• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제14권4호
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• pp.789-795
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• 2004

A promoter-probe shuttle vector pSK1Cat was constructed for the isolation of transcriptional signal sequences from Corynebacterium glutamicum. Besides conferring resistance to kanamycin in Escherichia coli and C. glutamicum, the vector carried a promoterless cat gene to confer resistance to chloramphenicol upon insertion of the appropriate transcriptional signals in the multiple cloning site. By utilizing the vector, a series of transcriptionally active fragments were isolated from the genome of C. glutamicum. The clones, ranging from 200 bp to 1 kb in size, were grouped into 3 classes of strong, medium, and weak, based on the chloramphenicol acetyltransferase (CAT) activity and sensitivity to the chloramphenicol of the clone-carrying C. glutamicum cells. C. glutamicum cells carrying the $P_{19}$ clone, a representative in the strong class, were able to grow on minimal agar plates containing over $40 mg/mell$ chloramphenicol, and showed CAT activity of 10 m㏖/mgㆍmin, performing slightly better than the cells carrying $P_{tac}$ , a strong E. coli promoter. Subcloning analysis of the $P_{19}$ clone identified a 180 bp intergenic fragment ($P_{180}$), which was located upstream of a gene encoding a hypothetical membrane protein. The expression conferred by $P_{180}$ was not affected by either the kinds of carbon sources or changes in temperature. These properties make the $P_{180}$ clone useful for the deregulated expression of biosynthetic genes in C. glutamicum during amino acid fermentation.

• 한국응용약물학회:학술대회논문집
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• 한국응용약물학회 1993년도 제2회 신약개발 연구발표회 초록집
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• pp.80-80
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• 1993

(목적) 본 연구에서 사용된 바이러스는 HIV-1 nef유전자가 일부 삭제되고 대신 Chloramphenicol acetyltransferase(CAT)가 pSVCAT recombinant 바이러스다. 이러한 recombinant 바이러스를 사용하는 이유는 첫째, CAT activity가 매우 민감하므로 바이러스의 복제억제 정도를 정확하게 측정 할 수 있고 둘째, simian immunodeficiency virus(SIV)의 경우 nef 유전가 in vivo에서는 바이러스의 복제에 필수적이므로 HIV가 SIV와 유사한 것으로 미루어 본 연구에서 사용되는 recombinant SVCAT 바이러스가 안전한 것으로 고려되기 때문이다. (방법) 특히 화합물이 HIV-1의 복제에 얼마나 영향이 있는가는 1) 어느정 도의 virus inoculm을 넣었는지 2) 사용하는 cell line 3) 사용한 cell line의 infection kinetics 4) 실험의 지속기간 5) 테스트하는 assay의 sensitivity에 의존한다. 따라서 $10^{5}$ cell의 H9과 sup T1을 24 well plate에 넣고 sup T1 cell line의 경우 3일 후 항 화합물에 의한 syncytia 형성 및 CAT activity의 억제정도를 현재 AIDS drug으로 쓰이고 있는 Zidovudine을 control로 비교 관찰하였다. H9 cell line의 경우 3일 간격으로 media의 3/4을 fresh media로 바꾸어 주고 9일 후 CAT assay를 하였다. 이러한 assay에서 activity를 보이는 화합물을 reverse transcriptase와 P24 ELISA assay를 재확인하였다.다.

• Food Science and Biotechnology
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• 제17권2호
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• pp.438-441
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• 2008

A novel lactobacilli replicon from plasmids of Lactobacillus reuteri KCTC 3678 was isolated. Eight L. reuteri strains from Korean Collection for Type Cultures (KCTC) and Korea Food Research Institute (KFRI) were screened for cryptic plasmids and most strains harbored 1 or 2 plasm ids. Particularly, L. reuteri KCTC 3678 contained 6 plasm ids which all were used for screening of lactobacilli replicon. EcoRI digests of the plasmid DNA prep from L. reuteri KCTC 3678 were ligated with pUC19 and the recombinant DNAs were serially named from pLR1 to pLR7. A cat (chloramphenicol acetyltransferase; $Cm^r$) gene originated from pC194 was introduced into pLR1-7, resulting in pLR1cat-pLR7cat, respectively. The recombinant plasmids were introduced into L. reuteri KCTC 3679, and only transformants harboring pLR5cat were obtained, indicating that the insert in pLR5 functioned as a lactobacilli replicon.

• Archives of Pharmacal Research
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• 제16권2호
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• pp.155-157
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• 1993

DNA transfection conditions were investigated by calcium phosphate-DNA co-precipitation in SK-N-BE(2)C human neuroblastoma cells. The DNA plasmid of TH2400CAT was used in which rat tyrosine hydroxylase gene was inserted into chloramphenicol acetyltransferase reporter gent. The transfection efficiency was 25-30% and the method was simple and reproducible. So, the method will be a good tool for transient transfection analysis.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제17권6호
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• pp.600-605
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• 1989

Escherichia coli 내에서 프로모터활성을 보이는 Zymomonas mobilis 유래의 유전자 절편을 분리하고 특성을 분석하였다. 프로모터 탐색용 벡터인 pCMT215는 promoter activity가 없는 pMT21의 HinIII 위치에 pYEJ001의 클로람페니콜 아세틸전이 효소유전자를 함유한 0.7-kb HindIII 조각을 접합시켜 제조하였다. E. mobilis의 chromosomal DNA를 Sau3AI으로 부분절단하여 pCMT215에 도입한 후, 이를 이용하여 대장균을 형질전환시킨 결과 14개의 형질전환주가 선별되었다. 이들은 30-750 $\mu$g/$m\ell$ 농도의 chloramphenicol에 내성을 보였으며 클로닝된 유전자조각의 크기는 0.1-1.5Kb였다. 이 가운데 5개의 염기서열을 분석해 본 결과 일반적인 프로모터의 염기서열과 많은 유사점이 발견되었는데, 대장균의 프로모터인 -35 또는 -10 지역과의 부분적인 일치와 A 또는 T 염기가 풍부한 지역과 연속적인 A 또는 T 염기배열, 그리고 회문형태의 염기서열 등이 발견되었다. 또한 대장균 내에서의 프라이머 연장실험결과 Z. mobilis로부터 유래된 DNA조각에서 전사의 시작이 4-170 염기의 거리를 두고 두 곳 또는 여러 곳에서 일어남을 알 수 있었다.

• Journal of Plant Biology
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• 제35권3호
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• pp.229-235
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• 1992

담배 식물체에서 Arabidopsis thaliana에 존재하는 3가지 다른 엽록소 a/b 결합 단백질 (cab) 유전자 promoter들의 발현을 조사하였다. 이들 promoter의 활성은 이들 promoter에 결합된 reporter gene의 식물인 CAT (chloramphenicol acetyltransfer-ase)의 활성으로 측정하였다. 담배엽에서 cab promoter의 활성은 cab1, cab2, cab3의 순이었고, 이들 잎에서 유도한 callus나 shoot에서도 동일한 양상을 보였다. 이들 3가지 promoter의 발현은 상부엽에서 하부엽보다 높은 활성은 보였으며 개체간의 높은 변이폭은 뿌리내리기를 통하여 무성증식된 식물체를 사용하여 줄일 수 있었다. 이들은 또한 기관 특이성을 보여 줄기 보다 잎에서의 활성이 높았고 뿌리에서는 거의 발현되지 않았다. 그러나 cab1 promoter의 경우, 다른 두 cab promoter들과는 다르게, 잎에 대한 줄기에서의 상대적인 활성이 높았으며, CAT 활성을 단위 단백질당을 표시하는 대신 단위 엽록소당 활성으로 나타내었을 때 줄기와 잎에서 활성의 차이가 관찰되지 않았다. 즉 cab2와 cab3는 광합성 기관 특이성을 보이는 반면 cab1의 경우는 이러한 특이성을 나타내지 않았다. 이러한 현상은 잎에서 유도한 shoot가 줄기와 잎으로 분화되는 과정에서도 관찰되었다.

• KSBB Journal
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• 제11권4호
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• pp.504-509
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• 1996

Promoters which are useful for constructing expression vectors for lactic acid bacteria were obtained from the chromosomal DNA of Lactococcus lactis ssp. lactis MG1363. pBV5030, a promoter-selection vector, replicates in L. lactis and Escherichia coli and carries a promoterless chloramphenicol acetyltransferase gene (cat-86). After examining E. coli transformants which grew on LB media containing chloramphenicol (Cm, 20$\mu\textrm{g}$/mL) , many MG1363 derived DNA fragments which encompass promoter sequences were identified. Some recombinant E. coli cells can grow at the Cm concentration of 1,000$\mu\textrm{g}$/mL. When plasmids from those highly resistant E. coli cells were purified and introduced into L. lactis ssp. lactis MG1614 cells by electroporation, lactococcal transformants showing Cm resistance were obtained. So far, five plasmids with different promoter inserts were introduced into L. lactis MGl614 cells. The maximum level of Cm resistance in L. lactis MG1614 transformants was quite low (20$\mu\textrm{g}$/mL) when compared with that observed in recombinant E. coli cells harboring the same plasmids.

• 미생물학회지
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• 제36권1호
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• pp.1-7
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• 2000

발광 박테리아인 Photobacterium 종들의 lux 오페론 하부 영역에서 riboflavin 생합성에 관여하는 유전자들(ribⅠ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ)이 발견되었다. Photobacterium phosphoreum의 lux 유전자와 rib 유전자를 포함하는 intergenic 영역의 단일사슬 DNA가 P. phosphoreum의 mRNA에 의하여 S1 nuclease digestion에서 손상받지 않았으며, ribⅠ에 의하여 암호화되는 P. phosphoreum의 riboflavin synthase의 활성도가 lux-specific한 효소들인 luciferase 혹은 fatty acid reductase 활성도와 같이 bioluminescence intensity의 발현과 함께 대수기 말기에서 증가하는 박테리아 발광반응의 특이한 조절 체계인 'autoinduction' 양상을 보였다. 또한 P. leiognathi의 luxB로부터 ribⅡ까지 포함하는 DNA를 강력한 lux 프로모터와 reporter(chloramphenicol acetyl transferase, CAT) 유전자 사이에 삽입하고 접합(conjugation)의 방법으로 P. leiognathi에 유전자 전이(gene transfer)시켜 CAT reporter 유전자의 발현을 P. leiognathi에서 조사한 바, 그 유전자의 발현 정도에 큰 차이가 없었을 뿐만 아니라 이 구조에서 lux 프로모터를 제거하게 되면 CAT reporter 유전자의 발현이 전혀 나타나지 않았다. 이들 실험 결과들은 lux 유전자와 rib 유전자의 intergenic영역에 lux 오페론의 전사 종결 구조(transcriptional terminator)가 존재하지 않으며 ribflavin 생합성 유전자들이 그들 고유의 프로모터에 의하여 전사되는 것이 아니라 lux 오페론의 프로모터에 의하여 발현됨을 나타내는 것으로, 이는 Photobacterium 종들에서 lux 유전자와 rib 유전자들은 공동의 발현 조절 체계를 갖는 것으로 요약된다.

• BMB Reports
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• 제30권4호
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• pp.269-273
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• 1997

Heptocvte-specific expression induced by Hepatitis B virus (HBV) enhancer 2-core gene promoter was examined in various hepatocyte and non-hepatocyte cell lines. using non-viral and retroviral vector systems in which chloramphenicol acetyltransferase (CAT) is used as a reporter. The non-viral plasmid containing the HBV enhancer 2-core promoter exhibited 22 and 66% of CAT activities in hepatoma cell lines. HepG2 and Hep3B, respectively when compared with CAT activity expressed by CMV promoter. The CAT activities, however. were found to be marginal in other tested hepatoma cell lines as well as mouse primary hepatocytes and non-hepatocytes. The HBV enhancer 2 located upstream the CMV promoter did not affect the CMV promoter activity nor provided hepatocyte-specific expression. Transfection of retroviral plasmid DNA containing the HBV enhancer 2-core promoter as an internal promoter exhibited high and specific CAT expression in HepG2 and Hep3B cell lines but the activity value was 5 to 10 fold lower than the non-viral plasmid with identical promoter. These results suggest that the usage of HBV enhancer 2-core promoter for liver specific expression is limited to certain vectors and hepatocyte cell lines.

• 한국어병학회지
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• 제6권1호
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• pp.57-64
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• 1993

어병 세균으로부터 분리된 R-plasmid의 특성과 그 DNA 구조는 Aeromonas hydrophila, A. salmonicida, Edwardsiella tarda, Enterococcus seriolicida, Pasteurella piscicida, Vibrio onguillarum등 세균의 종류에 따라 다르다. 그러나 A. hydrophila와 E. tarda로부터 그리고 A. hydrophila와 A. salmonicida로부터 분리된 몇몇 R-plasmid는 같은 내성형을 가지면서 유사한 DNA 구조를 보였다, V. anguillarum에서 분리된 R-plasmid는 1977년 이전, 1980년과 1983년 사이 그리고 1989년과 1991년 사이에 분리된 것이 그 DNA 구조에 차이를 보여 각각 그룹 1, 2, 3으로 구분되어졌다. P. piscicida의 경우에는 연도와 지역에 관계없이 동일한 DNA 구조를 갖는 R-plasmid가 분리되었다. Macrolide계 항생제(MLs), lincomycin(LM), tetracycline(TC) 그리고 MLs, LIM, chloramphenicol(CP) 내성을 나타내는 R-plasmid를 갖는 E. seriolicida가 각 지역의 Yellowtail 어장에 분포되어 있었다. P. piscicida의 R-plasmid에는 type I의 chloramphenicol acetyltransferase(CAT)에 의하여 CP 내성을 나타내는 유전자(cat)가, 그리고 E. tarda, A. salmonicida와 1980년 이후에 분리된 V. anguillarum의 R-plasmid에는 CAT type II에 해당하는 car 유전자가 분포되어 있었다. TC 내성 유전자(tet)의 경우에는 1977년 이전과 1980년 이후에 분리된 V. anguillarum으로부터 class B, G의 tet 유전자가 확인되었으나, E. tarda, P. piscicida, A. hydrophila 그리고 1989년 이후에 분리된 V. anguillarum등 어병세균의 R-plasmid에는 class D의 tet 유전자가 널리 분포하고 있는 것으로 나타났다.