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No Association between the CCR5Δ32 Polymorphism and Sporadic Esophageal Cancer in Punjab, North-West India

  • Sambyal, Vasudha;Manjari, Mridu;Sudan, Meena;Uppal, Manjit Singh;Singh, Neeti Rajan;Singh, Harpreet;Guleria, Kamlesh
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제16권10호
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    • pp.4291-4295
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    • 2015
  • Background: Chemokines and their receptors influence carcinogenesis and cysteine-cysteine chemokine receptor 5 (CCR5) directs spread of cancer to other tissues. A 32 base pair deletion in the coding region of CCR5 that might alter the expression or function of the protein has been implicated in a variety of immune-mediated diseases. The action of antiviral drugs being proposed as adjuvant therapy in cancer is dependent on CCR5 wild type status. In the present study, distribution of CCR5${\Delta}32$ polymorphism was assessed in North Indian esophageal cancer patients to explore the potential of using chemokine receptors antagonists as adjuvant therapy. Materials and Methods: DNA samples of 175 sporadic esophageal cancer patients (69 males and 106 females) and 175 unrelated healthy control individuals (69 males and 106 females) were screened for the CCR5${\Delta}32$ polymorphism by direct polymerase chain reaction (PCR). Results: The frequencies of wild type homozygous (CCR5/CCR5), heterozygous (CCR5/${\Delta}32$) and homozygous mutant (${\Delta}32/{\Delta}32$) genotypes were 96.0 vs 97.72%, 4.0 vs 1.71% and 0 vs 0.57% in patients and controls respectively. There was no difference in the genotype and allele frequencies of CCR5${\Delta}32$ polymorphism in esophageal cancer patients and control group. Conclusions: The CCR5${\Delta}32$ polymorphism is not associated with esophageal cancer in North Indians. As the majority of patients express the wild type allele, there is potential of using antiviral drug therapy as adjuvant therapy.

태그 기반 토픽맵 생성 시스템의 설계 및 구현 (Design and Implementation of Topic Map Generation System based Tag)

  • 이시화;이만형;황대훈
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제13권5호
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    • pp.730-739
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    • 2010
  • 웹2.0환경에서의 핵심적인 기술은 태깅이며, 현재 블로그와 같은 웹 문서에서부터 이미지, 동영상 등과 같은 멀티미디어 데이터에 이르기까지 폭넓게 적용되고 있다. 그러나 태깅에 사용된 태그가 정보 검색에 재사용되어 검색의 효율성을 극대화 시킬 것이라는 기대와는 달리 실제로는 태그가 가지는 근본적인 한계들로 인해 만족스럽지 못한 검색결과가 나타나고 있다. 이에 본 연구에서는 태그 클러스터링을 통한 이미지 검색에 대한 선행연구를 기반으로 의미론적 지식체계인 토픽맵 생성 시스템을 설계 및 구현하였다. 구현 결과 클러스터 내의 태그 정보들은 토픽맵에서의 토픽으로 자동 생성되었으며, 생성된 토픽맵의 토픽들 간에는 WordNet을 적용하여 의미연관관계를 부여하였다. 또한 토픽 쌍에 적합한 어커런스 정보들을 추출하여 토픽들에 부여함으로서 의미론적 지식체계인 토픽맵을 생성하였다. 이와 같이 생성된 토픽맵은 사용자의 정보검색 요구에 대한 시맨틱 내비게이션의 제공을 가능하게 할 뿐만 아니라 풍부한 정보제공이 가능하다.

홈 네트워크 서비스를 위한 인증시스템 구현에 관한 연구 (A Study on Implementation of Authentication System for Home Networking Service)

  • 이기영
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제13권6호
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    • pp.1091-1098
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    • 2009
  • 본 연구에서는 홈 네트워킹 서비스를 위한 인증 시스템을 설계하고 이것을 실제 센서 노드에 적용하였다. 무선 센서 네트워크의 키 관리 기법인 대칭키 사전 분배방식과 계층적인 키 구조를 적용하여 인증키의 노출을 방지하였다. 또한 SPINS를 기반으로 CBC(cipher block chain) 방식의 RC5 암호화 알고리즘을 적용하여 인증키 및 데이터의 암호화를 수행하였다. 베이스 스테이션(BS)과 센서 노드로 실험 환경을 구축하였고, 각 센서 노드들은 수신된 데이터를 암호화된 인증키와 함께 BS로 전송하게 된다. 실험은 홈 네트워크 서비스에서 발생할 수 있는 보안 위협에 대한 시나리오를 설정하여 진행하였다. 이를 위해 TinyOS의 TOS_Msg 데이터 구조를 약간 변경하여 인증을 위한 8바이트의 인증키를 저장하고 각 센서 노드의 인증 및 데이터의 암호화를 가능하게 하였다. 이를 통해 다른 그룹의 센서노드와 BS 사이의 통신 및 악의적인 목적으로 추가된 센서 노드와의 통선으로 인한 오동작을 막을 수 있었고 생체신호와 같은 중요한 데이터를 전송하는 경우 암호화를 통한 안전한 홈 네트워킹 서비스가 가능함을 확인하였다.

A heat shock cognate 70 gene in the endoparasitoid, Pteromalus puparum, and its expression in relation to thermal stress

  • Wang, Huan;Dong, Sheng-Zhang;Li, Kai;Hu, Cui;Ye, Gong-Yin
    • BMB Reports
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    • 제41권5호
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    • pp.388-393
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    • 2008
  • The Pphsc70 (heat shock cognate 70) gene was isolated from the endoparasitoid Pteromalus puparum and then characterized. The full-length cDNA was 2204 base pair (bp) and contained a single 1968 bp ORF that encoded a polypeptide of 656 amino acids with a predicted molecular mass of 71.28 kDa. Phylogenetic analysis based on Hsc70 amino acid sequences from fifteen insect species agreed with the present phylogeny. In addition, genomic DNA confirmed the presence of three introns located at the coding region as well as the 5'UTR. A significant elevation of Pphsc70 expression was observed following heat treatment, however, continued exposure to heat shock or recovery caused the expression of induced mRNA to gradually decline to levels that were significantly lower than those of control pupae (P < 0.05). In addition, a significant increase was observed in the emergence rate of pupae that were preheated at $40^{\circ}C$ and then exposed to $50^{\circ}C$ for 1 h when compared with the pupae that were not preheated, but instead directly exposed to $50^{\circ}C$. Taken together, these results revealed that exposure to gradually increasing temperatures can enhance an insects thermo-tolerance.

LTE-Advanced 네트워크에서 간섭 완화를 위한 FFFR 기반의 D2D 자원 할당 기법 (FFFR-Based Resource Allocation Mechanism for Interference Mitigation of D2D Communications in LTE-Advanced Networks)

  • 이한나;김향미;김상경
    • 정보처리학회논문지:컴퓨터 및 통신 시스템
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    • 제4권1호
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    • pp.5-10
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    • 2015
  • LTE-A 네트워크에서 D2D 통신은 시스템의 용량 및 스펙트럼의 효율성을 향상시키는 유망한 기술이다. 전체 스펙트럼의 효율성을 향상시킬 수 있는 이유는 기지국이 이미 셀룰러 단말에 할당한 무선 자원을 D2D 통신에 할당하여 자원을 재사용할 수 있기 때문이다. 하지만 동일한 자원을 셀룰러 및 D2D 통신이 공유하여 사용함으로써 셀 내에 간섭이 발생할 수 있다. 따라서 동일한 자원을 사용하는 셀룰러 통신과 D2D 통신 간에 간섭 조정을 위한 적절한 자원 할당 기법이 필요하다. 특히, LTE-A 환경에 D2D 통신을 적용하기 위해서는 셀 내 간섭뿐만 아니라 셀 간 간섭 조정이 반드시 필요하다. 본 논문에서는 셀 간 간섭 완화를 위해서 주파수 재사용 패턴 기법 중 하나인 FFFR 기법을 사용하고, 셀 내 간섭 완화를 위해서는 기지국이 셀룰러 사용자가 이미 사용 중인 자원을 랜덤하게 선택하여 D2D 통신에 할당하는 D2D 자원 할당 알고리즘을 제안한다. 제안된 자원 할당 알고리즘의 성능평가를 위해 시뮬레이션을 수행하였으며, 셀 내 간섭 완화, 시스템 처리량 및 계산복잡도 등이 향상되는 것을 확인하였다.

단계적 회귀법과 자료봉합분석을 이용한 변수선택기법의 개발 (Development of Variable Selection Technique using Stepwise Regression and Data Envelopment Analysis)

  • 정민의;유성진
    • 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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    • 제41권8호
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    • pp.598-604
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    • 2014
  • 본 연구는 주요변수를 선정하는 기법을 개발하기 위해서 단계적 회귀와 변수들의 효율성을 평가하기 위해 사용되는 자료봉합분석을 결합한 새로운 방법을 제안하였다. 이를 위해서 먼저 단계적 회귀를 이용하여 중요 변수들을 일차적으로 선정하고, 선정된 각 변수들의 중요도를 이해하기 위해 귀무가설을 세웠고, 중요 변수를 선택하기 위해 Kruskal-Wallis 검정을 사용했다. 또한 해당되는 변수를 Conover-Inman 검정을 사용하여 변동이 발생하는 각 변수들의 우선순위를 결정하였다. 따라서 그 결과, 많은 변수들과 DEA(Data Envelopment Analysis)의 한계를 극복하기 위해 원래 계획된 변수들 중 기준에 의해 원래 유지된 변수와 높은 연관성을 가진 변수들을 남기는 방식으로 변수를 선정하는 기법을 개발한 Jenkins의 기존연구에서는 I2, I4, I5, I6 변수가 누락되었고 I1, I3 변수만이 DEA에 사용되었지만, 본 논문에서 제안된 모델의 효율성 결과로는 I2와 I4 변수를 각각 유지하였다. 본 연구는 다른 문헌에서 단계적 변수의 선택을 보여주기 위해 같은 데이터 집합을 사용하였는데, 여기서 Jenkins의 연구와 같이 변수 I6과 I1, I2를 삭제하였고, I3, I4, I5는 유지하였다. 결론적으로 단계적 회귀 DEA 모델을 사용하여 긴 계산적 절차 없이 변수 선택이 가능함을 발견했으며 기존 연구의 데이터를 적용하여 제안된 모델을 검증하였다. 개발한 DEA모델 결과는 상호 변수에 따라 포함되거나 생략할 수 있기 때문에 실제 현실 상황에서의 지식과 경영적 판단에 매우 유용할 것이다.

다중 홉 질문 응답을 위한 쌍 선형 그래프 신경망 기반 추론 (Bilinear Graph Neural Network-Based Reasoning for Multi-Hop Question Answering)

  • 이상의;김인철
    • 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
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    • 제9권8호
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    • pp.243-250
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    • 2020
  • 지식 그래프 기반의 질문 응답 문제는 자연어 질문들에 대한 깊은 이해뿐만 아니라, 대규모 지식 그래프 상에서 올바른 답변을 찾기 위한 효과적인 추론 능력을 필요로 한다. 본 논문에서는 다중 홉 추론을 요구하는 복잡한 자연어 질문에 대해 연관 지식 그래프 위에서 답변 추론을 효과적으로 수행할 수 있는 심층 신경망 모델을 제안한다. 제안 모델에서는 지식 그래프 상의 각 개체 노드와 이웃 노드 간의 양방향 특징 전파를 허용할뿐만 아니라, 두 이웃 노드 쌍 간의 맥락 정보까지 활용할 수 있는, 표현력이 뛰어난 쌍 선형 그래프 신경망(BGNN)을 이용한다. 본 논문에서는 오픈 도메인의 지식 베이스인 Freebase, 자연어 질문 응답을 위한 벤치마크 데이터 집합들인 WebQuestionsSP와 MetaQA를 이용한 실험들을 통해, 제안 모델의 효과와 우수성을 확인하였다.

시차정보와 MPEG-2의 스케일러빌리티를 이용한 입체영상 압축 및 전송 (Stereoscopic Image Compression and Transmission Using Disparity Information and MPEG-2′s Scalability)

  • 민재홍;백중환
    • 융합신호처리학회논문지
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    • 제2권2호
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    • pp.20-27
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    • 2001
  • 입체영상의 부호화 및 전송 기술은 제한된 전송 채널에서 입체영상 정보의 전송에 필수적 인 기술로 입체영상 매체를 이용한 정보통신 서비스 분야에서 매우 중요하다. 본 논문에서는 시차정보를 이용하여 입체영상을 압축하고 MPEG-2의 스케일러빌리티 (scalability)를 이 용하여 전송하는 기법을 제안한다. 왼쪽 영상은 기본계층에, 오른쪽 영상은 고위계층에 각각 대웅하고 고위계층은 좌우영상의 시차정보와 고위계층간의 예측정보를 포함한다. 또한, 본 논문에서는 시차정보 탐색시간을 줄이기 위해 이전 입체영상 쌍으로부터 탐색한 시차정보를 이용하여 다음 입체영상 쌍의 시차정보를 예측하는 방법을 제안하고, 전송율 제어는 MPEG-2 TM6에서 제안한 방법을 사용한다. 실험 결과 제안한 탐색 방법을 사용한 경우 전체 코딩 시간이 기존의 전역 탐색 방법을 사용한 경우에 비해 현저히 단축되고 목표한 전송율에 도달됨을 알 수 있었다.

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Cloning and Characterization of the IgA Fc Receptor from Swine

  • Chen, Yumei;Liu, Yunchao;Zhang, Gaiping;Feng, Hua;Ji, Pengchao;Wang, Guoqiang;Liu, Chang;Song, Yapeng;Su, Yunfang;Qiao, Songlin;Wang, Aiping
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권12호
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    • pp.2192-2198
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    • 2016
  • The myeloid-specific IgA Fc receptor ($Fc{\alpha}R$) is a cell surface molecule on immunocytes that provides a fundamental connection between humoral and cellular immunity. In this study, the full-length cDNA sequence of swine $Fc{\alpha}RI$ ($swFc{\alpha}RI$) was isolated and characterized and found to contain a 792-base-pair open reading frame, encoding a 264-amino-acid transmembrane glycoprotein with a predicted molecular mass of 29.4 kDa. The $swFc{\alpha}RI$ shares high amino acid sequence homology (>50%) with its counterparts from cattle, seal, and horse. Rosetting analysis confirmed that COS-7 cells transfected with an $swFc{\alpha}RI$ expression plasmid was able to combine with chicken erythrocytes sensitized with porcine IgA, but not IgG.

Analysis of Squalene Synthase Expression During the Development of Ganoderma lucidum

  • Zhao, M.W.;Zhong, J.Y.;Liang, W.Q.;Wang, N.;Chen, M.J.;Zhang, D.B.;Pan, Y.J.;Jong.S.C.
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제14권1호
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    • pp.116-120
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    • 2004
  • The medicinal properties of Ganoderma lucidum have been recognized in China for many centuries. Active pharmaceutical components include triterpenes. To elucidate the molecular regulation of triterpene biosynthesis in this mushroom, a 57-base pair DNA fragment encoding the fourth conserved domain SQ-4 (SMGLFLQKTNIIRDYNEDL) of squalene synthase was synthesized and cloned into the expression vector pET-32a(+). The recombinant fusion protein induced by IPTG (isopropyl-$\beta$-D-thiogalactopyranoside) was overexpressed in the Escherichia coli. Using the purified recombinant fusion protein of 20.9 kDa, a specific polyclonal antibody was obtained from immunized rabbit. Expression of squalene synthase at different development stages of Ganoderma lucidum was analyzed.