• 제목/요약/키워드: Burkholderia mallei

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Simple Sequence Repeat (SSR)-Based Gene Diversity in Burkholderia pseudomallei and Burkholderia mallei

  • Song, Han;Hwang, Junghyun;Myung, Jaehee;Seo, Hyoseok;Yi, Hyojeong;Sim, Hee-Sun;Kim, Bong-Su;Nierman, William C.;Kim, Heenam Stanley
    • Molecules and Cells
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    • 제27권2호
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    • pp.237-241
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    • 2009
  • Pathogens Burkholderia pseudomallei (Bp) and Burkholderia mallei (Bm) contain a large number (> 12,000) of Simple Sequence Repeats (SSRs). To study the extent to which these features have contributed to the diversification of genes, we have conducted comparative studies with nineteen genomes of these bacteria. We found 210 genes with characteristic types of SSR variations. SSRs with nonamer repeat units were the most abundant, followed by hexamers and trimers. Amino acids with smaller and nonpolar R-groups are preferred to be encoded by the variant SSRs, perhaps due to their minimal impacts to protein functionality. A majority of these genes appears to code for surface or secreted proteins that may directly interact with the host factors during pathogenesis or other environmental factors. There also are others that encode diverse functions in the cytoplasm, and this protein variability may reflect an extensive involvement of phase variation in survival and adaptation of these pathogens.

배양법과 DGGE에 의한 해양세균 군집의 비교분석 (Comparison of Culture-dependent and DGGE based Method for the Analysis of Marine Bacterial Community)

  • 김말남;방효주
    • 환경생물
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    • 제24권4호
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    • pp.307-313
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    • 2006
  • 2004년 9월과 11월, 2005년 1월, 5월 및 8월의 총 5회에 걸쳐 대한민국 통영연안의 1개 정점에서 표층해수를 계절별로 채취하여 해양세균 군집을 분석하였다. 선택배지에서 순수분리하여 VITEK Microbe ID system으로 동정한 배양법과 16S rRNA PCR-DGGE로 분석한 결과를 상호비교하였다. 배양법에 의한 각 계절별 해양세균 군집의 종조성은 2004년 9월은 5종, 11월은 5종, 2005년 1월은 4종, 5월은 6종 및 8월은 10종으로 조사되었고, Pseudomonas fluorescens와 Acinetobacter lwoffii는 계절과 관계없이 모두 검출되었으며, 그 외에 Pseudomonas stutzeri, Sphingomonas paucimobilis 및 Burkholderia mallei 등이 동정되었다. 16S rRNA PCR-DGGE에 의한 군집분석 결과는 2004년 9월은 10개체군, 11월은 11개체군, 2005년 1월은 6개체군, 5월은 9개체군 및 8월에는 13개체군이 조사되었고, Acinetobacter lwoffii, Burkholderia mallei, Pseudomonas fluoresence, Actinobacillus ureae, Burkholderia sp., Pseudomonas stutzeri, Roseobacter sp., Vibrio parahaemolyticus, Sphingomonas paucimobilis 및 Rugeria algocolus 등이 동정되었다. 이로부터 해양세균 군집의 분포특성을 파악하는 데는 16S rRNA PCR-DGGE가 배양법보다 더 효율적임이 판명되었다.

면역증강물질을 생산하는 해양미생물의 분리 및 동정 (Isolation and Identification of a Marine Bacterium Producing an Immunostimulant)

  • 최혜정;정명주;정영기
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제29권6호
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    • pp.1145-1150
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    • 2000
  • 면역증강물질을 생산하는 균주를 해수로부터 분리하여 동정한 결과 크림색의 둥근 점질성의 집략을 나타내었으며, Gram 음성의 간산형이고, 미약한 운동성을 가지며 catalase 양성과 oxidase 음성 반응을 보였다. 균주를 6시간 , 20시간, 72시간, 및 144시간 뱅양하여 전자 현미경사에서 관찰한 결과 20시간 배양한 영양세포는 1.25~0.6$\times$0.6$\mu\textrm{m}$ 크기의 간균 형태를 갖추었으며 시간이 흐를수록 세포내 관립의 밀도가 증가하면서 세포형태가 다형태성으로 변하였다. 세포내 과립의 존재를 확인하기 위해 sudan black B로 염색한 결과 양성으로 polyhy-droxy butyrate로 예상되었다. 생육을 위한 최적 온도는 3$0^{\circ}C$, pH는 3.0~10.0이었으며, 호기성균이었다. D-Glu-cose, D-mannose, D-mannitiol. insitol, maltose 등의 당과 L-asparagine, L-glutamate 등의 아미노산을 이용하였고 특시, O/F test에서 glucose와 maltose를 산화 하였다. 이상과 같은 결과로 해양세균 유래인 Pseudo-mallei group의 Burkholderia 속으로 확인되었음로 본 균주를 Burkholderia sp. IS-203으로 명명하였다.

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생물무기로 사용된 병원균과 질병에 대한 고찰 (A review on the Pathogens and Diseases Associated with Biological weapons)

  • 최철순
    • 대한수의사회지
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    • 제38권9호
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    • pp.781-800
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    • 2002
  • Recently, biological weapons (BWs) prepared with pathogenic microorganisms, toxins and biological vectors have been used maliciously for biological warfare, bioterrorism and/or agroterrorism by hostile countries and terrorists. In this review, historical background of disease and malicious use of BWs pathogenicity of microorganisms, advanced methodology involved in laboratory diagnosis, and prevention and control of anthrax (Bacillus anthracis), plague (Yersinia pseudotuberculosis subs. pestis), glanders (Burkholderia mallei), and smallpox (Variola virus) which have been abused for biological warfare or bioterrorism were discussed. In addition, the pathogenicity of microorganisms and the methodology needed to diagnose and control 6 diseases identified by WHO/CDC, ie., smallpox, inhalation anthrax, pneumonic plague, botulism, tularemia, and hemorrhagic fevers that would wreak havoc if terrorists successfully disseminated the germs by air were described.

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통영 바다목장 해역의 종속영양세균 군집의 연차적 분포 (Annual Distribution of Heterotrophic Bacterial Community in the Marine Ranching Ground of Tongyeong Coastal Waters)

  • 김말남;이한웅;이진환
    • 환경생물
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    • 제25권3호
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    • pp.273-278
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    • 2007
  • [ $2003{\sim}2007$ ]년 통영 바다목장 해역 5개 정점을 대상으로 표층수와 저층수의 종속영양세균의 개체수를 측정하고, 종속영양세균 군집의 종조성 및 우점종을 분석하였다. 종속영양세균은 겨울이나 봄 및 가을에 비하여 해수의 온도가 높은 여름에 더 많이 검출되었으며, 정점별 변화는 특별한 변화 경향이 없었다. 2003년 10월 및 2004년 9월에는 태풍과 집중호우의 영향으로 표층수와 저층수의 개체수가 큰 차이를 나타내지 않거나 저층수의 개체수가 표층수보다 오히려 더 많은 경우도 있었다. 통영 바다목장 해역의 종속영양세균 개체수는 해를 거듭할수록 감소하는 추세를 나타내었다. 종속영양세균 군집의 종조성은 Pseudomonas fluorescens TY1, Pseudomonas stutzeri TY2, Acinetobacter lwoffii TY3, Sphingomonas paucimobilis TY4, Burkholderia mallei TY5, Pasteurella haemolytica TY6, Pasteurella multocida TY7, Comamonas acidovorans TY8, Actinobacillus ureae TY9 및 Chryseobacterium indologenes TY10으로 조사되었고, P. fluorescens TY1과 A lowffii TY3이 우점종으로 분석되었다.

Bee Venom (Apis Mellifera) an Effective Potential Alternative to Gentamicin for Specific Bacteria Strains - Bee Venom an Effective Potential for Bacteria-

  • Zolfagharian, Hossein;Mohajeri, Mohammad;Babaie, Mahdi
    • 대한약침학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.225-230
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    • 2016
  • Objectives: Mellitine, a major component of bee venom (BV, Apis mellifera), is more active against gram positive than gram negative bacteria. Moreover, BV has been reported to have multiple effects, including antibacterial, antivirus, and anti-inflammation effects, in various types of cells. In addition, wasp venom has been reported to have antibacterial properties. The aim of this study was to evaluate the antibacterial activity of BV against selected gram positive and gram negative bacterial strains of medical importance. Methods: This investigation was set up to evaluate the antibacterial activity of BV against six grams positive and gram negative bacteria, including Staphylococcus aureus (S. aureus), Salmonella typhimurium, Escherichia coli (E. coli) O157:H7, Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia mallei and Burkholderia pseudomallei. Three concentrations of crude BV and standard antibiotic (gentamicin) disks as positive controls were tested by using the disc diffusion method. Results: BV was found to have a significant antibacterial effect against E. coli, S. aureus, and Salmonella typhyimurium in all three concentrations tested. However, BV had no noticeable effect on other tested bacteria for any of the three doses tested. Conclusion: The results of the current study indicate that BV inhibits the growth and survival of bacterial strains and that BV can be used as a complementary antimicrobial agent against pathogenic bacteria. BV lacked the effective proteins necessary for it to exhibit antibacterial activity for some specific strains while being very effective against other specific strains. Thus, one may conclude, that Apis mellifera venom may have a specific mechanism that allows it to have an antibacterial effect on certain susceptible bacteria, but that mechanism is not well understood.