• 제목/요약/키워드: Combining p-values

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Comparison of the Formula of PSA, Age, Prostate Volume and Race Versus PSA Density and the Detection of Primary Malignant Circulating Prostate Cells in Predicting a Positive Initial Prostate Biopsy in Chilean Men with Suspicion of Prostate Cancer

  • Murray, Nigel P;Reyes, Eduardo;Fuentealba, Cynthia;Orellana, Nelson;Morales, Francisca;Jacob, Omar
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제16권13호
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    • pp.5365-5370
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    • 2015
  • Background: Combining risk factors for prostate cancer into a predictive tool may improve the detection of prostate cancer while decreasing the number of benign biopsies. We compare one such tool, age multiplied by prostate volume divided by total serum PSA (PSA-AV) with PSA density and detection of primary malignant circulating prostate cells (CPCs) in a Chilean prostate cancer screening program. The objectives were not only to determine the predictive values of each, but to determine the number of clinically significant cancers that would have been detected or missed. Materials and Methods: A prospective study was conducted of all men undergoing 12 core ultrasound guided prostate biopsy for suspicion of cancer attending the Hospital DIPRECA and Hospital de Carabineros de Chile. Total serum PSA was registered, prostate volumecalculated at the moment of biopsy, and an 8ml blood simple taken immediately before the biopsy procedure. Mononuclear cells were obtained from the blood simple using differential gel centrifugation and CPCs identified using immunocytchemistry with anti-PSA and anti-P504S. Biopsy results were classed as positive or negative for cancer and if positive the Gleason score, number of positive cores and percent infiltration recorded. Results: A total of 664 men participated, of whom 234 (35.2%) had cancer detected. They were older, had higher mean PSA, PSA density and lower PSA-AV. Detection of CPCs had high predictive score, sensitivity, sensibility and positive and negative predictive values, PSA-AV was not significantly different from PSA density in this population. The use of CPC detection avoided more biopsies and missed fewer significant cancers.Conclusions: In this screening population the use of CPC detection predicted the presence of clinically significant prostate cancer better than the other parameters. The high negative predictive value would allow men CPC negative to avoid biopsy but remain in follow up. The formula PSA-AV did not add to the predictive performance using PSA density.

잣나무 클론 채종원에서 간벌 강도에 따른 개량효과와 유전다양성 (Genetic Gain and Diversity in a Clonal Seed Orchard of Pinus Koraiensis Under Various Thinning Intensities)

  • 오창영;한상억;김장수;강규석;이병실
    • 한국육종학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.263-268
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    • 2008
  • 잣나무 채종원의 유전간벌을 위하여 재적생장에 대한 개량 효과와 유효클론수를 이용한 유전다양성을 평가하였다. 유전 간벌은 클론의 일반조합능력으로 나타나는 육종가(breeding value), 암꽃과 수꽃 개화량을 이용한 종자생산 기여도, 클론별 ramet수 등를 이용한 클론별 변이를 기초로 하였다. 차대 검정 결과에 의하여 산출된 재적생장에 대한 클론별 일반조합능력(genetic value) 및 1991년부터 2003년까지 조사된 개화량 성적을 이용하여 잣나무 채종원(1981년 조성) 179클론에 대하여 간벌 강도에 따른 유전다양성 및 개량효과를 분석하였다. 이때 채종원 외부로부터의 화분오염율은 30%(gene migration = 15%)로 설정하였다. 그 결과 재적생장에 대한 개량효과는 간벌율이 10%에서 60%까지 높아짐에 따라서 점차 증가하였다. 하지만 이보다 더 높은 간벌 강도에서 현저한 개량효과 증가는 나타나지 않았다. 유효클론수는 간벌강도 10%에서 60% 사이에서는 40클론으로 나타났으며, 70% 간벌율 이상에서는 증가하거나 감소하는 변동을 나타냈다. 따라서 본 잣나무 채종원에 대해서는 50%에서 60% 수준의 간벌 강도가 적당한 것으로 판단된다.

외과적 수술에 의한 송어의 혈장 아미노산 농도 측정을 이용한 아미노산 요구량 설정 모델 개발에 관한 기초연구 (Development of Modeling System for Assessing Essential Amino Acid Requirements Using Surgically Modified Rainbow Trout)

  • 배승철;옥임호;박건준;김강웅;최세민
    • 한국양식학회지
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    • 제16권1호
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    • pp.1-7
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    • 2003
  • 무지개송어의 대동맥에 삽입관을 부착한 후 스트레스와 관련된 생리화학적 반응을 조사하였고, 실험사료의 위내 강제공급 후 혈장내 유리 아미노산의 농도변화를 비교하였다. 무지개 송어에 있어 아미노산의 요구량 설정 모델 개발을 위한 기초연구로서 사료 영양학적 연구를 위한 새로운 사료공급 및 혈액채취 방법의 개발을 위하여, 강제투여 및 대동맥 삽입방법의 적용 가능성을 조사하였다. 스트레스와 관련된 생리화학적 반응조사에 있어서 혈액내 헤마토크리트(Ht)는 6시간에 최대치를 보였고, 12시간에 최초수준으로 돌아와 48시간까지 유지되었고 혈장내 코티졸과 글루코스는 3시간에 증가하기 시작하여 6시간에 최대치를 보였으며(P<0.05), 48시간에 최초수준으로 돌아왔다. 혈장내 총 단백질 함량, 삼투압, Na농도, K농도, Cl농도, 헤모글로빈(Hb)수와 적혈구수(red blood cell, RBC)는 48시간동안 큰 변화를 보이지 않았다. 실험사료의 위내 강제 공급 후 혈장내 유리 아미노산의 농도 변화는, arginine, histidine, Iysine, methionine, threonine. valine, glutamic acid. isoleucine, leucine, phenylalanine과 tryptophan이 사료공급 후 4시간에 최대치를 보였고, 8~24시간사이에 최초수준 또는 감소하고, 48시간까지 일정하게 유지되었다. glycine은 사료공급 후 4~8사이에 감소하여 12시간에 최대치를 보였고 24시간에 최초수준으로 돌아왔다. alanine과 aspartic acid의 농도는 사료공급 후 4시간에 최대치를 보였고, 48시간에 기본농도로 돌아왔다. 상기 결과를 토대로, 위내 강제 공급 방법과 대동맥 삽입방법을 무지개 송어의 사료 영양학적 연구에 적용 가능하였고, 유리아미노산의 농도 측정으로 필수 아미노산 요구량 추정이 가능함을 보여주었다.

IgG Avidity Antibodies against Toxoplasma gondii in High Risk Females of Reproductive Age Group in India

  • Siddiqui, Naushaba;Shujatullah, Fatima;Khan, Haris M.;Rabbani, Tamkin;Khan, Parvez A.
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제52권5호
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    • pp.487-491
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    • 2014
  • Toxoplasma gondii is an obligate intracellular protozoan that is distributed worldwide. Recently, several tests for avidity of Toxoplasma IgG antibodies have been introduced to help discriminate between recently acquired and distant infections. The study was conducted in Jawaharlal Nehru Medical College and Hospital, India from February 2011 to September 2012. Serum specimens were subjected to Toxoplasma IgM ELISA and IgG avidity ELISA test. Out of 48 patients with abortions, 17 (35.4%) were positive for IgM ELISA, and 8 (16.6%) had low IgG avidity antibodies. Out of 48 patients with other obstetric problems, 23 (47.9%) were positive for IgM ELISA, and 17 (35.4%) had low IgG avidity antibodies. Combining both groups on avidity test, only 25 of 40 (62.5 %) IgM-positive women had low-avidity IgG antibodies suggesting a recent T. gondii infection in these women. More importantly, 15 (37.5%) of the IgM-positive women had high-avidity antibodies suggesting that the infection was acquired before gestation The relation of IgM seropositivity with the following risk factors was not found to be statistically significant; contact with cats (0.13), non-vegetarian food habits (0.05), and low socio-economic status (0.49). While, for IgG avidity ELISA, only contact with cats (0.01) was significantly associated with seropositivity. All other risk factors have P-values of >0.05 (not significant). IgG avidity test when used in combination with IgM test was a valuable assay for diagnosis of ongoing or recently acquired T. gondii infection in India.

Comparative efficacy of photo-activated disinfection and calcium hydroxide for disinfection of remaining carious dentin in deep cavities: a clinical study

  • Sharma, Sidhartha;Logani, Ajay;Shah, Naseem
    • Restorative Dentistry and Endodontics
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    • 제39권3호
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    • pp.195-200
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    • 2014
  • Objectives: To comparatively evaluate the efficacy of photo-activated disinfection (PAD), calcium hydroxide (CH) and their combination on the treatment outcome of indirect pulp treatment (IPT). Materials and Methods: Institutional ethical clearance and informed consent of the patients were taken. The study was also registered with clinical registry of India. Sixty permanent molars exhibiting deep occlusal carious lesion in patients with the age range of 18 - 22 yr were included. Clinical and radiographic evaluation and set inclusion and exclusion criteria's were followed. Gross caries excavation was accomplished. In group I (n = 20) PAD was applied for sixty seconds. In group II (n = 20), CH was applied to the remaining carious dentin, while in group III (n = 20), PAD application was followed by CH placement. The teeth were permanently restored. They were clinically and radiographically followed-up at 45 day, 6 mon and 12 mon. Relative density of the remaining affected dentin was measured by 'Radiovisiography (RVG) densitometric' analysis. Results: Successful outcome with an increase in radiographic grey values were observed in all three groups. However, on inter-group comparison, this change was not significant (p > 0.05). Conclusions: PAD and CH both have equal disinfection efficacy in the treatment of deep carious dentin. PAD alone is as effective for treatment of deep carious lesion as calcium hydroxide and hence can be used as an alternative to CH. They can be used independently in IPT, since combining both does not offer any additional therapeutic benefits.

Effect of Titanium Prosthesis on Computed Tomography Measurements of Bone Mineral Density

  • Han, S.M.;Zude Feng
    • 대한의용생체공학회:의공학회지
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    • 제19권2호
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    • pp.177-182
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    • 1998
  • 본 연구에서는 체내의 티타늄, 보철물, malalignment, 측정범위, 그리고 보철물 distal flare등이 전산화단층(CT) 촬영으로 골밀도를 축정할때에 미치는 영향을 조사하였다. 8구의 남성 사체로부터 대퇴골과 경골을 각각 8개씩 얻었으며 경골의 상부에 위치해있는 해면골 부분에서 15개의 평행사변형 시편을 만들었다. 평행사변형 시편과 대퇴골을 CT 스캔받침대의 중앙에 바로 놓았을때와 조금 떨어져 놓았을 때 그리고 티타늄 보철물을 체내에 넣었을 경우와 그렇지 않았을 경우 모두에 대해서 각각 스캔하였다. 이때 얻어진 CT 영상자료는 측정범위를 10cm와 30cm로 해서 재구성 하였다. 그리고 골밀도는 영상분석 소프트웨어을 사용하여 측정하였다. 그 결과 시편을 CT 스캔받침의 중앙에 놓았을 경우에는 그렇지 않았을 경우에 비해 골밀도 평균값의 상대차이가 피질골과 해면골 모두에 대해서 1% 미만이었다. 그러나 보철물의 malalignment와 distal flare는 골밀도의 측정값에 상당히 영향을 미쳤다. 체내에 티타늄 보철물의 존재여부는 시편을 CT 스캔받침대의 중앙에 놓았을 경우에는 피질골 뿐만 아니라 해면골 골밀도 측정값에 영향을 미치지 않았다. 그러나 체내에 티타늄 보철물의 존재가 malalignment 효과와 합쳐졌을때에는 골밀도 측정값이 많은 차이를 드러내었다.

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분화성갑상선암에서 최초 고용량 방사성요오드 치료시 혈청 갑상선글로불린 수치 변화의 의의 (Value of the Serum Thyroglobulin Level Alteration at the First High Dose Radioiodine Treatment in Patients with Differentiated Thyroid Carcinoma)

  • 남현열;김인주;김용기;김성장;전성민;김범수
    • Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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    • 제43권4호
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    • pp.294-300
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    • 2009
  • 목적: 이 연구에서는 고용량 방사성요오드 치료 시행 전, 각각 rhTSH 전처치를 시행한 환자군(rHTSH군)과 갑상선 호르몬 투여 중단 시행한 환자군(THW군)에서 방사성요오드 투여 후 단기 혈청 갑상선글로불린(Tg) 상승 정도가 성공적인 잔여갑상선 제거(RRA)를 예측할 수 있는지, 그리고 두 군 사이에서 동등한 잔여갑상선 제거 효과를 보이는지 알아보았다. 대상 및 방법: 분화성갑상선암으로 수술후 방사성요오드 치료를 받은 환자들 중, rhTSH군은 2003년 1월에서 2006년 12월까지 39명, THW군은 2005년 1월에서 2005년 6월까지 46명을 대상으로 후향적으로 평가하였다. 이들은 방사성요오드 투여하는 날, 방사성요오드 투여 후 9일째 되는 날 및 6개월에서 12개월 사이에 시행한 추적 검사에서 갑상선기능검사를 시행하였다. 결과: 85명 중 64명에서 성공적 인 RRA를 보였다. rhTSH 군에서는 27명, THW 군에서는 37명에서 RRA 성공을 보였고 이 두 군의 결과는 유의한 차이를 보이지 않았다(p=0.347). rhTSH군 및 THW군에서 TgD9/TgD0은 RRA 성 공군에서 실패군보다 유의하게 높은 값을 보였다(p=0.03, p=0.04) TgD0와 TgD9/TgD0의 절단값을 결합하였을 경우, TgD0가 5.28 이하이면서 TgD9/TgD0이 4.37초과인 경우 96.7%(29/30)의 RRA 성공률을 보였고, rhTSH군과 THW군에서도 각각 92.9%(13/14)와 100%(16/16)의 높은 HRA 성공률을 나타냈다. 로지스틱 회귀분석에서는 오직 TgD0만 성공적인 RRA와 유의한 연관성을 보였다(p=0.001). 결론: THW군뿐 아니라 rhTSH군에서도 RRA를 위한 고용량 방사성요오드 치료 도중의 혈청 갑상선글로불린의 변화 양상으로 향후 성공적인 RRA를 예측할 수 있다.

주요 식량작물에 대한 시비적량 추정에 관한 연구 ($\frac{1}{4}$ß$\frac{1}{2}$)

  • 장석환;최재성
    • 응용통계연구
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    • 제1권2호
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    • pp.34-44
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    • 1987
  • 작물에 대한 생산수단의 하나인 비료의 양과 수량과의 관계에 대하여 1909년에 Mitcherlich 함수식이 발표된 이후 많은 연구가 이루어졌으며 여러가지 함수식에 대하여도 광범위하게 다루어졌다(Academic Sciences/National Research Council, 1961), Abraham 과 Rao(1960), Welch 등(1963), Hermanson(1965), Colwell 과 Esdaile(1965), Barker(1978) 등은 작물의 수량과 비료와의 관계를 주로 2차함수식으로 나타내었고 또 Abraham과 Rao(1966) 등 많은 사람들이 여러가지 작물에 대하여 다양한 함수식을 비교분석하였다. 吳와 張(1969) 은 2차 반응표면식을 이용하여 우리나라의 주요 작물에 대한 적정시비량을 추정한 바 있다. 작물에 미치는 비료의 효과는 토양과 기후조건에 따라 다르며 동일한 모재에서 유래된 토양이라 할지라도 토양의 관리방법에 따라 토양의 생산성이 다르기 때문에 (Greenwood등, 1974) 작물의 시비적량을 추정함에 있어서 Laird와 Rodriguez(1965)를 비롯하여 많은 사람들(Colwell, 1967, 1968, Abraham, 1973, 張 1980)이 실험지 변수를 이용한 중회귀모 형식을 써서 연구한 바 있다. 특히 張(1980)은 각 실험지별 오차분산이 동일하다는 가정하에 실험지 변수를 이용하기 위하여 비료성분 별로 도내의 모든 실험결과를 하나의 방정식에 넣어서 평가하였다. 본 연구에서는 다년간 농가 포장에서 실험한 비료시험 성적을 이용하여 張(1987)이 제시한 일련의 포장실험 결과의 가중통합 분석방법에 의하여 실험지별 비료의 반응과 실험지 $\times$ 비료반응의 교호작용을 검토하여 자료의 통합분석 가능성을 파악하고 수도에 대한 합리적인 시비적량을 추정하고자 한다.

Clomiphene Citrate 부하검사와 난소 반응 예측 인자와의 연관성에 관한 연구 (Clomiphene Citrate Challenge Test and Its Clinical Correlation with Prognostic Factors of Ovarian Response)

  • 문신용;채희동;김광례;서창석;김석현;최영민;신창재;김정구;이진용
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제23권3호
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    • pp.283-292
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    • 1996
  • Objective: To determine the cutoff value of clomiphene citrate challenge test(CCCT) that can predict the normal and abnormal(diminished) ovarian response group and to assess the usefulness of CCCT as a predictor of ovarian reserve. Materials and Methods: From March 1994 to Februry 1996, CCCT was performed to 129 infertile patients and among them, 20 patients whose basal FSH on the third day of menstrual cycle was more than 20 mIU/ml were excluded. At the same time, the same CCCT was performed to the fifteen healthy volunteers with proven fertility to determine the cutoff value of CCCT. Results; 1) A FSH value higher than 23.4 mIU/ml, measured on the 10th day of menstrual cycle, was defined as a abnormal ovarian response. The cutoff value of 23.4 mIU/ml is more than 2 standard deviations(SD) above the mean value of 15 healthy women after CCCT. 2) The abnormal CCCT group, the subpopulation with a FSH value of 23.4 mIU/ml or more, was 7.3%(8/109) and their mean age was higher than the normal CCCT group($36.5{\pm}4.5$ vs. $32.9{\pm}4.8$, P = 0.059). And the percentage of the patients older than 35 years of the abnormal CCCT group was significantly higher than that of the normal CCCT group(62.5% vs. 38.6%, p <0.05). 3) There was no correlation between the hormone values of the third day and the 10th day of menstrual cycle before and after CCCT except between FSH of the third day and the 10th day. Conclusion: The CCCT is a good method to predict the individual ovarian response to COH for ART, especially in the patients who has no other abnormal findings that predict poor prognosis. And it is neccessary to determine the cutoff value of CCCT by the large numbers of randomized study, and combining the previously proven prognostic factors, it can be applicated in many individual centers for evaluate the ovarian response before ART program.

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Development and Testing of a Machine Learning Model Using 18F-Fluorodeoxyglucose PET/CT-Derived Metabolic Parameters to Classify Human Papillomavirus Status in Oropharyngeal Squamous Carcinoma

  • Changsoo Woo;Kwan Hyeong Jo;Beomseok Sohn;Kisung Park;Hojin Cho;Won Jun Kang;Jinna Kim;Seung-Koo Lee
    • Korean Journal of Radiology
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    • 제24권1호
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    • pp.51-61
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    • 2023
  • Objective: To develop and test a machine learning model for classifying human papillomavirus (HPV) status of patients with oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC) using 18F-fluorodeoxyglucose (18F-FDG) PET-derived parameters in derived parameters and an appropriate combination of machine learning methods in patients with OPSCC. Materials and Methods: This retrospective study enrolled 126 patients (118 male; mean age, 60 years) with newly diagnosed, pathologically confirmed OPSCC, that underwent 18F-FDG PET-computed tomography (CT) between January 2012 and February 2020. Patients were randomly assigned to training and internal validation sets in a 7:3 ratio. An external test set of 19 patients (16 male; mean age, 65.3 years) was recruited sequentially from two other tertiary hospitals. Model 1 used only PET parameters, Model 2 used only clinical features, and Model 3 used both PET and clinical parameters. Multiple feature transforms, feature selection, oversampling, and training models are all investigated. The external test set was used to test the three models that performed best in the internal validation set. The values for area under the receiver operating characteristic curve (AUC) were compared between models. Results: In the external test set, ExtraTrees-based Model 3, which uses two PET-derived parameters and three clinical features, with a combination of MinMaxScaler, mutual information selection, and adaptive synthetic sampling approach, showed the best performance (AUC = 0.78; 95% confidence interval, 0.46-1). Model 3 outperformed Model 1 using PET parameters alone (AUC = 0.48, p = 0.047) and Model 2 using clinical parameters alone (AUC = 0.52, p = 0.142) in predicting HPV status. Conclusion: Using oversampling and mutual information selection, an ExtraTree-based HPV status classifier was developed by combining metabolic parameters derived from 18F-FDG PET/CT and clinical parameters in OPSCC, which exhibited higher performance than the models using either PET or clinical parameters alone.