파킨슨병은 뇌의 흑질 영역에서 도파민계 신경이 파괴되는 질병으로 알츠하이머병과 함께 대표적인 퇴행성 뇌 질환이다. 현재까지 병을 완치시킬 수 있는 치료법은 없지만 병의 진행을 완화시킬 수 있는 치료법이 존재하기 때문에 병의 진단이 굉장히 중요하다. 파킨슨병을 진단하기 위한 과거의 연구는 대부분 단일 바이오마커를 이용한 것으로 이러한 방법은 파킨슨병 환자를 높은 정확도로 진단할 수 있지만 정상인에 대한 진단은 상대적으로 낮은 성능의 한계성이 존재한다. 따라서 본 연구에서는 생화학적 바이오마커인 뇌척수액 내의 ${\alpha}$-synuclein 단백질 수치와 영상학적 바이오마커인 확산 텐서 영상의 여러 모수들을 결합하여 특징으로 사용하는 파킨슨병 진단 모델을 개발하고 성능을 평가하였다. 진단을 위해 개발된 모든 모델은 10-fold cross validation 성능평가에서 정확도가 최고 91.3%의 높은 성능을 보였으며, test 성능평가에서는 확산 텐서 영상의 모수들 중 FA와 ${\alpha}$-synuclein 단백질 수치가 결합된 모델, MO와 ${\alpha}$-synuclein 단백질 수치가 결합된 두 모델에서 최고 72%의 정확도 성능을 보여 파킨슨병의 진단에 유용하게 사용될 수 있는 가능성을 제시하였다. 파킨슨병의 진단을 위해 개발된 모델의 영상학적 특징 벡터를 통하여 파킨슨병 환자와 정상인의 신경섬유 경로의 특징을 분석하였다.
Kim, Byeonghyeon;Kim, Hye Ran;Kim, Ki Hyun;Kim, Minji;Baek, Youl-Chang;Lee, Sung Dae;Jeong, Jin Young
농업과학연구
/
제47권3호
/
pp.683-691
/
2020
A biomarker is needed to monitor and manage the health of pigs from heat stress (HS). Therefore, we investigated the effects of HS on growth performance, nutrient digestibility, and blood profiles in finishing pigs. A total of 12 finishing pigs (n = 12) were raised in thermal neutral (TN; 25℃) conditions for a 3-d adaptation period. After the adaption, 6 pigs were exposed to HS at 33℃ (HS33) for 5 d. The pigs were fed the same diet based on corn and soybean meal. Chromic oxide was added to all the diets at a level of 2 g·kg-1 as an indigestible marker for the determination of the apparent total track digestibility (ATTD) of nutrients and amino acids. Blood samples were collected after the adaptation and heat treatment to verify the blood profiles. The HS33 pigs had a lower (p < 0.01) average daily feed intake (ADFI) and higher (p < 0.05) rectal temperature compared to the TN pigs. However, there was no difference in the ATTD of nutrients and amino acids. The HS33 pigs had reduced (p < 0.05) levels of serum glucose, non-esterified fatty acids (NEFA), total protein, albumin, and calcium compared to the TN pigs. However, the level of total bilirubin was increased (p < 0.05) in the HS pigs. In conclusion, HS reduced the feed intake and had an adverse effect on health. Altered blood profiles as a result of a negative energy balance are expected to be biomarkers of HS in finishing pigs.
우라늄 피폭후 효소활성도가 내부피폭의 biomarker로서의 가능성을 연구하기 위하여 수서생물인 잉어(Caprinus carpio)의 복강내 우라늄 투여시 간조직에서 일어나는 여러가지 효소계의 변화를 조사하였다. 이러한 효소활성도의 변화는 우라늄 내부피폭의 biomarker로서 가능성을 가지고 있으며 연구결과는 다음과 같다. 1) 6일째까지 우라늄을 주사하여 적출한 간에서의 전체단백질량은 계속 감소하고 있다. 2) 세포내의 lysosome내에 함유하고 있는 acid pretense와 ${\beta}-glucuronidase$의 활성도는 6일째 투여후까지 활성도가 감소하고 있다. 3) Alkaline phosphatase의 경우 6일째 우라늄 투석후까지 증가하고 있으며 반대로 acid phosphatase의 경우 6일째 우라늄 투여후까지 활성도가 급격히 증가하였고 glutamate oxaloacetate transaminase의 활성도는 완만하게 증가하고 있다. 4) Creatine kinase의 활성도는 완만한 감소를 보이고 있으며 malate dehydrogenase는 첫번 우라늄 투여후에 활성도가 급격히 감소하였고 3일째 우라늄 투여후에는 활성도가 거의 나타나지 않았다.
Sohn, Uy-Dong;Je, Hyun-Dong;Shin, Chang-Yell;Park, Sun-Young;Yim, Sung-Hyuk;Kum, Chan;Huh, In-Hoi;Kim, Jin -Hak
Archives of Pharmacal Research
/
제25권2호
/
pp.184-191
/
2002
We investigated the role of vitamin C or rutin on neuropathy and lung damage of diabetic mellitus(DM) rats. Norepinephrine content was significantly decreased in sciatic nerves of DM rats compared with non-DM controls but vitamin C had no effect on decreases of norepinephrine. 2,4-dinitrophenylhydrazine (DNPH) incorporation, which is biomarker of protein oxidation, was increased in sciatic nerve of DM rats as compared with normal control. However, vitamin C had no effects on increases of DNPH incorporation . We measured the content of conjugated dienes (CD) as a biomarker of lipid oxidation in sciatic nerve. CD was increased in DM as compared with normal control, Vitamin C or rutin had no effects on increases of CD. However, Rutin plus vitamin C significantly decreased the content of CD as compared with CIM rats. In lung of DM rats, DNPH incorporation or CD was increased as compared with normal control. Vitamin C or Rutin had no effects on increases of CD However, Rutin plus vitamin C significantly decreased the content of DNPH incorporation or CD in lung tissue. Vitamin C caused marked pathological changes such as the increases of parenchyma and the thickening of alveolar septa in the lung of DM. Rutin had protective effects on the pathological changes in the lung of DM rats. In conclusion, Vitamin C had no effects on oxidative parameter, such as DNPH incorporation or CD, and on the decreases of norepinephrine content in DM rats. Vitamin C caused the marked pathological changes in the lung of DM rats but rutin had protective efforts against the pathological changes.
Chironomous is aquatic insect belonging to order Diptera, family Chironomidae. Their larval stage can be found mainly in aquatic benthic environment, hence good model organism to study environmental toxicology assessments and consider as useful bio indicators of contamination of the aquatic environment. In this study, Chironomus Heat Shock Proteins, Cytochrome 450, Glutathione S-transferase, Serine-type endopeptidase gene expressions were compared between polluted field areas (Chironomus plumosus) and under laboratory conditions (Chironomus riparious) to investigate molecular indicators for environmental contaminant stress assessment. Heavy metal (Al, Fe, Mn, Cu, Cr, Zn, Se, Pb, As, Cd) concentrations in sediments collected from three study areas exceeded the reference values. Moreover, HSPs, CYP450 and GST gene expression except SP for C. plumosus showed higher expression than C. riparious gene expression. Similar gene expression pattern was observed in C. riparious that exposed environment waters up to 96 h when compared to C. plumosus exposed to waters that grown in lab conditions. In summary, this comparative gene expression analysis in Chironomous between field and laboratory condition gave useful information to select candidate molecular indicators in heavy metal contaminations in the environment.
Hye Youn Sung;Jihye Han;Yun Ju Chae;Woong Ju;Jihee Lee Kang;Ae Kyung Park;Jung-Hyuck Ahn
BMB Reports
/
제56권6호
/
pp.347-352
/
2023
The protein family of poly (ADP-ribose) polymerases (PARPs) is comprised of multifunctional nuclear enzymes. Several PARP inhibitors have been developed as new anticancer drugs to combat resistance to chemotherapy. Herein, we characterized PARP4 mRNA expression profiles in cisplatin-sensitive and cisplatin-resistant ovarian cancer cell lines. PARP4 mRNA expression was significantly upregulated in cisplatin-resistant ovarian cancer cell lines, and this upregulation was associated with the hypomethylation of specific cytosine-phosphate-guanine (CpG) sites (cg18582260 and cg17117459) on its promoter. Reduced PARP4 expression was restored by treating cisplatin-sensitive cell lines with a demethylation agent, implicating the epigenetic regulation of PARP4 expression by promoter methylation. Depletion of PARP4 expression in cisplatin-resistant cell lines reduced cisplatin chemoresistance and promoted cisplatin-induced DNA fragmentation. The differential mRNA expression and DNA methylation status at specific PARP4 promoter CpG sites (cg18582260 and cg17117459) according to cisplatin responses, was further validated in primary ovarian tumor tissues. The results showed significantly increased PARP4 mRNA expressions and decreased DNA methylation levels at specific PARP4 promoter CpG sites (cg18582260 and cg17117459) in cisplatin-resistant patients. Additionally, the DNA methylation status at cg18582260 CpG sites in ovarian tumor tissues showed fairly clear discrimination between cisplatin-resistant patients and cisplatin-sensitive patients, with high accuracy (area under the curve = 0.86, P = 0.003845). Our findings suggest that the DNA methylation status of PARP4 at the specific promoter site (cg18582260) may be a useful diagnostic biomarker for predicting the response to cisplatin in ovarian cancer patients.
Kidney renal clear cell carcinoma (KIRC) is one of the most aggressive cancer type of the urinary system. Metastatic KIRC patients have poor prognosis and limited therapeutic options. Ankyrin 3 (ANK3) is a scaffold protein that plays important roles in maintaining physiological function of the kidney and its alteration is implicated in many cancers. In this study, we investigated differential expression of ANK3 in KIRC using GEPIA2, UALCAN, and HPA databases. Survival analysis was performed by GEPIA2, Kaplan-Meier plotter, and OS-kirc databases. Genetic alterations of ANK3 in KIRC were assessed using cBioPortal database. Interaction network and functional enrichment analyses of ANK3-correlated genes in KIRC were performed using GeneMANIA and Shiny GO, respectively. Finally, the TIMER2.0 database was used to assess correlation between ANK3 expression and immune infiltration in KIRC. We found that ANK3 expression was significantly decreased in KIRC compared to normal tissues. The KIRC patients with low ANK3 expression had poorer survival outcomes than those with high ANK3 expression. ANK3 mutations were found in 2.4% of KIRC patients and were frequently co-mutated with several genes with a prognostic significance. ANK3-correlated genes were significantly enriched in various biological processes, mainly involved in peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) signaling pathway, in which positive correlations of ANK3 with PPARA and PPARG expressions were confirmed. Expression of ANK3 in KIRC was significantly correlated with infiltration level of B cell, CD8+ T cell, macrophage, and neutrophil. These findings suggested that ANK3 could serve as a prognostic biomarker and promising therapeutic target for KIRC.
High-density lipoprotein (HDL) is a proven biomarker for the monitoring of changes in antioxidant and anti-inflammation capability of body fluids. The beneficial virtues of HDL are highly dependent on its lipids and protein compositions, and their ratios. In normal state, the HDL particle is enriched with lipids and several HDL-associated enzymes, which are responsible for its antioxidant activity. Lower HDL-cholesterol levels (<40 mg/dL) have been recognized as an independent risk factor for coronary artery disease, as well as being a known component of metabolic syndrome. Functional and structural changes of HDL have been recognized as factors pivotal to the evaluation of HDL-quality. In this review, I have elected to focus on the functional and structural correlations of HDL and the roles of HDL-associated apolipoproteins and enzymes. Recent clinical applications of HDL have also been reviewed, particularly the therapeutic targeting of HDL metabolism and reconstituted HDL; these techniques represent promising emerging strategies for the treatment of cardiovascular disease, for drug or gene therapy.
This experiment was performed to examine the immuno-reactive characteristics of fish metal-binding protein, metallothionein (MT), and gain the practical understandings for the proposed use of fish MT as a biomarker. Liver MT induced by Cd in the silver carp was seperated and purified by gel filtration chromatography and ion exchange chromatography. The immuno-reactivity of fish MT was examined with 3 rabbit antisera. Fish MT showed little reactivity with rabbit anti-rat MT antiserum and a weak reactivity with anti-MT peptide antiserum while showed a strong reactivity with rabbit anti-fish MT antiserum. The time-course change of liver MT in the silver carp, after waterborne exposure to 1 ppm of Cd, was checked by Cd-hem method and established competitive ELISA. In both cases, the induction of liver MT showed a good increasing relationship with the exposure days. The results indicate that the fish MT can be developed as a useful biomonitoring means in the toxicological study and for the evaluation of water pollution.
Aberrant DNA methylation, as an epigenetic marker of cancer, influences tumor development and progression. We downloaded publicly available DNA methylation and gene expression datasets of matched cancer and normal pairs from the Cancer Genome Atlas Data Portal and performed a systematic computational analysis. This study has three aims to screen genes that show hypermethylation and downregulated patterns in colorectal cancers, to identify differentially methylated regions in one of these genes, SFRP1, and to test whether the SFRP genes affect survival or not. Our results show that 31 hypermethylated genes had a negative correlation with gene expression. Among them, SFRP1 had a differentially methylated pattern at each methylation site. We also show that SFRP1 may be a potential biomarker for colorectal cancer survival.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.