• 한국생물정보학회:학술대회논문집
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• 한국생물정보시스템생물학회 2003년도 제2차 연례학술대회 발표논문집
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• pp.245-250
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• 2003

There are currently about 6000 bacterial species with validly published names, but scientists assume that these may be less than 1% of bacterial species present on the earth. Microbial resource is one of the most important bioresources in bioinderstry and provides us with high economic values. To find missing ones, the studies of metagenome, metabolome, and proteome about microbes have started recently in developed countries. We construct the information system that integrates information on microbial genome resources and manages the information to support efficient research of microbial genome application, and name this system 'Bio-Meta Information System (Bio-MIS)'. Bio-MIS consists of integrated microbial genome resources database, microbial genome resources input system, integrated microbial genome resources search engine, microbial resources on-line distribution system, portal service and management via internet. In the future, we will include public database connection and implement useful bioinformatics software for analyzing microbial genome resources. The web-site is accessible at http://biomis.probionic.com

• 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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• 제13권7호
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• pp.433-441
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• 2007

바이오센서는 생명공학 또는 의학 분야에서 사용되는 인간의 생체 신호를 감지할 수 있는 센서들로 의료기기에 주로 사용되는데, 최근 MEMS 기술의 발달로 작은 크기의 하드웨어에 센서 인터페이스, 프로세서, 무선통신, 배터리 등을 포함한 모듈을 센서노드(모트 : Mote)들로 구성된 센서기반 네트워크에서 바이오센서 네트워크로 응용분야를 확장하고 있다. 이에 본 논문에서는 바이오센서 기술과 센서네트워크 기술을 융합한 기술인 바이오 센서네트워크를 활용한 응급 구조 시스템의 설계 및 구현을 제안한다. 제안된 시스템에 사용된 바이오센서는 근전도(EKG), 혈압(Blood Pressure), 맥박(Heart Rate), 산소포화도(Pulse Oximeter), 혈당(Glucose)센서들로, 바이오센서에서 측정된 생체 신호를 센서네트워크 모트를 통해 데이타를 수집하고, 수집된 데이타를 이용하여 건강관리 측정 데이타로 활용하였으며 측정된 데이터는 무선단말기(PDA, 휴대폰), 전자액자 디스플레이장치 등에서 확인 가능하도록 구성하였다. 아울러, 제안한 u- 응급 구조 시스템의 유효성을 실험하기 위해서 사용자의 바이탈사인 정보와 주변 환경정보를 고려한 실험을 수행하였다.

• 미술이론과 현장
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• 제15호
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• pp.137-165
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• 2013

The prefix 'bio' with the meaning of 'life,' has been used for biotechnology, biochemistry, bioengineering, biomedicine, bioethics, bio-information as well as 'bio art' since 1990s. Bio art is an art as life itself and a kind of new direction in contemporary art that manipulates the processes of life. Bio artists use the properties of life and materials as scientists in laboratory of biology, and change organisms within their own species, of invents life with new characteristics. Technologically and socio-culturally, bio art has been connected with bioengineering. This essay is on the bio art that use vegetables, and on the specified gaze of so-called 'Sci-Artists.' Not only the genetically modified vegetables like works of George Gessert, Ackroyd & Harvey, and Eduardo Kac, but also the works made from the critical viewpoint like those of Paul Vanouse, Natalie Jeremijenko, and Amy Youngs, have 'the molecular gaze'(Suzanne Anker and Dorothy Nelkin's concept) of the genetic age in their art works. As the art history have showed, artists' gazes have insights about social problems that surround us. Bioartists' gazes reveal their insights about social and ethical problems, possibly concealed by science itself. Those problems are about results from practical discoveries of the sequencing of the genome, genetic engineering, cloning and reproduction of human and animals, body transformation, and the commercialization of cell and genes etc. We can find the significance of bioart in the molecular gaze about those problems, and we can rethink the identity of human, the reception of social influences from bio-technology and medicine.

• 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지
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• 제22권4호
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• pp.195-200
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• 2016

스마트 워치, 스마트 밴드 같은 웨어러블 디바이스가 개발됨에 따라, 웨어러블 디바이스 사용자의 건강상태를 측정할 수 있는 생체신호 모니터링 기술이 각광 받고 있다[1]. 하지만 한 개의 웨어러블 디바이스에서 여러 가지 생체신호를 측정하기 위해 웨어러블 디바이스에 여러 가지 생체신호 센서를 내장하게 되면 디바이스 자체 크기와 같은 제한적인 자원 측면에서 문제가 발생한다. 또한 새로운 생체신호 센서를 추가 할 때 문제가 발생한다. 본 논문에서는 웨어러블 디바이스 사용자의 요청이 있을 때 가속도 센서, ECG 센서, PPG 센서를 Cradle형태의 모듈에서 동작시킨 후 사용한 센서에서 측정되는 생체 신호를 실시간으로 수집하여 다른 웨어러블 디바이스로 전송할 수 있는 플러그인(Plug-in) 모듈인 Bio-Cradle을 제안한다. Bio-Cradle은 다른 웨어러블 디바이스에 플러그인하면, 디바이스의 종류에 무관하게 동기화 된 다수 생체신호를 전송할 수 있다. 즉 Bio-Cradle을 사용함으로써, 다수 생체신호의 동시 측정이 가능해지고, 웨어러블 디바이스 내부에 생체신호 센서를 내장 할 필요가 없어진다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제35권6호
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• pp.575-584
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• 2019

Colletotrichum acutatum is a species complex responsible for anthracnose disease in a wide range of host plants. Strain C. acutatum KC05, which was previously isolated from an infected pepper in Gangwon Province of South Korea, was reidentified as C. scovillei using combined sequence analyses of multiple genes. As a prerequisite for understanding the pathogenic development of the pepper anthracnose pathogen, we optimized the transformation system of C. scovillei KC05. Protoplast generation from young hyphae of KC05 was optimal in an enzymatic digestion using a combined treatment of 2% lysing enzyme and 0.8% driselase in 1 M NH₄Cl for 3 h incubation. Prolonged incubation for more than 3 h decreased protoplast yields. Protoplast growth of KC05 was completely inhibited for 4 days on regeneration media containing 200 ㎍/ml hygromycin B, indicating the viability of this antibiotic as a selection marker. To evaluate transformation efficiency, we tested polyethylene glycol-mediated protoplast transformation of KC05 using 19 different loci found throughout 10 (of 27) scaffolds, covering approximately 84.1% of the entire genome. PCR screening showed that the average transformation efficiency was about 17.1% per 100 colonies. Southern blot analyses revealed that at least one transformant per locus had single copy integration of PCR-screened positive transformants. Our results provide valuable information for a functional genomics approach to the pepper anthracnose pathogen C. scovillei.

• 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
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• 제2권2호
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• pp.97-106
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• 2013

인간 게놈 프로젝트의 완성 이후 유전체 분석 비용은 매우 빠르게 감소하고 있다. 이에 따라 인간 유전체 분석 요구가 급증할 것으로 예상된다. 인간 유전체 분석과 같은 대규모 바이오 데이터 분석을 고속으로 수행하기 위해서는 비IT 전문가들이 다양한 특성의 바이오 응용들을 고성능컴퓨팅 시스템을 통해 효과적으로 실행할 수 있어야 한다. 이를 위해서는 여러 응용들이 조합되어 순서를 갖고 실행되어야 하는 바이오 응용들을 워크플로우 형태로 쉽게 정의할 수 있어야 하며, 이 워크플로우를 HPC 클러스터 시스템에서 최적 자원을 할당 받아 분산 병렬 수행시켜야 한다. 이를 통해 바이오 데이터 분석 성능과 응답시간의 개선을 기대할 수 있다. 본 논문에서는 HPC 환경에 익숙하지 않은 비IT 바이오 연구자들이 쉽게 바이오 데이터 분석을 할 수 있도록 바이오 워크플로우를 쉽게 정의하고 실행할 수 있는 바이오 특화된 워크플로우 기반 대규모 데이터 분석 시스템을 제안한다.

• 한국수산과학회지
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• 제46권1호
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• pp.1-9
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• 2013

Fisheries' biological resources were considered public resources before the 1990s. Every country could access and use these resources without regulation. However, the United Nations adopted the Convention on Biological Diversity and the privileges and rights to these resources were attributed to countries. This research starts with the research background and social and academic value of "The Jasan Eobo (or Report on Marine Organisms in the Coastal Waters near Heuksan Island)" by Jeong Yak-Jeon, who pioneered the new field of Fisheries Science and Marine Biology in Korea in the early 1800s. We also searched for recent results from the Marine Bio-Diversity Research Activities of the Korean National Council for Conservation of Nature (KNCCN) and the Ministry of Maritime Affairs and Fisheries (MOMAF). KNCCN reported that marine bio-diversity comprised approximately 6,500 species in 1996, and the Ministry of Maritime Affairs and Fisheries reported there were about 10,000 species in 2007. Among these marine species, plankton account for about 25%, seaweeds 11%, invertebrates 52%, and vertebrates 12% in Korean Coastal Areas. The Ministry for Food, Agriculture, Forestry, and Fisheries (MIFAFF) enacted a law for Agriculture and Fisheries Resources Management in 2012; this law includes the preservation of marine ecosystems, the conservation of wetlands and the preservation of fisheries resources, and describes the boundary of taxonomy for new species and unknown species that could be identified in the near future. To follow the new regulation for Access to General Resources and Benefit-Sharing, this research suggests (1) the importance of taxonomy for new species and unknown species as a goal of "No Name = No Information", (2) integrated research on bio-diversity, species distributions and the abundance of fisheries resources, both in local areas and in Korean Coastal Areas, and (3) the observance of international regulations or agreements for benefit-sharing without additional damage in the future.

• 한국컴퓨터정보학회논문지
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• 제15권10호
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• pp.105-112
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• 2010

의료 분야의 감성 및 심리 치료를 확장하여 이와 관련된 기술을 일반 생활에 접목하고, 또한 생체신호를 이용하여 보다 쾌적한 삶의 환경을 구축하려는 연구가 활발하게 진행되고 있다. 본 논문에서는 뇌전도(EEG : electroencephalogram)와 심전도(ECG : electrocardiogram)의 심박변이도(HRV : Heart Rate Variability)의 패턴을 분석하여 평온, 집중, 긴장, 우울의 네 가지 감성을 분류하고 추론하기 위한 감성추론시스템을 설계하고 구현하였다. 많은 감성 인식 연구가 얼굴이나 음성의 인식에 의하여 이루어지고 있으며, 생체신호를 이용한 추론 연구의 경우에도, 뇌전도나 심전도 등의 단일 생체신호의 분석에 의하여 이루어지고 있다. 본 논문에서는 단일 생체신호가 아닌 뇌전도와 심전도신호를 조합하여 복합적으로 분석함으로서 단일 생체신호의 분석 연구보다 추론의 정확도를 높였으며, 감성 추론을 위한 엔진으로지도 학습과 비지도학습의 RBFN(Radial Basis Function Network) 신경망을 적용하여 오류역전파 알고리즘의 지역 최소점과 수렴속도가 느린 단점을 보완하였다.

• Agricultural and Biosystems Engineering
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• 제5권1호
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• pp.1-4
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• 2004

Community-based precision farming is a new concept of agricultural systems, which leads to organize groups of wise farmers and technology platforms in Japan. The wisdom farmers create a rational farming system to manage hierarchical variability: variability in farmers' community as well as variability of within-field and between-field. The technology platform develops and provides three key-technologies: mapping technology, variable-rate technology, and decision support systems available for rural constraints. Advancement of bio-production robots leads precision farming to the next level, where two technological innovations: how to produce and manage information-oriented fields and information-added products, can be attained.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제35권8호
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• pp.2585-2588
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• 2014