• 제목/요약/키워드: Animal systematics

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DNA Barcode Examination of Bryozoa (Class: Gymnolaemata) in Korean Seawater

  • Lee, Hyun-Jung;Kwan, Ye-Seul;Kong, So-Ra;Min, Bum-Sik;Seo, Ji-Eun;Won, Yong-Jin
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제27권2호
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    • pp.159-163
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    • 2011
  • DNA barcoding of Bryozoa or "moss animals" has hardly advanced and lacks reference sequences for correct species identification. To date only a small number of cytochrome c oxidase subunit I (COI) sequences from 82 bryozoan species have been deposited in the National Center for Biotechnology Information (NCBI) GenBank and Barcode of Life Data Systems (BOLD). We here report COI data from 53 individual samples of 29 bryozoan species collected from Korean seawater. To our knowledge this is the single largest gathering of COI barcode data of bryozoans to date. The average genetic divergence was estimated as 23.3% among species of the same genus, 25% among genera of the same family, and 1.7% at intraspecific level with a few rare exceptions having a large difference, indicating a possibility of presence of cryptic species. Our data show that COI is a very appropriate marker for species identification of bryozoans, but does not provide enough phylogenetic information at higher taxonomic ranks. Greater effort involving larger taxon sampling for the barcode analyses is needed for bryozoan taxonomy.

Fish Community Structure in the Pyeongchanggang River

  • Choi, Jun-Kil
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제27권2호
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    • pp.151-158
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    • 2011
  • Fish community structure in the Pyeongchanggang River was investigated from April to November 2009. About 900 individuals representing 24 species from eight families at six sites in the Pyeongchanggang River were collected. It was similar to the 2001's survey and it was less than 2006's survey. The Korean endemic species, Zacco koreanus was the most abundant, whereas subdominant species were native species, such as Pungtungia herzi, Zacco platypus, Rhynchocypris kumgangensis and Rhynchocypris oxycephalus. Three endangered species were collected at the sampling area, Acheilognathus signifier (relative abundance [RA] 0.9%), Pseudopungtungia tenuicorpa (RA 1.4%), and Cottus koreanus (RA 3.6%). One natural monument species, Hemibarbus mylodon, was included. According to the analysis of ecological indicator characteristics, the relative proportion of tolerant species was 6.3% (57 individuals), whereas the proportion of sensitive species was 65.9% (593 individuals). Species evenness, richness and diversity indices decreased gradually through the month from April to November during the study. Community indices in Pyeongchanggang River showed a high evenness index (J'>0.6), a low level of species richness (R<3.5) and a medium level of diversity (1.5

Exploring the Utility of Partial Cytochrome c Oxidase Subunit 1 for DNA Barcoding of Gobies

  • Jeon, Hyung-Bae;Choi, Seung-Ho;Suk, Ho Young
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제28권4호
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    • pp.269-278
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    • 2012
  • Gobiids are hyperdiverse compared with other teleost groups, with about 2,000 species occurring in marine, freshwater, and blackish habitats, and they show a remarkable variety of morphologies and ecology. Testing the effectiveness of DNA barcodes on species that have emerged as a result of radiation remains a major challenge in evolutionary biology. Here, we used the cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) sequences from 144 species of gobies and related species to evaluate the performance of distance-based DNA barcoding and to conduct a phylogenetic analysis. The average intra-genus genetic distance was considerably higher than that obtained in previous studies. Additionally, the interspecific divergence at higher taxonomic levels was not significantly different from that at the intragenus level, suggesting that congeneric gobies possess substantial interspecific sequence divergence in their COI gene. However, levels of intragenus divergence varied greatly among genera, and we do not provide sufficient evidence for using COI for cryptic species delimitation. Significantly more nucleotide changes were observed at the third codon position than that at the first and the second codons, revealing that extensive variation in COI reflects synonymous changes and little protein level variation. Despite clear signatures in several genera, the COI sequences did resolve genealogical relationships in the phylogenetic analysis well. Our results support the validity of COI barcoding for gobiid species identification, but the utilization of more gene regions will assist to offer a more robust gobiid species phylogeny.

New Record of Two Apokeronopsis Species (Ciliophora: Urostylida: Pseudokeronopsidae) from Korea

  • Jung, Jae-Ho;Baek, Ye-Seul;Min, Gi-Sik
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제27권2호
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    • pp.115-122
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    • 2011
  • The morphology of the two marine hypotrichous ciliates Apokeronopsis bergeri and A. ovalis, isolated from the Yellow Sea, Korea, are described based on live and protargol-impregnated specimens. It is the first time that these species have been recorded in Korea. In addition, the small subunit ribosomal RNA gene was sequenced for comparison with the public database. The genus Apokeronopsis has recently been established in the family Pseudokeronopsidae, and the two congeners of the Korean population share the following characteristics: one row of one or more buccal cirri; usually two frontoterminal cirri; midventral complex composed of two distinctly separated rows; one left and one right marginal row; number of transverse cirri, more than eight; absence of caudal cirri; two types of cortical granules. Apokeronopsis bergeri differs from A. ovalis primarily in body shape (fusiform vs. oval form), size (usually $260{\times}80{\mu}m$ vs. $160{\times}55{\mu}m$), type II cortical granules (oval vs. round shape; yellow-green vs. mostly colourless and only a few yellow-green in colour), and morphometric data (75-106 vs. 53-70 in adoral membranelles; 37-47 vs. 24-36 in frontal cirri; 9-15 vs. 1-2 in buccal cirri), as well as molecular data (2.87% of pairwise distance).

한국의 털진드기상 및 검색표 (진드기 목 : 털진드기 과 와 Leeuwenhoekiidae) (Fauna and Key to the Chigger Mites of Korea (Acarina ; Trombiculidae and Leeuwenhoekiidae))

  • 이한일
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제6권1호
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    • pp.57-70
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    • 1990
  • 한국산 털진드기 종을 다룬 모든 문헌을 조사 정리한 결과 총 43종이 보고되었는데, 그중 Salchia brennani ventralis 는 오동정한 것으로 W. comataxila 이었고 Shunsennia gracilis 는 S. hertigi 의 동종이명일 가능성이있으나 문헌상으로는 확인할 수 없었다. Leptotromibidium intermedium 의 경우 문헌상의 근거가 전혀 없어 국내 서식종으로 인정할 수 없었다. 필자가 직접 표본을 조사하여 확인할 수 있었던 종은 모두 17 종이었는데 그 가운데 Leptotromibidium akamushi 는 L.zutum 의 , L.miyajimai 는 L.orientale 의 오동정이었다. 결국 한국산 털진드기류는 모두 2과 , 12속, 39종이 된다. 이 중 2 종은 조류에 , 7종은 박쥐에, 그리고 29종은 설치류에 각각 기생하는 종이고 1종은 조류와 포유류에 공동기생하는 종이다. 현재 한국산 털진드기를 동정하는데 이용할 수 있는 검색표로는 29종을 아룬 Southwick (1968) 의것이 있을 뿐이고, 우리나라와 동물상이 유사하나 일본 종에 대한 검색표도 우리나라 토착종 21종이 들어 있지 않아 도움이 되지 않는다. 뿐만 아니라, 기존 검색표는 다리의 강모식(leg setal formula) 이나 촉수의 강모식( palpal setal formula)등 관찰하기 어려운 형질을 많이 사용하고 있어서 동정에 어려움이 많았다. 이에 필자는 현재까지 한국 종으로 정리된 총 39종에 대한 검색표를 만들었는데, 관찰이 용이하면서도 변이가 적은 형질을 최대한 사용하였고 특히 종 특징을 잘 나타내는 배판(scutum)의 형질을 주로 사용하였다. 실용성이 보다 큰 도식형 검색표( pictorial key)도 함께 만들었는데 원저자들의 도표에서 배판(scutum)을 그대로 전사하여 종 간 비교를 용이하게 하였다.

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한국산 가시톡토기 과 (곤충 강: 톡토기 목)의 문제 2아속의 계통분화 (Phylogenetic Study of Two Problematic Subgenera of Tomoceridae (Insecta : Collembola) from Korea)

  • 박경화;이병훈
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제15권1호
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    • pp.11-25
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    • 1999
  • 가시톡토기 과에서 분류학적으로 문제되는 2아속 3종의 유연관계를 밝히기 위해 형태형질 및 효소유전자분석을 실시하였다. 형태형질분석과 효소의 분석에서 서로 다른 계통수가 만들어졌다. 형태형질분석에서는 아속간에 분리가 이루어지지 않았으나 효소분석의 경우 아속간에 확실히 구분되었으며 유전적 차이도 매우 컸다. 그러나 이들 계통수들은 distance method나 분지분석방법에서 모두 같은 분지순서를 나타냈는데 특히 형태형질분석의 경우에 형질평가방법과 형질비평가 방법을 사용했음에도 불구하고 결과는 같았다. 본 연구 결과 어떤 중요한 형태적인 형질이 효소분석에서 처럼 유전적 분화를 나타내면 강렬한 분류형질이 될 수 있다고 생각된다.

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한국산 해양 완보류의 분류학적 연구 I. Batillipes 속 (이완보 강: Batillipedidae 과) (Taxonomic Study of Marine Tardigrades from Korea I. Genus Batillipes (Heterotardigrada: Batillipediae))

  • 노현수;민봉희;장천영
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제15권1호
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    • pp.107-118
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    • 1999
  • 1995년 2월부터 1998년 11월까지 한국 해안의 조간대와 조하대의 모래틈이나 부식질틈에서 채집된 Batillipes 속 해양완보류를 조사한 결과, 29개 지점에서 출현한 8종을 동정.분류하였다. 이 가운데 1종(B. rotundiculus n. sp.)은 신종, 5종(B. pennaki Marcus, B. similis Schulz, B. tridentatus Pollock, B. crassipes Tchesunov and Mokievsky, B. philippinensis Chang and Rho)은 한국 미기록종이었다. 신종을 기재하였고, 5종의 한국 미기록종에 대하여는 삽화와 함께 간략히 고찰하였으며, 한국산 Batillipes 속에 대한 종검색표를 작성하였다.

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제주도산 육서 등각류(절지동물문, 갑각류) (Terrestrial Isopoda (Crustacea) from Cheju Island, Korea)

  • Do Heon Kwon
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제11권4호
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    • pp.509-538
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    • 1995
  • 제주도와 추자군도의 육서 등각류 21종을 보고하였다 Quelpartoniscus를 신속으로, Q. granulatus를 신종으로 기재하였다. Koshiniscus Nunomura를 Armadilloniscus Uljanin의 동물이명으로 처리하였다. Armadilloniscus hoshikawai Nunomura와 A. amakusaensis Nunomura는 A. ellipticus의 Mongoloniscus nipponicus(Arcangeli)는 M. vannamei(Arcangeli)의 , Nagurus tsushimaensis Nunomura. N. pallidus Nunomura 및 Mongoloniscus nigrogranulatus Kwon and Taiti는 M. koreanus (Verhoeff)의 동물이명이었다. Nagurus sinuosus Nunomura는 Lucasioides 속으로, Protracheoniscus pannuosus Nunomura(동물이명인 P. awaensis Nunomura, Nagurus gotoensis Nunomura 및 N. izuharaensis Nunomura 포함)는 Agnara속으로 Armadillo obscurus Budde-Lund는 Venezillo속으로 이전하였다. 이전의 기재가 명확하지 않은 종들은 그림과 함께 재기재하였다.

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한국산 잎응애 상과의 목록 및 검색표 (A Check List and Key to the Tetranychod Mites (Acari: Chelicerata) of Korea)

  • 이원구;이정상
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • nspc3호
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    • pp.45-58
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    • 1992
  • Tetranychoid mites found from Korea until now are 42 species belonging to 12 genera, 2 families as follows: 1 Bryobia japonica Ehara et Yamada, 2. B. praetiosa Koch, 3. B. rubrioculus(Scheuten), 4. Petrobia latens(Muller), 5. Aponychus corpuzae Rimando, 6. A firmianae(Ma et Yuan). 7. Panonychus citri(McGregor), 8. P. ulmi(Koch), 9. Eotetranychus carpini Oudemans, 10. E. hicoriae(McGregor), 11. E. populi(Koch), 12. E. rubiphilus (Reck), 13. E. sexmaculatus (Riley), 14. E. smithi Pritchard et Baker, 15. E. tiliarium (Hermann), 16. E. uchidai Ehara, 17. Schizotetranychus bambusae Reck, 18. S. celarius(Banks), 19. S. leguminosus Ehara, 20. Oligonychus aceris(Shimer), 21. O. clavatus(Ehara), 22. O. hondoensis(Ehara), 23. O. ilicis(McGregor), 24. O. karamatus(Ehara), 25. O. orthius Rimando, 26. O. peridtus Pritchard et Baker, 27. O. shinkajii Ehara, 28. O. pustulosus (Ehara), 29. O. ununguis(Jacobi), 30. O. sp. 31. Tetranychus kanzawai Kishida, 32. T. phaselus Ehara, 33. T. truncatus Ehara, 34. T. urticae Koch, 35. T. vienensis Zacher, 36. Aegyptobia nothus Pritchard et Baker, 37. Pentamerismus taxi (Haller), 38. P. oregonensis McGregor, 39. Brevipalpus californicus(Banks), 40. B. lewisi McGregor, 41. B. obovatus Donnadieu, 42. Tenuipalpus zhizhilashviliae Reck. On the above species, a taxanomic key was made and ecological data including distribution and host plant are presented in this paper.

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Gonepteryx속(인시목: 흰나비과) 교미낭의 미세구조에 관한 비교분석 (A Microscopic Study of the Bursa Copulatrix of Gonepteryx (Lepidoptera: Pieridae))

  • 정선우;이창언;김훈수
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • nspc3호
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    • pp.121-128
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    • 1992
  • 흰나비과중 Gonepteryx속의 6아종에 대한 교미낭을 해부 및 주사전자현미경으로 관찰하여 종간의 형태를 비교분석 하였다. 흰나비과의 다른 속에서처럼 이속의 교미낭도 ductus bursa, corpus bursa 그리고 appendix bursa의 세 부분으로 뚜렷이 구분되었으며, corpus bursa의 형태는 종에 따라 그 차이가 비교적 뚜렷하였으나 signum은 모두 ribbon모양으로 속내에서 매우 안정된 형태를 보였다. Signum주위 내벽에는 동심원상으로 많은 주름이 발달해 있었으며 그곳에는 내벽돌기가 없었고 맞은편에 광범하게 분포하였다. 내벽돌기는 대부분 방추형이었으며 교미낭의 형태와 내벽돌기의 상태로 고려했을때 G. aspasia와 G.taiwana가 속내에서 가장 유사한 종들로 인식되었다.

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