Cho, Yoonjung;Lee, Min Ho;Kim, Su Jin;Park, Ji Hwan;Jung, Ju Yeon
Biomedical Science Letters
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v.28
no.3
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pp.157-169
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2022
DNA typing is the typical technology in the forensic science and plays a significant role in the personal identification of victims and suspects. Short tandem repeat (STR) is the short tandemly repeated DNA sequence consisting of 2~7 bp DNA units in specific loci. It is disseminated across the human genome and represents polymorphism among individuals. Because polymorphism is a key feature of the application of DNA typing STR analysis, STR analysis becomes the standard technology in forensics. Therefore, the DNA database (DNA-DB) was first introduced with 4 essential STR markers for the application of forensic science; however, the number of STR markers was expanded from 4 to 13 and 13 to 20 later to counteract the continuously increased DNA profile and other needed situations. After applying expanded STR markers to the South Korean DNA-DB system, it positively affected to low copy number analysis that had a high possibility of partial DNA profiles, and especially contributed to the theft cases due to the high portion of touch DNA evidence in the theft case. Furthermore, STR marker expansion not only contributed to the resolution of cold cases but also increased kinship index indicating the potential for improved kinship test accuracy using extended STR markers. Collectively, the expansion of the STR locus was considered to be necessary to keep pace with the continuously increasing DNA profile, and to improve the data integrity of the DNA-DB.
Purpose: This study aims to compare health status and health behavior among the hypertension group, the DM group, and the hypertension-DM group for aged clients of customized home visiting health care services. Methods: This study was conducted as cross-sectional research. The subjects of this study were 2,235 aged people over 65 living in J City. Data were collected using structured questionnaires and measurements. The collected data were analyzed using the SPSS/WIN 12.0 program, and descriptive statistics, $x^2$ test, t-test and ANOVA were used for the analyses. Results: BP and glucose control showed a significant difference among the groups. BMI and waist circumference were significantly higher in the hypertension-DM group than in the other groups. Stroke, arthritis, and perceived health status were significantly different among the three groups. Depression was high, but not significantly different among the groups. Smoking and drinking were not significantly different among the groups. Physical activity was very low, especially in the hypertension group. Medication was high, especially in the hypertension-DM group. Conclusion: It is necessary to consider care plans for the hypertension-DM group, and educate the group for care management. Also, depression and physical activity programs are needed for the age.
This study was carried out to explore the illness-related activities of the menopaused women. To achieve such a purpose, sixty-six cases of the middle aged women were sampled the naturally and the artificially menopaused group respectively from 1st, Aug. to 31th, Aug. in 1988. For the collection of data, 1, 140 women aged between 45-54 were selected through stratified sampling techniques in urban and rural area. Among them the final subjects for analysis were restricted to only those who had experienced menopause naturally or artificially. And then, after control for age and education analysis was performed. The data was analysed by use of frequency, percentage, $X^2-test,$ t-test, Pearson correlation coefficiency and stop-wise multiple regression. The obtained results were as follows. I. As for the se1f-perception on menopausal symptoms, it was revealed than Korean women, neithe in naturally and artificially, accepted the change of menstruation itself as serious. This shows us that middle-aged women had positively receptive attitudes that the change of menstruation is follwed by amenorrhea. 2. The artificially menopaused group scored more than the naturally one: (I) on the self-control activities such as self-assessment, lay-consultation, fever check, pulse check and observation of vagina discharge, (2) on the self-decision activities such as hospital and pharmacy utilization, (3) on the self maintenance activities such as walking, aerobic, weight check, skin care, skin protect, calori control diet control, milk intake, vegetable intake, cold water drinking before meal, parasol use and BP check The above results lead us that the self care practices of the menopaused women revealed' coping wit I menopausal symptoms at the first level in community and must be developed by the adequate nursin intervention.
So, Jae-Seong;Lee, Ki-Yong;Soo, Jea-Kal;Heo, Tae-Ryeon;Kim, Seung-Cheol
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.12
no.1
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pp.176-181
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2002
In order to isolate and identify Bifidobacterium spp. that originated in Korea, feces were sampled from healthy Korean adults and children living in three villages, the first having a history of longevity and the other two where the diet did not include fermented milk or any pharmaceutical preparations. Through the use of Gram staining and microscopic examination for cell morphology, 23 bacterial strains presumed to be the Bifidobacterium genus were isolated from the feces of 13 out of a total of 59 Korean people. To identify the Bifidobacterium strains at the genus level, these bacteria were then analyzed by TLC and the fructose-6-phosphate phosphoketolase (F6PPK) test. The result showed that 22 of the isolated strains were confirmed to be members of the genus Bifidobacterium. All of these bifidobacteria were also identified as Bifidobacterium spp. by the fermentation test. Using a RFLP analysis, an attempt was made to identify the Bifidobacterium spp. that had been isolated from both Korean adults and children. In a genomic Southern blot analysis after digestion with two restriction enzymes (EcoRI, HindIII), all of the 14 randomly selected Korean isolates showed patterns identical to those of three different B. longum species. Another restriction enzyme, CfoI (4-bp recognition enzyme), was then used to identify the strain. Interestingly, all the Korean isolates were identified as B. longum ATCC 15708, indicating that a RFLP analysis was effective for identifying Bifidobacterium spp. at both the strain and species levels.
Reovirus was found to inhabit both the respiratory and the enteric tract of human and animals. The genome of reovirus comprises 10 segments of double-stranded RNA, total size 24 kbp. Nine strains of reovirus were isolated from human and field mice in Korea. Aseptically collected sera from human and lung tissues from field mice were used for virus isolation. For serotype determination, hemagglutination inhibition test was used, and three strains were confirmed to type 2 and six strains to type 3. To determine the genomic diversity and molecular phylogeny of reoviruses isolated in Korea, part of S4 genomic segment of reovirus was enzymatically amplified and directly sequenced. In nucleotide level, Apo98-35 strain showed 15.4%, 19.3%, and 14.4% differences compared to type 1 (T1L, Lang), type 2 (T2J), and type 3 reference strains, respectively. In amino acid level, Apo98-35 strain showed 10.5%, 13.7%, and 9.5% differences compared to type 1, type 2, and type 3 reference strains, respectively. Using the maximum parsimony method based on 285 bp spaning region of the S4 genomic segment, phylogenetic analysis indicated that Apo98-35 from Korea formed different phylogenetic branch. Our data obtained by sequence and phylogenetic analyses of reoviruses are consistent with the distinct geographically dependent evolution of reoviruses in Korea.
Journal of Korea Society of Industrial Information Systems
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v.11
no.1
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pp.77-85
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2006
In this paper, we propose a hierarchical classifier of object images using neural networks for content-based image classification. The images for classification are object images that can be divided into foreground and background. In the preprocessing step, we extract the object region and shape-based texture features extracted from wavelet transformed images. We group the image classes into clusters which have similar texture features using Principal Component Analysis(PCA) and K-means. The hierarchical classifier has five layes which combine the clusters. The hierarchical classifier consists of 59 neural network classifiers learned with the back propagation algorithm. Among the various texture features, the diagonal moment was the most effective. A test with 1000 training data and 1000 test data composed of 10 images from each of 100 classes shows classification rates of 81.5% and 75.1% correct, respectively.
This study carried out to investigate the antimicrobial resistance and biochemical characteristics of Staphylococcus aureus (S. aureus) isolated from reproductive and respiratory tract in Thoroughbred horse. The specimens were collected from equine vaginal mucosa and upper respiratory tract from March to December 2006 using a culture swab in Korea. S. aureus suspected colonies on blood agar plates were selected and identified as standard biochemical tests and PCR (Applied Biosystems, USA). Antimicrobial resistance test of S. aureus isolates was performed with 30 antimicrobial agents (BBL, USA) by using the agar disk diffusion method. S. aureus isolates were isolated 58 (39.2%) strains of 148 samples: wound 64.7% (11/17), genital discharge 37.0% (37/100) and nasal discharge 32.2% (10/31). Almost isolates showed high resistance to spectinomycin, sulfonamides, erythromycin, tetracyelin, ciprofloxacin and penicillin. These results may provide the basic information to establish strategies for treatment and prevention of reproductive and respiratory disease in Thoroughbred horses in Korea.
Baek, Jong Chul;Jo, Jae Yoon;Lee, Seon Mi;Cho, In Ae;Shin, Jeong Kyu;Lee, Soon Ae;Lee, Jong Hak;Cho, Min-Chul;Choi, Won Jun
Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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v.46
no.3
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pp.125-131
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2019
Objective: To investigate serum 25-hydroxyl vitamin D (25(OH)D) and vitamin D-binding protein (VDBP) concentrations in women with endometriosis according to the severity of disease. Methods: Women with mild endometriosis (n = 9) and advanced endometriosis (n = 7), as well as healthy controls (n = 16), were enrolled in this observational study. Serum total 25(OH)D concentrations were analyzed using the Elecsys vitamin D total kit with the Cobas e602 module. Concentrations of bioavailable and free 25(OH)D were calculated. Concentrations of VDBP were measured using the Human Vitamin D BP Quantikine ELISA kit. Variables were tested for normality and homoscedasticity using the Shapiro-Wilk test and Leven F test, respectively. Correlation analysis was used to identify the variables related to total 25(OH)D and VDBP levels. To assess the effects of total 25(OH)D and VDBP levels in the three groups, multivariate generalized additive modeling (GAM) was performed. Results: Gravidity and parity were significantly different across the three groups. Erythrocyte sedimentation rate (ESR) and CA-125 levels increased as a function of endometriosis severity, respectively (p= 0.051, p= 0.004). The correlation analysis showed that total 25(OH)D levels were positively correlated with gravidity (r = 0.59, p< 0.001) and parity (r = 0.51, p< 0.003). Multivariate GAM showed no significant relationship of total 25(OH)D levels with EMT severity after adjusting for gravidity and ESR. However, the coefficient of total 25(OH)D levels with gravidity was significant (1.87; 95% confidence interval, 0.12-3.63; p= 0.040). Conclusion: These results indicate that vitamin D and VDBP levels were not associated with the severity of endometriosis.
Choi, In Young;Kim, Jinhee;Kim, Su-Hyeon;Ban, O-Hyun;Yang, Jungwoo;Park, Mi-Kyung
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.31
no.7
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pp.949-955
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2021
Previously, our research group isolated Bifidobacterium breve IDCC4401 from infant feces as a potential probiotic. For this study, we evaluated the safety of B. breve IDCC4401 using genomic and phenotypic analyses. Whole genome sequencing was performed to identify genomic characteristics and investigate the potential presence of genes encoding virulence, antibiotic resistance, and mobile genetic elements. Phenotypic analyses including antibiotic susceptibility, enzyme activity, production of biogenic amines (BAs), and proportion of D-/L-lactate were evaluated using E-test, API ZYM test, high-performance liquid chromatography (HPLC), and D-/L-lactic acid assay respectively. The genome of B. breve IDCC4401 consists of 2,426,499 bp with a GC content of 58.70% and 2,016 coding regions. Confirmation of the genome as B. breve was provided by its 98.93% similarity with B. breve DSM20213. Furthermore, B. breve IDCC4401 genes encoding virulence and antibiotic resistance were not identified. Although B. breve IDCC4401 showed antibiotic resistance against vancomycin, we confirmed that this was an intrinsic feature since the antibiotic resistance gene was not present. B. breve IDCC4401 showed leucine arylamidase, cystine arylamidase, α-galactosidase, β-galactosidase, and α-glucosidase activities, whereas it did not show production of harmful enzymes such as β-glucosidase and β-glucuronidase. In addition, B. breve IDCC4401 did not produce any tyramine, histamine, putrescine, cadaverine, or 2-phenethylamine, which are frequently detected BAs during fermentation. B. breve IDCC4401 produced 95.08% of L-lactate and 4.92% of D-lactate. Therefore, our findings demonstrate the safety of B. breve IDCC 4401 as a potential probiotic for use in the food industry.
The strains were added to the feed in the concentration of $10^3$, $10^5$, and $10^7$ CFU/kg and 2% of fishes were given the feed twice a day (8 AM and 5 PM) for 12 weeks. In result of the nonspecific immune response study to examine Respiratory burst activity, Lysozyme activity and Phagocytosis activity every two weeks until the end of the study, all test samples showed greater activities than control samples and improved immune activity with Bacillus sp. IS-2. The mortality test performed by artificial infection using Streptococcus iniae, a pathogenic bacterium, after the completion of this study also showed over 55% greater survival rate in all test samples. In result of performing PCR using the universal primer to verify that the probiotic stays in the intestines of the fishes, all test samples showed PCR product of 1,465 bp. Based on the above findings, it was concluded that Bacillus sp. IS-2 in the feed improved farmed flatfish's immune system and resistance against diseases as the probiotics. Also, the physiological indicators discovered by this study would be useful for identifying the mechanisms of probiotics.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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