Gly-224 residue of yeast alcohol dehydrogenase was mutated by site-directed mufagenesis to isoleucine, which is the corresponding amino acid residue of horse liver alcohol dehydrogenase. The mutated gene on M13 vector was subcloned in YEp13 and used to transform Saccharomyces cerevisiae 302-21 #2 strain, and the expressed protein was purified. The tumover numbers of mutant enzyme for ethanol and acetaldehyde were decreased copared to wild-type enzyme. The results of product inhibition studies indicated that the reaction mechanism was changed to Iso Theorell-Chance from Ordered Bi Bi. We supposed that Gly-224 was related to the enzyme reaction mechanism.
The kinetic constants and the reaction mechanism of the K228G mutant horse liver alcohol dehyrogenase isoenzyme E (HLADH-E) were compared to the wild-type enzyme. All the Km and Ki constants of the mutant enzyme for NAD+, ethanol, acetaldehyde and NADH were larger than those of the wild-type enzyme. The dissociation constants for the NADH and $NAD^{+}$ (Kiq and Kia) were greatly increased by 130-and 460-fold, respectively. The product inhibition patterns suggested that the reaction mechanism of the mutant enzyme was changed to Random Bi Bi. These results could attribute to the increase in the dissociation rate of coenzyme with the substitution at Lys-228 residue.
Saccharomyces cerevisiae에서 얻은 purine nucleoside phosphorylase (PNP)의 반응 기작을 밝히기 위해 반응속도론적 분석이 수행되어졌다. 반응기작에 PNP${\cdot}$phosphate와 PNP${\cdot}$ribose 1-phosphate의 binary complex가 형성되는 것으로 추정되어진다. Initial velocity와 product inhibition study의 결과는 반응이 ordered bi, bi reaction으로 일어난다는 것과 일치하고 있다. 두 개의 기질중 무기인산이 효소에 먼저 붙고, 그 다음에 nucleoside, 그리고 base가 효소를 떠나는 첫 번째 생성물이고 마지막으로 ribose 1-phosphate가 생성되고 효소는 원래의 상태로 돌아간다. 반응속도론적 분석에 이해 제안된 작용기작은 sulfhydryl reagents인 p-chloromercuribenzoate(PCMB) and 5,5'-dithiobisnitrobenzoate (DTNB)에 의한 효소의 불활성화에 대한 기질으 보호작용의 결과와 일치하고 있다. PNP는 ribose 1-phosphate와 phosphate에 의해 보호되지만 nucleoside나 base에 의해서는 아무런 효과과 없다는 사실은 반응 순서가 효소에 무기인산이 먼저 붙는 ordered bi, bi 기작이라는 것을 지지하고 있다. PCMB 나 DTNB에 의해 불활성화된 PNP는 dithiothreitol(DTT)에 의해서는 활성이 완전히 회복되고 2-mercaptoethanol에 의해서는 77%의 활성이 회복된다는 사실은 효소의 불활성화가 가역적이라는 것을 시사하고 있다. PCMB에 의해 불활성화된 효소는 inosine이 변화하는 기질일때 정상효소보다 높은 $K_m$과 낮은 $V_m$ 값을 보여주고 이런 현상은 DTT 처리시 원래의 상태로 돌아온다. DTNB에 의해 불활성화된 효소는 PCMB 처리시와 비슷하게 정상효소보다 높은 $V_m$ 값을 보이지만 $V_m$ 값은 큰 변화가 없다. S. cerevisiae PNP에서 발견되는 높은 무기인산의 농도에서의 하위단위체간의 음성적 협동성이 PCMB나 DTNB를 처리한 PNP에서는 보이지 않았다.
Ile-269 in horse liver alcohol dehydrogenase isoenzyme S(HLADH-S) was mutated to serine by phosphorothioate-based site-directed mutagenesis in order to study the role of the residue in coenzyme binding. The specific activity of the mutant(1269S) enzyme to ethanol was increased 49-fold. All turnover numbers of 1269S enzyme toward 9 primary alcohols were increased. The mutant enzyme showed 3.6, 4.6, 11.6-fold higher catalytic efficiency for $5{\beta}$-androstane-3, 17-dione, $5{\beta}$-cholanic acid-3-one and retinal than wild-type, respectively. The reaction mechanism of 1269S enzyme was ordered bi bi as wild-type's. These results indicate that the hydrophobic interaction of Ile-269 residue with coenzyme plays an important role in dissociation of coenzyme from enzyme-coenzyme complex, which has been known as the rate limiting step of ADH reaction.
The engineered Aspergillus oryzae has a high NADPH demand for xylose utilization and overproduction of target metabolites. Glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PDH, E.C. 1.1.1.49) is one of two key enzymes in the oxidative part of the pentose phosphate pathway, and is also the main enzyme involved in NADPH regeneration. The open reading frame and cDNA of the putative A. oryzae G6PDH (AoG6PDH) were obtained, followed by heterogeneous expression in Escherichia coli and purification as a his6-tagged protein. The purified protein was characterized to be in possession of G6PDH activity with a molecular mass of 118.0 kDa. The enzyme displayed maximal activity at pH 7.5 and the optimal temperature was $50^{\circ}C$. This enzyme also had a half-life of 33.3 min at $40^{\circ}C$. Kinetics assay showed that AoG6PDH was strictly dependent on $NADP^+$ ($K_m=6.3{\mu}M$, $k_{cat}=1000.0s^{-1}$, $k_{cat}/K_m=158.7s^{-1}{\cdot}{\mu}M^{-1}$) as cofactor. The $K_m$ and $k_{cat}/K_m$ values of glucose-6-phosphate were $109.7s^{-1}{\cdot}{\mu}M^{-1}$ and $9.1s^{-1}{\cdot}{\mu}M^{-1}$ respectively. Initial velocity and product inhibition analyses indicated the catalytic reaction followed a two-substrate, steady-state, ordered BiBi mechanism, where $NADP^+$ was the first substrate bound to the enzyme and NADPH was the second product released from the catalytic complex. The established kinetic model could be applied in further regulation of the pentose phosphate pathway and NADPH regeneration of A. oryzae to improve its xylose utilization and yields of valued metabolites.
Kinetic studies were done to elucidate the reaction mechanism of purine nucleoside phosphorylase (PNP) in Micrococcus Luteus. PNP catalyzes the reversible phosphorolysis of ribonucleosides to their respective base. The effect of alternative competing substrates suggested that a single enzyme was involved in binding to the active site for all purine nucleosides, inosine, deoxyiosine, guanosine, deoxyguanosine, adenosine and deoxyadenosine. Affinity studies showed that pentose moiety reduced the binding capacity and methylation of ring N-1 of inosine and guanosine had little effect on binding to bacterial enzyme, whereas these compounds did not bind to the mammalian enzymes. The initial velocity and product inhibition studies demonstrated that the predominant mechanism of reaction was an ordered bi, bi reaction. The nucleoside bound to the enzyme first, followed by phosphate. Ribose 1-phosphate was the first product to leave, followed by base.
본 연구에서는 글루코스 검출을 위한 HRP (horseradish peroxidase)와 GOD (glucose oxidase)를 혼합한 형태의 다중 효소 반응 바이오센서 개발연구를 수행하였다. 바이오센서는 제작 시간 단축을 위하여 전기전착법을 이용하여 제작하였으며, 경제적인 센서 제작을 위하여 SPE (screen printed electrode)를 사용하였다. 다중 효소 바이오센서의 효과를 확인하기 위하여 단일 효소 바이오센서를 제작하여 비교 및 분석하였다. 센서의 특성을 평가하기 위해서 주사전자현미경(scanning electron microscopy, SEM), 순환전위법(cyclic voltammetry, CV), 전기화학적 임피던스 분광법(electrochemical impedance spectroscopy, EIS), 시간대전류법(chronoamperometry, CA), 흐름 주입분석법(flow injection analysis, FIA)를 수행하였다. SEM, CV, EIS의 분석결과로부터 효소가 전극 표면에 고정화가 잘 된 것을 확인하였고, CA로부터 제작된 다중 효소 바이오센서가 단일 효소 바이오센서에 비해 신호성능이 200% 향상된 것을 확인하였다. 이로부터 HRP와 GOD가 서로 촉매적으로 반응한다는 것을 설명할 수 있었다. 또한, FIA의 결과에서 동일한 농도의 글루코스 용액을 4회 나누어 주입하였을 때, 전류신호량이 일정함을 확인하였고, 농도에 따른 전류신호량을 분석하여 신호민감성, 재현성, 안정성 등이 우수함을 설명할 수 있었다.
G. melanogenus로부터 분리한 폴리올 탈수소 효소는 이미 알려진 바의 다른 폴리올 탈수소 효소와는 달리 조효소로서 2,6-dichlorophenolindophenol (DPIP)와 같은 인위적 전자 수용체를 필수로 요구하고 있음으로 이 특수 효소의 반응메카니즘을 반응속도론적 연구를 통하여 규명코저 시도하였으며, 폴리올 산화반응에 대한 초기속도 측정실험과 효소반응 산물인 케토산에 의한 저해 실험을 통하여 이 반응은 Ping-Pong Bi-Bi형의 반응메카니즘으로 진행됨을 확인하였다. 따라서 두 기질 즉 포리올로서 D-mannitol 및 전자수용체로 DPIP가 효소에 의하여 반응이 진행될 경우 D-mannitol이 우선 효소와 작용하며 첫 반응산물로서 해당하는 케토산인 D-fructose가 생성될 것으로 기대되며 이 반응이 전체 반응속도를 조절하는 과정일 것이라고 추측하였다.
In order to observe clinical effects of Kwi-Bi-Tang(歸脾湯) and Sa-Mul-An-Shin-Tang(四物安神湯), I reached following conclusion through the physiochemical investigation the following results obtained. 1)In serum Lipid, only Total cholesterol is significantly decresed in medication group of Kwi-Bi-Tang(歸脾湯), but is not in the medicaton of Sa-Mul-An-Tang(四物安神湯). 2). The value of Cardiac enzyme is remarkably decreased in the medication group of Kwi-Bi-Tang(歸脾湯), Only AST is significantly decresed in the medication group of Sa-Mul-An-Tang(四物安神湯). 3) In determination of LDH isoenzyme, LDI is significantly decrease both in the medication group of Kwi-Bi-Tang(歸脾湯) and Sa-Mul-An-Shin-Tang(四物安神湯). Especially, LDI is remarkably decreased in the medication group of Kwi-Bi-Tang(歸脾湯). In view of the results so far achieved, we knew that Kwi-Bi-Tnag(歸脾湯) and Sa-Mul-An-Shin_Tang(四物安神湯) had improved ischemic condition of cardiac muscle, specially, Kwi-Bi-Tnag(歸脾湯) was significant compared to Sa-Mul-An-Shin-Tang(四物安神湯).
The antioxidant potential and enzyme activities in Salicornia herbacea, Corylopsis coreana, Erythronium japonicum, Phragmites communis, Momordica Charantia, Nelumbo nucifera, Salvia plebeia, Portulaca oleracea, Ficus carica, Citrus junos and Cornus officinalis were determined. Their antioxidant activities were measured using DPPH radical scavenging and nitrite scavenging activity. Enzyme activities in investigated plants were evaluated as superoxide dismutase (SOD), catalase (CAT), peroxidase (POD), and ascorbate peroxidase (APX). The DPPH scavenging rate from 100 to 2500 $mgL^{-1}$ was the highest in the flower of Corylopsis coreana. However, it was not detected in most of the samples at concentration below 100 $mgL^{-1}$. The nitrite scavenging activity according to each kind of resource plants was significantly higher in the stem of Corylopsis coreana and leaf of Nelumbo nucifera. The root extract of Erythronium japonicum had the highest SOD enzyme activity of 94.0% while leaf of Salvia plebeia showed the lowest SOD enzyme activity of 30.4%. The activity of CAT and APX showed higher values in the stem of Corylopsis coreana, root of Erythronium japonicum and root of Phragmites communis in comparison with other plants. The activity of POD showed significantly high values in stem of Corylopsis coreana, Momordica Charantia and pericarp of Citrus junos extracts. The antioxidant enzyme activities differ significantly in different plants. In conclusion, we showed that Corylopsis coreana, Erythronium japonicum Cornus officinalis, and Momordica Charantia had the potent biological activities. Therefore, these plant resources showing antioxidant activity could be good materials for development of source of functional healthy food.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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