Agrobacterum tumefaciens-mediated transformation (ATMT) is becoming an effective system as an insertional mutagenesis tool in filamentous fungi. We developed and optimized ATMT for two Colletotrichum species, C. falcatum and C. acutatum, which are the causal agents of sugarcane red rot and pepper anthracnose, respectively. A. tumefaciens strain SK1044, carrying a hygromycin phosphotransferase gene (hph) and a green fluorescent protein (GFP) gene, was used to transform the conidia of these two Colletotrichum species. Transformation efficiency was correlated with co-cultivation time and bacterial cell concentration and was higher in C. falcatum than in C. acutatum. Southern blot analysis indicated that about 65% of the transformants had a single copy of the T-DNA in both C. falcatum and C. acutatum and that T-DNA integrated randomly in both fungal genomes. T-DNA insertions were identified in transformants through thermal asymmetrical interlaced PCR (TAIL-PCR) followed by sequencing. Our results suggested that ATMT can be used as a molecular tool to identify and characterize pathogenicity-related genes in these two economically important Colletotrichum species.
Le Dinh Thao;Hyorim Choi;Yunhee Choi;Anbazhagan Mageswari;Daseul Lee;Seung-Beom Hong
The Plant Pathology Journal
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제39권4호
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pp.384-396
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2023
Colletotrichum acutatum species complex is one of the most important groups in the genus Colletotrichum with a high species diversity and a wide range of host plants. C. acutatum and related species have been collected from different plants and locations in Korea and deposited into the Korean Agricultural Culture Collection (KACC), National Institute of Agricultural Sciences since the 1990s. These fungal isolates were previously identified based mainly on morphological characteristics, and a limitation of molecular data was provided. To confirm the identification of species, 64 C. acutatum species complex isolates in KACC were used in this study for DNA sequence analyses of six loci: nuclear ribosomal internal transcribed spacers (ITS), betatubulin 2 (TUB2), histone-3 (HIS3), glyceraldehyde3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), chitin synthase 1 (CHS-1), and actin (ACT). The molecular analysis revealed that they were identified in six different species of C. fioriniae (24 isolates), C. nymphaeae (21 isolates), C. scovillei (12 isolates), C. chrysanthemi (three isolates), C. lupini (two isolates), and C. godetiae (one isolate), and a novel species candidate. We compared the hosts of KACC isolates with "The List of Plant Diseases in Korea", previous reports in Korea and global reports and found that 23 combinations between hosts and pathogens could be newly reported in Korea after pathogenicity tests, and 12 of these have not been recorded in the world.
사과, 호박, 고추에서 분리된 탄저병균들(Colletotrichum gloeosporioides, C. orbiculare, C. acutatum)이 복분자딸기에 병원성을 나타냈으며. 특히 사과에서 분리된 탄저병균은 무상처 접종에서도 병원성을 나타냈다. 복분자 딸기에서 분리한 탄저병균(Colletotrichum gloeosporioides, C. coccodes, C. acutatum)은 사과와 딸기에서는 dropping 접종에 의해 병원성을 보였으나 고추와 토마토에서는 낮은 병원성을 나타내었다.
Lamsal, Kabir;Kim, Sang Woo;Kim, Yun Seok;Lee, Youn Su
Mycobiology
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제40권4호
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pp.244-251
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2012
In vitro and greenhouse screening of seven rhizobacterial isolates, AB05, AB10, AB11, AB12, AB14, AB15 and AB17, was conducted to investigate the plant growth promoting activities and inhibition against anthracnose caused by Colletotrichum acutatum in pepper. According to identification based on 16S rDNA sequencing, the majority of the isolates are members of Bacillus and a single isolate belongs to the genus Paenibacillus. All seven bacterial isolates were capable of inhibiting C. acutatum to various degrees. The results primarily showed that antibiotic substances produced by the selected bacteria were effective and resulted in strong antifungal activity against the fungi. However, isolate AB15 was the most effective bacterial strain, with the potential to suppress more than 50% mycelial growth of C. acutatum in vitro. Moreover, antibiotics from Paenibacillus polymyxa (AB15) and volatile compounds from Bacillus subtilis (AB14) exerted efficient antagonistic activity against the pathogens in a dual culture assay. In vivo suppression activity of selected bacteria was also analyzed in a greenhouse with the reference to their prominent in vitro antagonism efficacy. Induced systemic resistance in pepper against C. acutatum was also observed under greenhouse conditions. Where, isolate AB15 was found to be the most effective bacterial strain at suppressing pepper anthracnose under greenhouse conditions. Moreover, four isolates, AB10, AB12, AB15, and AB17, were identified as the most effective growth promoting bacteria under greenhouse conditions, with AB17 inducing the greatest enhancement of pepper growth.
Oo, May Moe;Yoon, Ha-Yeon;Jang, Hyun A;Oh, Sang-Keun
The Plant Pathology Journal
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제34권6호
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pp.480-489
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2018
Bitter rot caused by Colletotrichum species is a common fruit rotting disease of apple and one of the economically important disease in worldwide. In 2015 and 2016, distinct symptoms of bitter rot disease were observed in apple orchards in five regions of South Korea. In the present study, infected apples from these regions were utilized to obtain eighteen isolates of Colletotrichum spp. These isolates were identified and characterized according to their morphological characteristics and nucleotide sequence data of internal transcribed spacer regions and glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase. Molecular analyses suggested that the isolates of Colletotrichum causing the bitter rot disease in South Korea belong to 4 species: C. siamense; C. fructicola; C. fioriniae and C. nymphaeae. C. siamense and C. fructicola belonged to Musae Clade of C. gloeosporioides complex species while C. fioriniae and C. nymphaeae belonged to the Clade 3 and Clade 2 of C. acutatum complex species, respectively. Additionally, we also found that the isolates of C. gloeosporioides species-complex were more aggressive than those in the C. acutatum species complex via pathogenicity tests. Taken together, our results suggest that accurate identification of Colletotrichum spp. within each species complex is required for management of bitter rot disease on apple fruit in South Korea.
Colletotrichum acutatum에 의해 발생하는 고추탄저병을 방제하기 위해 토양 근권으로부터 분리한 미생물 중 길항효과가 있는 미생물을 선발하여 주요 작물병원균에 대한 항균활성 효과와 포장에서의 방제효과를 검정하였다. 기내 대치배양법을 이용한 길항력을 검정하였을 때, CAB13001 균주는 고추 탄저병을 일으키는 Colletotrichum acutatum을 포함한 식물 병원균 Sclerotinia cepivorum, Sclerotinia sclerotium, Botrytis cinerea에 대한 뛰어난 항균활성 효과를 보였다. 또한 풋고추를 이용한 생체 검정에서 선발균주는 고추 탄저병의 병반진전 억제효과가 우수하였으며, 포장에서의 방제가 역시 무처리 대비 82.4%로 매우 우수하였다. 이러한 결과로 볼 때 CAB13001 균주는 공기 전염을 하는 고추 탄저병의 생물적 방제제로 매우 유용할 것으로 판단된다. 한편, 본 연구에 사용된 길항미생물 CAB13001 균주는 16s rRNA gene의 계통학적 위치를 분석한 결과 Burkholderia lata로 동정하였다.
고추 탄저병균인 Colletotrichum acutatum JC24는 PDA 배지에 치상한 cellophane막에 포자 접종하여 $25^{\circ}C$의 암상태에서 20시간 배양한 균사체를 2%의 lysing enzyme에 2-3시간 처리하여 $2-3\;{\times}\;10^6$ 개/mL의 원형질체를 수확할 수 있었다. 이때에는 0.02 M phosphate buffer(pH 7.0)와, 삼투압 안정제로는 1.2 M sorbitol용액을 사용하였을 때가 원형질체의 생성량이 가장 높았다. C. acutatum JC24의 균사체에서 얻은 원형질체에 propineb를 $10\;{\mu}\;g\;mL^{-1}$를 처리하였을 경우에, 균사생장 억제효과는 미미하였지만 원형질체의 재생은 100% 억제하였다. Tebuconazole의 재생 억제효과는 균사생장 억제효과와는 큰 차이를 보였는데, $0.5\;{\mu}\;g\;mL^{-1}$ 처리구에서는 원형질체의 재생이 100% 억제되었고, $0.1\;{\mu}\;g\;mL^{-1}$ 처리구에서는 0.9%밖에 억제하지 못하였다. 하지만 동일한 농도에서 균사생장에 대한 억제효과는 85.1과 75.7%로 억제의 경향이 매우 달랐다. Carbendazim의 경우에는 원형질체 재생과 균사생장에 미치는 효과가 비슷하였다. Trifloxystrobin과 kresoxim-methyl을 SHAm과 동시에 처리하였을 원형질체의 재생에 대한 억제 효과가 크게 상승하였다.
고추 탄저병은 국내 고추재배에 가장 큰 피해를 일으키며, Colletotrichum acutatum이 주요 원인균이다. 본 연구에서는 포장에서 고추탄저병의 방제와 식물생장촉진효과를 선발된 길항미생물을 이용하여 평가하였다. 4개의 길항미생물은 이전 연구를 통하여 고추포장(GJ01, GJ11)과 갯벌(LB01, LB14)에서 선발하였다. 4개의 길항미생물은 대조균주 EXTN-1을 포함하여 C. acutatum과 대치배양에서 길항효과를 보였다. 식물생장촉진효과를 알아보기 위해 고추종자의 발아율과 초기생장효과, 그리고 포장에서 식물의 생장효과를 검정하였다. 그 결과 4개의 선발균주는 모두 식물생장효과가 있었다. 그 중에서도 GJ01은 초기생육에서 가장 높은 생장효과를 보였으며, GJ11은 포장에서 가장 높은 고추수확량을 얻었다. 그리고 포장에서 탄저병의 방제효과는 4개의 길항미생물 처리에 의해 63.2~72.5%의 방제가를 보였다. 현재 연구를 토대로 4개의 길항미생물은 고추 탄저병에 대한 잠재적인 생물학적 방제제로서의 가능성을 보여주었다.
Resazurin 기반 호흡 측정법으로 strobilurin계 살균제에 대해서 감수성인 고추탄저병균 Colletotrichum acutatum s. lat. 20JDS8에 대한 살균제의 호흡 억제 효과를 조사하였다. Potato dextrose broth에 병원균의 포자를 접종하고 배양하면서 시간별로 상대 형광값(relative fluorescence unit)을 조사한 결과, 12시간 후부터 상승하기 시작하여 24시간 후의 1×104, 1×105, 1×106 spores/ml의 포자 접종구에서 상대 형광값은 1,965.5, 5,412.5, 10,061.0이었다. 병원균을 0, 6, 12, 24시간씩 배양 후에 공시한 살균제를 처리하고, 24시간 후에 상대 형광값을 조사하였다. Dithianon, isopyrazam, pyraclostrobin, fluazinam을 병원균의 포자(0시간), 포자 발아(6시간), 균사 생장(12시간) 단계에 처리할 경우, 각 살균제의 고농도에서 호흡을 90-100% 억제하였다. 하지만 병원균을 24시간 배양한 후에 살균제를 처리할 경우에는 호흡 억제 효과가 크게 감소하였다. Pyraclostrobin 저항성인 C. acutatum s. lat. 20CDJ6에 대해서 pyraclostrobin, azxoystrobin, trifloxystrobin, kresoxim-methyl을 병원균의 모든 생장 단계에 각각 처리하였을 때, 호흡에 대한 억제 효과는 매우 미미하거나, 나타나지 않았다.
Park, Eun-Sook;Lee, Bo-Heu;Min, Ji-Young;Cho, In-Joon;Kang, Beum-Kwan;Chung, Hae-Yeon;Yoo, Seung-Heon;Kim, Heung-Tae
한국식물병리학회:학술대회논문집
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한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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pp.131.1-131
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2003
This study reports the identification of species of Colletotrichum strains originating from red-pepper and Chinese matrimony vine in Cheongyang. Ninteen isolates of red-pepper and 26 Coiletotrichum isolates of Chinese matrimony vine were compared with 5 isolates of strawberry representing C. gloeosporioides, by use of morphological and cultural criteria. Twenty three isolates among 26 isolates from Chinese matrimony vine were identified as C. acutatum, characterized by the low growth rates and the low sensitivity to carbendazim and diethofencarb. Also, all the isolates of red-pepper were identified as C. acutatum, showing the same characteristics as those of Chinese matrimony vine. Three and five isolates from Chinese matrimony vine and strawberry, respectively, were identified as C. gloeosporioides, characterized by the high growth rates and the high seneitivity to carbendazim and diethofencarb. There were differences in colony color and pathogenicity between Chinese matrimony vine isolates and red-pepper isolates of C. autatum. The isolates of C. acutatum from Chinese matrimony vine producing orange colored colonies with abundant spores showed the strong pathogenicity to Chinese matrimony vine, although they could not infect fruits of red-pepper by the wound inoculation. However, red-pepper isolates of C. acutatum producing gray colonies showed the strong pathogenicity to Chinese matrimony vine as well as red-pepper. Furthermore, comparative study on PCR amplification of ITS regions of rDNA was carried out using a number of Colletotrichum isolates. A species-specific primer could be used for the identification of C. acutatum from red-pepper and Chinese matrimony vine.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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