• 제목/요약/키워드: Clustering Effect

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The Effect of Lidocaine.HCl on the Fluidity of Native and Model Membrane Lipid Bilayers

  • Park, Jun-Seop;Jung, Tae-Sang;Noh, Yang-Ho;Kim, Woo-Sung;Park, Won-Ick;Kim, Young-Soo;Chung, In-Kyo;Sohn, Uy Dong;Bae, Soo-Kyung;Bae, Moon-Kyoung;Jang, Hye-Ock;Yun, Il
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제16권6호
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    • pp.413-422
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    • 2012
  • The purpose of this study is to investigated the mechanism of pharmacological action of local anesthetic and provide the basic information about the development of new effective local anesthetics. Fluorescent probe techniques were used to evaluate the effect of lidocaine HCl on the physical properties (transbilayer asymmetric lateral and rotational mobility, annular lipid fluidity and protein distribution) of synaptosomal plasma membrane vesicles (SPMV) isolated from bovine cerebral cortex, and liposomes of total lipids (SPMVTL) and phospholipids (SPMVPL) extracted from the SPMV. An experimental procedure was used based on selective quenching of 1,3-di(1-pyrenyl)propane (Py-3-Py) and 1,6-diphenyl-1,3,5-hexatriene (DPH) by trinitrophenyl groups, and radiationless energy transfer from the tryptophans of membrane proteins to Py-3-Py. Lidocaine HCl increased the bulk lateral and rotational mobility of neuronal and model membrane lipid bilayes, and had a greater fluidizing effect on the inner monolayer than the outer monolayer. Lidocaine HCl increased annular lipid fluidity in SPMV lipid bilayers. It also caused membrane proteins to cluster. The most important finding of this study is that there is far greater increase in annular lipid fluidity than that in lateral and rotational mobilities by lidocaine HCl. Lidocaine HCl alters the stereo or dynamics of the proteins in the lipid bilayers by combining with lipids, especially with the annular lipids. In conclusion, the present data suggest that lidocaine, in addition to its direct interaction with proteins, concurrently interacts with membrane lipids, fluidizing the membrane, and thus inducing conformational changes of proteins known to be intimately associated with membrane lipid.

In vitro Activation of Procaspase-8 by Forming the Cytoplasmic Component of the Death-inducing Signaling Complex (cDISC)

  • Roy, Ankoor;Hong, Jong hui;Lee, Jin-Hee;Lee, Young-Tae;Lee, Bong-Jin;Kim, Key-Sun
    • Molecules and Cells
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    • 제26권2호
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    • pp.165-170
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    • 2008
  • Procaspase-8 is activated by forming a death-inducing signaling complex (DISC) with the Fas-associated death domain (FADD) and the Fas receptor, but the mechanism of its activation is not well understood. Procaspase-8 devoid of the death effector domain at its N-terminus (${\Delta}nprocaspase-8$) was reported to be activated by kosmotropic salts, but it has not been induced to form a DISC in vitro because it cannot interact with FADD. Here, we report the production of full-length procaspase-8 and show that it is activated by adding the Fas death domain (Fas-DD) and the FADD forming the cytoplasmic part of the DISC (cDISC). Furthermore, mutations known to affect DISC formation in vivo were shown to have the same effect on procaspase-8 activation in vitro. An antibody that induces Fas-DD association enhanced procaspase-8 activation, suggesting that the Fas ligand is not required for low-level activation of procaspase-8, but that Fas receptor clustering is needed for high-level activation of procaspase-8 leading to cell death. In vitro activation of procaspase-8 by forming a cDISC will be invaluable for investigating activation of ligand-mediated apoptosis and the numerous interactions affecting procaspase-8 activation.

Effect of Sexual Partners on the Oestrous Behaviour Response in Zebu Cattle (80S Indicus) Following Synchronisation with a Progestagen (Synchro-Mate B)

  • Cortes, R.;Orihuelal, J.A.;Galina, C.S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제12권4호
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    • pp.515-519
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    • 1999
  • With the purpose of determining the influence of sexual partners on the oestrous behaviour and to evaluate the accuracy of predicting the time from implant withdrawal to sexual receptivity following a treatment with Synchromate B (SMB), 15 adult Brahman cows were used in each of three phases. During phase I and n, random pairs of animals were induced to display oestrus one pair after the other at daily intervals, while in phase III, cows were induced alternately, every other day, one cow on the 1st day, two on the 3rd, one on the 5th, two on the 7th until all cows were treated. Sixty six percent of the cows in phases I and II, and 80% in phase III came into oestrous after treatment. The interval between implant withdrawal and, expected and observed oestrous was statistically different in all phases. Clustering of oestrous was evident. Cows displayed sexual receptivity within a. range of -24 to +96; -24 to +72 and -216 to +192 hours after implant withdrawal for the three phases, respectively, with a tendency for cows treated first (within treatments), to delay their oestrus signs and vice versa. In phase III, four cows showed oestrous behaviour with the implant in place. These in spite of not observing pre-ovulatory follicles. Correlation values of 0.99, 0.93 and 0.90 (P<0.05) were found respectively among treatments, between the number of cows coming into oestrus and the number of mounts observed. These findings suggest that there are social and behavioural factors in a herd that may override exogenous synchronisation treatments.

가우시안 영역 분리 기반 명암 대비 향상 (Contrast Enhancement based on Gaussian Region Segmentation)

  • 심우성
    • 방송공학회논문지
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    • 제22권5호
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    • pp.608-617
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    • 2017
  • 영역 분리에 의한 명암대비 방법들이 제안되어 왔지만 영상의 히스토그램에 따라 과포화 되는 부작용이나 밝기 값 보존과 명암대비 효과의 상반 관계에 대한 개선이 필요하다. 본 논문은 다양한 히스토그램에서도 명암 대비가 개선 되도록 영역 분리 시 각 서브 영역이 가우시안 분포를 갖도록 분리하고 영역별 평활화하는 명암 대비 방법을 제안 한다. 영역 분리는 $L^*a^*b^*$ 컬러 공간에서 K-평균 방법과 기대-최대 방법에 의해 영역맵과 확률맵을 생성하며 영역별 히스토그램 평활화 방법은 영역간 히스토그램 중복 최소를 위해 평균값 이동과 영역 분리에서 생성된 확률맵을 변환 함수에 활용함으로써 영역별 밝기값을 보존 하였다. 실험은 기존의 명암 대비 방법들과 평균 밝기 차이와 평균 엔트로피 값을 이용하여 밝기 변화가 적고 영상의 세부 정보가 표현됨에 의한 명암대비 개선을 보인다.

지적 구조의 규명을 위한 네트워크 형성 방식에 관한 연구 (A Study on the Network Generation Methods for Examining the Intellectual Structure of Knowledge Domains)

  • 이재윤
    • 한국문헌정보학회지
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    • 제40권2호
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    • pp.333-355
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    • 2006
  • 이 연구에서는 지적 구조 분석을 위해서 계량서지적 자료를 시각적으로 표현하는 다양한 네트워크 형성 방식에 대해서 사례와 함께 각각의 특성을 살펴보았다. 기준값 절단 방식, 최근접이웃 그래프, 최소비용 신장트리, 패스파인더 네트워크의 네 가지 네트워크 형성 방식 중에서 전체 구조와 세부 구조의 표현 능력이 모두 뛰어난 패스파인더 네트워크 알고리즘이 최근 가장 활발히 응용되고 있다. 최근접이웃 그래프는 아직까지 계량서지적 분석에 응용된 사례는 없으나 간단한 알고리즘과 클러스터링 능력 등과 같은 지적 구조 규명에 도움이 될 수 있는 몇 가지 장점을 갖추고 있는 것으로 확인되었다. 다차원척도나 군집분석과 달리 네트워크를 이용한 시각화에서는 입력자료의 전처리에 따라서 생성된 지적 구조의 차이가 큰 것으로 나타났다. 이 연구에서 고찰한 여러 네트워크 형성 방식을 적절히 활용함으로써 국내의 지적 구조 규명 연구를 활성화할 수 있을 것이라 기대된다.

반자연 소나무 숲에 있어서의 Ordination 미분류 및 인근 효과 ( 경쟁 ) 에 대하여 (On Ordination, Clustering and Neighbourhood Effects in the Semi-natural Pine Stands in Central Korea)

  • Oh, Kye-Chil;Lee, Kun-Seop
    • The Korean Journal of Ecology
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    • 제12권2호
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    • pp.83-108
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    • 1989
  • To discern general tendency in relatively pure even-aged pine stands, to group the stands and to perceive neighbourhood effects a total of 39 sites of pine stand was surveyed from nearby Seoul (12 sites), Chunsung, Kangwon (13 sites) and Sosan, Chungnam (14 sites), for herb and shrub species 32, 19; 37, 19 and 41, 14 in the respective areas from September 1987 to July 1988. In terms of detrended correspondence analysis (DECORANA), the stands were subjected to ordinate with 16 physical variables and the vegetational variables. The resource ratio (N:P, N:K, P:K) as physical variables also was tried out in the DECORANA as well as independent variable (N.P.K). The outcome did not show any meaningful difference. It is suggested that there seems to be no apparent interaction among the elements in the study. Three vertical vegetation componeent, that is, tree layer, shrub layer, herb layer were subjccted to DECORANA independently, pairwisely and as a whole (a total 7 combinations). Of those analysis herb layer trial alone seems to indicate relatively clearer differences among the physical variables. In the stands nearby Seoul first axis indicated soil field capacity and exchangeable cations (K, Ca and Na) and second axis did not show any tendency. For the Chunsung stands first axis also revealed soil field capcity and amount of arganic matter and second axis showed amount of exchangeable cation (K, Ca and Na), In the Seosan 1st axis indicated pH and exchangeable cations (K, Ca and Na). For the 39 sites 4 clusters in terms of herb layer might be defined: Peucedanum terebinthaceum-Cymbopogon tortilis-Polygala japonica-Festuca ovina (1); Atractylodes japonica-Patrina scabiosaefolia (2); Potentilla fragarioides-Atractylodes (3); and Cymbopogon tortilis (4). In the neighbourhood effects study in terms of the basal area distribution, Thiessen polygon area and Gini coefficient for the Pinus thunbergii stands of Seosan the Thiessen polygon area approach seems to indicate earlier (30 years old) neighbourhood effect than the others (45 years).

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개별 인용 필드의 인용 매칭에 대한 영향력 평가 (Evaluating an Influence of Individual Citation Field on Citation Matching)

  • 구희관;강인수;정한민;이승우;성원경
    • 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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    • 한국콘텐츠학회 2007년도 추계 종합학술대회 논문집
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    • pp.414-417
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    • 2007
  • 인용 매칭(Citation Matching, CM)은 동일한 논문을 지칭하는 인용레코드(Citation Record)를 군집화하는 방법이다. 일반적으로, 저자, 논문제목, 게재지명이나 출판연도 등의 인용 필드로 구분하는 인용 필드 분해가 인용 매칭 보다 선행하게 된다. 상당히 많은 연구가 인용 매칭과 인용 필드 분해의 문제를 해결하고자 했지만, 인용 필드 분해와 인용 매칭과의 상관관계에 대한 연구는 부족하였다. 인용 매칭에 대한 인용 필드 분해의 여러 측면 중에, 본 논문은 인용 매칭에 가장 영향력이 있는 인용 필드를 밝히고자 한다. 첫 번째 시도로, 수작업으로 인용 필드 분해를 수행한 다양한 크기의 인용 필드 집합에 대하여 인용 매칭의 성능을 비교하였고, 그 결과 많은 인용 필드를 사용한 인용 매칭이 인용 레코드를 더 잘 군집화 할 수 있다는 것을 확인하였다.

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청크 기반 MOLAP 큐브를 위한 비트맵 인덱스 (A Bitmap Index for Chunk-Based MOLAP Cubes)

  • 임윤선;김명
    • 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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    • 제30권3호
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    • pp.225-236
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    • 2003
  • 다차원 온라인 분석처리 (MOLAP, Multidimensional On-line Analytical Processing) 시스템은 데이타를 큐브라고 불리는 다차원 배열에 저장하고 배열 인덱스를 이용하여 데이타를 엑세스한다. 큐브를 디스크에 저장할 때 각 변의 길이가 같은 작은 청크들로 조각내어 저장하게 되면 데이타 클러스터링 효과를 통해 모든 차원에 공평한 질의 처리 성능이 보장되며, 이러한 큐브 저장 방법을 ‘청크기반 MOLAP 큐브’ 저장 방법이라고 부른다. 공간 효율성을 높이기 위해 밀도가 낮은 청크들은 또한 압축되어 저장되는데 이 과정에서 데이타의 상대 위치 정보가 상실되며 원하는 청크들을 신속하게 엑세스하기 위해 인덱스가 필요하게 된다. 본 연구에서는 비트맵을 사용하여 청크기반 MOLAP 큐브를 인덱싱하는 방법을 제시한다. 인덱스는 큐브가 생성될 때 동시에 생성될 수 있으며, 인덱스 수준에서 청크들의 상대 위치 정보를 보존하여 청크들을 상수 시간에 검색할 수 있도록 하였고, 인덱스 블록마다 가능한 많은 청크들의 위치 정보가 포함되도록 하여 범위 질의를 비롯한 OLAP 주요 연산 처리 시에 인덱스 엑세스 회수를 크게 감소시켰다. 인덱스의 시간 공간적 효율성은 다차원 인덱싱 기법인 UB-트리, 그리드 파일과의 비교를 통해 검증하였다.

Effects of Soil-Plant Interactive System on Response to Exposure to ZnO Nanoparticles

  • Lee, Sooyeon;Kim, Saeyeon;Kim, Sunghyun;Lee, Insook
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제22권9호
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    • pp.1264-1270
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    • 2012
  • The ecotoxicological effects of nanomaterials on animal, plant, and soil microorganisms have been widely investigated; however, the nanotoxic effects of plant-soil interactive systems are still largely unknown. In the present study, the effects of ZnO nanoparticles (NPs) on the soil-plant interactive system were estimated. The growth of plant seedlings in the presence of different concentrations of ZnO NPs within microcosm soil (M) and natural soil (NS) was compared. Changes in dehydrogenase activity (DHA) and soil bacterial community diversity were estimated based on the microcosm with plants (M+P) and microcosm without plants (M-P) in different concentrations of ZnO NPs treatment. The shoot growth of M+P and NS+P was significantly inhibited by 24% and 31.5% relative to the control at a ZnO NPs concentration of 1,000 mg/kg. The DHA levels decreased following increased ZnO NPs concentration. Specifically, these levels were significantly reduced from 100 mg/kg in M-P and only 1,000 mg/kg in M+P. Different clustering groups of M+P and M-P were observed in the principal component analysis (PCA). Therefore, the M-P's soil bacterial population may have more toxic effects at a high dose of ZnO NPs than M+P's. The plant and activation of soil bacteria in the M+P may have a less toxic interactive effect on each of the soil bacterial populations and plant growth by the ZnO NPs attachment or absorption of plant roots surface. The soil-plant interactive system might help decrease the toxic effects of ZnO NPs on the rhizobacteria population.

하이브리드 통계적 특징 모델과 신경망을 이용한 자동차 번호판 인식 (Recognition of License Plates Using a Hybrid Statistical Feature Model and Neural Networks)

  • 유신;정병준;강현철
    • 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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    • 제36권12호
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    • pp.1016-1023
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    • 2009
  • 자동차 번호판 인식 시스템은 문자 추출, 특징 추출 등의 영상처리와 추출된 문자를 인식하는 인식기로 구성된다. 특징 추출은 문자 영역의 데이터 감소뿐만 아니라 인식 성능을 결정한다. 따라서 본 논문에서는 번호판 인식의 결과에 영향이 큰 숫자 인식, 특히 숫자의 특징 추출에 초점을 두었으며, 데이터의 군집성을 재배치하여 데이터 간의 최적의 산란도를 확보할 수 있는 통계적 특징의 혼합 모델을 제안하고, 이를 다층 퍼셉트론과 LVQ 신경망을 이용하여 유효성을 검증하였다. 제안된 통계적 특징 추출 방법은 번호판 영상이 갖는 정보를 가장 잘 유지하고, 잡음과 외부 환경에 강건하며 효과적인 방법임을 보여준다.