• 대한전기학회논문지:전기물성ㆍ응용부문C
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• 제54권8호
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• pp.378-383
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• 2005

We report the development of miniature fluorescence detection systems that employ miniature prism, mirrors and low coat CCD camera to detect the fluorescence emitted from 40 fluorescently-labeled protein patterns without scanner. This kind of miniature fluorescence detection system can be used in point of care. We introduce two systems, one uses prism+mirror block and the other uses prism and two mirrors. A large NA microscope eyepiece and low cost CCD camera are used. We fabricated protein chip containing multi-pattern BSA labeled with Cy5, using MEMS technology and modified the surface chemically to clean and to immobilize proteins. The measurements show that the combination of prism and mirrors can homogenize elliptical excitation light over the sample with higher optical efficiency, and increase the separation between excitation and fluorescence light at the CCD to give higher signal intensity and higher signal to noise ratio. The measurements also show that protein concentrations ranging from 10 ng/ml to 1000 ng/ml can be assayed with very small error. We believe that the proposed fluorescence detection system can be refined to build a commercially valuable hand-held or miniature detection device.

• BMB Reports
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• 제37권2호
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• pp.148-152
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• 2004

A new molecular-baiting method was studied by retrieving targeted gene fragments from an oligonucleotide microarray bait after hybridization. To make the microarray bait, 70-mer oligonucleotides that were designed to specifically represent the SSA1 gene of Saccharomyces cerevisiae were printed on the slide. Samples of the Saccharomyces cerevisiae mRNA were extracted and labeled by the RD-PCR (Restriction Display PCR) method using the Cy5-labelled universal primer, then applied for hybridization. The sample fragments that hybridized to the microarray were stripped, and the eluted cDNAs were retrieved and cloned into the pMD 18-T vector for transformation, plasmid preparation, and sequencing. BLAST searching of the GenBank database identified the retrieved fragments as being identical to the SSA1 gene (from 2057-2541bp). A new method is being established that can retrieve the sample fragments using an oligo-microarray-bait.

• 한국표면공학회지
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• 제14권4호
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• pp.215-220
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• 1981

The surface appearance of chromium electrodeposit was studied by employing a pulse curr-ent plating in self-regulating high speed (SRHS) bath containing 20 g/$\ell$, K2SiF6 7.5 g/$\ell$ SrSO4 and 250 g/$\ell$ CrO3. As the pulse frequency increased, the surface appearance changed suddenly from bright a-ppearance in a direct current plating condition to gray one in the range of pulse frequency less than about 20KHz. However the bright appearance is recovered as the pulse frequen-cy exceeded 20 KHz. This phenomena seemed to be related with the preferred orientation of electrodeposits, considering the relationship between the preferred orientation of elect-rodeposits and surface appearance in a SRHS bath. Direct current plating was also applied to both Sargent and SRHS bath and investigat-ion on surface appearance was extended to the high current density of 400 A/dm2. In a Sa-rgent bath, the increase in bath temperature was necessary for bright appearance as the current density was increased within 150 A/dm2, but bright region was shown in the cons-tant temperature of 70-75$^{\circ}C$ above the current density of 150A/dm2. On the other hand, two regions of surface brightness was found in a SRHS bath. One is region in the low temperature less than 25$^{\circ}C$ and the other in the moderate temperature range from 55$^{\circ}C$ to 65$^{\circ}C$.

• Genomics & Informatics
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• 제19권3호
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• pp.21.1-21.5
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• 2021

The use of social media data, like Twitter, for biomedical research has been gradually increasing over the years. With the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, researchers have turned to more non-traditional sources of clinical data to characterize the disease in near-real time, study the societal implications of interventions, as well as the sequelae that recovered COVID-19 cases present. However, manually curated social media datasets are difficult to come by due to the expensive costs of manual annotation and the efforts needed to identify the correct texts. When datasets are available, they are usually very small and their annotations don't generalize well over time or to larger sets of documents. As part of the 2021 Biomedical Linked Annotation Hackathon, we release our dataset of over 120 million automatically annotated tweets for biomedical research purposes. Incorporating best-practices, we identify tweets with potentially high clinical relevance. We evaluated our work by comparing several SpaCy-based annotation frameworks against a manually annotated gold-standard dataset. Selecting the best method to use for automatic annotation, we then annotated 120 million tweets and released them publicly for future downstream usage within the biomedical domain.

• Archives of Pharmacal Research
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• 제19권4호
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• pp.286-291
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• 1996

Phenolic compounds are prevalent as toxins or environmental pollutants, but they are also widely used as drugs for various purpose including anticancer agent. A novel biphenolic compound, bis(2-hydroxy-3-tert-butyl-5-methylphenyl)methane (GERI-BPO02-A) was isolated from the fermentation broth of Aspergillus fumigatus F93 previously, and it has revealed cytotoxicity against human solid tumor cells. Its effective doses that cause 50% inhibition of cell growth in vitro against non-small cell lung cancer cell A549, ovarian cancer cell SK-OV-3, skin cancer cell SK-MEL-2 and central nerve system cancer cell XF498 were 8.24, 10.60, 8.83, $9.85\mug/ml$ respectively. GERI-BPO02-A has also revealed cytotoxicity against P-glycoproteinexpressed human colon cancer cell HCT15 and its multidrug-resistant subline HCT15/CL02, and its cytotoxicity was not affected by P-glycoprotein. We have also tested cytotoxicities of structurally related compounds of GERI-BPO02-A such as diphenylmethane, 1,1-bis(3,4dimethylphenyl)ethane, 2,2-diphenylpropane, 2-benzylpyridine, 3-benzylpyridine, $4,4^I-di-tert-butylphenyl$, bibenzyl, $2,2^I-dimethylbibenzyl$, cis-stilbene, trans-stilbene, 3-tert-butyl-4-hydroxy-5-methylphenyisulfide, sulfadiazine and sulfisomidine for studying of structure and activity relationship, and from these data we could suppose that hydroxyl group of GERI-BPO02A conducted important role in its cytotoxicity.

• 한국축산식품학회지
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• 제22권4호
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• pp.316-321
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• 2002

본 실험 결과를 종합하여 볼 때 전자선의 처리는 돈육의 냉장, 냉동 중 일반세균과 중온균의 증식 억제에 효과가 있는 것으로 밝혀졌으며 전자선의 조사량이 증가할 수록(1.5에서 3.0 kGy로) 그 효과는 더욱 커지는 것으로 나타났다. 본 실험에서 사용한 전자선 1.5와 3.0 kGy는 그 조사량이 매우 낮은 수준이므로 조사량을 증가시키면 살균효과는 증대될 것으로 예상된다. 반면 전자선의 처리가 지방의 산패를 촉진한다는 결과는 충분히 예상한 결과였고 본 실험에서도 전자 건의 조사량이 증가할수록(1.5에서 3.0 kCy로) 산패는 더욱 촉진되었다. 따라서 전자선 처리의 살균 효과를 극대화하기 위하여는 전자선을 조사하여도 돈육의 산패도는 전자선을 조사하지 않은 돈육의 수준으로 유지시킬 수 있는 방법이 필수적으로 연구되어야 할 것이다. 이러한 방법으로는 전자선의 조사 속도를 조절한다든지 공기조절 포장 방법($N_2$, $CO_2$) 과의 병용 등을 들 수 있을 것이다. 전자선을 식품에 활용하는 작업은 그 유용성이 무궁 무진 할 수 있으므로 앞으로도 그 활용이 기대되며 우선적으로 해결해야 할 문제는 전자선 조사에 의 한 지방의 산패를 억제 할 수 있는 방법을 강구하는 것이다.

• Archives of Pharmacal Research
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• 제28권5호
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• pp.582-586
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• 2005

The present study was designed to characterize the possible roles of spinally located cholera toxin (CTX)- and pertussis toxin (PTX)-sensitive G-proteins in pro- inflammatory cy tokine induced pain behaviors. Intrathecal injection of tumor necrosis factor-a (TNF-${\alpha}$; 100 pg), interleukin-1${\beta}$ (IL-1${\beta}$ 100 pg) and interferon-${\gamma}$ (INF-${\gamma}$; 100 pg) showed pain behavior. Intrathecal pretreatment with CTX (0.05, 0.1 and 0.5 mg) attenuated pain behavior induced by TNF-${\alpha}$ and INF-${\gamma}$ administered intrathecally. But intrathecal pretreatment with CTX (0.05, 0.1 and 0.5${\mu}g$) did not attenuate pain behavior induced by IL-1${\beta}$. On the other hand, intrathecal pretreatment with PTX further increased the pain behavior induced by TNF-${\alpha}$ and IL-1${\beta}$ administered intrathecally, especially at the dose of 0.5 ${\mu}g$. But intrathecal pretreatment with PTX did not affect pain behavior induced by INF-${\gamma}$. Our results suggest that, at the spinal cord level, CTX- and PTX-sensitive G-proteins appear to play important roles in modulating pain behavior induced by pro-inflammatory cytokines administered spinally. Furthermore, TNF-${\alpha}$, IL-1${\beta}$ arid INF-${\gamma}$ administered spinally appear to produce pain behavior by different mechanisms.

• 한국식품과학회지
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• 제28권3호
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• pp.558-565
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• 1996

감마선 조사된 대투의 이화학적 품질 특성에서 일반성분 지방산 조성 및 무기질 성분은 모든 조사선량에서 변화가 없었으며, 질소 용해도파 추출성 phents 및 phytate 함량은 5 kGy까지의 조사군 사이에는 차이가 없었으나. 10 kGy와 20 k0y의 고선량 조사군에서는 다소의 영향이 화인되었으며, 1년 저장후에는 모든 시험군에서 감소현상을 보였다. 산가 및 유기산 함량도 2.5 kGy 조사군까지는 비조사군과 차이가 없었으나 5kGy 이상 조사군에서는 증가하는 경향이었고, 1년 저장 후 모든 시험군에서 증가함을 보였다. 조사된 대두의 총 아미노산 함량과 조성은 10 kGy 선량까지는 변화가 없었으나, 10kGy 이상의 조사군에서 cysteine과 methionine의 감소를 나타내었다. 대두 색도는 감마선 조사선량의 증가와 저장기간의 경과로 명도와 황색도의 감소가 적색도의 증가를 나타내었다.

• Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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• 제34권1호
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• pp.19-31
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• 2007

목 적: 자궁내막증은 자궁내부에 존재하여야 할 자금내막조직이 자궁 외에 존재하는 질환으로 그 발생기전은 아직 명확하게 밝혀져 있지 않다. 이에 저자들은 자궁내막증 환자와 정상 대조군의 자궁내막조직 간의 유전자 발현의 차이가 자궁내막증의 발병과 관련이 있을 것이라는 가정 하에 DNA microarray 기술을 도입하여 연구를 시행하였다. 연구방법: 2002년 1월부터 2002년 12월까지의 기간 동안 본원 산부인과에서 자궁내막증 환자와 자궁내막증 이외의 다른 부인과적 질환으로 수술을 시행한 환자들을 대상으로 채취한 자궁내막 조직으로 KNU 4.8K cDNA chip을 이용하여 유전자 발현을 비교 연구하였다. 유전자칩으로 자궁내막증 조직에서 발현의 증감을 보였던 유전자 중에서 8종의 유전자를 대상으르 RT-PCR이나 real time RT-PCR 법을 통하여 그 발현 양상을 검증하였다. 결 과: 자궁내막증에 이환된 여성의 자궁내막조직에서 대조군에 비하여 높게 발현되고 있는 것으로 나타난 유전자들은 ATP synthase H transporting F1 (ATP5B), eukaryotic translation elongation factor 1, isocitrate dehydrogenase 1 (NADP+), mitochondrial ribosomal protein L3, ATP synthase H+ trarsporting (ATP5C1), LPS induced TNF-$\alpha$ factor 등으로 세포의 에너지 생성과 대사과정 및 신호전달에 관여하는 유전자들이었다. 한편 자궁내막중 환자의 자궁내막조직에서 대조군에 비하여 낮게 발현된 유전자들은 insulin like growth factor II associated protein, EGF-containing fibulin-like EMP1, matrix Gla protein, TGF beta-induced, TGF beta receptor 1(activin A receptor type II-like kinase), cystallin alpha B, fibulin 5, tissue inhibitor of metalloproteinase 3, collage type XII, alpha 1, tissue inhibitor of metalloproteinase 1, decorin 등으로 세포외기질의 구성 및 기능에 관련이 있었다. 결 론: 이상의 DNA mirroarry 및 RT-PCR을 통해 얻어진 결과에서 자궁내막증의 자궁내막조직에서 대조군에 비하여 유전자들의 발현에 차이가 있음을 확인하였다.

• 생명과학회지
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• 제13권3호
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• pp.252-257
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• 2003

인가성 종인 노랑 초파리의 제2염색체를 대상으로, 자연집단과 장기 유지시켜온 실험집단의 생존도 관련 유해유전자의 빈도를 조사하였다. 2년간 연속 조사한 부산 일원 자연집단내의 치사 및 반치사를 포함한 유해유전자의 빈도는 약 14.3∼25.4% 정도로서 년도 의존적 불안정 변이를 보인 반면 집단 형성 후 약 6570일과 약 7300일째의 실험집단내의 동 빈도는 약 26.5∼27.2% 정도로서 매우 안정적인 변이를 나타내고 있었다. 치사유전자 보유 염색체를 대상으로한 동좌율 조사에서는 자연집단에서 0.76%의 낮은 비율인데 반하여 실험집단에서는 9.76∼14.17%의 높은 동좌 비율을 보였다. 완전 정상 유전자 보유 계통만으로 형성, 장기 유지시켜온 실험집단내의 치사유전자의 유발과 축적은 세대를 거듭함에 따라 자연 돌연변이에 의해 6570일 현재 약 14.5%의 안정적 빈도를 보여주었다. 집단 내 치사 유전자의 동형접합체화로 인한 집단 내에서의 제거율은 6570일 현재 약 0.0106 정도이며, 이로부터 환산되는 실험집단내의 유효크기는 약 430개체 정도였다.