과 관련하여 1편인 것으로 확인되었다. 결론 : IEP에서 협력적 팀 접근 중재 속 작업치료사의 역할은 중재의 목표에서 중요한 역할임을 확인할 수 있었다. 이를 기반으로 국내의 IEP에서 협력적 팀 접근의 전문가 중 하나로 작업치료사의 전문성을 설명할 수 있는 근거가 될 것으로 보인다.

체외에서 성숙되고 수정된 소 난자의 배반포 형성에 있어 항산화제의 역할 (Effect of Thiol Compounds on the Blastocyst Formation of In Vitro Matured and Fertilized Bovine Embryos)

  • 정미용;도정태;엄진희;엄상준;김남형;이훈택;정길생
    • 한국가축번식학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.293-300
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    • 1998
  • 본 연구는 체외에서 성숙되고 수정된 소 수정란의 체외 발달에 thiol compound인 $\beta$-mercaptoethanol($\beta$-ME)과 cysteine(CYS)의 첨가 효과를 알아보기 위하여 실시하였다. 미성숙 난포란을 회수한 후 TCM-199 배양액내에서 24시간 동안 성숙을 유도하였다. 수정은 Fert-TALP 배양액에서 실시하였으며, 2세포기로 발달한 수정란만을 선별하여 CR1aa 배양액내에 $\beta$-ME 및 CYS를 첨가하여 체외배양하였다. 실험 1에서는 $\beta$-ME과 CYS의 최적농도를 알아보기 위해서 0, 5, 25, 125$\mu$M의 $\beta$-ME과 0, 0.01, 0.1, 0mM의 CYS이 첨가된 배양액에 2세포기 난자를 9일 동안 배양하면서 배반포까지 발달율을 조사하였다. 그 결과 25$\mu$M의 $\beta$-ME 그리고 0.1mM의 CYS이 첨가된 배양액에서 배반포까지의 발달율은 각각 30.7%와 31.0%로 대조군의 발달율(8.0%, 15%)에 비해 유의적으로 높은 결과를 보였다(P<0.05). 실험 2에서는 배반포 형성에 있어 최적농도인 25$\mu$M의 $\beta$-ME과 0.1mM의 CYS을 각각 초기배(2$\longrightarrow$8세포기)와 후기배 (8세포기 이후) 배양시 첨가하였을 때, 그 효과를 알아보았다. 그 결과 후기배양시 25$\mu$M의 $\beta$-ME과 0.1mM의 CYS이 첨가된 배양액내에서 배반포까지의 발달율은 각각 60.2%와 43.1%로 초기배 배양에서의 첨가군(18.2%, 23.7%)과 대조군(22.5%, 18.1%)에 비해 유\ulcorner거으로 높게 나타났다(P<0.05). 따라서 배양액내 $\beta$-ME과 CYS의 첨가는 체외에서 생산된 소 난자의 배발달율을 향상시키며, 초기배 수정란의 genome 활성이 일어나는 시기 (8~16 세포) 이후에 첨가효과가 큼을 알 수 있었다.

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DNA Chip using Single Stranded Large Circular DNA: Low Background and Stronger Signal Intensity

  • Park, Jong-Gu
    • 대한의생명과학회지
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    • 제10권2호
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    • pp.75-84
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    • 2004
  • Massive identification of differentially expressed patterns has been used as a tool to detect genes that are involved in disease related process. We employed circular single stranded sense molecules as probe DNA for a DNA chip. The circular single stranded DNAs derived from 1,152 unigene cDNA clones were purified in a high throughput mode from the culture supernatant of bacterial transformants containing recombinant phagemids and arrayed onto silanized slide glasses. The DNA chip was examined for its utility in detection of differential expression profile by using cDNA hybridization. Hybridization of the single stranded probe DNA were performed with Cy3- or Cy5-labeled target cDNA preparations at $60^\circ$C. Dot scanning performed with the hybridized slide showed 29 up-regulated and 6 down-regulated genes in a cancerous liver tissue when compared to those of adjacent noncancerous liver tissue. These results indicate that the circular single stranded sense molecules can be employed as probe DNA of arrays in order to obtain a precious panel of differentially expressed genes.

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과채쥬스 제조를 위한 혼합조건의 선정 (Selection of Mixing Ratio for Preparation of Mixed Vegetable Juice)

  • 이규희;고영수;최희숙;김우정
    • 한국식품조리과학회지
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    • 제11권2호
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    • pp.113-118
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    • 1995
  • A preferable mixing ratio of a six-vegetable juice was suggested in this study. The vegetables used for preparation of mixed vegetable juice were carrot(Ct), cabbage(Cg), pear(Pr), cucumber(Cr), celery (Cy) and dongchimi(Di). The characteristics of pH, titratible acidity, reducing sugar, turbidity, solids, color and acceptability were compared to determine the mixing ratio. The vegetables showed a wide ranHe of pH of 3.70-6.01, acidity of 28.92 uv~74.40 nd and reducing sugar of 1.20ft~ 12.69fo. Celery juice showed the higest suspension stability and "b" value and the lowest values in Hunter "L" and "a" values among the 6 vegetable juice. The preferable mixing ratio of two-vegetable juice selected were Ct-Di(1 : 4), Cg-Pr(1 : 3) and Cr-Cy(3 : 1). From the various ratio of the three of biary mixtures of Cg-Pr(1 : 3): Ct-Di(1 : 4): Cr-Sy(3 : 1), two ratio of 5.0 : 2.5 2.5(V-6A) and 6.0 : 2.0 : 2.0(V-6B) were suggested as the most prefered six-vegetable juice. Pear, dongchimi and cucumber were found to be influential on the preference. The pH and titratible acidity of the two juices with different ratios were in the range of 4.92~4.98 and 36.g∼37.4 ml, respectively.

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한국잔디 신품종 '장성초록(JangsungChorok)'과 '장성샛별(JangsungSaetbyeol)' 개발 (Development of New Cultivars 'JangsungChorok' and 'JangsungSaetbyeol' in Zoysiagrass)

  • 최준수;양근모;오찬진;이긍주;배은지;이광수
    • Weed & Turfgrass Science
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    • 제7권3호
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    • pp.231-238
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    • 2018
  • 본 실험은 한국잔디 신품종 '장성초록'(품종보호출원:2013-3)과 '장성샛별(품종보호출원:2013-4)의 개발에 관한 것이다. 2010-2011년에 국내 잔디 주 생산 단지인 전라남도 장성 지역에서 수집한 101개 유전자원의 특성 평가를 통해 2개 계통을 선발하였다. 선발계통 중에서 CY6097(장성초록)과 CY6069(장성샛별)은 봄철 휴면타파 속도가 빠르고, 초기 생육속도가 우수하였다. '장성초록'은 엽색이 연녹색이며, 엽 너비가 4.4 mm로 중엽형이다. 지면에서부터 첫 번째 잎까지의 높이가 3.2 cm로 낮아 낮게 깎기가 가능하며, 초장 평균도 18 cm로 낮게 자라는 특성을 갖고 있다. 늦가을 휴면진입 속도가 늦어 녹색 보유 정도가 많으며, 봄철에도 타 잔디에 비해 휴면타파 속도가 빠르다. '장성샛별'은 엽색이 진녹색이며, 엽 너비가 3.5 mm로 중세엽 형이다. 지면에서부터 첫 번째 잎까지의 높이가 4.3 cm로 높고, 초장 평균도 22.6 cm로 높다. 봄철 휴면타파 속도가 빨라 조기 수확이 가능하기 때문에 장성잔디 재배 농가에서 고품질 뗏장 생산에 유용하게 활용될 수 있을 것으로 판단된다.

토끼모델을 이용한 미니스크류 형상에 따른 토오크의 평가 - 원통형과 원추형 간의 비교 (The comparison of torque values in two types of miniscrews placed in rabbits: tapered and cylindrical shapes - Preliminary study)

  • 김경호;정주령;유현미;박동성;장인성;경승현
    • 대한치과교정학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.280-287
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    • 2011
  • Objective: This study compared the stability of cylindrical miniscrews (Cy, 7 mm in length) with that of tapered miniscrews (Ta, 5 mm in length), using torque values to determine if the healing time before loading affects the stability of the miniscrew and if the insertion torque is associated with the removal torque measured after a few weeks of healing. Methods: Ta and Cy with different thread lengths were placed in the tibias of 12 female New Zealand white rabbits (body weight: 3.0 - 3.5 kg), and the maximum insertion torque values (ITV) were measured. No orthodontic forces were applied so as to allow us to determine the pure effects of the different shapes. After 3 different healing periods (2, 4, and 6 weeks), maximum removal torque values (RTV) were measured immediately before the rabbits were sacrificed. Results: No miniscrews were loosened. There were no significant differences in ITV or RTV between the Ta and Cy nor were there any significant differences in the ITV and RTV between the 3 groups, which had different healing periods. There was a correlation between the ITV and RTV. Conclusions: Shorter Ta showed similar stability as Cy, as determined by torque values. This result strongly suggests that the tapered shape is more advantageous than the cylindrical shape. The RTV did not increase significantly over time. It is recommended that a miniscrew be loaded immediately; waiting a few weeks before loading should be avoided. The correlation between the ITV and RTV suggests that the ITV can be used to estimate a screw's future stability.

고산지역에서의 크리핑 벤트그래스 품종 생육특성 비교 (Comparison of the Growth Characteristics of Creeping Bentgrass (Agrostis palustris Huds.) Cultivars at Mountain Area)

  • 정준기;이종민;김기동;이정호;주영규
    • Weed & Turfgrass Science
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    • 제2권3호
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    • pp.283-291
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    • 2013
  • 고산지역 기후 환경에서 크리핑 벤트그래스품종의 생육특성을 비교 분석하여 그린과 페어웨이조건에 적합한 품종을 선발하기 위해본 실험을 실시하였다. 먼저 경기중부, 영서시내, 영서 고산지대의 기후환경 데이터를 비교 분석하였을 때, 고도에 따른 기후의 차이가 위도에 따른 지역 차이보다 큰 것으로 분석되었다. 영서산악지대에 USGA 방식의 그린용 지반과 캘리포니아식의 페어웨이 지반의 시험포장을 조성한 후 5가지 종류의 크리핑 벤트그래스 품종을 파종하여 두 지반에 따라 깎는 높이를 달리하여 3년간 생육기간의 품종별 생육특성을 비교 분석하였다. 봄철 그린 업 측정한 결과 'T-1'과 'CY-2'는 타 품종들 보다 좀 그린업이 빨랐으나 'Penncross'는 그린업이 가장 더딘 것으로 나타났다. 그린과 페어웨이 예고환경에서 비슷한 결과가 나타났다. 실험기간 중 'T-1' 품종이 전반적인 시각적 품질평가 결과와 전반적인 뿌리길이에서 가장 우수하였으나 하절기에는 'Penncross'의 뿌리 길이와 건중량이 높았고, 'Penn A-1' 품종이 가장 낮은 결과를 보였다. 전반적으로 페어웨이에서도 그린조건에서와 같이 'T-1', 'CY-2' 품종이 엽색, 피복도, 뿌리길이 등 양호한 생육특성을 보였다.

cDNA microarray를 이용하여 한우의 근육과 지방조직의 유전자 발현 패턴 분석 및 bovine customer cDNA chip 구성 연구 (Construction of Ovine Customer cDNA Chip and Analysis of Gene Expression Patterns in the Muscle and Fat Tissues of Native Korean Cattle)

  • 한경호;최은영;홍연희;김재영;최인순;이상석;최윤재;조광근
    • 생명과학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.376-384
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    • 2015
  • 소의 질을 평가하기 위해서는 중요한 인자인 근육내 지방(또는 마블링)을 조절하는 분자를 연구해야 한다. cDNA microarray를 사용하여 등지방 조직과 최장근의 유전자발현 차이를 비교하였다. 이 연구를 통해, 우리는 한우의 지방조직에 1211개, 근육조직에서 1346개의 특이 유전자를 확인하였다. bovine chip은 지방조직의 920개 유전자와 근육조직의 760개 유전자로 이루어진 1680개의 특이 유전자로 구성되어있다. 이 실험에서 Microarray 분석은 등지방조직(Cy3)과 최장근(Cy5)의 유전자 발현에 있어서 큰 차이를 보여준다. 차이를 보이는 많은 특이유전자 중에서, 12-리폭시게나아제 유전자와 프로스타글란딘 D 합성효소는 근육내 지방의 축적을 조절하는 중요한 효소이다. 본 연구에서, 일반적으로 발현되지만 한우의 근육과 지방 조직에서 차이를 보이는 많은 유전자를 hybridization 분석을 통해 발견하였다. 선택된 유전자의 발현 수준은 반정량적 RT-PCR을 통해 확인하였고, 그 결과는 cDNA microarray와 유사하였다.

유기인산계 추출제로 합성한 이온성액체에 의한 묽은 염산용액에서 코발트(II)와 니켈(II)의 추출분리 (Solvent Extraction Separation of Co(II) and Ni(II) from Weak Hydrochloric Acid Solution with Ionic Liquids Synthesized from Organophosphorus Acids)

  • 문현승;송시정;;이만승
    • 자원리싸이클링
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    • 제29권5호
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    • pp.55-63
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    • 2020
  • 묽은 염산용액에서 이온성액체에 의한 코발트(II)와 니켈(II)의 분리를 조사하기 위해 이온성액체의 종류와 농도 및 수상의 초기 pH를 변화시켜 추출실험을 수행했다. 본 논문에서는 유기인산(D2EHPA, PC88A, Cyanex 272, Cyanex 301)을 Aliquat 336과 반응시켜 제조한 이온성액체와 Aliquat 336의 염소이온을 SCN과 치환한 이온성액체를 사용했다. 세 종류의 이온성액체(ALi-D2, ALi-PC, ALi-CY272)에 코발트(II)가 니켈(II)보다 추출이 잘 되었으며 평형 pH가 초기 pH보다 높았다. ALi-CY301의 경우 코발트(II)와 니켈(II)의 선택도는 추출조건에 의존했다. 또한 상기 이온성액체에 TBP의 첨가가 두 금속의 추출에 미치는 영향도 조사했다. 추출제로 ALi-SCN를 사용하는 조건에서 코발트(II)가 선택적으로 추출되어 두 금속을 완전히 분리하는 것이 가능했다.