• Title/Summary/Keyword: Coat-color

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Genome-wide Single Nucleotide Polymorphism Analyses Reveal Genetic Diversity and Structure of Wild and Domestic Cattle in Bangladesh

  • Uzzaman, Md. Rasel;Edea, Zewdu;Bhuiyan, Md. Shamsul Alam;Walker, Jeremy;Bhuiyan, A.K.F.H.;Kim, Kwan-Suk
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제27권10호
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    • pp.1381-1386
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    • 2014
  • In spite of variation in coat color, size, and production traits among indigenous Bangladeshi cattle populations, genetic differences among most of the populations have not been investigated or exploited. In this study, we used a high-density bovine single nucleotide polymorphism (SNP) 80K Bead Chip derived from Bos indicus breeds to assess genetic diversity and population structure of 2 Bangladeshi zebu cattle populations (red Chittagong, n = 28 and non-descript deshi, n = 28) and a semi-domesticated population (gayal, n = 17). Overall, 95% and 58% of the total SNPs (69,804) showed polymorphisms in the zebu and gayal populations, respectively. Similarly, the average minor allele frequency value was as high 0.29 in zebu and as low as 0.09 in gayal. The mean expected heterozygosity varied from $0.42{\pm}0.14$ in zebu to $0.148{\pm}0.14$ in gayal with significant heterozygosity deficiency of 0.06 ($F_{IS}$) in the latter. Coancestry estimations revealed that the two zebu populations are weakly differentiated, with over 99% of the total genetic variation retained within populations and less than 1% accounted for between populations. Conversely, strong genetic differentiation ($F_{ST}=0.33$) was observed between zebu and gayal populations. Results of population structure and principal component analyses suggest that gayal is distinct from Bos indicus and that the two zebu populations were weakly structured. This study provides basic information about the genetic diversity and structure of Bangladeshi cattle and the semi-domesticated gayal population that can be used for future appraisal of breed utilization and management strategies.

Sinapine 누출정도에 따른 무(Raphanus sativus L.) 종자의 발아율과 종자 및 유묘의 외형적 차이 (Relationship Between Sinapine Leakage Degrees of Radish Seeds and Germination and Morphological Differences of the Seeds and Seedlings)

  • 민태기;백준호;김복진
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제40권3호
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    • pp.238-242
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    • 1997
  • 5개 무 품종의 종자를 3시간 물에 침지한 후 cellulose 분말을 코팅하여 UV 광하에서 sinapine 누출정도에 따른 형광색의 분포정도에 따라 무형광(NF)종자, 일부형광(PF)종자, 완전형광(FF)종자로 구분하고, 또 이들 종자와 발아한 유묘의 외부형태를 주사전자현미경(SEM), 광학현미경 및 육안으로 관찰하였다. 종자의 발아율은 무형광(NF)종자>일부형광(PF)종자>완전형광(FF)종자 순으로 낮았으며, 무형광(NF)종자는 종피조직이 치밀하고 둥근 모양이었으나, 일부형광(PF) 및 완전형광(FF)종자는 종피가 주름지거나 상처가 있는 것이 대부분이었다. 또 무형광(NF)종자에서 나온 유묘의 떡잎과 배축은 정상이었으나, 일부형광(PF) 및 완전형광(FF)종자에서 나온 유묘의 떡잎에는 조직이 괴사한 흔적이 많았으며 떡잎과 배축의 크기가 작고 비정상적이었다.

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가구산업에 사용되는 이소시안화물 폭로에 대한 평가 (Evaluation of Exposure to Isocyanates Used in Furniture Industry)

  • 이수길;이내우;디노 피사니엘로
    • 한국안전학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.138-142
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    • 2006
  • 직업성 천식은 시안화물의 폭로에 의해 발생되는 것으로 알려져 있다. 남호주에 있는 가구산업에서는 일반적으로 목재판 위를 피복하기 위해 이중분사도포를 할 때 이소시안화물 도포제가 사용된다. 이 연구는 이와 관련 된 분야의 자료부족으로 관련 산업에서의 환경 및 피부와 안구폭로에 대한 모니터링을 위하여 수행되었다. 이 연구결과에 의하면 저압다량(HVLP)의 분사기 사용, 페인트 용액중의 저농도 경화제 및 전면 호흡보호구와 같은 적절한 보호구의 사용시에는 대기로부터 오염물질의 유입은 거의 없었고, 분사실 주변의 일반적인 작업범위에도 HDI 가 거의 감지되지 않았다. 페인트분사시의 일회용 장갑착용으로 피부폭로는 발견되지 않았으나, 칼라 모니터링에 의하면 장갑을 착용하지 않거나 청결하게 관리할 수 있는 공정이나 안전한 장소에 보관하지 않으면 작업장으로부터 피부폭로가 있었다. 페인트분사로부터 눈의 오염은 감지되지 않았고, 호흡기, 피부 및 안구에도 폭로되지 않았으며 유입과 가장 관련성이 있는 것은 작업형태이다.

소 모색관련 MC1R 유전자의 SNP와 관련한 3'-tailed primer를 이용한 한우육의 판별 (Identification of Hanwoo Using 3'-tailed Primer Associated with Single Nucleotide Polymorphism(SNP) in Melanocortin 1 Receptor(MC1R) gene)

  • 김태중;박성도;이재일
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권6호
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    • pp.897-902
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    • 2004
  • 이전에 연구된 한우육과 Holstein 및 Black angus육 감별법의 신속성, 편리성, 경제성 등의 단점을 보완하기 위해 소의 MC1R gene의 SNP를 이용한 새로운 감별법을 시도하였다. 본 연구에서는 소의 MC1R gene 중 594번째 염기인 Guanine이 한우에서는 결실된 점을 이용하여 한우의 sequence를 바탕으로 3 쪽에 2mers의 tail을 달아 한우에게는 상보적이나 다른 종에서는 상보적이지 않은 3 -tailed primers를 제작하였다. 이 primer들을 이용해서 한우에서만 MC1R 중 571번째 염기서열부터 919번째 염기서열까지의 343bp의 단편이 증폭되도록 하였다. 그 결과, Holstein, Black angus에서는 모두 band가 관찰되지 않았으나 한우에서는 343bp의 band가 확인되었다. 따라서 본 연구에서 사용한 3 -tailed primer를 이용하면 보다 정확하고 재현성 있으며 신속하고 편리하며 경제적인 한우육의 감별이 될 것으로 판단된다.

무미와 단미로 특징되는 동경이에 대한 연구 (Study on Dongkyung-i Dog Characterized as Anury and Brachyury)

  • 조성진;박영석;이은수;이현아;김옥진
    • 한국임상수의학회지
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    • 제25권1호
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    • pp.15-18
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    • 2008
  • 최근 댕견으로 불리는 동경이에 대한 과학적 연구는 현재까지 거의 없는 실정이며, 본 연구는 동경이의 형태학적 특징을 조사하기 위하여 수행되었다. 연구 결과 동경이는 활동적이고 체격이 단단하고 사람과 친화적인 것을 알 수 있었다. 형태학적으로 평균 22.6kg의 체중을 보여 중형견으로 분류되었고 피모색은 주로 황갈색으로 짧은 털을 가지고 있었고 외관상 골반이 단단하고 꼬리가 없거나 매우 짧았다. 방사선학적 연구 결과 꼬리의 미추가 형성되지 않았거나 미약한 것을 알 수 있었다. 이러한 연구 결과로부터 한국 고유 품종의 하나인 동경이의 특징은 무미 또는 단미인 것을 알 수 있었다. 향후 혈통에 대한 유전학적 연구의 진행으로 한국 고유의 특성 있는 품종의 개발 가치가 있을 것으로 판단된다.

Taxonomy of Asian Geranium L.(Geraniaceae) based on fruit and seed morphology

  • Park, Seon-Joo;Park, Hong-Duok
    • 한국환경과학회지
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    • 제11권2호
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    • pp.121-130
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    • 2002
  • Compare to investigate the taxonomic utility of infragenera system and interspecific of Asian Geranium, we examined the fruit and seed morphology from 35 taxa. The fruit shape and seed's dispersal way did so that may divide subgenus or some part section to do could reason evolutionary trends. That is, at seed dispersal, the awns of section Geranium of subgenus Geranium, ramains attached at the top of rostrum, though fairy easily broken off, because seed increases awn's elasticity by diffusive way, it is long characteristic seed\`s dispersal distance, and subgenus Robertium observed that seed dispersal distance is short because it is no awn's elasticity by way that seed dispersal is gone as awn drops with rostrum. Also, section Geranium of subgenus Geranium and subgenus Robertium act role that awn keeps temporarily breed swerving with mericarp instead of bristle because section Tuberosa of subgenus Geranium is not bristled function that keep temporarily breed because mericarp bristled on base at seed dispersal do while. Therefore, is thought that is talon that when consider formation's development and function regarding this seed dispersal function, subgenus Geraniuum evolves more than subgenus Robertium. Seed morphology can divide by 2 subgenera(Geranium, Robertium) according to pattern of seed coat. and Seed's morphology characteristic(whole shape, color, form of seed apical and base, micropyle area, hilum area, chalaza, and position of seed hilum area), can distinguish some species, but is thought that is not reasonable as for discernment characteristic form and nature by repetition of characteristic form and nature. Especially, infrasection do in fruit and seed's morphology that is handling in this research that know to argue classification system and relationship by repetition of characteristic form and nature difficult. To all reliable truth, cytological, ecological, embryology, and molecular genetics research about talon is considered that should be achieved section Geranium that do not handle yet.

Analysis of Dietary Fiber of 66 Korean Varieties of Sprout Beans and Bean Sprouts

  • Lee, Kyung-A;Cho, Young-Ae;Hwang, Young-Hyun;Lee, Hye-Sung
    • Preventive Nutrition and Food Science
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    • 제8권2호
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    • pp.173-178
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    • 2003
  • The present study was conducted to determine a high-fiber variety of sprout bean and bean sprout. Sixty-six varieties of Korean sprout beans and thirty varieties of Korean bean sprouts were analyzed for their total dietary fiber (TDF) using a combination of enzymatic and gravimetric methods adopted by AOAC. The average and range of the TDF contents of the 66 varieties of sprout beans were 21.73$\pm$2.43% and 16.60~29.2% (dry basis), respectively. The top five types of sprout beans with high TDF anions the 66 samples were KLG10658 (29.2%), Dawonkong (28.46%), Sohokong (25.66%), Moohankong (25.465%) and Samnamkong (24.94%). The mean TDF content of sprout beans was relatively high in the variety with yellow seed coat color and a smaller seed size (<15 g/100 seeds) than the ones with other colors and of medium or large seed size. The average and range of the TDF content of the 30 varieties of bean sprouts were 24.48$\pm$3.9% and 18.3~33.38%, respectively. Dawonkong sprouts showed the highest TDF content (33.38%). The average TDF content of bean sprouts was 1.16 times higher than that of the corresponding seed beans. The TDF content of bean sprouts did not significantly change during the days of culture. The TDF content in the different parts of the bean sprout were high in the order of roots, hypocotyl and cotyledon.

Identification of Korean Native Pork Using Breed-Specific DNA Marker of KIT Gene

  • Chung, Eui-Ryong;Chung, Ku-Young
    • 한국축산식품학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.403-409
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    • 2010
  • Accurate methods for the identification of closely related species or breeds in raw and processed meats must be developed in order to protect both consumers and producers from mislabeling and fraud. This paper describes the development of DNA markers for the discrimination and improvement of Korean native pig (KNP) meat. The KIT gene is related to pig coat color and is often used as a candidate marker. A 538 bp fragment comprising intron 19 of the pig KIT gene was amplified by PCR using specific primers, after which the PCR amplicons of a number of meat samples from KNP and three major improved breeds (Landrace, Duroc and Yorkshire) were sequenced in order to find a nucleotide region suitable for PCR-RFLP analysis. Sequence data showed the presence of two nucleotide substitutions, g.276G>A and g.295A>C, between KNP and the improved pig breeds. Digestion of KIT amplicons with AccII enzyme generated characteristic PCR-RFLP profiles that allowed discrimination between meats from KNP and improved pig. KNP showed three visible DNA bands of 264/249, 199, and 75 bp, whereas DNA bands of 249, 199, and 90 bp were detected in the three improved pig breeds. Therefore, the 75 bp DNA fragment was specific only to KNP, whereas the 90 bp DNA fragment was specific to the improved breeds. The breed-specific DNA markers reported here that target the KIT gene could be useful for the identification of KNP meat from improved pig meats, thus contributing to the prevention of falsified breed labeling.

한국산 용담과 쓴풀속(Ophelia) 식물의 분류 1. 외부형태 및 분포 (A taxonomic study of the Ophezia(Gentianaceae) in Korea 1. External morphology and distribution)

    • 한국자원식물학회지
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    • 제12권4호
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    • pp.324-339
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    • 1999
  • 한국산 쓴풀속(용담과) 식물 중 남한에 분포하는 5분류군과 변이체라 생각되는 1분류군, 총 6분류군에 대하여 외부형태학적 형질을 재검토하였고 판별분석(44개의 양적형질)을 수행하여 절과 종간의 한계를 분명히 하여 종 동정의 어려움을 해결하고 분류학적 위치를 설정하고자 본 연구를 수행하였다. 또한 북한에 분포하는 1분류군은 동경대학의 소장품을 관찰하여 분류군의 기재에만 사용하였다. 조사결과, 밀선의 전체적 형태, 화관과 꽃받침의 열편수에 의해 2개 절로 구분되었으며 경생엽의 형태와 화관의 색과 무의에 의해 종간 구분이 가능하였다. 변이체라고 생각되었던 큰잎쓴풀(화관 열편에 자색 점무의를 갖는 분류군) A형은 자색 점 이외의 형질들에서는 전혀 차이를 찾아볼 수 없어 모종의 변이 폭에 넣는 것이 타당하다고 생각된다. 판별분석에 의해 쓴풀속의 식물들을 구별하는 중요한 양적형질은 화관에 관여하는 형질들임이 밝혀졌다. 종자의 형태와 종피의 형질은 종이상을 구별하는 매우 유용한 형질로 밝혀졌다. 따라서 한국산 쓴풀속 식물들에 대한 종 동정의 어려움을 해결하였으며, 속내의 분류학적 위치를 명확히 하였다.

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콩깍지 추출물의 항산화·항염·항비만 및 에스트로겐 유사활성 평가 (Antioxidant, Anti-inflammatory, Anti-obesity and Estrogen-like Activities of Soybean Pod Extracts)

  • 정은숙;김행란;황유진;장경아;서미경;추한나
    • 한국식생활문화학회지
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    • 제36권6호
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    • pp.649-660
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    • 2021
  • In this study, soybean pods of 45 soybean landraces (or varieties) were classified as yellow (19 samples), black (23 samples), or black in green (3 samples) based on soybean seed coat color. Total polyphenol and flavonoid contents were measured, and antioxidant, anti-inflammatory, anti-obesity, and estrogen-like activities were assessed. Total polyphenol and flavonoid content ranges were 24.13-108.03 mg GAE/g and 3.31-72.02 mg CE/g, respectively, and were highest in the black group followed by the yellow group and were least in the black in green group, while ABTS and DPPH activities followed the order black in green > black > yellow. Estrogen-like and estrogen receptor-α activity ranges were 29.06-35.58 pg/mL and 7.05-10.13 pg/mL and were followed the order yellow > black > black in green and black in green > yellow > black, respectively. Nitric oxide (NO) inhibitory and UCP-1 activities followed the same order as estrogen receptor-α activities. Our findings suggest that soybean pods are excellent sources of antioxidants and high-quality functional materials.