• 제목/요약/키워드: Charophytes

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Six Taxa of Newly Recorded Species of Charophytes (Charophyta) in Korea

  • Lee, Nam Ju;Kim, Jee Hwan;Kim, Mi Ran;Lee, Ok Min
    • 환경생물
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    • 제36권3호
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    • pp.285-290
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    • 2018
  • Six taxa of unrecorded Korean species of charophytes are described. Freshwater and aerial charophytes were collected from the bark of trees, reservoirs, small ponds and swamps from April 2017 to September 2017. The newly recorded species of Korea were Cosmarium quadrifarium f. octastichum, Euastrum turneri, Spondylosium nitens var. triangulare, Staurastrum kouwetsii, Staurodesmus dickiei var. latus, and Klebsormidium subtile. K. subtile was transferred from Stichococcus subtilis.

Four Embryophyte Introns and psbB Operon Indicate Chlorokybus as a Basal Streptophyte Lineage

  • Lee, Jung-Ho;James R. Manhart
    • ALGAE
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    • 제17권1호
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    • pp.53-58
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    • 2002
  • The transition of plant life from aquatic algae to land to land plants was one of the major events in the history of life. However, in hypothesizing the exact evolutionary path of the transition, limited shared phenotypic characters in aquatic algae and land plants (embryophytes) have been a major hinderance. Chloroplast genomes contain characters useful in tracing evolutionary histories. Embryophyte chloroplast genomes are distinguished from algal cpDNAs by having over 20 group Ⅱ introns, some of which were gained during the transition from algae to embryophytes (Manhart and Palmer 1990; Lew and Manhart 1993;Lee and Manhart 2002). Here we examine a gene cluster that, in land plants, contains psbB, psbT, psbH, petB and petD with introns found in petB and petD (petB.i and petD.i). In addition the presence/absence of introns in trnA and trnI (trnA.i and trnI.i) were determined in all five major lineages of charophytes. We found that the psbB gene cluster occurs in most surveyed charophytes and embryophytes except Spirogyra (Zygnematales) which lacks it due to intra-genomic rearrangement. All four introns are absent in Chlorokybus but present in some or all of the other four charophyte lineages (Klebsormidiales, Zygnematales, Coleochaetales, and Charales). In addition, Chlorokybus is distinguished from other charophytes and embryophytes by having an unusually long spacer (over 2 kb) between psbH-petB. The results indicate that Chlorokybus diverged before the intron gains but after psbB gene cluster formation, placing the other charophyte lineages closer to embryophytes.

The Chloroplast rpl23 Gene Cluster of Spirogyra maxima (Charophyceae) Shares Many Similarities with the Angiosperm rpl23 Operon

  • Lee, Jung-Ho;James R. Manhart
    • ALGAE
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    • 제17권1호
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    • pp.59-68
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    • 2002
  • A phylogenetic affinity between charophytes and embryophytes (land plants) has been explained by a few chloroplast genomic characters including gene and intron (Manhart and Palmer 1990; Baldauf et al. 1990; Lew and Manhart 1993). Here we show that a charophyte, Spirogyra maxima, has the largest operon of angiosperm chloroplast genomes, rpl23 operon (trnⅠ-rpl23-rpl2-rps19-rpl22-rps3-rpl16-rpl14-rps8-infA-rpl36-rps11-rpoA) containing both embryophyte introns, rpl16.i and rpl2.i. The rpl23 gene cluster of Spirogyra contains a distinct eubacterial promoter sequence upstream of rpl23, which is the first gene of the green algal rpl23 gene cluster. This sequence is completely absent in angiosperms but is present in non-flowering plants. The results imply that, in the rpl23 gene cluster, early charophytes had at least two promoters, one upstream of trnⅠ and and another upstream of rpl23, which partially or completely lost its function in land plants. A comparison of gene clusters of prokaryotes, algal chloroplast DNAs and land plant cpDNAs indicated a loss of numerous genes in chlorophyll a+b eukaryotes. A phylogenetic analysis using presence/absence of genes and introns as characters produced trees with a strongly supported clade containing chlorophyll a+b eukaryotes. Spirogyra and embryophytes formed a clade characterized by the loss of rpl5 and rps9 and the gain of trnⅠ (CAU) and introns in rpl2 and rpl16. The analyses support the hypothesis that the rpl23 gene cluster and the rpl2 and rpl16 introns of land plants originated from a common ancestor of Spirogyra and land plants.

Four Newly Recorded Taxa of Charophytes and Chlorophytes (Charophyta and Chlorophyta, Viridiplantae) in Korea

  • Jung, Hyun-Chul;Lee, Nam-Ju;Kim, Do-Hyun;Lee, Ok Min
    • 환경생물
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    • 제35권3호
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    • pp.289-295
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    • 2017
  • The freshwater algae were collected at reservoirs and small ponds in Gyeonggi-do and Jeju-do on June 2016. Four species of Korean previously unrecorded algae were collected in domestic fresh waters: Coelastrum rugosum, Cosmarium baccatum, Cosmarium norimbergense and Staurastrum connatum var. pseudoamericanum. The morphological characteristics of the four taxa identified in this study were showed mostly similar to the characteristics of the previously reported characteristics. However, Cosmarium baccatum was larger than the previously recorded species and Staurastrum connatum var. pseudoamericanum was wider than the previously recorded species.

임진강대의 중부 고생대층: 임진계 (Devonian Strata in Imjingang Belt of the Central Korean Peninsula: Imjin System)

  • 최용미;조석주;이정현;이동찬;이정구;권이균;조림;이동진
    • 암석학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.107-124
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    • 2015
  • 1962년 북한 연구자들은 휴전선 이북에 분포된 임진강 유역의 상부고생대 평안계 지층에서 데본기의 것으로 추정되는 완족동물과 극피동물 화석을 찾아 이 화석들을 포함하는 지층을 평안계로부터 분리하여 '임진계'로 설정하였다. 이후 임진계의 여러 분포지에서 발견된 중기 데본기의 차축조(車軸藻, 윤조(輪藻)와 동의어)화석은 그 지질시대를 확정하는 결정적 요소가 되었다. 평남분지와 경기육괴 사이에 분포하는 임진계는 강원도 철원군, 황해북도 금천군, 판문군 및 토산군에 걸치는 동부와, 황해남도 강령군과 옹진군 일원의 서부지역에 대상으로 분포하며, 경기도 북부의 연천층군(변성암복합체)을 포함한다. 해성 무척추 동물화석만 산출되는 하부 고생대층과는 달리 임진계는 다양한 육상 식물화석을 포함한다. 임진계에서 흔히 산출되는 완족동물화석은 남중국대지 데본기 지층에서 알려진 것과 종의 구성에서 유사할 뿐 아니라 남중국대지의 풍토종을 포함하고 있어 두 지역 사이의 고지리적 근연관계를 지시한다. 임진계의 지질시대는 연구자에 따라 견해차는 있으나, 데본기 중-후기로 보는 견해가 지배적이며, 일부 연구자는 데본기 중기-석탄기로 추정하기도 한다. 북한의 연구자들은 데본기에 남중국의 바다가 한반도까지 확장된 '임진해'가 존재하였으며, 따라서 임진계가 현 위치에서 퇴적된 것으로 해석하였다. 임진계는 분포 지역에 따라 심한 층서적 편차를 보이며 국지적으로 두꺼운 층후를 보인다. 최근 북한의 임진계 분포지 도처에서 충상에 의한 지층의 역전과 반복이 보고되었으며, 남한에 분포한 임진계의 연장부인 연천층군의 퇴적기원 변성암 또한 고도의 압축변형작용에 기인한 것으로 알려져, 임진계 분포지 전반에 걸쳐 광범위한 습곡-충상단층대가 형성되었음을 시사한다. 연천층군이 임진강대의 북부로 가면서 점진적으로 고변성대에서 저변성대로 바뀌는 사실로 미루어볼 때, 경기육괴의 북부지역 및 임진강대는 다비-술루(Dabie-Sulu) 벨트의 연장부로 남중국대지와 한중대지의 충돌대였으며, 임진계는 남중국대지의 연장선상에 있었던 경기육괴에서 발달한 퇴적층으로, 남중국대지와 한중대지가 충돌하면서 첨합(accretion)된 잔재로 해석된다. 향후 한반도와 동아시아의 고생대 고지리의 복원과 지각진화사를 심도 있게 이해하기 위하여 임진계의 층서, 퇴적 및 조구조적 진화에 대하여 남북한 관련분야 연구자들이 함께 참여하는 후속연구가 필요하다.