The recent rapid increase in genomic data related to many microorganisms and the development of computational tools to accurately analyze large amounts of data have enabled us to design several kinds of simulation approaches for the complex behaviors of cells. Among these approaches, dFBA (dynamic flux balance analysis), which utilizes FBA, differential equations, and regulatory events, has correctly predicted cellular behaviors under given environmental conditions. However, until now, dFBA has centered on substrate concentration, cell growth, and gene on/off, but a detailed hierarchical structure of a regulatory network has not been taken into account. The use of Boolean rules for regulatory events in dFBA has limited the representation of interactions between specific regulatory proteins and genes and the whole transcriptional regulation mechanism with environmental change. In this paper, we adopted the operon as the basic structure, constructed a hierarchical structure for a regulatory network with defined fundamental symbols, and introduced a weight between symbols in order to solve the above problems. Finally, the total control mechanism of regulatory elements (operons, genes, effectors, etc.) with time was simulated through the linkage of dFBA with regulatory network modeling. The lac operon, trp operon, and tna operon in the central metabolic network of E. coli were chosen as the basic models for control patterns. The suggested modeling method in this study can be adopted as a basic framework to describe other transcriptional regulations, and provide biologists and engineers with useful information on transcriptional regulation mechanisms under extracellular environmental change.
Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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v.18
no.3
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pp.519-525
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2014
In this paper, we show a scheme to directly access DLNA network with the 3G/4G communication module of a smartphone in home or office environment. By exploiting this scheme, end users can use DLNA service more conveniently regardless of the type of activated communication module in a smartphone. For the implementation of this scheme, we use a femtocell that is a basestation with small coverage. A problem caused by the IP address hierarch discrepancy between the IP address of 3G/4G module of smartphone and those of local network nodes is resolved by deploying local IP address scheme. The processing of multicasting packet, that is required in DLNA service, is enabled by using IP tunneling scheme. As a result, end user can access DLNA network regardless of the type of activated wireless communication module. We validate the design result by implementing it on a commercial WCDMA femtocell.
Journal of Korea Spatial Information System Society
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v.10
no.3
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pp.45-54
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2008
This paper designs and Implements a connectivity analyzer for the hybrid vehicular network based on the real-life movement history data achieved from the Taxi telematics system currently in operation, aiming at providing a useful guideline and information to build a telematics network. The simulator traces the location of each vehicle, sets the vehicle type, either gateway or normal, decides whether it can be connected to a mobile gateway, keeps track of status of the vehicle, and calculates the duration of disconnected state. With this analysis considering the transmission range and gateway ratio, we can decide the cost-effective number of mobile gateways having both cellular and ad-hoc network interfaces, and buffer space requirement based on the measured disconnection time and message generation ratio.
The Journal of Korean Institute of Communications and Information Sciences
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v.34
no.11A
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pp.815-821
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2009
In this paper, we propose a new type of mutually cooperative relaying (MCR) scheme based on a spatially coordinate-interleaved orthogonal design (SCID), in which two cooperative users are spatially multiplexed without bandwidth expansion. It provides not only diversity gain (with order of two) as in the existing MCR scheme, but also additional coding gain. Our simulation results demonstrate that the proposed SCID scheme is useful for improving the uplink performance as long as one user can find another active user as a close neighbor that is simultaneously communicating with the same destination, e.g., a base station in the cellular network.
KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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v.10
no.1
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pp.79-95
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2016
In order to improve the Quality-of-Service (QoS) of latency sensitive applications in next-generation cellular networks, multi-path is adopted to transmit packet stream in real-time to achieve high-quality video transmission in heterogeneous wireless networks. However, multi-path also introduces two important challenges: out-of-order issue and reordering delay. In this paper, we propose a new architecture based on Software Defined Network (SDN) for flow aggregation and flow splitting, and then design a Multiple Access Radio Scheduling (MARS) scheme based on relative Round-Trip Time (RTT) measurement. The QoS metrics including end-to-end delay, throughput and the packet out-of-order problem at the receiver have been investigated using the extensive simulation experiments. The performance results show that this SDN architecture coupled with the proposed MARS scheme can reduce the end-to-end delay and the reordering delay time caused by packet out-of-order as well as achieve a better throughput than the existing SMOS and Round-Robin algorithms.
Journal of the Korean Society for Precision Engineering
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v.21
no.10
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pp.86-93
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2004
This paper presents the remote measurement of the ECU signals adopted with KWP 2000 protocol using the wireless communication technique of bluetooth. The bluetooth technology will be the most promising network paradigm which can open the new area in the information technology. Especially, bluetooth module is able to link all the electrical products and personal computers to cellular phone or PDA. This research has a try to design a wireless measurement model of ECU signal based on the car telemery system using bluetooth device. In order to measure the ECU signals, we designed the interface circuits which is able to communicate between the ECU system and the terminal circuits according to the ISO, SAE regulation of communication protocol standard. A microprocessor S3c341 OX is used for the system control and communication of ECU signals. The embedded system software is programmed to measure the ECU signals using the ARM compiler and ANCI C based on Micro/OS-II kernel to communicate between two bluetooth modules using bluetooth stack. The remote measurement of ECU signals using the bluetooth was designed and implemented to evaluate the performance of wireless network to the transmit measurement data. The possibility for the remote measurement of the self diagnosis signals of ECU adopted with KWP2000 protocol verified through the developed systems and algorithms in embedded system.
Kim Dong-Kyun;Kim Ki-Young;Kim Hee-Ja;Lee Hae Gak;Lee Sang-Jeong
Journal of Digital Contents Society
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v.5
no.2
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pp.114-120
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2004
This paper proposes the wireless integrated service for controlling networked appliances. Using wireless devices such as celluar phone and PDA which can communicate through Bluetooth and CDMA technology, home appliances are accessed and controlled from outside of house. The XML and the SMS message format is designed to specify controlling information for home appliances. Also the mobile agent and the message processor for networked appliances are implemented in the home gateway. In order to verify the proposed service system, a universal remote controller for cellular phone and PDA and network appliance simulator on web browser are implemented. Correct operation is verified through simulation using them.
Proceedings of the Korean Operations and Management Science Society Conference
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2005.05a
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pp.775-783
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2005
이동통신 네트워크의 위치영역 설계는 위치관리 비용을 최소화하도록 네트워크를 위치영역으로 분리하는 문제이다. 기존 위치영역 설계 관련 연구는 설계의 모수가 되는 호 발생률 및 셀 간 가입자 이동률을 고정된 것으로 가정하였다. 그러나 실제 환경에서의 두 모수는 시간에 따라 변화하고, 일정한 패턴을 나타내며, 시간 당 셀 내 인구에 영향을 받는다. 본 연구에서는 이러한 인구유동 및 호 발생의 불확실성 및 시간에 따는 패턴 변화를 고려하여 기준 이상의 페이징 서비스 품질을 만족시키고, 비용을 최소화 하는 위치영역 설계 방식을 제안하였다. 모수의 변동에 일정 서비스 품질을 보장하기 위해 시간대 및 가동률 상한의 개념을 도입하여 추계적 문제를 정적 그래프 분리문제로 변환하였고, 이에 대한 솔루션은 Simulated Annealing을 응용한 경험적 최적해 도출 알고리즘을 이용하여 도출했다.
The rapid proliferation of wireless networks and mobile computing applications has changed the landscape of network security. Anomaly detection is a pattern recognition task whose goal is to report the occurrence of abnormal or unknown behavior in a given system being monitored. This paper presents an efficient rough set based anomaly detection method that can effectively identify a group of especially harmful internal attackers - masqueraders in cellular mobile networks. Our scheme uses the trace data of wireless application layer by a user as feature value. Based on this, the used pattern of a mobile's user can be captured by rough sets, and the abnormal behavior of the mobile can be also detected effectively by applying a roughness membership function with the age of the user profile. The performance of the proposed scheme is evaluated by using a simulation. Simulation results demonstrate that the anomalies are well detected by the proposed scheme that considers the age of user profiles.
Journal of the Korean Data and Information Science Society
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v.18
no.2
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pp.315-326
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2007
The rapid proliferation of wireless networks and mobile computing applications has changed the landscape of network security. Anomaly detection is a pattern recognition task whose goal is to report the occurrence of abnormal or unknown behavior in a given system being monitored. This paper presents a dynamic anomaly detection scheme that can effectively identify a group of especially harmful internal masqueraders in cellular mobile networks. Our scheme uses the trace data of wireless application layer by a user as feature value. Based on the feature values, the use pattern of a mobile's user can be captured by rough sets, and the abnormal behavior of the mobile can be also detected effectively by applying a roughness membership function with both the age of the user profile and weighted feature values. The performance of our scheme is evaluated by a simulation. Simulation results demonstrate that the anomalies are well detected by the proposed dynamic scheme that considers the age of user profiles.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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