Park, Sang-Youn;Yoo, Min-Jae;Shin, Jae-Min;Cho, Kwang-Hwi
BMB Reports
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제44권2호
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pp.118-122
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2011
Most widely used secondary structure assignment methods such as DSSP identify structural elements based on N-H and C=O hydrogen bonding patterns from X-ray or NMR-determined coordinates. Secondary structure assignment algorithms using limited $C{\alpha}$ information have been under development as well, but their accuracy is only ~80% compared to DSSP. We have hereby developed SABA (Secondary Structure Assignment Program Based on only Alpha Carbons) with ~90% accuracy. SABA defines a novel geometrical parameter, termed a pseudo center, which is the midpoint of two continuous $C{\alpha}s$. SABA is capable of identifying $\alpha$-helices, $3_{10}$-helices, and $\beta$-strands with high accuracy by using cut-off criteria on distances and dihedral angles between two or more pseudo centers. In addition to assigning secondary structures to $C{\alpha}$-only structures, algorithms using limited $C{\alpha}$ information with high accuracy have the potential to enhance the speed of calculations for high capacity structure comparison.
최근 이동통신 네트워크에서 채널의 수요는 폭발적으로 증가하고 있다. 그렇지만 수요에 맞는 충분한 채널을 제공하기는 힘든 것이 현실이다. 이러한 수요를 충족시키기 위하여는 채널들을 간섭 현상이 없도록 재사용 함으로써 효율적으로 이용할 수 있도록 각 셀의 수요에 맞게 최적으로 할당하는 것이 요구된다. 본 논문의 목적은 이동통신 서비스 지역에 따라 채널 수요에 대한 변화가 불확실하고, 시간에 따라 변화가 심한 이동통신 네트워크에서 각 셀이 채널을 필요로 할 때 필요한 채널 수만큼을 동적으로 빠른 시간에 최적 할당하는 것이다. 이 목적을 달성하기 위하여 휴리스틱 알고리즘(Heuristic Algerian)을 사용하여 채널간의 간섭 정도를 최소화하는 동적 채널 할당방법을 개발하였다.
With the limited frequency spectrum and an increasing demand for cellular communication services, the problem of channel assignment becomes increasingly important. However, finding a conflict free channel assignment with the minimum channel span is NP hard. As demand for services has expanded in the cellular segment, sever innovations have been made in order to increase the utilization of bandwidth. The innovations are cellular concept, dynamic channel assignment and hierarchical network design. Hierarchical network design holds the public eye because of increasing demand and quality of service to mobile users. We consider the frequency assignment problem and the base station placement simultaneously. Our model takes the candidate locations emanating from this process and the cost of assigning a frequency, operating and maintaining equipment as an input. In addition, we know the avenue and demand as an assumption. We propose the network about the profit maximization. This study can apply to GSM(Global System for Mobile Communication) which has 70% portion in the world. Hierarchical network design using GA(Genetic Algorithm) is the first three-tier (Macro, Micro, Pico) model, We increase the reality through applying to EMC (Electromagnetic Compatibility Constraints). Computational experiments on 72 problem instances which have 15${\sim}$40 candidate locations demonstrate the computational viability of our procedure. The result of experiments increases the reality and covers more than 90% of the demand.
파장 할당에 대해 제안된 알고리즘들의 대부분은 무한한 수의 ADM을 가정하여 I/O 블로킹을 배제하였으며 파장을 할당한 이후, 네트워크 내에 파장이 불연속적인 형태로 남게 되어 링크 블로킹을 증가시킬 수 있다는 문제점이 있다. 또한 최악의 경우 O(W $N^3$)의 시간 복잡도를 갖는다. 본 논문에서는 온라인 상에서 동적인 트래픽 요청에 대해 최악의 경우 O(W $N^2$)의 복잡도를 가지면서 I/O 블로킹과 링크 블로킹을 모두 고려하는 파장 할당 알고리즘을 제안하였다. 파장의 불연속성을 최소화함으로써 블로킹의 발생을 감소시킬 수 있었다.
본 논문은 선형 병목할당 문제의 최적해를 간단히 찾는 알고리즘을 제안하였다. 일반적으로 병목할당 문제의 최적해는 한계 또는 증대경로 알고리즘으로 구한다. 제안된 알고리즘은 2단계를 수행하는 역-삭제 알고리즘이다. 첫 번째로, 행 또는 열의 개수가 1개가 될 때까지 최대 비용을 삭제하여 초기해를 구한다. 두 번째로 한계치 보다 큰 값이 초기해로 선택되었으면 해를 개선하는 과정을 수행하였다. 제안된 알고리즘을 28개의 병목 균형 할당 문제와 7개의 병목 불균형 할당 문제에 적용한 결과 최적해를 쉽게 찾는데 성공하였다.
이동통신에 있어서 채널 할당 문제는 조합적 최적화 문제로 문제의 범위가 증가함에 따라 계산량이 지수함수적으로 증가하는 NP-완성형 문제이다. 본 논문에서는 Hopfield 모델을 이용하여 동일 채널 간섭, 인접 기지국 간섭, 동일 기지국 간섭등의 제약조건을 만족하여 각 기지국의 채널 요구량에 따라 채널을 할당하는 방법을 고려하였다. 본 논문에서 고려한 Hopfield 모델은 현재의 하드웨어 구현기술의 제약 요건등을 고려하여 가장 기본적인 모델을 가정하였으며, 고정 채널할당 방법에서 균일, 불균일 트래픽 요구량을 고려하였고, 동적 채널 할당 방법의 적용 가능성을 타진해 보았다.
In Home Area Network (HAN) of the smart grid, Power Line Communication (PLC) technology and ZigBee communication technology can be used in the communication among the Advanced Metering Infrastructure (AMI) devices. However, according to performance evaluation results of the PLC technology, we find that using the PLC technology is unsuitable for the remote meter reading service. It is worth noting that some parts of the PLC are converted to the ZigBee communication technology in Jeju, Korea. Compared with PLC, ZigBee has no restriction of the place, where the equipments can be freely set up, due to the advantage of radio communication. However, number of usable devices will impact the network performance which is depended on the address assignment. In addition, due to the restriction of transmission range among devices, it is difficult to apply the ZigBee address assignment method to the practical circumstance. In this paper, we examine the previous ZigBee address assignment schemes and the corresponding routing algorithms, and propose a novel address assignment scheme compared with the existing methods, the performance of the proposed one is improved. In particular, evaluation results show that the proposed scheme reduces the average number of hop count, the transfer time and the processing time.
워크플로우 시스템은 긴 주기의 프로세스의 실행을 통제하는 소프트웨어 시스템이다. 조직의 구성원들이 프로세스의 실행을 담당하는데, 프로세스의 특정 부분을 누가 수행하는가를 결정하는 작업할당 정책이 워크플로우 시스템에 설계 및 구현되어 있어야한다. 여러 조직들의 작업할당에는 매우 다양한 문제들이 있을 수 있어서, 다양한 여러 문제들을 다 포괄하는 하나의 모델을 고안하는 것은 가능하지 않을 것이다. 본 논문에서는 워크플로우 시스템에서의 작업할당 정책에 대한 보편적인 설계 방법으로서, 각 조직에 주어진 임의의 고려할 사항들에서부터 작업할당 정책들을 정의하기 위한 메타 모델 기반 접근 방법을 제시한다.
High-rate WPAN 은 CAT의 Time Slot 할당 스케줄링 방법을 정의 하고 있지 않다. 이에 CAT의 Time Slot 할당 스케줄링 방법 에 관한 많은 연구가 진행 중이다. 하지만 지금까지의 연구들은 Air Interface의 에러 요소의 미적용이나 특정 DEV의 기아 현상 등의 단점 등을 내포하고 있다. 이에 본 논문에서는 채널의 상태에 따른 우회 경로를 제공하여 채널 타임 할당 스케줄링 방법의 단점을 극복하는 알고리즘을 제안한다.
본 논문에서는 상향링크 Massive multiple-input multiple-output 시스템 상황에서의 파일럿 할당 알고리즘을 소개한다. 기존에 제안된 파일럿 할당 알고리즘은 최적 알고리즘에 비해 성능 열화가 크기 때문에, 본 논문에서는 Pre-determined Interference 기법과 Pre-determined Desired-term 기법을 이용한 알고리즘을 제안한다. 제안하는 기법은 최적 알고리즘에 비해 복잡도가 낮음과 동시에 성능 열화가 작다. 실험 결과를 통해 제안하는 기법의 성능을 확인한다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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