• 제목/요약/키워드: Chaetoceros

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RAPD Analysis of DNA Polymorphism and Genetic Species-Specificity Using PCR Technique in the Marine Microalgae

  • Yoon, Jong-Man;Chang, Kye-Nam
    • 한국어업기술학회:학술대회논문집
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    • 한국어업기술학회 2000년도 춘계수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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    • pp.487-488
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    • 2000
  • Genomic DNA was isolated from the marine microalgae representing genetic characteristics and genomic polymorphisms by polymerase chain reaction amplification of DNA as arbitrary primers. The electrophoretc analysis of PCR-RAPD products showed hig levels of variation between different genus and little variation between different species. Outer of these primers, 6 generated 248 highly reproducible RAPD markers, producing almost seven polymorphic bands per primers. The degree of similarity frequency between Chaetoceros gracilis and Chaetoceros calcitrans species showed 90% as calculated by sharing analysis. The RAPD polymorphism generated by this primer may be used as a genetic marker for genus or species identification in important marine microalgae. (omitted)

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Annotation and Expression Profile Analysis of cDNAs from the Antarctic Diatom Chaetoceros neogracile

  • Jung, Gyeong-Seo;Lee, Choul-Gyun;Kang, Sung-Ho;Jin, Eon-Seon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권8호
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    • pp.1330-1337
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    • 2007
  • To better understand the gene expression of the cold-adapted polar diatom, we conducted a survey of the Chaetoceros neogracile transcriptome by cDNA sequencing and expression of interested cDNAs from the Antarctic diatom. A non-normalized cDNA library was constructed from the C. neogracile, and a total of 2,500 cDNAs were sequenced to generate 1,881 high-quality expressed sequence tags (ESTs) (accession numbers EL620615-EL622495). Based on their clustering, we identified 154 unique clusters comprising 342 ESTs. The remaining 1,540 ESTs did not cluster. The number of unique genes identified in the data set is thus estimated to be 1,694. Taking advantage of various tools and databases, putative functions were assigned to 939 (55.4%) of these genes. Of the remaining 540 (31.9%) unknown sequences, 215 (12.7%) appeared to be C. neogracile-specific since they lacked any significant sequence similarity to any sequence available in the public databases. C. neogracile consisted of a relatively high percentage of genes involved in metabolism, genetic information processing, cellular processes, defense or stress resistance, photosynthesis, structure, and signal transduction. From the ESTs, the expression of these putative C. neogracile genes was investigated: fucoxanthin chlorophyll (chl) a,c-binding protein (FCP), ascorbate peroxidase (ASP), and heat-shock protein 90 (HSP90). The abundance of ASP and HSP90 changed substantially in response to different culture conditions, indicating the possible regulation of these genes in C. neogracile.

한국 동해 남부해역의 일차생산계 II. 식물플랑크톤 군집구조 (Primary Production System in the Southern Waters of the East Sea, Korea II. The Structure of Phytoplankton Community)

  • 심재형;여환구
    • 한국해양학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.163-169
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    • 1995
  • 동해 남부해역에서 1988년 5월과 1989년 7월 및 1991년 11월에 관찰된 식물 플랑크톤 집은 총 190종의 출현종을 기록하였고 규조류가 우점하고 있었다. 춘계 에는 Leptocylindrus danicus, Nitzschia pungens, Bacteriastrum delicatulum 등이 우점종으로 나타났고 하계에는 Skeletonema costatum이 전반적인 우점현상을 보였 으며 Chaetoceros socialis, Rhizosolenia alata f. gracillima 등이 수역에 따라 우점 하였다. 추계에는 Chaetoceros socialis, Nitzschia delicatissima, Nitzschia sp., Gymnodinium sp.. 등이 우점하였다. 종다양성 지수의 평균은 춘계에 1.24, 하계에 1.69, 추계에 2.12로 다소 낮게 측정되었다. 식물플랑크톤 군집의 집괴분석 결과 하 계에는 표층에서 대마난류의 영향을 받는 외양적 특성의 수계와 동해 연안의 수계 및 울릉도 주변수등 크게 3개의 수역으로 구분할 수 있는 것으로 나타났다. 한편 하계의 40m 수층 집괴분석 결과는 연구해역의 중앙부에서 표층 자료의 수역 구분 과는 별개의 또다른 식물수문학적 수역이 인지되었는데 이곳은 표층 주변의 대마 난류의 영향과 50m 이심의 수층에 존재하는 수온 1$0^{\circ}C$ 수괴의 양면적 영향을 받는 것으로 사료된다.

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고리, 월성, 울진과 영광 연안해역에서 식물플랑크톤 군집의 생태학적 특성 Ⅲ. 우점종 분포와 환경요인들 (Ecological Characteristics of Phytoplankton Communities in the Coastal Waters of Gori, Wolseong, Uljin and Younggwang Ⅲ. Distribution of Dominant Species and Environmental Variables)

  • 강연식;최중기;엄희문
    • ALGAE
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    • 제18권1호
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    • pp.29-47
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    • 2003
  • In order to investigate the distribution of dominant phytoplankton species in the coastal waters of Gori, Wolseong, Uljin and Younggwang, the standing crops of dominant species were studied during 1992-1996 and the relationships between standing crops and environmental variables were analyzed.The standing crops of diatom Skeletonema costatum, Thalassiosira decipiens, Chaetoceros debilis, Pseudo-nitzchia seriata, Paralia sulcata and dinoflgaellate Prorocentrum triestinum were on average from 16,373 to 118,549 cellso$l^{-1}$, from 11,180 to 210,313 cellso$l^{-1}$, from 23,341 to 55,889 cellso$l^{-1}$, from 6,784 to 15,766 cellso$l^{-1}$, from 342 to 41,596 cellso$l^{-1}$ and from 4,828 to 22,397 cellso$l^{-1}$ in the four study areas, respectively. The standing crops of Skeletonema costatum, Thalassiosira decipiens and Paralia sulcata were higher in Younggwang, while Chaetoceros debilis, Pseudo-nitzschia seriata and Prorocentrum triestinum were higher in Wolseong than other areas. The standing crops of silicoflgaellate Distephanus speculum were from 157 to 4,239 cellso$l^{-1}$ in the four study areas, showing an tendency increasing in Uljin. The abundance rates of Skeletonema costatum, Thalassiosira decipiens and Chaetoceros debilis were from 7.04 to 15.74%, from 6.95 to 33.69% and from 5.17 to 13.88% in the four study areas, respectivelyThe results of correlation coefficient between standing crops of dominant species and environmental variables show that phosphates were related with the distribution of dominant species in Gori, Uljin and Younggwang, while nitrogen compounds affected the distribution of dominant species in Wolseong. In addition, salinity and temperature affected the distribution of dominant species in Wolseong and Younggwang, respectively.

Statistical Optimization of the Growth Factors for Chaetoceros neogracile Using Fractional Factorial Design and Central Composite Design

  • Jeong, Sung-Eun;Park, Jae-Kweon;Kim, Jeong-Dong;Chang, In-Jeong;Hong, Seong-Joo;Kang, Sung-Ho;Lee, Choul-Gyun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제18권12호
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    • pp.1919-1926
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    • 2008
  • Statistical experimental designs; involving (i) a fractional factorial design (FFD) and (ii) a central composite design (CCD) were applied to optimize the culture medium constituents for production of a unique antifreeze protein by the Antartic micro algae Chaetoceros neogracile. The results of the FFD suggested that NaCl, KCl, $MgCl_2$, and ${Na}_{2}{SiO}_{3}$ were significant variables that highly influenced the growth rate and biomass production. The optimum culture medium for the production of an antifreeze protein from C. neogracile was found to be Kalle's artificial seawater, pH of $7.0{\pm}0.5$, consisting of 28.566 g/l of NaCl, 3.887 g/l of $MgCl_2$, 1.787 g/l of $MgSO_4$, 1.308 g/l of $CaSO_4$, 0.832 g/l of ${K_2}{SO_4}$, 0.124 g/l of $CaCO_3$, 0.103 g/l of KBr, 0.0288 g/l of $SrSO_4$, and 0.0282 g/l of ${H_3}{BO_3}$. The antifreeze activity significantly increased after cells were treated with cold shock (at $-5^{\circ}C$) for 14 h. To the best of our knowledge, this is the first report demonstrating an antifreeze-like protein of C. neogracile.

유해성 적조생물에 대한 Ceratium 추출물 영향 평가 (The Influences of Extracts from Ceratium spp, on the Growth of Harmful Microalgae)

  • Cho, Eun-Seob
    • 생명과학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.589-592
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    • 2004
  • Ceratium 적조생물을 메타놀이나 수용성 물질을 분리하거나 cell-free medium 추출물을 Cochlodinium polykrikoides 성장에 미치는 영향을 조사했다. cell-free medium을 25% 이상 첨가한 시험구에서 가장 우수한 C. polykrikoides 성장을 가져왔다. 그러나 메타놀이나 수용성으로 처리한 추출물에서는 고농도로 배지에 첨가시켜도 C. polykrikoides 성장에는 큰 영향이 없었다. 특히 cell-free medium은 Gyredinium impudicum이나 Chaetoceros 종에서도 C. polykrikoides와 비슷한 양상을 보였으나, Alxendrium 적조생물에 대해서는 현저히 성장을 저해시키는 결과를 나타내었고, Prorocentrium minimum에서도 성장을 촉진시키지는 못했다. 이러한 결과로 보와서 Ceratium 추출물은 C. polykrikoides성장을 촉진시킬 수 있는 주요한 역할을 하는 것으로 보여서 두 적조생물이 공존하게 되면 상호간에 영향을 미칠 수 있을 것으로 판단된다.

해삼, Stichopus japonicus 유생의 성장과 생존에 미치는 먹이 및 수용밀도의 영향 (Influence of Food and Density on the Growth and Survival of Sea Cucumber, Stichopus japonicus)

  • 이채성;박영제
    • 한국양식학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.39-45
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    • 1999
  • 해삼의 인공종묘생산 기술개발을 위한 생물학적 기초자료로 이용하고자 산란유발, 유생발달 과정, 유생 사육시 먹이와수용밀도에 관한 시험을 실시한 결과는 다음과 같다. 산란유발은 수온자극에서 6.0~17.5%의 반응이 있었으며, 간출자극에서는 1.4~4.0%로 낮은 반응률을 보였다. 산란량은 50~500만개였고, 수정률은 84.0~96.0%였으며, 부화율은 71.4~84.6%로 나타났다. 해삼의 수정난은 $154{\mu}m$이며, 난발생은 수온 $23^{circ)C$에서 수정후 2시간 10분만에 4세포기, 3시간 40분이 지나면 16세포기로 되며, 14시간 30분 후에는 포배기로 되면서 부화하였다. 그 이후 3일째에는 auricularia 유생으로 되었고, 11일째에는 doliolaria 유생, 15일째에 pentactula 유생으로 변태하였다. 유생의 먹이로는 Chaetoceros calcitrans와 Pav-lova lutheri가 적당한 것으로 나타났으나, 이 중 Chaetoceros calcitrans는 변태가 빠르고 생존율도 높아 해삼 유생의 먹이로 가장 좋았으며, 유생 사육을 위한 최적 밀도는 2개체/ml 이하를 유지하는 것이 좋은 것으로 나타났다.

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동해 북동부해역 제 4기 후기 퇴적물의 규조 산출과 고해양학적 변화 (Occurrence of Diatom in the Late Quaternary Sediments of the Northeastern East Sea (Sea of Japan) and its Paleoceanographic Changes)

  • 신유나;;윤호일;김예동;우경식;김부근
    • 한국해양학회지:바다
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    • 제5권4호
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    • pp.305-319
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    • 2000
  • 동해 북동쪽에 위치한 홋카이도섬 서부해역에서 채취된 중력시추코아 GH98-1223의 45개 퇴적물 시료들로부터 휴면포자를 제외한 총 31속 50종 1아종의 규조류가 동정되었다. 최대 산출종은 Thalassionema nitzschioides로 전시료에서 29${\sim}$59%의 높은 산출빈도를 나타냈으며, 그 외에 비교적 개체 보존이 양호한 Denticulopsis seminae와 Pseudoeunotia doliolus를 비롯한 대부분의 종들은 평균 산출빈도가 5% 이내로 매우 낮게 나타났다 전 시료에서 한류종의 산출빈도가 난류종보다 상대적으로 우세하였으며, 수직분포는 각 종의 생태적 특성에 따라 차이가 있으나 대부분의 층준에서 난류종과 한류종의 산출빈도는 서로 상반되는 경향을 보였다. 대표적인 한류종인 D. seminae와 난류종으로 쿠로시오해류(Kuroshio Current)의 지류인 대마난류(Tsushima Warm Current)의 지시종인 P doliolus의 전체적인 변화양상은 뚜렷하게 상반되며, 이것은 규조온도지수(T$_d$)의 수직적인 변화와도 서로 일치한다. 규조온도지수는 150 cm깊이를 기준으로 코아의 상부에서는 평균 이상의 높은 수치를 나타내며 하부에서는 평균 이하의 낮은 수치를 나타내는데, 이러한 경향은 동해의 북부지역에 위치한 본 연구지역에 대마난류의 영향이 홀로세의 후빙기를 거치면서 점차적으로 증가된 것을 지시하고 있다. 또한, 하층부에서 규조온도지수는 지그재그형의 변화를 나타내는데 이는 규조류가 서식하는 해수의 환경이 불안정하였다는 것을 의미한다. 생산성과 용승의 정도를 지시하는 Chaetoceros resting spores는 5.3${\sim}$40% 정도의 산출빈도를 보이는데 , 최대값은 80 cm 보다 상층부에서 나타났다. 퇴적물의 생물 기원물질의 상대적인 양을 예측하는데 이용되는 Chaetoceros resting spores/Chaetoceroe vegetative cells도 80 cm 보다 상층에서는 높게 나타나 규조온도지수 분포와도 일치하는 경향을 보인다. 이상의 규조군집 분석 결과에 의하면, 홀로세의 후빙기동안 본 연구 지역인 동해 북동부에는 대마 난류의 유입이후 현재와 유사한 환경이 우세하게 발달했으나, 난류종 P. doliolus의 변화는 동해내에서 대마난류의 세기가 반복되었음을 지시하고 있다.

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춘계 진해만에서 농도 구배로 첨가한 영양염에 의한 식물플랑크톤 성장반응과 군집구조의 명확한 특징 (The distinct characteristics of phytoplankton growth response and their community structure following seven different nutrients addition in spring season of Jinhae Bay)

  • 손문호;백승호
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제16권10호
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    • pp.6567-6574
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    • 2015
  • 본 연구는 진해만에서 2010년 부영양화해역(St.1)과 빈영양화해역(St.22)에서, 2011년에는 부영양화해역(St.1, St.5), 중영양화해역(St.19), 빈영양화해역(St.22) 등 해역의 특성이 다른 정점에서 영양염농도구배(Nitrate: 0, 1, 5, 10, 20, 50, $100{\mu}M$; Phosphate: 0, 0.1, 0.5, 1, 2, 5, $10{\mu}M$)에 따른 식물플랑크톤의 성장반응 및 군집구조의 특성을 파악하였다. 2010년 St.1에서 질산염과 인산염첨가군에서는 농도구별에 따른 식물플랑크톤성장의 차이를 보였으나(One-way ANOVA:P<0.01), St.22에서는 영염첨농도구배에 따른 영양염첨가효과가 명확하지 않았다. 2010년 St. 1의 질산염 첨가군에서 와편모조류 Heterocapsa triquetra가 우점하였고, 인산염 실험군에서는 규조류 Pseudo-nitzchia spp.가 각각 우점하였다 진해만 중앙의 빈영양수계 St. 22에서는 질산염농도가 $10{\mu}M$ 전 후에서 Chaetoceros spp.가, $20{\mu}M$에서 Thalassiosira spp.가, > $50{\mu}M$에서 Pseudo-nitzchia spp.가 각각 우점하였고, 인산염 첨가시 $2{\mu}M$ 이하에서는 Cylindrotheca spp.로, $5{\mu}M$ 이상에서는 Pseudo-nitzchia spp.로 우점하였다. 2011년에는 4해역 모두 영양염농도구배에 따른 식물플랑크톤 성장의 명확한 차이를 보였다(One-way ANOVA:P<0.01). 하지만, 정점1, 5, 19에서는 식물플랑크톤의 성장이 2일 후부터 점차적으로 증가하였으나, 정점 22에서는 실험 6일후부터 반응하였고, 이는 낮은 영양염농도에 적응된 생물군에 갑작스럽게 영양염이 공급되어도 성장 지연현상이 일어날수 있다는 것을 의미한다. 식물플랑크톤의 우점종은 정점1의 낮은 영양염농도에서는 Eucampia spp., Chaetoceros spp.가 높게, 높은 영양염농도에서는 Skeletonema spp.와 Thalassiosira spp.로 나타났다. St. 5에서는 Skeletonema spp.가 우점하였고, St.19에서는 Chaetoceros spp.와 Skeletonema spp.도 상대적으로 높은 비율을 차지하였다. 반면, St. 22에서는 Thalassiosira spp.가 높은 점유율을 보였다. 결과적으로 영양염특성이 다른 해역에서 추가적으로 첨가한 영양염은 영양염 농도구배에 따라서 식물플랑크톤의 우점종 및 종조성을 차이를 보였고, 이는 각각의 해역의 특성에 따라서 식물플랑크톤의 현존량 및 우점종의 차이가 명확하게 나타나는 것을 잘 대변할 수 있는 중요한 근거라고 판단된다.