• 제목/요약/키워드: Aspirin intolerant asthma

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정규상호정보와 지지벡터기계를 이용한 천식 관련 단일염기다형성 유전형 자료 분석 (Analysis of Asthma Related SNP Genotype Data Using Normalized Mutual Information and Support Vector Machines)

  • 이중섭;김승현;신기섭;임규철
    • 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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    • 제36권9호
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    • pp.691-696
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    • 2009
  • 서론: 천식에는 아스피린 과민증 (aspirin hypersensitivity)에 따라 아스피린 불내성 (aspirin intolerant asthma, AIA)과 내성 천식 (aspirin tolerant asthma, ATA) 두 가지 유형이 있다. 천식과 관련된 유전적 위험 요인들은 집중적으로 또한 광범위하게 연구되고 있다. 그러나 단일염기다형성들의 조합의 효과에 대해서는 거의 평가되지 않았다. 본 논문에서는 두 유형의 천식 진단에 유용한 단일염기다형성의 최상의 조합을 찾는다. 방법: 본 논문에서는 246명의 천식환자들을 조사하였다. (94명은 아스피린 불내성 천식을 152명은 아스피린 내성 천식을 가지고 있다) 그리고 천식과 관련된 것으로 추측되는 25개의 단일염기다형성들을 분석하였다. 단일염기다형성의 조합의 정규상호정보 값을 계산하여 높은 정규상호정보 값을 갖는 단일염기다형성들의 조합을 선택하고 선택된 조합들의 예측 정확도를 지지벡터기계를 사용하여 계산하였다. 결과: 최상의 조합은 4개짜리이고 ALOX5_p1_1708, B2ADR_q1_46, CCR3_p1_520, CysLTR1_p1_534로 구성된 모델이다. 이것은 0.053의 정규상호정보 값과 71.14%의 ATA 질병에 대한 예측 정확도를 갖는다.

Association of PTGER gene family polymorphisms with aspirin intolerant asthma in Korean asthmatics

  • Park, Byung-Lae;Park, Se-Min;Park, Jong-Sook;Uh, Soo-Taek;Choi, Jae-Sung;Kim, Yong-Hoon;Kim, Mi-Kyeong;Choi, In-Seon S.;Choi, Byoung-Whui;Cho, Sang-Heon;Hong, Chein-Soo;Lee, Yong-Won;Lee, Jae-Young;Park, Choon-Sik;Shin, Hyoung-Doo
    • BMB Reports
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    • 제43권6호
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    • pp.445-449
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    • 2010
  • Aspirin-intolerant asthma (AIA) is characterized by severe asthmatic attack after ingestion of aspirin and/or non-steroidal anti-inflammatory drugs. In this study, we investigated the relationship between Prostaglandin E2 receptor (PTGER) gene family polymorphisms and AIA in 243 AIA patients and 919 aspirin-tolerant asthma (ATA) controls of Korean ethnicity in two separate study cohorts. After genotyping 120 SNPs of the PTGER gene family for the $1^{st}$ cohort study, four SNPs in PTGER1, ten in PTGER3, six in PTGER3, and a haplotype of PTGER2 showed association signals with decreased or increased risk of AIA. Among the positively associated SNPs, one in PTGER1 and four in PTGER3 were analyzed in the $2^{nd}$ cohort study. The results show that rs7543182 and rs959 in PTGER3 retained their effect, although no statistical significance was retained in the $2^{nd}$ cohort study. Our findings provide further evidence that polymorphisms in PTGER3 might play a significant role in aspirin hypersensitivity among Korean asthmatics.

Leukotrienes C4 synthase와 cysteinyl leukotriene receptor 1 유전자 다형성과 한국 소아 천식 표현형 및 임상 지표와의 연관성 연구 (Association study of polymorphism in leukotriene C4 synthase and cysteinyl leukotriene receptor 1 genes with phenotype of asthma and clinical parameters in Korean children)

  • 심정연;김병주;송영화;강미진;이소연;김효빈;유진호;홍수종
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제52권6호
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    • pp.680-688
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    • 2009
  • 목 적 : 류코트리엔은 천식의 병태생리에 중요한 향염증성 매개체이며, 천식이나 운동유발성 천식에서 증가되어 있다. Leukotriene C4 synthase (LTC4S)의 A(-444)C 유전자 다형성과 cysteinyl leukotriene receptor 1 (CysLTR1) T(+927)C 유전자 다형성이 한국 소아의 천식, 아토피 천식 및 운동유발성 천식과 연관이 있는지 알아보고, 폐기능, 기관지과민성, 총IgE 치에 영향을 미치는지 알아보고자 하였다. 방 법 : 총 856명의 천식 환자와 254명의 천식이 없는 정상아를 대상으로 하여 피부반응검사, 폐기능, 메타콜린 기관지 유발검사, 총 IgE 검사를 실시하였고, 천식 환자를 아토피 천식(699명), 운동유발성 천식(277명)으로 나누어 유전자 다형성과의 연관성을 조사하였다. LTC4S A9-444)C, CysLTR1 T(+927)C 유전자형은 PCR-restriction fragment length polymorphism 방법으로 분석하였다. 결 과 : LTC4S A(-444)C 및 CysLTR1 T(+927)C 유전자 다형성은 천식, 아토피 천식, 운동유발성 천식과의 연관성이 없었고, 폐기능, $PC_{20}$, 총IgE에도 차이를 보이지 않았다. 아토피 천식에서 총 호산구수는 변종형 LTC4S 유전자형에서 야생형 보다 높았다. LTC4S A(-444)C와 CysLTR1 T(+927)C의 유전자-유전자 상호 작용도 천식, 아토피 천식, 운동유발성 천식과의 연관이 없었다. 결 론 : 한국 소아 천식의 표현형, 폐기능, 기관지과민성, 총IgE 농도는 LTC4S A(-444)C와 CysLTR1 T(+927)C 유전자 다형성, 혹은 유전자-유전자 상호작용과 연관이 없는 것으로 생각된다.