• 제목/요약/키워드: Bayesian information

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Determination of Genetic Diversity Using 15 Simple Sequence Repeats Markers in Long Term Selected Japanese Quail Lines

  • Karabag, Kemal;Balcioglu, Murat Soner;Karli, Taki;Alkan, Sezai
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권12호
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    • pp.1696-1701
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    • 2016
  • Japanese quail is still used as a model for poultry research because of their usefulness as laying, meat, and laboratory animals. Microsatellite markers are the most widely used molecular markers, due to their relative ease of scoring and high levels of polymorphism. The objective of the research was to determine genetic diversity and population genetic structures of selected Japanese quail lines (high body weight 1 [HBW1], HBW2, low body weight [LBW], and layer [L]) throughout 15th generations and an unselected control (C). A total of 69 individuals from five quail lines were genotyped by fifteen microsatellite markers. When analyzed profiles of the markers the observed ($H_o$) and expected ($H_e$) heterozygosity ranged from 0.04 (GUJ0027) to 0.64 (GUJ0087) and 0.21 (GUJ0027) to 0.84 (GUJ0037), respectively. Also, $H_o$ and $H_e$ were separated from 0.30 (L and LBW) to 0.33 (C and HBW2) and from 0.52 (HBW2) to 0.58 (L and LBW), respectively. The mean polymorphic information content (PIC) ranged from 0.46 (HBW2) to 0.52 (L). Approximately half of the markers were informative ($PIC{\geq}0.50$). Genetic distances were calculated from 0.09 (HBW1 and HBW2) to 0.33 (C and L). Phylogenetic dendrogram showed that the quail lines were clearly defined by the microsatellite markers used here. Bayesian model-based clustering supported the results from the phylogenetic tree. These results reflect that the set of studied markers can be used effectively to capture the magnitude of genetic variability in selected Japanese quail lines. Also, to identify markers and alleles which are specific to the divergence lines, further generations of selection are required.

스피어피싱 메일 필터링 보안 기능 분석 : 기업메일 호스팅 서비스 중심으로 (Spear-phishing Mail Filtering Security Analysis : Focusing on Corporate Mail Hosting Services)

  • 신동천;염다연
    • 융합보안논문지
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    • 제20권3호
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    • pp.61-69
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    • 2020
  • 스피어피싱 메일 공격은 특정 대상의 정보를 지속적으로 수집하여 이용하므로 지능적이고 새로운 공격 유형인 APT 공격이나 사회공학적 공격의 일환으로 공격 대상에 미치는 영향이 매우 크다. 스피어피싱 메일은 공격 대상, 목적, 수단 등이 스팸메일과 다르므로 보편적인 스팸메일 필터링 서비스 기능으로는 대응에 한계가 있다. 본 논문에서는 상대적으로 보안성이 취약한 중소기업을 대상으로 호스팅 메일 서비스를 제공하는 기업의 메일 보안 기능이 스피어피싱 메일 공격에 대응할 수 있는지를 분석한다. 분석 결과에 따르면, 스피어피싱 메일 공격 방식이 다양해짐에도 불구하고 제공하고 있는 메일 보안 서비스는 스팸메일을 포함한 메일 관리 수준에 머물러 있다고 판단할 수 있다. 분석 결과는 스피어피싱 메일 공격에 대한 체계적이고 효과적인 대응방안 도출을 위한 기초로 활용될 수 있다.

Facial profile parameters and their relative influence on bilabial prominence and the perceptions of facial profile attractiveness: A novel approach

  • Denize, Erin Stewart;McDonald, Fraser;Sherriff, Martyn;Naini, Farhad B.
    • 대한치과교정학회지
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    • 제44권4호
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    • pp.184-194
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    • 2014
  • Objective: To evaluate the relative importance of bilabial prominence in relation to other facial profile parameters in a normal population. Methods: Profile stimulus images of 38 individuals (28 female and 10 male; ages 19-25 years) were shown to an unrelated group of first-year students (n = 42; ages 18-24 years). The images were individually viewed on a 17-inch monitor. The observers received standardized instructions before viewing. A six-question questionnaire was completed using a Likert-type scale. The responses were analyzed by ordered logistic regression to identify associations between profile characteristics and observer preferences. The Bayesian Information Criterion was used to select variables that explained observer preferences most accurately. Results: Nasal, bilabial, and chin prominences; the nasofrontal angle; and lip curls had the greatest effect on overall profile attractiveness perceptions. The lip-chin-throat angle and upper lip curl had the greatest effect on forehead prominence perceptions. The bilabial prominence, nasolabial angle (particularly the lower component), and mentolabial angle had the greatest effect on nasal prominence perceptions. The bilabial prominence, nasolabial angle, chin prominence, and submental length had the greatest effect on lip prominence perceptions. The bilabial prominence, nasolabial angle, mentolabial angle, and submental length had the greatest effect on chin prominence perceptions. Conclusions: More prominent lips, within normal limits, may be considered more attractive in the profile view. Profile parameters have a greater influence on their neighboring aesthetic units but indirectly influence related profile parameters, endorsing the importance of achieving an aesthetic balance between relative prominences of all aesthetic units of the facial profile.

그리드 단체 위의 디리슐레 분포에서 마르코프 연쇄 몬테 칼로 표집 (MCMC Algorithm for Dirichlet Distribution over Gridded Simplex)

  • 신봉기
    • 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지
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    • 제21권1호
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    • pp.94-99
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    • 2015
  • 비모수 베이스 통계학, 확률적 표집에 기반한 추론 등이 기계학습의 주요 패러다임으로 등장하면서 디리슐레(Dirichlet) 분포는 최근 다양한 그래프 모형 곳곳에 등장하고 있다. 디리슐레 분포는 일변수 감마 분포를 벡터 분포로 확장한 형태의 하나이다. 본 논문에서는 감마 분포를 갖는 임의의 자연수 X를 K개의 자연수의 합으로 임의 분할 할 때 각 부분의 크기 비율을 디리슐레 분포에서 표집하는 방법을 제안한다. 일반적으로 디리슐레 분포는 연속적인 (K-1)-단체(simplex) 위에 정의 되지만 자연수로 분할하는 표본은 자연수라는 조건 때문에 단체 내부의 이산 그리드 점에만 정의된다. 본 논문에서는 단체 위의 그리드 상의 이웃 점들의 확률 분포로부터 마르코프연쇄 몬테 칼로(MCMC) 제안 분포를 정의하고 일련의 표본들의 마르코프 연쇄를 구현하는 알고리듬을 제안한다. 본 방법은 마르코프 모델, HMM 및 준-HMM 등에서 각 상태별 시간 지속 분포를 표현하는데 활용 가능하다. 나아가 최근 제안된 전역-지역(global-local) 상태지속 분포를 동시에 모형화하는 감마-디리슐레 HMM에도 응용가능하다.

진화연산과 적응적 ${\alpha}$-cut 기반 평가를 이용한 유전자 발현 데이타의 퍼지 클러스터 분석 (Fuzzy Cluster Analysis of Gene Expression Profiles Using Evolutionary Computation and Adaptive ${\alpha}$-cut based Evaluation)

  • 박한샘;조성배
    • 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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    • 제33권8호
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    • pp.681-691
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    • 2006
  • 유전자 데이타의 클러스터링은 방대한 유전자 정보를 발현 정도에 따라 비슷한 그룹으로 나누어 분석하는 방법으로 유전자의 기능을 분석하는데 사용되어 왔다. 클러스터링의 한 종류인 퍼지 클러스터링은 하나의 샘플이 소속정도에 따라 여러 그룹에 동시에 소속되도록 나누는 방법으로, 하나의 유전자 데이타는 여러가지 유전 정보를 가칠 수 있기 때문에 유전자 발현 데이타의 분석에 보다 적절한 방법이다. 그러나 보통 클러스터링 방법은 초기 값에 민감하고, 지역해에 빠질 수 있는 단점을 갖는다. 이런 단점을 해결하기 위해 본 논문에서는 진화 연산을 이용한 퍼지 클러스터링 방법을 제안한다. 이때, 적합도 평가를 위해서 모든 데이타에 대해 동일한 기준을 적용하는 베이지안 검증방법의 단점을 개선하여, 데이타의 특성 을 고려하여 결정된 적용적 ${\alpha}$-cut 기반 평가방법을 사용한다. SRBCT 데이타와 효모 세포주기 데이타를 이용해 실험을 하고 결과를 분석하여 제안하는 방법의 유용성을 확인하였다.

다중 동적 위상보존 자기구성 지도의 결합을 통한 필기숫자 데이타의 분류율 향상 (Improvement of Classification Rate of Handwritten Digits by Combining Multiple Dynamic Topology-Preserving Self-Organizing Maps)

  • 김현돈;조성배
    • 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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    • 제28권12호
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    • pp.875-884
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    • 2001
  • 자기 구성지도는 데이타 시각화, 위상보존 매핑 등의 분야에서 널리 사용되고 있지만. 학습이 되기 전에 위상을 미리 고정시켜야 하기 때문에 실제 문제에 적용하기 어렵다는 것과 클러스터링 능력에 비해 분류율이 낮다는 결점이 있다. 이를 해결하기 위해서 자기구성 지도의 출력 노드를 동적으로 분화하고 분화된 노드를 파습하는 동적 위상보존 사기구성 지도를 제안하고, 이를 다중 결합함으로써 분류율을 향상 시켰다. 동적 위상보존 자기구성 지도의 결함 방법으로는 자기구성 지도의 K개 노드가 출격을 내도록하는 K-Winner 방법 및 K-Winner+ 가중치 방법이 제안되었는데, 이는 다수결 투표, 가중치, BKS, Byayesian, Borda, Condorect, 신뢰값 합산 등의 기존 결합 방법보다도 우수한 결과를 나타내었다. 동적 위상보존 자기 구성 지도를 통해서 위상을 고정 시켜야 하는 결점을 해결할 수 있었고. 서로 다른 특징으로 학습된 동적 위상보존 자기구성 지도들을 결합하여 분류 능력을 향상시킬 수 있었다. 필기 숫자데이타로. 실험한 결과, 제안한 방법이 자기구성 지도의 결점을 효과적으로 해결하여 98.1% 의 높은 인식률을 보였다.

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Extensive Lymph Node Dissection Improves Survival among American Patients with Gastric Adenocarcinoma Treated Surgically: Analysis of the National Cancer Database

  • Naffouje, Samer A.;Salti, George I.
    • Journal of Gastric Cancer
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    • 제17권4호
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    • pp.319-330
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    • 2017
  • Introduction: The extent of lymphadenectomy in the surgical treatment of gastric cancer is a topic of controversy among surgeons. This study was conducted to analyze the American National Cancer Database (NCDB) and conclude the optimal extent of lymphadenectomy for gastric adenocarcinoma. Methods: The NCDB for gastric cancer was utilized. Patients who received at least a partial gastrectomy were included. Patients with metastatic disease, unknown TNM stages, R1/R2 resection, or treated with a palliative intent were excluded. Joinpoint regression was used to identify the extent of lymphadenectomy that reflects the optimal survival. Cox regression analysis and Bayesian information criterion were used to identify significant survival predictors. Kaplan-Meier was applied to study overall survival and stage migration. Results: 40,281 patients of 168,377 met the inclusion criteria. Joinpoint analysis showed that dissection of 29 nodes provides the optimal median survival for the overall population. Regression analysis reported the cutoff ${\geq}29$ to have a better fit in the prognostic model than that of ${\geq}15$. Dissection of ${\geq}29$ nodes in the higher stages provides a comparable overall survival to the immediately lower stage. Nonetheless, the retrieval of ${\geq}15$ nodes proved to be adequate for staging without a significant stage migration compared to ${\geq}29$ nodes. Conclusion: The extent of lymphadenectomy in gastric adenocarcinoma is a marker of improved resection which reflects in a longer overall survival. Our analysis concludes that the dissection of ${\geq}15$ nodes is adequate for staging. However, the dissection of 29 nodes might be needed to provide a significantly improved survival.

Operational modal analysis of a long-span suspension bridge under different earthquake events

  • Ni, Yi-Qing;Zhang, Feng-Liang;Xia, Yun-Xia;Au, Siu-Kui
    • Earthquakes and Structures
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    • 제8권4호
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    • pp.859-887
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    • 2015
  • Structural health monitoring (SHM) has gained in popularity in recent years since it can assess the performance and condition of instrumented structures in real time and provide valuable information to the asset's manager and owner. Operational modal analysis plays an important role in SHM and it involves the determination of natural frequencies, damping ratios and mode shapes of a constructed structure based on measured dynamic data. This paper presents the operational modal analysis and seismic response characterization of the Tsing Ma Suspension Bridge of 2,160 m long subjected to different earthquake events. Three kinds of events, i.e., short-distance, middle-distance and long-distance earthquakes are taken into account. A fast Bayesian modal identification method is used to carry out the operational modal analysis. The modal properties of the bridge are identified and compared by use of the field monitoring data acquired before and after the earthquake for each type of the events. Research emphasis is given on identifying the predominant modes of the seismic responses in the deck during short-distance, middle-distance and long-distance earthquakes, respectively, and characterizing the response pattern of various structural portions (deck, towers, main cables, etc.) under different types of earthquakes. Since the bridge is over 2,000 m long, the seismic wave would arrive at the tower/anchorage basements of the two side spans at different time instants. The behaviors of structural dynamic responses on the Tsing Yi side span and on the Ma Wan side span under each type of the earthquake events are compared. The results obtained from this study would be beneficial to the seismic design of future long-span bridges to be built around Hong Kong (e.g., the Hong Kong-Zhuhai-Macau Bridge).

NHPP 소프트웨어 신뢰도 모형에 대한 모수 추정 비교 (The Comparison of Parameter Estimation for Nonhomogeneous Poisson Process Software Reliability Model)

  • 김희철;이상식;송영재
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제11D권6호
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    • pp.1269-1276
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    • 2004
  • 본 논문에서는 기존의 소프트웨어 신뢰성 모형인 Goel-Okumoto 모형과 Yamada-Ohba-Osaki 모형을 재조명하고 또, 랄리 분포를 이용한 랄리 모형을 적용하여 모수 추정방법을 연구하였다. 본 연구에서는 기존의 최우추정법과 잠재변수를 도입하여 깁스 샘플링(Gibbs sampling)을 이용한 베이지안 모수추정 방법을 비교하고 그 특징을 분석하고자 한다. 또, 효율적 모형을 위한 모형선택으로서 잔차제곱합(Sum of the squared errors ; SSE)과 Braun 통계량을 적용하여 모형들에 대한 효율성 입증방법을 설명하였다. 그리고 수치적인 예로서 실제 자료를 이용한 수치 견과를 나열하였다. 이 접근방법을 기초로 하여 수명분포가 중첩(Superposition) 및 혼합(Mixture)인 경우에 대한 접근방법이 연구되었으면 한다.

Estimation of genetic relationships between growth curve parameters in Guilan sheep

  • Hossein-Zadeh, Navid Ghavi
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제57권5호
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    • pp.19.1-19.6
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    • 2015
  • The objective of this study was to estimate variance components and genetic parameters for growth curve parameters in Guilan sheep. Studied traits were parameters of Brody growth model which included A (asymptotic mature weight), B (initial animal weight) and K (maturation rate). The data set and pedigree information used in this study were obtained from the Agricultural Organization of Guilan province (Rasht, Iran) and comprised 8647 growth curve records of lambs from birth to 240 days of age during 1994 to 2014. Marginal posterior distributions of parameters and variance components were estimated using TM program. The Gibbs sampler was run 300000 rounds and the first 60000 rounds were discarded as a burn-in period. Posterior mean estimates of direct heritabilities for A, B and K were 0.39, 0.23 and 0.039, respectively. Estimates of direct genetic correlation between growth curve parameters were 0.57, 0.03 and -0.01 between A-B, A-K and B-K, respectively. Estimates of direct genetic trends for A, B and K were positive and their corresponding values were $0.014{\pm}0.003$ (P < 0.001), $0.0012{\pm}0.0009$ (P > 0.05) and $0.000002{\pm}0.0001$ (P > 0.05), respectively. Residual correlations between growth curve parameters varied form -0.52 (between A-K) to 0.48 (between A-B). Also, phenotypic correlations between growth curve parameters varied form -0.49 (between A-K) to 0.47 (between A-B). The results of this study indicated that improvement of growth curve parameters of Guilan sheep seems feasible in selection programs. It is worthwhile to develop a selection strategy to obtain an appropriate shape of growth curve through changing genetically the parameters of growth model.