• 제목/요약/키워드: Colony-PCR

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MicroRNA-301b promotes cell proliferation and apoptosis resistance in triple-negative breast cancer by targeting CYLD

  • Song, Hongming;Li, Dengfeng;Wu, Tianqi;Xie, Dan;Hua, Kaiyao;Hu, Jiashu;Deng, Xiaochong;Ji, Changle;Deng, Yijun;Fang, Lin
    • BMB Reports
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    • 제51권11호
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    • pp.602-607
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    • 2018
  • Aberrant expression of microRNAs (miRNAs) plays important roles in carcinogenesis and tumor progression. However, the expression and biological role of miR-301b in triple-negative breast cancer (TNBC) remains unclear. Here we aimed to evaluate the roles and mechanisms of miR-301b in TNBC cells. miR-301b expression was assessed in TNBC specimens and cell lines by quantitative Real-Time PCR (qRT-PCR). TNBC cells were transfected with miR-301b mimics, inhibitors or Cylindromatosis (CYLD) small interfering RNA (siRNA) using Lipofectamine 2000. The functional roles of miR-301b were determined by cell proliferation, colony formation, and apoptosis assays. Western blots and qRT-PCR were used to measure the expression of mRNAs and proteins in the cells. We found that miR-301b was upregulated in TNBC specimens and cell lines. Overexpression of miR-301b promoted cell proliferation in TNBC cells, while inhibited the apoptosis induced by 5-FU. CYLD was downregulated by miR-301b at both mRNA and protein levels in TNBC cells. Dual-luciferase report assay confirmed that miR-301b downregulated CYLD by direct interaction with the 3'-untranslated region(3'-UTR) of CYLD mRNA. $NF-{\kappa}B$ activation was mechanistically associated with miR-301b-mediated downregulation of CYLD. However, inhibition of miR-301b reversed all the effects of miR-301b. In conclusion, miR-301b plays an oncogenic role in TNBC possibly by downregulating CYLD and subsequently activating $NF-{\kappa}B$ p65, and this may provide a novel therapeutic approach for TNBC.

GM-CSF가 돼지 처녀 생식 배아 발달에 미치는 영향 (Effect of GM-CSF on Porcine Parthenotes Development)

  • 이재달
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제16권1호
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    • pp.365-370
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    • 2015
  • GM-CSF는 중요한 조혈모세포 성장인자로서 면역요법에서 중요한 기능을 한다. 본 연구의 목적은 GM-CSF가 돼지 처녀생식배아의 발달과 세포 수 및 착상관련 유전자의 발현에 관한 영향을 평가하는 것이다. 본 연구에서 돼지 처녀 활성화 배아는 GM-CSF가 5, 10, 20 ng/ml 존재 하에서 7일 동안 배양하여 배 반포의 형성율과 전 세포 수 그리고 유전자 발현을 평가하였다. 그 결과 단백질이 없는 배양액에 20 ng/ml의 GM-CSF를 첨가 하였을 때 배 반포의 형성 율이 유의적으로 증가하였으며 배반포의 세포 수 또한 GM-CSF 를 첨가한 배양액에서 증가 하였다. GM-CSF는 처녀생식 배 반포에서 interleukin-6의 mRNA 발현을 증가 시켰으나, LIF 수용체 mRNA 발현에는 영향을 주지 않는다는 것을 real time RT-PCR로 밝혀내었다. 이 결과로 GM-CSF 성분이 확인된 배양액에서 돼지 배아의 체외 발달 과 생존력을 강화 시켰음을 시사하고 있다.

치과대학 임상 시뮬레이션 실습실 치과용 유니트 수계의 세균 오염도 조사 (Bacterial Contamination of Dental Unit Water Systems in a Student Clinical Simulation Laboratory of College of Dentistry)

  • 윤혜영;이시영
    • 치위생과학회지
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    • 제15권2호
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    • pp.232-237
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    • 2015
  • 이 연구는 강릉원주대학교 치과대학 학생들의 임상실습을 위해 사용되고 있는 DCU에서 배출되는 물 속 종속영양세균의 수준을 평가하면서 사용빈도에 따른 세균 오염수준의 차이를 확인하고 기회 감염성 병원균의 존재를 분자생물학적 방법을 사용하여 확인하였다. 임상 실습실에서 사용되는 DCU 36개를 대상으로 초음파치석제거기에서 물 시료를 수집하여 평균 CFU/ml를 조사하고 초음파치석제거기의 한달 사용빈도에 따라 DCU를 세 집단으로 분류하여 세균오염수준을 비교하였다. 또한 수집한 물 시료에서 세균의 genomic DNA를 추출한 후 PCR 분석을 통해 기회감염성 병원균의 존재를 확인한 결과는 다음과 같다. 학생 실습에 사용한 DCU에서 수집한 물 시료의 평균 종속영양세균수준은 16,095 CFU/ml로 ADA에서 권장하는 200 CFU/ml 이하의 수준에 적합하지 않은 것을 확인하였다. 초음파 치석제거기의 한 달 사용빈도에 따라 3집단으로 나누어 CFU/ml를 조사하였을 때, 초음파치석제거기를 한 달에 1번 이상 3번 미만 사용한 DCU에서 평균 CFU/ml가 20,070 CFU/ml로 가장 높게 나타났으며, 3번 이상 사용한 유니트는 CFU/ml 평균이 8,420 CFU/ml로 가장 적게 나타났다. 3개군의 CFU/ml 차이는 통계학적으로 유의성이 있는 것을 보여주었고(p<0.05), 그 중 사용빈도가 가장 높은 군에서 유의하게 낮은 CFU/ml를 보여주었다. 치과에서 사용하는 DCU에 존재하는 기회감염성 병원균이 학생실습에 사용하는 DCU에서도 분리되었다. 36개의 genomic DNA 시료 중 1개의 시료에서 Pseudomonas species가 검출되었고, 2개의 시료에서 비결핵성 Mycobacterium species가 검출되었다. 따라서 학생실습용으로 사용되는 DCU는 학생들과 대상자에게 잠재적 감염의 원인이 될 수 있으며, 실습 전 학생들의 보호장비 착용과 실습 후 수관관리가 필요하다.

담배거세미나방(Spodoptera litura) Chitinase gene의 RNA interference (RNA Interference of Chitinase Gene in Spodoptera litura)

  • 전미진;서미자;윤영남;유용만
    • 농약과학회지
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    • 제18권3호
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    • pp.202-209
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    • 2014
  • RNA interference(RNAi)는 살아있는 세포 내에서 유전자의 표현 형을 억제하는 작용을 하고 Chitinase는 곤충이 탈피를 하는 동안 오래된 큐티클의 분해와 재흡수를 도와주는 효소로 알려져 있다. 이러한 작용기작을 이용하는 연구를 수행하기 위하여 담배거세미나방의 chitinase와 관련하여 탈피저해 효과를 조사하였다. 담배거세미나방 5령 유충으로부터 RNA를 추출하고 이용하여 cDNA를 합성하고 약 700 bp의 chitinase를 증폭 하였다. 증폭한 PCR product를 pGEM T-easy vector에 cloning하여 competent cell (E.coli)에 형질전환 시키고 mixture를 배양 후 colony를 선발하고 plasmid DNA를 추출하였다. 그 결과 약 3 kb size의 vector band와 약 700 bp의 insert band를 확인 할 수 있었다. dsRNA를 합성하기 위해 각각의 DNA를 Spe I과 Nco I의 제한 효소 처리를 하여 linear form의 DNA로 만들었다. dsRNA 합성 후 약 $10{\mu}g/{\mu}l$의 농도로 $5{\mu}l$씩 담배거세미나방 4령 유충에 주입하였다. 그 결과 유충-유충간의 탈피에서는 기형발육, 탈피저해, 표피의 색소 변이가 나타났다. 번데기-성충 간의 탈피에서는 탈피저해, 날개변이, 기형발육 현상을 볼 수 있었다. 용화율의 경우 무처리구 83.3%, DW 처리구 78.3%, dsRNA 처리구 66.7%로 나타났다. 우화율의 경우 무처리구 90.0%, DW 처리구 72.3%, dsRNA 처리구 65.0%로 나타나 dsRNA를 처리한 그룹에서 상대적인 탈피 저해 효과를 확인할 수 있었다. 그러나 변이율의 경우 무처리구 8.9%, DW 처리구 2.9%, dsRNA 처리구 19.2%로 dsRNA를 주입한 처리구에서 변이율이 가장 높게 나타난 것을 확인할 수 있었다. 표현형적 변이는 dsRNA 주입 후 약 18 시간 이후부터 뚜렷하게 나타나는 것을 볼 수 있었다.

상처와 효모추출물 처리조건에서 유발되는 야생벼 유전자 스크린 (Genes of Wild Rice (Oryza grandiglumis) Induced by Wounding and Yeast Extract)

  • Shin, Sang-Hyun;Im, Hyun-Hee;Lee, Jai-Heon;Kim, Doh-Hoon;Chung, Won-Bok;Kang, Kyung-Ho;Cho, Sung-Ki;Shin, Jeong-Sheop;Chung, Young-Soo
    • 생명과학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.650-656
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    • 2004
  • 야생벼의 일종인 Oryza grandiglumis (CCDD, 2n=48)는 도열병, 잎집무늬마름병, 흰빛잎마름병, 그리고 벼멸구와 같은 병충해에 저항성을 가지는 것으로 알려져 있다. 이와 같은 곰팡이와 해충에 반응하여 차별 발현하는 유전자를 클로닝 하기 위하여 상처처리와 yeast extract를 Oryza grandiglumis에 0시간과 24시간 각각 처리하였다. 유전자의 클로닝을 위하여 희귀 발현유전자의 클로닝에 효율적인 것으로 알려진 Suppression Subtractive Hybridization (SSH) 방법이 처리 후 24시간 된 식물을 재료로 사용되었다. 그 결과, 776개의 cDNA clones이 확보되었으며, 유전자 발현의 진위여부를 빠르게 스크린하기 위하여 colony array가 수행되었다. 115개의 colony가 positive로 판명되었고, 이들의 평균 insert size는 400 bp에서 700 bp에 이르렀고, 이들에 대한 염기서열 분석이 수행되었다. 염기서열 분석 결과, 68개 clone들이 알려진 기능의 유전자와 homology를 나타냈으며, 이중에서 16개 clone이 일차대사에 관련된 것과 유사성을, 5개가 plant retrotransposon과 유사성을, 5개가 식물 방어기작 관련 metallothionein-like gene과 염기서열 유사성을 보였다. 이외에 다양한 유전자들이 아미노산 합성관련, membrane transport, signal transduction등에 관여하는 유전자들과 상동성을 나타내었다. 이들 유전자중에서 4 개의 클론(ogwfi-161, ogwfi-646, ogwfi-663, ogwfi-695)들이 선발되었고 이들에 대한 Northern 분석이 수행되었다. Northern 분석 결과 ogwfi-161, ogwfi-646, ogwfi-663, ogwfi-695는 wounding과 yeast extract처리 에 의한 차별 발현이 확인되었다. 이상의 결과를 종합하여 볼 때, SSH방법은 병충해등과 같은 조건에 의해 차별 발현되는 유전자들을 빠른 시간 내에 다량으로 발굴할 수 있는 매우 효율적인 방법이라고 생각된다.

팔진탕합화적환(八珍湯合化積丸)과 Adriamycin의 병용처리시 나타나는 synergistic 항종양(抗腫瘍) 효과(效果)에 관(關)한 작용기전 연구(硏究) (Study on Synergistic Anti-tumor Effect of Combination with Adriamycin and Palginhonhapwhajucwhan)

  • 문구;문석재;원진희;조정연;박상구;송봉길;박래길;이병구
    • 대한한방내과학회지
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    • 제21권3호
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    • pp.443-452
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    • 2000
  • Objective : This study was designed to evaluate the synergistic effect on cytotoxicity of combination with adriamycin and Palginhonhapwhajucwhan, a traditional prescription for cancer treatment in oriental medicine, in Chang, HL-60, Hep-3B and Alexander cells. Methods : We observed cell viability in Chang, HL-60, Hep-3B, and Alexander cells by crystal violet staining. Those cells were treated with various concentrations of adriamycin alone, Palginhonhapwhajucwhan alone and combination of two medications for 10 hr. On condition of $0.5{\mu}l/ml$ adriamycin alone, $15.6{\mu}l/ml$ Paljintanghapwhajucwhan alone and combination of two medications, at first, we observed colony forming of Chang and HL-60 cells. Second, we observed DNA fragmentation by agarose electrophoresis in Chang, HL-60, Hep-38 and Alexander cells. Third, we measured the catalytic activation of caspase-1, 2, 3, 6, 8, and 9 protease in Chang cells and caspase-3 protease in Chang, HL-60, Hep-3B and Alexander cells by using fluorogenic substrate. Finally, we isolated mRNA of Fas in Chang, HL-60, Hep-38 and Alexander cells and observed that Fas gene was amplified by RT-PCR Results : 1. The combination of adriamycin and Palginhonhapwhajucwhan synergistically augmented the cytotoxicity of Chang and HL-60 cells whereas did not in Hep-38 and Alexander cells. 2. Cotreatment of two drugs also markedly inhibited the colony forming ability both in Chang and HL-60 cells. 3. The cytotoxicity of these medicatons was revealed as apoptosis characterized by high molecular wight DNA fragmentaton. 4. The apoptotic cytotoxicity was mediated by activation of caspase-3 protease in Chang cells. 5. Synergistic increase in apoptotic cytotoxicity by combination of two medications was dependent on the expression of Fas in cancer cells. Conclusions : Combination of adriamycin and Palginhonhapwhajucwhan significantly augmented apoptotic cytotoxicity of Fas-positive cells such as Chang and HL-60 cells via acticaton of apoptosis signaling pathway.

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Escherichia coli O114에 의한 용혈성 요독 증후군 2례 (Two cases of Hemolytic Uremic Syndrome Associated with Esecherichia coli O114)

  • 류수정;한혜원;유수진;이병선;이재규;김미나;김의종;박영서
    • Childhood Kidney Diseases
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    • 제6권1호
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    • pp.102-108
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    • 2002
  • 저자들은 stx2 유전자 양성인 E.coli O114 에 의한 용혈성 요독 증후군 2례를 경험하여 보고하는 바이다. 두 환자 모두 설사와 구토가 1-2일 지속된 후 급작스럽게 요량 감소와 빈혈, 혈소판감소증을 보였으며 10일 간의 복막 투석 치료를 받았으며 급성기에 혈압 증가와 함께 전신성 강직 간대성의 경련이 15-20분 간 있었다. 15여 일 경과 후 후유증 없이 회복되었다. 대변 배양액의 PCR에거 eae와 stx2 유전자를 확인하였고 colony hybridization을 시행하여 O114 혈청형으로 진단하였다. 본 증례는 E.coli O114에 의해 유발된 용혈성 요독 증후군의 첫 국내 보고이다.

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두 개의 다른 마우스 배아줄기세포의 차별적인 조혈세포 분화능 (Different Potential of Hematopoietic Differentiation in Two Distinct Mouse Embryonic Stem Cells)

  • 김진숙;강호범;송지연;오구택;남기환;이영희
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제9권2호
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    • pp.105-114
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    • 2005
  • 배아 줄기세포는 세포 치료 목적을 위한 재료로써 매우 큰 잠재력을 가지고 있으며, 이러한 잠재력의 실현을 위해서 세포의 운명에 결정적인 역할을 하는 요소들을 확인하고 특정 세포의 대량 생산을 위한 방법을 개발하여야 한다. 조혈과정은 폭넓게 연구되어 왔으며, 배아 줄기세포로부터 조혈세포의 분화는 lineage commitment에 관한 연구에 좋은 모델이 된다. 본 연구에서는, 두 종류의 마우스 배아 줄기세포주 TC-1과 B6-1를 이용하여 그 특성과 조혈세포 분화능을 비교하여 보았다. 두 세포주는 작은 차이는 있으나 줄기세포로서의 특성을 공통적으로 가지고 있었다. 그러나 methylcellulose 배양 system을 사용하여 embryonic body 형성능을 확인한 결과 TC-1이 B6-1에 비해 월등함을 확인하였다. 조혈세포 분화의 추적을 위해 blast colony의 형성, progenitor assay, RT-PCR을 통한 조혈세포 분화 관련 marker의 발현 분석을 수행한 결과, TC-1은 정상적으로 조혈세포를 생성해 내지만, B6-1은 제대로 분화되지 못함을 확인할 수 있었다. 이러한 결과들은 in vitro에서 배아 줄기세포로부터 조혈세포로 분화를 유도할 때, 보다 적합한 세포주의 탐색이 요구됨을 제시하며 이는 향후 인간 배아 줄기세포주에서도 마찬가지로 적용될 수 있음을 암시한다고 사료된다.

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자두 탄저병균의 분리 및 동정 (Isolation and Characterization of Colletotrichum Isolates Causing Anthracnose of Japanese Plum Fruit)

  • 이용세;하다희;이태이;박민정;정종배;정병룡
    • 한국환경농학회지
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    • 제36권4호
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    • pp.299-305
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    • 2017
  • 탄저병이 발생한 자두에서 11개 탄저병균을 순수 분리하여 병원성을 검정한 후 PDA에 접종하여 $25^{\circ}C$에서 7-10일 동안 배양하면서 각 균주의 균사 생장속도, colony의 특징과 색, 포자 형태 및 크기를 관찰하였다. 각 균주의 genomic DNA를 추출하여 rDNA-ITS 영역을 증폭한 다음, PCR을 하여 염기서열을 해독하였다. 각 균주의 배양적 특성, 포자의 형태와 크기 및 염기서열을 NCBI GenBank의 염기서열과 상동성을 비교하여 동정한 결과 6개 균주는 Colletotrichum acutatum으로, 5개 균주는 C. gloeosporioides로 동정되었다.

Macrophage Colony-Stimulating Factor와 Osteoclast Differentiation Factor로 분화 유도된 생쥐 파골세포에서 Vitamin D 및 수종의 싸이토카인 수용체의 발현 (Expression of receptors of Vitamin D and cytokines in osteoclasts differentiated by M-CSF and ODF)

  • 성수미;엄흥식;고성희;우경미;장범석
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • 제32권4호
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    • pp.865-873
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    • 2002
  • The primary cause of tooth loss after 30 years of age is periodontal disease. Destruction of alveolar bone by periodontal disease is done by bone resorbing activity of osteoclasts. Understanding differentiation and activation mechanism of osteoclasts is essential for controling periodontal disease. The purpose of this study is to identify the possible effects of Vitamin D and cytokines affecting osteoclasts and its precursor cells. Four to six week-old mice were killed and humerus, radius, tibia and femur were removed aseptically and washed two times with Hank's solution containing penicillin-streptomycin and then soft tissue were removed. Bone marrow cells were collected by 22 gauge needle. Cells were cultured in Hank's solution containing 1 mg/ml type II collagenase, 0.05% trypsin, 41mM EDTA. Supernatant solution was removed 5 times after 15 minutes of digestion with above mentioned enzyme solution, and remained bone particles were maintained in alpha-MEM for 15 minutes and $4^{\circ}C$ temperature. Bone particles were agitated for 1 minute and supernatant solution containing osteoclast precursor cells were filtrated with cell stainer. These separated osteoclast precursor cells were dispensed with 100-mm culture dish by $1{\times}10^7$ cells unit and cultured in ${\alpha}$- MEM containing 20 ng/ml recombinant human M-CSF, 30 ng/ml recombinant human soluble osteoclast differentiation factor and 10% fetal calf serum for 2 and 7 days. Total RNA of osteoclast precursor cells were extracted using RNeasy kit. One ${\mu}g$ of total RNA was reverse transcribed in $42^{\circ}C$ for 30 minutes using SuperScriptII reverse transcriptase. Expression of transcribed receptors of each hormone and cytokine were traced with 1 ${\mu}l$ of cDNA solution by PCR amplification. Vitamin D receptor WAS found in cells cultured for 7 days. TNF-${\alpha}$ receptor was found in cells cultured for 2 days and amount of receptors were increased by 7 days. IL-1 type I receptor was not found in cells cultured 2 and 7 days. But, IL-1 receptor type II was found in cells cultured for 2 days. TGF-${\alpha},{\beta}$type I receptor was found in cells cultured 2 and 7 days, and amount of receptors were increased by 7 days of culture. These results implies Vitamin D and cytokines can affect osteoclasts directly, and affecting period in differentiation cycle of osteoclasts is different by Vitamin D and cytokines.