• 대한두경부종양학회:학술대회논문집
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• 대한두경부종양학회 1996년도 제13차 학술대회 연제순서 및 초록집
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• pp.257.2-258
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• 1996

• 디지털융복합연구
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• 제14권10호
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• pp.349-354
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• 2016

다양한 extended-spectrum ${\beta}$-lactamase (ESBL)를 생성하는 폐렴막대균의 출현 및 확산은 세균에 의한 감염증 치료에 어려움을 가중시키고 있다. 본 연구에서는 충청지역에서 분리된 폐렴막대균을 대상으로 ESBL 유전자를 검출하고 항균제 감수성 양상을 조사하였다. 또한 같은 클론에서 유래하였는지를 확인하기 위해 repetitive element sequence-based (REP)-PCR을 수행하였다. 충청지역에서 분리된 폐렴막대균 102균주 중 21균주가 CTX-M-14 및/또는 CTX-M-15를 생성하는 것으로 나타났으며 이 균주들은 3세대 cephalosporin 계열 항균제에 대해 70% 이상의 높은 내성율을 보였다. 본 연구에서 분리된 CTX-M형 ESBL생성 폐렴막대균은 다양한 클론으로부터 유래되었으며 그 중 일부는 지역사회에 확산되어 있음이 확인되었다. 이러한 폐렴막대균의 감염 및 확산을 방지하기 위해서는 감염관리의 강화가 필요하다. 아울러 좀 더 효과적인 내성세균의 관리를 위해서는 내성유전자의 생물학적 조사와 통계학적 분석을 통해 통합적으로 구축된 데이터베이스를 모니터링 할 필요가 있을 것으로 사료된다.

• Journal of Gastric Cancer
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• 제1권3호
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• pp.129-135
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• 2001

Purpose: Dysplasia or flat adenoma of the stomach is regarded as a precancerous lesion. However, the frequency and the evolutionary process of malignant transformation of gastric dysplasia are still debated. In order to see whether the lesion was a monoclonal or a polyclonal proliferation, clonality was assayed by X-linked HUMARA polymorphism. Materials and Methods: DNA was extracted from the paraffin-embedded tissue of 16 consecutive cases of endoscopic biopsy, eight of which supplied both dysplastic and nondysplastic tissue for comparison. HUMARA was amplified by PCR with or without pretreatment with methylationsensitive restriction enzyme, HpaII. The amplification products were electrophoresed on polyacrylamide gel and silver-stained. Results: Among the 16 cases, 13 cases were informative and 3 cases noninformative. Of the 13 cases, one case showed skewed lyonization, rendering 12 cases to be analyzed further. A monoclonal band pattern was noted in 2 cases, and a polyclonal band pattern in 10 cases. A review of the histopathologies of the monoclonal and the polyclonal cases did not reveal features discriminating the two groups. Conclusion: These results suggest that gastric dysplasia is a disease entity heterogeneous in the genetic level, and many cases may be non-neoplastic.

• Journal of Microbiology
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• 제42권1호
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• pp.14-19
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• 2004

Salmonella enterica serovar Typhimurium DT104 (Salmonella Typhimurium DT104 or DT104) has been emerging as a common pathogen for human in Korea since 1997. In order to compare the genomic relationship and to search for the dominant strains in Korea, we conducted pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and IS200 fingerprinting of 25 epidemiological unrelated isolates from human and animals from Korea and cattle from America. Two Salmonella Typhimurium DT104 isolates from human in Korea and all 8 isolates from American cattle had indistinguishable patterns from the PFGE and IS200 fingerprinting but multidrug-resistant Salmonella Typhimurium isolates, including DT104, from Korean animals had diverse genetic patterns. The data suggest that a dominant DT104 strain might have circulated between Korean and American cattle and that it had a high level of clonality.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제17권2호
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• pp.491-495
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• 2016

Background: Small B-cell non-Hodgkins lymphoma (NHL) is difficult to be distinguished from non-neoplastic reactive processes using conventional haematoxylin-eosin (HE) staining due to different interpretations among pathologists with diagnosis based on morphologic features. Ancillary examinations such as immunohistochemical (IHC) staining are essential. However, negative or doubtful results are still sometimes obtained due to unsatisfactory tissue processing or IHC technique. The polymerase chain reaction (PCR) as a molecular diagnostic technique is very sensitive and specific. Clonality detection of heavy chain immunoglobulin (IgH) gene rearrangement has been widely used to establish diagnosis of B-cell NHL. Aims: To elaborate interobserver variation in small B-cell NHL diagnosis based on morphologic features only and to confirm sensitivity and specificity of the PCR technique as an ancillary method. Materials and Methods: A toptal of 28 samples of small B cell NHL and suspicious lymphoma were interpreted by 3 pathologists in Sardjito General Hospital based on their morphology only. The reliability of assessment and the coefficient of interobserver agreement were calculated by Fleiss kappa statistics. Interpretation results were confirmed with IHC staining (CD20, CD3, Bcl2). PCR was performed to analyze the clonality of IgH gene rearrangement. Results: Interobserver agreement in morphologic evalution of small B cell NHL and chronic lymphadenitis revealed kappa coefficient 0.69 included in the substantial agreement category. The cases were divided into 3 groups based on morphology and IHC results; lymphoma, reactive process and undetermined group. PCR analysis showed 90% sensitivity and 60% specificity. Conclusions: The present study revealed a substantial agreement among pathologists in small B-cell NHL diagnosis. For difficult cases, PCR is useful as complementary method to morphologic and IHC examinations to establish definitive diagnosis.

• Journal of Korean Neurosurgical Society
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• 제64권4호
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• pp.505-513
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• 2021

Objective : The adaptive immune response following subarachnoid hemorrhage (SAH) is not well understood. We evaluated and compared the T cell receptor (TCR) immune repertoire of good-grade and poor-grade SAH patients to elucidate the T cell immunology after ictus. Methods : Peripheral blood from six SAH patients was collected at two different times, admission and at the 7-day follow-up. Composition and variation of the TCR β-chain (TCRB) complimentary determining regions (CDR) 3 repertoire was examined using high-throughput sequencing; the analysis was based on sampling time and disease severity (good vs. poor-grade SAH). Results : Clonality at admission and follow-up were 0.059 (0.037-0.038) and 0.027 (0.014-0.082) (median, 25th-75th percentile). Poor-grade SAH (0.025 [0.011-0.038]) was associated with significantly lower clonality than good-grade SAH (0.095 [0.079-0.101]). Poor-grade SAH patients had higher diversity scores than good-grade SAH patients. CDR length was shorter in good-grade SAH vs. poor-grade SAH. Differences in clonotype distribution were more prominent in TCRBV gene segments than TCRBJ segments. TCRBV19-01/TCRBJ02-04 and TCRBV28-01/TCRBJ02-04 were the most increased and the most decreased V-J pairs in the 7-day follow-up compared to admission in good-grade SAH. The most increased and decreased V-J pairs in poor-grade SAH patients were TCRBV28-01/TCRBJ02-06 and TCRBV30-01/TCRBJ02-04, respectively. Conclusion : The TCRB repertoire is dynamic in nature following SAH. TCRB repertoire may facilitate our understanding of adaptive immune response according to SAH severity.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제47권2호
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• pp.150-160
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• 1999

연구배경: CREST 증후군은 전신성 경화증의 이형으로 전신성 경화증에 비교하여 병의 진행이 늦은 것으로 알려져 있다. 하지만 CREST 증후군 환자의 약 50%에서 폐나 심장질환의 증거 없이 폐고혈압이 발생하며, 이러한 환자들의 이년 생존률은 40%로 폐고혈압이 없는 환자에 비해 예후가 매우 나쁘다. 그러나 CREST 증후군에 동반되는 폐고혈압의 원인과 병리기전에 대해서는 전혀 알려진 바 없으며 막연히 원발성 폐고혈압의 이형(variant form) 또는 이차성 폐고혈압으로 분류되고 있다. 총상병변(plexiform lesion) 내 증식된 내피세포의 클론성 검증은 폐고혈압을 원발성과 이차성으로 나누는 기준이 되고 있다. 이에 저자들은 CREST 증후군이 동반된 폐고혈압 환자의 총상병변 내피세포의 클론성을 분석함으로써 CREST 동반된 폐고혈압이 원발성인지 이차성인지를 알아보고자 하였다. 방법: 폐고혈압을 동반한 CREST 증후군 여자환자에서 얻은 폐조직의 파라핀 block을 사용하여 microdissection 방법으로 총상병변내에 증식된 내피세포를 분리한후 X-염색체의 methylation pattern을 이용하여 클론성 분석을 시행하였다. 같은 방법으로 중막 비후를 보이는 혈관의 혈관 평활근과 폐실질의 클론성도 분석하였다. 결과: 14개 총상병변의 '증식된 내피세포'의 클론성 모두 다클론성 이었다. 또한 중막비후가 현저한 5개 폐동맥의 평활근세포 클론성도 모두 다클론성 이었다. 결론: 이상의 결과는 CREST 증후군에 동반되는 폐고혈압이 원발성 폐고혈압과는 다른 병리 기전을 갖는 이차성 폐고혈압임을 시사한다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제52권6호
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• pp.643-648
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• 2009

Blood eosinophilia can be classified as either familial or acquired. Familial eosinophilia is a rare autosomal dominant disorder characterized by a stable eosinophil count. Acquired eosinophilia is classified further into a primary or secondary phenomenon depending on whether eosinophils are considered integral to the underlying disease. Primary eosinophilia is considered clonal in the presence of either a cytogenetic abnormality or bone marrow histological evidence of classified hematologic malignancies. Causes of secondary eosinophilia include infections, allergic or immunologic disorders, and drugs. Idiopathic eosinophilia belongs to a category of primary eosinophilia, and this is a diagnosis of exclusion. Cases with eosinophilia that lack evidence of clonality may be diagnosed as idiopathic hypereosinophilic syndrome after all causes of reactive eosinophilia have been eliminated. Genetic mutations involving the platelet-derived growth receptor genes (PDGFRA and PDGFRB) have been pathogenetically linked to clonal eosinophilia, and their presence predicts the treatment response to imatinib. In this review, I will present a clinical summary of both familial and acquired eosinophilia with emphasis on recent developments in molecular pathogenesis and treatment.

• 대한임상검사과학회지
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• 제47권2호
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• pp.65-70
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• 2015

최근까지도 세균 감염증 치료 또는 성장촉진을 목적으로 가축에게 광범위하게 항균제를 사용해 왔으며, 이는 사람에게 보편적으로 사용되는 항균제들에 대한 내성세균의 출현 및 확산을 유도했다. 이렇게 출현한 다제 내성세균은 사람에게 음식을 통해 전달되고 내성유전자를 확산시킬 수 있어 더 큰 문제가 되고 있다. 본 연구에서는 충청지역에서 사육된 닭으로부터 분리된 Proteus mirabilis 균주를 대상으로 integron의 빈도 및 integron의 존재에 따른 항균제 내성 비율의 변화를 조사하였다. 총 26 균주의 Proteus mirabilis가 분리되었으며 이 균주를 대상으로 항균제 감수성 검사와 PCR 및 DNA 염기서열분석을 통한 integron의 유전자 카세트 분석이 이루어졌다. 또한 extragenic palindromic sequence-based PCR (REP-PCR) 방법을 이용하여 P. mirabilis 균주들의 clonality를 확인하였다. P. mirabilis 26균주 중 14 균주(53.8%)가 class 1 integrons을 가지고 있음이 확인되었다. Class 1 integron 내에는 aminoglycoside (aacC, aadA), trimethoprim (dfrA), lincosamide (linF), 및 erythromycin (ereA) 등의 내성을 유도하는 유전자 카세트가 위치해 있었다. 이들 class 1 integron을 포함하는 균주는 integron을 포함하지 않는 균주보다 aminoglycoside 및 trimethoprim 계열 항균제에 대해 높은 내성율을 보였다. 본 연구에서 class 1 integron은 P. mirabilis 균주들 사이에 광범위하게 확산되어 있으며 다양한 항균제에 내성을 나타내는데 중요한 역할을 하고 있음이 확인되었다. 따라서 축사환경에 다제 내성세균의 출현 및 증가에 중요한 역할을 하는 integron의 확산에 대한 지속적인 감시가 필요할 것으로 사료된다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제48권2호
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• pp.94-101
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• 2016

Acinetobacter species는 중요한 기회감염균으로 빈번하게 원내감염을 일으킨다. 뿐만 아니라 다제내성을 보이는 경우가 많아 치료를 위한 항균제 선택이 매우 제한적이다. 본 연구에서는 Acinetobacter species 68균주를 대상으로 하여 다양한 carbapenemase 유전자를 조사했다. 디스크확산법으로 항균제 감수성 양상을 조사했으며 다중 중합효소연쇄반응을 통해 carbapenemase 유전자를 포함하고 있는 균주를 선별하였고 PCR과 염기서열분석을 통해 최종적으로 carbapenemase 유전형을 확인했다. 한편 REP-PCR 방법으로 균주간의 clonality를 분석했다. 본 연구에서 A. baumannii 균주는 분석된 모든 항균제에 대해 높은 내성을 나타냈으나 non-A. baumannii 균주는 분석된 항균제 중 aztreonam과 cefotaxime을 제외한 항균제에 모두 감수성을 보였다. A. baumannii 51 균주는 $bla_{OXA-51}$ 유전자를 가지고 있었으며 그 중 37(72.5%)균주는 $bla_{OXA-23}$ 유전자도 동시에 가지고 있었다. 본 연구에서 39 균주의 다제내성 A. baumannii 가 분리되었는데 그 중 37균주가 $bla_{OXA-23}$ 유전자를 가지고 있었다. $bla_{OXA-23}$ 유전자를 포함하고 있는 균주들은 I (n=22) 형 또는 II (n=15) 형의 REP-PCR band 패턴을 보였는데 이는 대전에 위치한 일개의 대학병원에 $bla_{OXA-23}$ 유전자를 포함하고 있는 다제내성 균주들이 수평 확산 되어 있음을 의미한다. 다제내성 A. baumannii 균주에 의한 감염 및 집락화를 막기 위해서는 지속적으로 내성을 유발하는 인자를 조사하고 MDR균주의 출현 및 확산을 감시할 필요가 있을 것으로 사료된다.