• 미생물학회지
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• 제32권1호
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• pp.53-59
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• 1994

Agrobacterium tumefaciens KU12내에 존재하는 240kb 크기으 octopine형 Ti 플라스미드인 pTiKU12와 45kb 크기의 잠재 플라스미드인 pTi12를 제거하여 무독성의 A. tumefaciens 균주를 제조하였다. Octopine형 Ti 플라스미드인 pTiKU12는 고온(37${\circ}C$)에서의 배양과 ethidium bromide가 첨가되어 있는 배지에서의 배양을 각각 실시하여 제거하였으며, 잠재 플라스미드인 pTi12는 pTi12의 복제기원이 클로닝되어 잇는 재조합 플라스믿인 pYWXP와의 비화합성을 이용하여 제거하였다. pYWXP는 ethidium bromide가 첨가되어 있는 배지에서 고온(37${\circ}C$)으로 배양하여 제거하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제19권1호
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• pp.31-36
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• 1991

Tn5의 kanamycin 저항성 유전자를 가진 pBEL1 plasmid와 C.glutamicum cryptic plasmid인 pSR1으로 7.5kb의 새로운 plasmid를 만든 후, 이를 pCE1301이라 명명하였다. 이 pCE1301은 PEG1301은 PEG-protoplast법으로 C.glutamicum을 형질전환하였을 때 효율이 약 $3.0\times 10^3$형질전환제/$\mu g$이었으며 SalI과 EcoRI 제한효소 절단부위가 1개씩이었다. 또 Km이 없는 배지에서 25세대까지 안정하게 유지되었으며 B.flavum, E.coli에서 복제되었다. 이 pCE1301을 이용하여 C.glutamicum 의 homoserine dehydrogenase 유전자를 cloning하였다.

• 한국생명과학회:학술대회논문집
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• 한국생명과학회 2001년도 10주년 기념 국제학술 심포지움 및 추계학술대회
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• pp.82-82
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• 2001

• 한국미생물학회:학술대회논문집
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• 한국미생물학회 2006년도 International Meeting of the Microbiological Society of Korea
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• pp.50-52
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• 2006

• 미생물학회지
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• 제24권1호
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• pp.7-11
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• 1986

Pseudomonas의 분해계 플라스미드와 이들에 유용한 벡터를 개발하기 위해서 본 연구실에서 분리, 보존하고 있는 Pseudomonas 중에서 P.putita KU 190으로부터 하나의 플라스미드를 분리하여 그 특성을 해석코저 하였다. size marker로 RP4와 pSy343를 사용하여 플라스미드의 크기를 결정한 바 41Kb로 나타났으며, 이 플라스미드를 pKU 41라 명명하였다. 제한효소 Bglll, BamHl, Eco Rl, HindIII, Sall등으로 이 플라스미드를 소화하여 이들의 제한효소 pattern을 조사한 결과, Bg III가 1. BamHl 3, Hin dIll는 3, EcoRI은 6 그리고 SalI은 13개 이상의 절단부위를 가지고 있었다. 이 제한효소의 절단부위, 토막들의 크기로부터 BamHI, HindIII에 대한 지도를 작성하였다. 플라스미드의 생울학적 기능을 조사하기 위하여 탄화수소 자화능에 대한 큐어링 실험을 하였으나 이로부터 뚜렷한 관련성 여부를 관찰할 수 없었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제18권10호
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• pp.1630-1633
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• 2008

A novel putative toxin-antitoxin segregational stability system named KyAB system was identified in a novel native plasmid pBMB8240 from Bacillus thuringiensis strain YBT-1520, based on sequences homology with other toxin-antitoxin systems, the lethal activity of the KyB putative toxin in Escherichia coli and the stabilizing effect of the kyAB system in Bacillus thuringiensis. Secondarily, the native plasmid pBMB9741 from the same strain was resequenced and the corrected plasmid was named as pBMB7635. Based on sequence homology with the tasAB system and the lethal activity of toxin protein in Escherichia coli, a tasAB-like putative toxin-antitoxin system was identified on pBMB7635.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제23권2호
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• pp.164-169
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• 1995

An endogenous cryptic plasmid, pBL1, which has been used to construct plasmid vectors for coryneform bacteria producing amino acids, was eliminated from Brevibacterium lactofermentum. The pBL1 was partially digested with Sau3AI and the resulting DNA fragments were subcloned into a suicide vector pEM1 which contains a kanamycin-resistant (km$^{r}$) gene. KM$^{r}$ B. lactofermentum transconjugants were obtained by conjugal transfer of the pEM1 derivatives containing pBL1 DNA fragments from Escherichia coli into B. lactofermentum. A km$^{r}$ transconjugant was analyzed to contain a plasmid pEB14, which occurred in vivo by homologous recombination between pBL1 and the conjugal-transferred plasmid. The pEB14 including the pEM1-derived km$^{r}$ gene was found to be lost concomitantly with km$^{r}$ phenotype, resulting in the construction of a pBL1-free strain of B lactofermentum. Based on transformation efficiencies and plasmid stability, the resultant pBL1- free strain is more useful than wild strain as a host cell for genetic manipulation. It could be concluded that foreign plasmid DNAs are efficiently isolated and analyzed from the pBL1-free strain because of the absence of endogenous pBL1 plasmid.

• KSBB Journal
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• 제5권3호
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• pp.299-306
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• 1990

대장균과 코리네형 세균간의 shutle vector pECCGI과 pECCD2를 제작하고, plasmid pECCGI과 glycine배지에서 다양한 Corynebacterium glutamicum을 사용하여 전기장 충격법에 의한 형질전환에 있어서 여러 조건을 조사한 결과 세포 현탁액 40ul와 DNA 2ul의 혼합액 사용시 저항 600 obms, 전기장의 세기 12.5kv/cm, DNA양 10ng, 세포수 $4.5$\times$10^8$와 세포회수 시기를 1.0이하의 $A^6^0^0$으로 했을때 $10^6$transformants/ug of DNA의 형질전환 효율을 보였다.

• 한국동물학회지
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• 제39권4호
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• pp.378-386
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• 1996

우리는 두 가지의 새로운 luciferase reporter plasmid를 개발하였는데 그 하나는 이 plasmid에 promoter조각을 삽입한 다음에 그 promoter의 활성을 측정하는 용도로 사용 될수 있고, 다른 하나는 매우 낮은 basal promoter 활성을 갖고 있기 때문에 진핵생물의 전사 조절인자의 연구에 도움이 될 수 있다. 후자의 reporter plasmid에는 17염기쌍의 initator 와 Spl,GAL4그리고 일부 Drosophila homeodomain protein의 결합우뷔에 해당하는 cis elements등을 들어 있다.그리고 tranciption termination을 촉진할 수 있는 signal을 initiator앞서 삽입하여 이런 reporter plasmid에 존재할 수 있는 cryptic promoter에서 시작된 transcript가 luciferase reporter cDNA로 진행되는 것을 방지하는 개선된 reporter plasmid를 제조하여 promoter활성을 Drosophila Schneider line 2 cells을 이용한 transient transfection assay방법으로 측정하였다. 여기에 사용한 termination 촉진 signal은 SV40 polyadenylation signal의 3연속 조각(AAA)과 tenscription termination signal이 포함된 것으로 믿어지는 mouse c-mos 유전자의 일부조각 (UMS)이다. 기대한으로 이 두가지의 signal을 삽입하였을 때 basal promoter활성이 최대한으로 감소하였으며 이 두 가지 signal을 삽입된 reporter plasmid를 사용하여 promoter의 활성을 보다 sensitive하게 측정하였다. 이 reporter plasmid는 Droiophlla melanogaiter뿐만 아니라 포유동물을 포함한 고등생물의 전사 조절인자 연구의 한 도구로 사용될 수 있을 것이다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제33권2호
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• pp.211-218
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• 2023

A cryptic plasmid (pTH32) was characterized from Tetragenococcus halophilus 32, an isolate from jeotgal, Korean traditional fermented seafood. pTH32 is 3,198 bp in size with G+C content of 35.84%, and contains 4 open reading frames (ORFs). orf1 and orf2 are 456 bp and 273 bp in size, respectively, and their translation products showed 65.16% and 69.35% similarities with RepB family plasmid replication initiators, respectively, suggesting the rolling-circle replication (RCR) mode of pTH32. orf3 and orf4 encodes putative hypothetical protein of 186 and 76 amino acids, respectively. A novel Tetragenococcus-Escherichia coli shuttle vector, pMJ32E (7.3 kb, Em^r), was constructed by ligation of pTH32 with pBluescript II KS(+) and an erythromycin resistance gene (ErmC). pMJ32E successfully replicated in Enterococcus faecalis 29212 and T. halophilus 31 but not in other LAB species. A pepA gene, encoding aminopeptidase A (PepA) from T. halophilus CY54, was successfully expressed in T. halophilus 31 using pMJ32E. The transformant (TF) showed higher PepA activity (49.8 U/mg protein) than T. halophilus 31 cell (control). When T. halophilus 31 TF was subculturd in MRS broth without antibiotic at 48 h intervals, 53.8% of cells retained pMJ32E after 96 h, and only 2.4% of cells retained pMJ32E after 14 days, supporting the RCR mode of pTH32. pMJ32E could be useful for the genetic engineering of Tetragenococcus and Enterococcus species.