• 제목/요약/키워드: CO I gene

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Novel $\delta$-Lactam base Histone Deacetylase Inhibitors: Synthesis and Biological Evaluation I.

  • Park, Bum-Woo;Ryu, Dong-Kyu;Kim, Tae-Kyun;Park, Song-Kyu;Han, Jeong-Hwan;Han, Gyoon-Hee
    • 대한약학회:학술대회논문집
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    • 대한약학회 2003년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2-2
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    • pp.184.1-184.1
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    • 2003
  • HDAC and HAT (histone acetyltransferase) are involved in co-regulation in chromatin remodeling and the functional regulation of gene transcription. Abnormal recruitment of HDAC is related to carcinogenesis. Thus, the identification of potent histone deacetylase (HDAC) inhibitor has been considered as very intriguing approach for development for cancer chemotherapy. More recently, anti-inflammatory activity of SAHA cytokines was reported via reduction of proinflammatory cytokinres in vitro and in vivo. (omitted)

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First Molecular Characterization of Hypoderma actaeon in Cattle and Red Deer (Cervus elaphus) in Portugal

  • Ahmed, Haroon;Sousa, Sergio Ramalho;Simsek, Sami;Anastacio, Sofia;Kilinc, Seyma Gunyakti
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제55권6호
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    • pp.653-658
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    • 2017
  • Hypoderma spp. larvae cause subcutaneous myiasis in several animal species. The objective of the present investigation was to identify and characterize morphologically and molecularly the larvae of Hypoderma spp. collected from cattle (Bos taurus taurus) and red deer (Cervus elaphus) in the district of Castelo Branco, Portugal. For this purpose, a total of 8 larvae were collected from cattle (n=2) and red deer (n=6). After morphological identification of Hypoderma spp. larvae, molecular characterization was based on PCR-RFLP and mitochondrial CO1 gene sequence analysis. All larvae were morphologically characterized as the third instar larvae (L3) of H. actaeon. Two restriction enzymes were used for molecular identification of the larvae. TaqI restriction enzyme was not able to cut H. actaeon. However, MboII restriction enzyme differentiated Hypoderma species showing 210 and 450 bp bands in H. actaeon. Furthermore, according to the alignment of the mt-CO1 gene sequences of Hypoderma species and to PCR-RFLP findings, all the identified Hypoderma larvae were confirmed as H. actaeon. This is the first report of identification of Hypoderma spp. (Diptera; Oestridae) from cattle and red deer in Portugal, based on morphological and molecular analyses.

Expressional Subpopulation of Cancers Determined by G64, a Co-regulated Module

  • Min, Jae-Woong;Choi, Sun Shim
    • Genomics & Informatics
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    • 제13권4호
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    • pp.132-136
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    • 2015
  • Studies of cancer heterogeneity have received considerable attention recently, because the presence or absence of resistant sub-clones may determine whether or not certain therapeutic treatments are effective. Previously, we have reported G64, a co-regulated gene module composed of 64 different genes, can differentiate tumor intra- or inter-subpopulations in lung adenocarcinomas (LADCs). Here, we investigated whether the G64 module genes were also expressed distinctively in different subpopulations of other cancers. RNA sequencing-based transcriptome data derived from 22 cancers, except LADC, were downloaded from The Cancer Genome Atlas (TCGA). Interestingly, the 22 cancers also expressed the G64 genes in a correlated manner, as observed previously in an LADC study. Considering that gene expression levels were continuous among different tumor samples, tumor subpopulations were investigated using extreme expressional ranges of G64-i.e., tumor subpopulation with the lowest 15% of G64 expression, tumor subpopulation with the highest 15% of G64 expression, and tumor subpopulation with intermediate expression. In each of the 22 cancers, we examined whether patient survival was different among the three different subgroups and found that G64 could differentiate tumor subpopulations in six other cancers, including sarcoma, kidney, brain, liver, and esophageal cancers.

파블로바 비리디스로부터 분리한 세균에 의한 미세조류의 생장 촉진 (Growth Promotion of Pavlova viridis by Bacteria Isolated from the Microalga)

  • 사커 아노와룰 아하메드;김진주;최태오;최태진
    • 생명과학회지
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    • 제25권5호
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    • pp.568-576
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    • 2015
  • 해양 미세조류인 파블로바 비리디스는 빨리 자라며, DHA, EPA와 같은 해양생물을 키우는데 필수적인 영양요소를 축적하는 능력을 가지고 있어 어류와 새우류 치어 사육에 이용되어 왔다. 본 연구에서는 파블로바 비리디스와이 미세조류의 표면에 붙어서는 세균과의 공생적 상호작용을 연구하였다. 무균의 파블로바 비리디스 균주는 항생제 혼합액을 포함하는 액체배지에 반복 배양함으로써 얻어졌다. 무균상태는 항생제를 포함하지 않는 배지에 3번 계대배양한 후 확인하였다. 무균상태의 조류는 이 조류로부터 분리되었으며, 임의로 I1–I5로 명명한 세균과 혼합배양하면서 조류의 성장 촉진 효과를 조사하였다. 모든 세균이 파블로바 비리디스의 생장을 촉진하였으며, 그 중 I3로 명명한 세균이 5가지 세균 중 가장 효과가 좋았다. 혼합배양 상태에서 파블로바 비리디스의 세포 수는 대조구에 비하여 유의하게 많았다. I3의 16S rRNA 유전자에 대한 염기서열 분석 결과 시트로박터 종의 그것과 97%의 염기서열 상동성을 보였다. I3을 파블로바 비리디스와 혼합배양할 경우 I3의 성장도 유의하게 증가하였으며, 이것은 조류와 그 표면에 부착하여 살아가는 세균들 사이에 공생관계가 존재한다는 것을 제시한다. 미세조류와 세균과의 공생관계는 전자현미경적 관찰을 이용하여 확인하였다.

소아에서 치은 과증식에 대한 cyclosporine의 효과를 연구하는 새로운 방법 (A Novel Method to Study the Effects of Cyclosporine on Gingival Overgrowth in Children)

  • 한금아;김종수
    • 대한소아치과학회지
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    • 제45권3호
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    • pp.271-279
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    • 2018
  • 소아에서 사이클로스포린에 의해 유발되는 치은과증식의 병인을 규명하기 위한 이전의 연구에서는, 개체 간의 차이를 유발할 수 있는 요인을 완전히 배제하지 않았다. 본 연구는 개체 별로 생물학적 변이의 영향을 통제한 실험 모델에 의해 사이클로스포린이 1형 교원질의 대사에 미치는 영향을 알아보았다. 5주령의 수컷 Sprague-Dawley rats 5마리에 6주 동안 사이클로스포린을 위장으로 투여하였다. 사이클로스포린 투여 전과 투여 후 2, 4, 6주째에 쥐의 하악구치부에서 치은을 채취하였다. 20개의 치은표본으로부터 치은섬유모 세포를 추출하였다. 개체 별로 사이클로스포린을 투여하기 전 채취한 치은섬유모세포의 반은 대조군, 나머지 반은 실험실 내 약물 처리한 실험군(Tt)으로 하였다. 사이클로스포린 투여 후 2, 4, 6주째 채취한 치은섬유모세포는 각각의 실험군으로서 T2, T4, T6으로 명명하였다. 면역형광법을 시행하여 모든 치은모세포 내의 1형 교원질의 존재를 확인하였다. 각 개체 별로 대조군과 실험군에서 1형 교원질의 유전자와 단백질 발현의 변화를 분석하기 위해서 각각 Real-time polymerase chain reaction과 Western blotting을 시행하였다. 사이클로스포린을 처리하기 전과 후를 한 개체내에서 비교하여 1형 교원질의 변화를 평가하였다. 대조군과 실험군에서 1형 교원질의 유전자 발현에서는 유의한 차이가 없었다. 모든 개체에서 실험실 내 사이클로스포린 처리한 치은섬유모세포의 1형 교원질의 단백질 발현이 증가한 경우, 사이클로스포린을 투여한 후 채취한 치은섬유모세포에서도 1형 교원질의 단백질 발현이 증가하였다. 본 연구에서 시행한 개체별로 발생할 수 있는 생물학적 변이를 모두 통제한 실험 방법은 유용하였다. 1형 교원질 이외에 다른 요인들에 대한 후속 연구 및 인간에서의 심도 있는 연구가 필요하다.

Phylogenetic Relationships of the Fireflies Co-occurring in Korean and Japanese Territories Analyzed by Luciferase and Mitochondrial DNA Sequences

  • Kim, Iksoo;Kim, Jong Gill;Jin, Byung Rae
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제9권2호
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    • pp.155-165
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    • 2004
  • In Korean Peninsula including neighboring islands and Japanese Islands identical firefly species or the species belonging to same genera occur together in both territories. These geographic firefly species, nonetheless, have never been subject to taxonomic consideration together until recently, lacking clear species status and phylogenetic relationships. A recent serial study of these fireflies using luciferase gene and/or portions of mitochondrial DNA sequences provided some insight into these populations in terms of validity of species name, phylogenetic relationships, and speciation event. In this article, thus, we have reviewed the recent progress on phylogenetic and/or population genetic aspects of these species, i.e., Hotaria-group fireflies, Luciola lateralis, and Pyrocoelia rufa to better understand the firefly species in these regions.

비티 새싹 추출물의 항산화 및 항염효과 (Anti-oxidant and Anti-inflammatory Activities of Beet (Beta vulgaris) Sprout Extract)

  • 한송이;변지훈;강미숙;강소미;김재훈
    • 한국자원식물학회:학술대회논문집
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    • 한국자원식물학회 2020년도 추계국제학술대회
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    • pp.77-77
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    • 2020
  • 본 연구에서는 비트 새싹 추출물의 항산화 및 항염증 효능을 평가하기 위해 3가지 품종의 레드 비트(메를린, 우단, 디트로이트다크레드) 새싹을 60% 에탄올로 추출한 후 free radical 소거활성, 총 폴리페놀 함량을 측정하였다. 또한, LPS로 염증반응이 유도된 대식세포인 RAW264.7 세포에서 nitric oxide(NO) 생성억제 효과를 알아보았다. 메를린, 우단, 디트로이트다크레드 새싹 추출물의 총 폴리페놀 함량을 querceitn을 표준물질로 사용하여 측정한 결과 2.84 mg Que/g, 2.61 mg Que/g, 2.71 mg Que/g으로 나타났고 DPPH 라디칼 소거능은 농도 의존적으로 증가하였으며, 200 ㎍/ml일 때, 55%, 72%, 63%로 나타났다. 또한, DPPH 라디칼 소거능이 가장 높은 메를린 새싹 추출물은 LPS로 염증반응이 유도된 RAW264.7 세포에서 농도 의존적으로 iNOS와 COX-2를 억제하는 것을 확인하였다. 이러한 결과를 바탕으로 메를린 비트 새싹 추출물이 항산화 및 항염증제의 천연물 소재로 활용이 가능할 것으로 생각된다.

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Bifidobacterium longum의 Sucrose 대사 관련 scr 유전자군의 특성 규명 (Characterization of the scr Gene Cluster Involved! in Sucrose Utilization in Bifidobacterium longum)

  • 권태연;이종훈
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.199-205
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    • 2004
  • Bifidobacterium longum SJ32 균주로부터 cloning한 sucrose phosphorylase 유전자를 포함하는 8.6 kb의 EclRI 단편의 염기서열을 결정하였다. 5개의 open reading frame이 존재하였고, 상동성 검색의 결과, sucrose대사에 관여하는 sucrose phosphorylase (ScrP), sucrose transporter (ScrT), GalR-LacI-type transcriptional regulator (ScrR) 유전자의 존재를 확인하였다. SJ32 균주의 scrPTR 유전자군은 다른 B. longum균주의 scrPTR과 배열이 동일하고, 각 유전자 산물이 아미노산 수준에서 94%이상의 상동성을 가지고 있지만, 주변 유전자는 다르게 나타나 B. longum균주 간의 scrPTR 유전자군의 horizontal transfer를 추정하게 한다. 대장균에서의 scrP와 scrT의 동시 발현은 세포 내로의 sucrose 유입을 증가시켜 sucrose phosphorylase의 활성 증가에 영향을 주는 것으로 나타나, scrT가 sucrose transporter유전자임을 뒷받침한다. 기존에 보고된 B. longum NCC2705균주의 유전체로부터 scrPTR외에도 sucrose대사에 관여하는 다양한 sucrose multiple transport system에 관여하는 유전자의 존재가 확인되어, B. longum이 다양한 sucrose유입체계를 보유하고 있음이 추정된다.

유산균 발효에 의한 인삼열매 추출물의 항산화 및 항노화 효과 (Antioxidant and Antiaging Effect of Ginseng Berry Extract Fermented by Lactic Acid Bacteria)

  • 전지민;최성규;김윤정;장수진;천종우;이현상
    • 대한화장품학회지
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    • 제37권1호
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    • pp.75-81
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    • 2011
  • 본 연구에서는 유산균 발효에 의한 인삼열매 추출물의 여러 가지 생리활성을 평가하였다. 고성능액체크로마토그래피를 수행하여 인삼열매 추출물과 유산균 발효 인삼열매 추출물의 ginsenoside Re, Rc 및 Rb1의 함량분석 결과 유산균 발효에 의해 ginsenoside Re, Rc 및 Rb1의 함량이 모두 증가하였다. 인삼열매 추출물과 유산균 발효 인삼열매 추출물의 DPPH free radical 소거활성과 SOD 유사활성 측정결과 1.00 %의 농도에서 유산균 발효 인삼열매 추출물은 각각 86.34, 76.82 %의 DPPH free radical 소거활성과 SOD 유사활성을 나타내었고, 인삼열매 추출물은 각각 49.78, 40.80 %의 DPPH free radical 소거활성과 SOD 유사활성을 나타내어 유산균 발효에 의해 항산화 활성이 증가하는 것을 확인하였다. 또한 유산균 발효 인삼열매 추출물 0.50 %의 농도로 처리한 피부 섬유아세포에서 procollagen type I (COL1A1)은 828.13 % 증가하였으며, matrix metalloproteinase (MMP)-1은 87.88 %, tumor necrosis factor (TNF)-${\alpha}$는 99.92 %감소하는 효과를 보여주었다. 이처럼 항산화, 주름, 항염에 효능을 보이는 유산균 발효에 의한 인삼열매 추출물은 기능성 화장품 소재로 개발될 수 있는 가능성이 있다.

Co-expression and Sequence Determination of Estrogen Receptor Variant Messenger RNAs in Swine Uterus

  • Ying, C.;Chan, M.-A.;Cheng, W.T.K.;Hong, W.-F.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제16권12호
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    • pp.1716-1721
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    • 2003
  • Steroid hormones and their receptors play an important role in reproductive process. Estrogen is intimately involved with pregnancy and its function is mediated through the estrogen receptor which has been chosen as a candidate gene to study litter size in pigs. In this study, we report that two estrogen receptor variants, designated pER-1 and pER-2 were co-expressed in the uteri of normal cycling Lan-Yu pig (Sus vittatus; a small-ear miniature in Taiwan) with the pER-1 expression level appeared to be several times higher than that of pER-2. These receptor variants were isolated using reverse transcription-PCR from the pig uteri and their sequences were determined. The pER-1 and pER-2 sequences, which are homologous to those found in other mammalian estrogen receptors, encode putative proteins consisting of 574 and 486 amino acids, respectively. A deletion in exon I was identified in both sequences, with deletion lengths of 63 bp in pER-1 and 327 bp in pER-2. The deletion in pER-1 is internal to that in pER-2 and both deletions resulted in a truncation of the B domain, which confers the transactivating activity of estrogen receptor protein. This result describes the existence of estrogen receptor variants with a deletion in exon I and implies the possibility that physiological functioning of an estrogen receptor may not require the presence of an intact B domain.