Barley plants growing in the wet paddy field easily encounter suboptimal oxygen concentration in the rhizosphere that causes molecular oxygen deficiency in root cells. The capacity of root cells to utilize energy sources is known to be positively related to resistance to hypoxia stress. This study was conducted to investigate effects of hypoxia on enzymes involved in the starch and sucrose metabolism. Barley seedlings at the third leaf stage were subjected to hypoxia (1 ppm dissolved oxygen) by purging the culture solution with nitrogen gas for up to seven days. The protein content was slightly decreased by hypoxia for 7 days. $\alpha-Amylase$ activities increased significantly in the root but not in the shoot after 3 to 7 days of hypoxia. $\beta-Amylase$ activities were not affected significantly in both tissues. Additionally, sucrose synthase activities were affected little in both tissues by 7 days of hypoxia. The results indicate that root cells activate breakdown of polysaccharide reserves in response to an acute hypoxia to supply energy sources for fermentative glycolysis and cell wall fortification.
Because the biological tissue with inhomogeneous acoustic properties does not keep a particular shape, the measurement of propagation characteristics of ultrasonic fields by the conventional scanning method with a miniature hydrophone is difficult. In this study, a two-dimensional may hydrophone was fabricated using the PVDF (Polyvinylidene fluoride) piezo-electric film and a ultrasonic field measurement system with it was established. For the acoustic field produced by a circular plan transducer with center frequency of 2.25㎒ and 13㎜ in diameter, it was possible to make a fairly accurate field measurement using the hydrophone system. The attenuation coefficients at 2.25 ㎒ for biological tissues were 0.7∼1.3 dB/cm(average; 1.0 dB/cm) in bovine liver, 1.0∼1.8 dB/cm (average; 1.6 dB/cm) in pig liver, 0.9∼2,9 dB/cm(average: 2.1 dB/cm) in bovine muscles, 1.7∼3.3 dB/cm (average; 2.5 dB/cm) in pig muscles.
Kim, Nayoung;Hong, Yourae;Kwon, Doyoung;Yoon, Sukjoon
Genomics & Informatics
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제11권4호
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pp.239-244
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2013
Somatic mutation is a major cause of cancer progression and varied responses of tumors against anticancer agents. Thus, we must obtain and characterize genome-wide mutational profiles in individual cancer subtypes. The Cancer Genome Atlas database includes large amounts of sequencing and omics data generated from diverse human cancer tissues. In the present study, we integrated and analyzed the exome sequencing data from ~3,000 tissue samples and summarized the major mutant genes in each of the diverse cancer subtypes and stages. Mutations were observed in most human genes (~23,000 genes) with low frequency from an analysis of 11 major cancer subtypes. The majority of tissue samples harbored 20-80 different mutant genes, on average. Lung cancer samples showed a greater number of mutations in diverse genes than other cancer subtypes. Only a few genes were mutated with over 5% frequency in tissue samples. Interestingly, mutation frequency was generally similar between non-metastatic and metastastic samples in most cancer subtypes. Among the 12 major mutations, the TP53, USH2A, TTN, and MUC16 genes were found to be frequent in most cancer types, while BRAF, FRG1B, PBRM1, and VHL showed lineage-specific mutation patterns. The present study provides a useful resource to understand the broad spectrum of mutation frequencies in various cancer types.
Background: Light-emitting diodes curing unit (LCU), which emit blue light, is used for polymerization of composite resins in many dentistry. Although the use of LCU for light-cured composite resin polymerization is considered safe, it is still controversial whether it can directly or indirectly have harmful biological influences on oral tissues. The aim of this study was to elucidate the biological effects of LCU in wavelengths ranging from 440 to 490 nm, on the cell viability and secretion of inflammatory cytokines in MDPC-23 odontoblastic cells and inflammatory-induced MDPC-23 cells by lipopolysaccharide (LPS). Methods: The MTT assay and observation using microscope were performed on MDPC-23 cells to investigate the cell viability and cytotoxic effects on LCU irradiation. Results: MDPC-23 cells and LPS stimulated MDPC-23 cells were found to have no effects on cell viability and cell morphology in the LCU irradiation. Nitric oxide (NO) and prostaglandin $E_2$ which are the pro-inflammatory mediators, and interleukin-$1{\beta}$ and tumor necrosis factor-${\alpha}$ (TNF-${\alpha}$) which are the proinflammatory cytokines were significantly increased in MCPD-23 cells after LCU irradiation as time increased in comparison with the control. LCU irradiation has the potential to induce inflammation or biological damages in normal dental tissues, including MDPC-23 cells. Conclusion: Therefore, it is necessary to limit the use of LCU except for the appropriate dose and irradiation time. In addition, LCU irradiation of inflammatory-induced MDPC-23 cells by LPS was reduced the secretion of NO compared to the LPS alone treatment group and was significantly reduced the secretion of TNF-${\alpha}$ in all the time groups. Therefore, LCU application in LPS stimulated MDPC-23 odontoblastic cells has a photodynamic therapy like effect as well as inflammation relief.
Background: The regulation of maternal immunity is critical for the establishment and maintenance of successful pregnancy. Among many cell types regulating the immune system, innate lymphoid cells (ILCs) are known to play an important role in innate immunity. Although some reports show that ILCs are present at the maternalconceptus interface in humans and mice, the expression and function of ILCs in the endometrium have not been studied in pigs. Methods: Thus, we determined the expression, localization, and regulation of ILC markers, CD127 (a common marker for ILCs), BCL11B (a ILC2 marker), and RORC (a ILC3 marker) at the maternal-conceptus interface in pigs. Results: The expression of BCL11B and RORC, but not CD127, in the endometrium changed during pregnancy in a stage-specific manner and the expression of CD127, BCL11B, and RORC was greatest on Day 15 during pregnancy. CD127, BCL11B, and RORC were also expressed in conceptus tissues during early pregnancy and in chorioallantoic tissues during the later stage of pregnancy. BCL11B and RORC proteins were localized to specific cells in endometrial stroma. The expression of CD127 and BCL11B, but not RORC, was increased by the increasing doses of interferon-γ (IFNG) in endometrial explants. Conclusions: These results suggest that ILCs present at the maternal-conceptus interface may play a role in the establishment and maintenance of pregnancy by regulating the innate immunity in pigs.
This paper aims to suggest a policy for biological resource based on a comprehensive understanding on biological resources. Biological resources are different from traditionally recognized viable organisms (Biodiversity) in ecosystems. Biological resources are culturable and replicable resources of living organisms such as tissues, cells and genes. Moreover, biological resources include human-derived biological materials. Biological resources is not simply a matter of science and technology. Biological resources should be dealt with as national resources. There are many international issues regarding biological resources, such as intellectual property rights (IPRs), safety on handling and distribution, material transfer agreements (MTAs) for mutual benefits and biological standards. Ethical debates are also being raised because biological resources are related with human-derived biological materials. Every nation has tendency to adopt its government policies to strengthen its sovereignty on biological resources and international cooperation. In addition, international linkages are essential for providing enhanced worldwide accessibility to biological resources. Japan has shown several international initiatives in the field of biological resources. Korea has just begun to design appropriate policies for the use and R&D of biological resources. Therefore, this paper suggests the following needs: 1) policy at the national level beyond the interests of researchers, 2) inter-ministerial coordination across government ministries, 3) expansion of scope and size of each BRC (Biological Resource Centers), and 4) building networks and systems such as national information center, representative centers by field, and each BRC.
The effect of cryopreservation on extracellular matrix was studied with the ultimate objective of permiting a prediction of the tendency of aorta conduit tissue to calcify following transplantation. Cryopreserved and fresh porcine aorta conduit tissues were extracted using guanidine-hydrochloride (Gdn-HCl) followed by sequential digestion of the tissues with collagenase, elastase, and papain. Glycosaminoglycans (GAGs) of the proteoglycans (PGs) were isolated and quantitated. Gdn-HCl extracted about 61% and 62% of the total GAG (proteoqlycan) material from cryopreserved and fresh tissues, respectively. Collagenasesolubilized proteoglycans from Gdn-HCl extracted tissue represented 20% and 13%, respectively, of the total GAGs present in cryopreserved and fresh tissues. Subsequent elastase hydrolysis of collagenase-digested tissue released about 11% of total GAGs from cryopreserved tissue and 16% from fresh tissue. The remaining 8%, from cryopreserved tissue, and 9%, from fresh tissue, of the total GAGs were obtained after using a papain hydrolysis. There was essentially no difference between fresh and cryopreserved tissues in the relative distribution of proteoglycans in the extracts and digestions except in the initial digestion step where more proteoglycans were obtained from collagenase solubilization of cryopreserved tissue than fresh tissue (p<0.05). The histologic status of the fresh and cryopreserved porcine aortic conduit did not differ markedly. The normal tissue architecture was not affected markedly by the cryopreservation procedure as neither alteration of elastic structure, fibrous proteins nor alteration of nuclear distribution or smooth muscle cell morphology was detected. Quantitative tissue mineral studies revealed that the mean calcium content of the cryopreserved aorta conduit tissue $(165{\pm}3\;{\mu}g/g\;wet\;tissue)$ was higher than that of the fresh tissue $(105{\pm}4\;{\mu}g/g\;wet\;tissue)$$(p<0.05)$. The mean phosphorus content was $703{\pm}35\;{\mu}g$ wet tissue from cryopreserved tissue and $720{\pm}26\;{\mu}g$ wet tissue from fresh tissue. The study indicates that there is no significant alteration in the distribution of PGs in properly cryopreserved tissue, but the total calcium level appears to be increased in tissue cryopreserved by the cryopreservation process used in this study.
Objectives: To explore the expression of aquaporin 1 ($AQP_1$) in bladder uroepithelium cell carcinoma (BUCC) and its relevance to recurrence. Materials and Methods: Tissue samples from 45 BUCC patients who underwent total cystectomy or transurethral resection of bladder tumor (TURBT) and from 40 patients with non-bladder cancers who underwent special detection or treatments were collected. The level of expression of $AQP_1$ in BUCC tissues and normal bladder tissues was assessed by immunohistochemistry so as to analyze the relevance to pathological patterns and time of recurrence in BUCC patients. Results: The expression levels of $AQP_1$ normal bladder tissues and BUCC tissues were $2.175{\pm}0.693$ and $3.689{\pm}0.701$, respectively, and the difference was significant (t=9.99, P<0.0001). Marked increase was noted with BUCC histological grade and pathological stage (P<0.01). Moreover, the expression of $AQP_1$ was evidently higher in cancerous tissues with lymph node metastasis than in those without (P<0.01). With short-term recurrence, the positive cell expression rate of $AQP_1$ was higher in primary tissues, which increased obviously after recurrence. Additionally, the recurrent time of BUCC was negatively associated with the positive cell expression rate of $AQP_1$ and the difference between the expression of $AQP_1$ before and after recurrence (r=-0.843, F=39.302, P=0.000; r=-0.829, F=35.191, P=0.000). Conclusions: $AQP_1$, which reflects the grade, stage, lymph node metastasis and recurrence of BUCC, has potential guiding significance in the diagnosis and treatment of bladder cancarcinoma.
Recent researches have shown that important cellular-based autoprotective mechanisms are mediated by heat-shock proteins(HSPs), also called 'molecular chaperones'. HSPs as molecular chaperones are the primary cellular defense mechanism against damage to the proteome, initiating refolding of denatured proteins and regulating degradation after severe protein damage. HSPs also modulate multiple events within apoptotic pathways to help sustain cell survival following damaging stimuli. HSPs are induced by almost every type of stresses including physical and psychological stresses. Our nervous system in the brain are more vulnerable to stress and damage than any other tissues due to HSPs insufficiency. The normal function of HSPs is a key factor for endogenous stress adaptation of neural tissues. HSPs play an important role in the process of neurodevelopment, neurodegeneration, and neuroendocrine regulation. The altered function of HSPs would be associated with the development of several neuropsychiatric disorders. Therefore, an understanding of HSPs activities could help to improve autoprotective mechanism of our neural system. This paper will review the literature related to the significance of HSPs in neuropsychiatric field.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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