• 제목/요약/키워드: Coefficients of the variation

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담수환경에서 eDNA와 eRNA를 이용한 Microcystin 합성 남조류 탐색 및 세포 내 Microcystin 생합성 활성 변화 (Detection of Microcystin Synthetic Cyanobacteria and Variation of Intracellular Microcystin Synthesis Using by eDNA and eRNA in Freshwater Ecocystem)

  • 김건희;박채홍;조현진;권대률;황순진
    • 생태와환경
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    • 제56권1호
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    • pp.1-13
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    • 2023
  • 북한강 수역에서 가장 많이 검출되는 Microcystin (MC)을 대상으로 하여 MC 생합성 유전자(mcyA gene), 남조류 세포밀도, MC 농도 사이의 관계를 분석하여 RNA-MC 환산식을 도출하고 남조류 세포 내 존재하는 MC 농도를 예측하였다. 북한강 수역에서 mcyA 유전자는 묵현천 합류 이후 북한강 하류 지점에서 주로 발견되었으며 평균적으로 다른 지점보다 높은 copy number가 발견되었다. 북한강 상류 의암호 수역의 경우, 공지천 지점에서 mcyA 유전자 copy number가 증가하였으며 9월 이후 북한강 수역 전체에서 mcyA 유전자 copy number는 감소하였다. mcyA gene expression은 상류와 하류 수역의 시·공간적 차이가 존재하였으며 여름철 짧은 시기에 집중적으로 발현하였다. mcyA gene expression 양은 MC 농도와 상관성이 매우 높을 뿐만 아니라 MC을 생합성하는 것으로 알려진 Microcystis aeruginosa와 Dolichospermum circinale의 세포밀도와도 통계적으로 유의한 상관성이 존재하였다. RNA-MC 관계를 기반으로 도출된 6개의 환산식은 통계적 유의성을 보이며(p<0.05) 0.9 이상의 높은 상관계수(r)를 나타냈다. eRNA에 존재하는 MC 생합성 유전자 발현량은 수중의 남조독소 물질 합성을 판단하고 유전자의 활성 정도를 빠르게 정량하여 MC 발생 조기경보에 충분히 활용할 수 있을 것으로 판단된다.

Development of a multiplex qRT-PCR assay for detection of African swine fever virus, classical swine fever virus and porcine reproductive and respiratory syndrome virus

  • Chen, Yating;Shi, Kaichuang;Liu, Huixin;Yin, Yanwen;Zhao, Jing;Long, Feng;Lu, Wenjun;Si, Hongbin
    • Journal of Veterinary Science
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    • 제22권6호
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    • pp.87.1-87.12
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    • 2021
  • Background: African swine fever virus (ASFV), classical swine fever virus (CSFV), and porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) are still prevalent in many regions of China. Co-infections make it difficult to distinguish their clinical symptoms and pathological changes. Therefore, a rapid and specific method is needed for the differential detection of these pathogens. Objectives: The aim of this study was to develop a multiplex real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (multiplex qRT-PCR) for the simultaneous differential detection of ASFV, CSFV, and PRRSV. Methods: Three pairs of primers and TaqMan probes targeting the ASFV p72 gene, CSFV 5' untranslated region, and PRRSV ORF7 gene were designed. After optimizing the reaction conditions, including the annealing temperature, primer concentration, and probe concentration, multiplex qRT-PCR for simultaneous and differential detection of ASFV, CSFV, and PRRSV was developed. Subsequently, 1,143 clinical samples were detected to verify the practicality of the assay. Results: The multiplex qRT-PCR assay could specifically and simultaneously detect the ASFV, CSFV, and PRRSV with a detection limit of 1.78 × 100 copies for the ASFV, CSFV, and PRRSV, but could not amplify the other major porcine viruses, such as pseudorabies virus, porcine circovirus type 1 (PCV1), PCV2, PCV3, foot-and-mouth disease virus, porcine parvovirus, atypical porcine pestivirus, and Senecavirus A. The assay had good repeatability with coefficients of variation of intra- and inter-assay of less than 1.2%. Finally, the assay was used to detect 1,143 clinical samples to evaluate its practicality in the field. The positive rates of ASFV, CSFV, and PRRSV were 25.63%, 9.36%, and 17.50%, respectively. The co-infection rates of ASFV+CSFV, ASFV+PRRSV, CSFV+PRRSV, and ASFV+CSFV+PRRSV were 2.45%, 2.36%, 1.57%, and 0.17%, respectively. Conclusions: The multiplex qRT-PCR developed in this study could provide a rapid, sensitive, specific diagnostic tool for the simultaneous and differential detection of ASFV, CSFV, and PRRSV.

면내삽법이 환경적 형평성 분석에 미치는 영향 (Effects of Areal Interpolation Methods on Environmental Equity Analysis)

  • 전병운
    • 한국지역지리학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.736-751
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    • 2008
  • 다수의 연구들이 환경적 형평성 분석에 있어서 환경위험의 영향권 내에 있는 인구를 추산하기 위하여 흔히 단순면가중내삽법을 사용하고 있지만, 그 도출된 결과치는 불가피하게 부정확하다. 왜냐하면, 단순면가중치법은 인구가 원시구역 내에서 균등하게 분포되어 있다는 것을 비현실적으로 전제하고 있기 때문이다. 두 개의 대안적인 면가중치법, 즉 지능형 면가중치법과 회귀법은 주택의 위치에 관한 추가적인 지리적 정보를 이용함으로써 환경위험의 영향권 내에 있는 인구를 추정하는데 있어서 분포적인 편차를 설명할 수 있다. 본 연구는 환경적 형평성 분석에 있어서 환경위험의 영향권 내에 있는 인구를 추정하기 위한 다섯 개의 면내갑법을 탐색하고, 상이한 면내삽법에 대한 환경적 형평성의 민감도를 분석하고자 한다. 본 연구는 면내삽 과정에서 원시구역과 목표구역에 위성영상으로부터 추출된 토지피복의 분포와 같은 추가적인 지리정보를 제공하기 위하여 GIS 기법을 사용하였다. 독립표본 t-test통계량은 환경적 형평성 가설을 검정하기 위하여 사용되었다. 또한, 편재계수는 상이한 면내삽법에 따른 인구추정치의 상대적 변이성을 비교하기 위하여 계산되었다. 본 연구는 사례지역에서 환경적 형평성 분석의 결과는 환경위험의 영향권 내에 있는 인구를 추정하기 위해서 사용된 면내삽법에 민감하지는 않았지만, 상이한 면내삽법들이 사용됨에 따라 그 추정치는 대개 변동적 이었다는 것을 규명하였다. 이것은 환경적 형평성에 대한 통계적 분석결과는 어떤 면내삽법을 사용하느냐에 따라서 어느 정도까지는 변할 수 있다는 것을 암시한다.

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참돔(Pagrus major)의 혈장 난황단백전구체에 대한 효소면역측정법과 난소성숙의 조기판정 (Enzymeimmunoassay for the Plasma Vitellogenin and Early Determination of Ovarian Maturation in Red Seabream, Pagrus major)

  • 한창희;양문호;백재민;임상구;김광현
    • 한국양식학회지
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    • 제8권1호
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    • pp.1-19
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    • 1995
  • 난황형성 중인 암 참돔의 혈청 내에는 암 특이혈청단백질이 존재하고 있음이 Ouchterlony의 면역확산 검정과 면역 전기영동에 의하여 밝혀졌으며, 이러한 암 특이혈청단백질은 암 $\cdot$수 혈청과 난추출액의 면역학적인 조사에 의해 난황단백 전구체임이 밝혀졌다. 또한 난추출액으로부터 정제된 난황단백질은 난황전구체와 공통의 항원성이 있음도 면역학적인 조사에 의하여 알 수 있었다. 변형한 효소면역측정법의 타당성을 조사하였다. 일정 비율로 희석한 성숙중인 암 혈청의 흡광도 곡선은 난황단백질의 표준곡선과 평행하였다 본 효소면역측정법의 평균 회수율은 $109\pm5.6\%$이었으며, $10\%$ 이내의 assay내 변동계수 범위는 $31\~1,000ng/ml$이었다. 생식소의 성숙 단계에 대한 혈장내의 난황단백전구체의 양과의 관계를 조사하기 위하여 휴지기후기(1월)부터 난황형성기(4월)까지 난황단백질에 대한 항체를 이용한 효소면역측정법에 의하여 혈장 난황단백전구체의 양을 측정하였다. 난황단백전구체의 양은 난황형성 전기인 2월부터 증가하기 시작하여, 난황형성기(3월부터 4월) 동안에는 난이 성장하면서 계속 증가하였다 2월부터 혈장내의 난황단백전구체의 양이 암$\cdot$수에 따라 현저하게 차이가 났다. 따라서 참돔 친어의 성 구분은 효소면역 측정법에 의하여 2월부터는 명확히 할 수 있다

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Influence of Ionophore Supplementation on Growth Performance, Dietary Energetics and Carcass Characteristics in Finishing Cattle during Period of Heat Stress

  • Barreras, A.;Castro-Perez, B.I.;Lopez-Soto, M.A.;Torrentera, N.G.;Montano, M.F.;Estrada-Angulo, A.;Rios, F.G.;Davila-Ramos, H.;Plascencia, A.;Zinn, R.A.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제26권11호
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    • pp.1553-1561
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    • 2013
  • Forty-eight crossbred heifers ($378.1{\pm}18$ kg) were used in a 56-d feeding trial (four pens per treatment in a randomised complete block design) to evaluate the influence of ionophore supplementation on growth performance, dietary energetics and carcass characteristics in finishing cattle during a period of heat stress. Heifers were fed a diet based on steam-flaked corn (2.22 Mcal $NE_m/kg$) with and without an ionophore. Treatments were: i) control, no ionophore; ii) 30 mg/kg monensin sodium (RUM30); iii) 20 mg/kg lasalocid sodium (BOV20), and iv) 30 mg/kg lasalocid sodium (BOV30). Both dry matter intake (DMI) and climatic variables were measured daily and the temperature humidity index (THI) was estimated. The maximum THI during the study averaged 93, while the minimum was 70 (THI average = $79.2{\pm}2.3$). Compared to controls, monensin supplementation did not influence average daily gain, the estimated NE value of the diet, or observed-to-expected DMI, but tended (p = 0.07) to increase (4.8%) gain to feed. Compared to controls, the group fed BOV30 increased ($p{\leq}0.03$) daily gain (11.8%), gain to feed (8.3%), net energy of the diet (5%), and observed-to-expected DMI (5.2%). Daily weight gain was greater (7.6%, p = 0.05) for heifers fed BOV30 than for heifers fed MON30. Otherwise, differences between the two treatments in DMI, gain to feed, and dietary NE were not statistically significant (p>0.11). Plotting weekly intakes versus THI, observed intake of controls was greater (p<0.05) at THI values ${\leq}77$ than ionophore groups. When THI values were greater than 79, DMI of control and MON30 were not different (p = 0.42), although less than that of groups fed lasalocid (p = 0.04). Variation in energy intake was lower (p>0.05) in the ionophores group (CV = 1.7%) than in the control group (CV = 4.5%). Inclusion of ionophores in the diet resulted in relatively minor changes in carcass characteristics. It is concluded that ionophore supplementation did not exacerbate the decline of DM intake in heat-stressed cattle fed a high-energy finishing diet; on the contrary, it stabilised feed intake and favoured feed efficiency. Ionophore supplementation reduced estimated maintenance coefficients around 10% in finishing cattle during a period of heat stress. This effect was greatest for heifers supplemented with 30 mg lasalocid/kg of diet.

Sound Absorption Properties of Sound Absorption Materials Using Zelkova serrata Leaves

  • Eunji Bae;Junho Goh;Dahye Yeom;Kyungrok Won;Reekeun Kong;Heeseop Byeon
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제40권2호
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    • pp.90-98
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    • 2024
  • This study analyzes the characteristics of sound-absorbing materials made from forest by-products of the deciduous tree species Zelkova serrata (Z. serrata) by evaluating their sound absorption performance. Accordingly, sound-absorbing materials with varying sample thicknesses, leaf sizes, and drying conditions were fabricated. The sound absorption properties were measured using the impedance tube method via middle-type measurement tube (100 Hz-3,200 Hz). The sound absorption properties were evaluated using the average sound absorption coefficient (ASAC), which was calculated from the measured sound absorption coefficients at 250 Hz, 500 Hz, 1,000 Hz, and 2,000 Hz. The ASAC value significantly improved as the leaf size increased to 0.5×0.5 cm2, 1.0×1.0 cm2, and 2.0×2.0 cm2. The ASAC values under the two drying conditions were similar. There was no significant difference in ASAC according to the leaf size under the air-dried leaf condition, with a thickness of 2.50 cm. The highest ASAC value according to the sound-absorbing material thickness was 0.47 at a thickness of 2.50 cm and leaf size of 2.0×2.0 cm2 under the air-dried leaf condition. In addition, the variation in ASAC was 0.23, indicating that the sound absorption performance according to leaf thickness was more significant than the difference in absorption properties according to leaf size. A sound absorption coefficient (SAC) of 0.4 or higher was observed across the measurable frequency band (100 Hz-3,200 Hz). Furthermore, the SAC values with respect to leaf size and thickness were close to 1 in the high-frequency range above 2,000 Hz. Therefore, it is considered that sound-absorbing materials using Z. serrata leaves are advantageous in the field of absorbing noise in a high-frequency band of 2,000 Hz or more, and it is better to manufacture a thickness of 2.50 and 2.0×2.0 cm2.

구면 스레피안 함수로 표현된 지각 자기이상값과 구배 성분 (Spherical Slepian Harmonic Expression of the Crustal Magnetic Vector and Its Gradient Components)

  • 김형래
    • 자원환경지질
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    • 제49권4호
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    • pp.269-280
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    • 2016
  • 지역에 최적화된 스레피안 구면함수(spherical Slepian function)를 활용하여 남극을 중심으로 반경 $20^{\circ}$ 범위의 지역에 지각 자기이상의 3개의 방향 성분과 6개의 구배성분들을 표현하였다. 2013년 11월 유럽 항공 우주국이 발사한 3개의 자력 위성인 Swarm은 궤도 전개를 통해 동서 방향의 구배값은 물론 남북 및 수직방향의 구배값을 얻을 수 있도록 계획하였다. 이미 발사된 여러 중력위성들(i.e., GRACE and GOCE) 역시 이러한 구배값을 활용하여 보다 정확한 중력 이상값 및 지표에서의 시간에 따른 중력변화 연구등을 수행해 왔으나 자력 위성자료를 통해서는 많은 연구들이 이루어지고 있지 않는 상태이다. 한편 지역화 모델링은 관심 지역 또는 자료 분포의 제한인 지역인 경우에 활용될 수 있다. 또한 전지구 모델보다 효율적인 연산이 가능하여 위성자료로부터 고해상도의 지각 자기이상값을 표현할 수 있다는 장점을 지니고 있다. 또한 기존의 전지구 구면조화함수의 선형 결합으로 이루어진 기저함수들은 서로 직교성(orthogonality)이 유지되므로 스레피안 구면함수의 계수를 전지구 구면조화함수의 계수로 변환이 가능하여 스펙트럼 분석에 활용할 수 있다. 따라서 Swarm 위성자료의 구배 성분을 이용한 지역화 모델링 방법은 앞으로 많은 활용이 기대되며 여기서는 Swarm 위성자료로부터 얻어진 지각 자기이상값의 전지구 조화함수 계수 모델을 사용하여 자기이상의 방향성분과 구배성분을 유도하고 이를 스레피안 구면 조화함수에 적용하여 관심지역인 남극지역의 방향 성분과 구배 성분을 표현하고 이에 대한 결과를 토의 하고자 한다.

통계분석을 이용한 경기도 대기 중 미세먼지 및 중금속 분포 특성 (Distribution Characteristics of PM10 and Heavy Metals in Ambient Air of Gyeonggi-do Area using Statistical Analysis)

  • 김종수;홍순모;김명숙;김요용;신은상
    • 한국대기환경학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.281-290
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    • 2014
  • This study was conducted to evaluate the distribution characteristics of $PM_{10}$ and heavy metals concentrations in the ambient air of Gyeonggi-do area by region and season from February, 2013 to March, 2014. The regression model for the prediction of formation characteristics and contamination degree of $PM_{10}$ and heavy metals by correlation analysis and regression analysis for using the multivariate statistical analysis was also established. The main wind direction during the investigation period was South East (SE) and West South West (WSW) winds, and the concentration of $SO_2$ at Ansan with industrial region showed 1.6 times higher than Suwon, Euiwang with residential region. The concentrations (median) of Pb, Cu and Ni at Ansan showed 3.2~4.5, 1.9~2.2 and 1.7~2.6 times respectively higher than those at Suwon. By the seasonal concentration variation, the concentrations of $PM_{10}$, Pb, Fe and As in winter and spring (December to May) showed 1.7, 1.9, 1.9 and 2.7 times respectively higher than those in summer and fall (June to November). As, Fe and $PM_{10}$ had a big difference by the seasonal factors, and Cu and Ni were evaluated to be influenced by the regional factors. From the results of correlation analysis among the target items, the correlation coefficient of PM and Mn had 0.82 (p/0.01) and that of Fe and Mn had 0.82 (p/0.01), which showed high correlation. And the correlation coefficients for $SO_2$ and Pb, CO and $PM_{10}$ were 0.66 (p/0.01) and 0.62 (p/0.01) respectively. The multiple linear regression models for $PM_{10}$, Pb, Cu, Cr, As, Ni, Fe and Mn were established by independent variables of CO, $SO_2$ and meteorological factors (wind speed, relative humidity). In the regression models, independent variable $SO_2$ was in cause-and-effect relationship with all dependent variables, and $PM_{10}$, Fe and Mn were influenced by CO and wind speed, and Pb, Cu, Ni and As had a main factor of $SO_2$.

ESTIMATION OF CLEAR WOOD PROPERTIES BY NEAR INFRARED SPECTROSCOPY

  • Schimleck, Laurence R.;Evans, Robert;Ilic, Jugo;Matheson, A.Colin
    • 한국근적외분광분석학회:학술대회논문집
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    • 한국근적외분광분석학회 2001년도 NIR-2001
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    • pp.1161-1161
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    • 2001
  • Rapid cost-effective methods of measuring wood quality are extremely important to tree improvement programs where it is necessary to test large numbers of trees. Non-destructive sampling of a forest can be achieved by using increment cores generally removed at breast height. At CSIRO Forestry and Forest Products methods for the rapid, non-destructive measurement of wood properties and wood chemistry based on increment core samples have been developed. In this paper the application of near infrared (NIR) spectroscopy to the prediction of a range solid wood properties, including density, longitudinal modulus of elasticity (E$\sub$L/) and microfibril angle (MFA), is described. Experiments conducted on individual species (Eucalyptus delegatensis and Pinus radiata), the two species combined and a number of mixed species from several genera are reported. NIR spectra were obtained from the radial/longitudinal face of each sample and used to develop calibrations for the measured physical properties. When the individual species were used the relationships between laboratory determined data and NIR fitted data were good in all cases. Coefficients of determination (R$^2$) ranging from 0.77 for MFA to 0.93 for stick density were obtained for E. delegatensis and R$^2$ ranging from 0.68 for MFA to 0.94 for strip density were obtained for P. radiata. The calibration statistics for the combined E. delegatensis and P. radiata samples were similar to those found for the individual species. As these results indicated that it might be possible to produce general calibrations based on samples from a number of species of a single genus or samples from a number of different genera, a wide range of species was subsequently tested. Good relationships were obtained for both density and E$\sub$L/. These calibrations had R$^2$ that were slightly lower than those determined using individual species and standard errors that were higher. The mixed species calibrations, when applied to the E. delegatensis and P. radiata sample sets, provided good estimates of density (stick and strip) and E$\sub$L/. The results demonstrated that a mixed species calibration, that encompasses wide variation in terms of, wood anatomy, chemistry and physical properties, could be used to rank trees. Experiments reported in this paper demonstrate that solid wood properties can be estimated by NIR spectroscopy. The method offers a rapid and non-destructive alternative to traditional methods of analysis and is applicable to large-scale non-destructive forest resource assessment, and to tree breeding and silvicultural programs.

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플래쉬 중각냉각기와 플래쉬 가스 바이패스를 이용한 이단압축 이산화탄소 사이클의 냉방성능에 관한 해석적 연구 (Simulation Study on the Cooling Performance of the Two-Stage Compression CO2 Cycle with the a Flash Intercooler and Flash Gas Bypass)

  • 곽명석;조홍현
    • 대한기계학회논문집B
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    • 제36권1호
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    • pp.17-24
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    • 2012
  • 본 연구에서는 효율적인 냉방시스템의 성능특성을 연구하기 위하여 2단압축을 이용한 이산화탄소 냉방사이클의 성능에 대하여 해석적 연구를 진행하였다. 2단압축을 이용한 플래쉬 중간냉각(flash intercooler)과 플래쉬 가스 바이패스(flash gas bypass) 사이클에 대한 해석적 모델을 개발하였으며 실내온도, 실외온도, 그리고 1단 및 2단 EEV 개도를 변화시켰다. 그 결과 FI와 FGB 사이클의 성능계수는 실외온도를 변화시켰을 경우 각각 28.5%, 22.1% 정도 감소하였으며, 실내온도 변화에 따른 이단압축 사이클의 성능변화는 단단압축 사이클에 비하여 적은 것으로 나타났다. 또한 저단 및 고단 EEV 개도를 변경하였을 경우 성능은 각각 13.5%, 6.9% 그리고 0.9%, 2.6% 정도 증가하는 것으로 나타나 고단 EEV 개도보다 저단의 EEV 개도의 변화가 시스템의 성능에 미치는 영향이 큰 것으로 확인되었다. FI 사이클은 다양한 운전조건에서 시스템의 성능이 가장 높게 나타나는 것을 확인할 수 있었다.