• 제목/요약/키워드: Agar gel

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제주도 토양방선균의 수집과 항균물질 생산균의 선별 (Collection of Soil Actinomycetes from Cheju Island and Screening for their Antibacterial Activities)

  • 정완석;김창진;고영환
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제42권2호
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    • pp.99-104
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    • 1999
  • 제주도내 25개 지점의 토양시료로부터 총 703 주의 방선균을 분리하였다. 네 종류의 배지 중 soil extract를 함유한 arginine glycerol salts agar가 다양한 방선균을 분리하는데 가장 적합하였으며, 목장초지 토양이 다른 지역의 토양에 비해서 방선균의 다양성과 밀도면에서 가장 좋은 분리원이었다 순수분리된 526개의 균주를 대상으로 Escherichia coli, Staphylococcus aureus 및 Pseudomonas solanacearum을 검정균으로 하여, 항균성 물질 생산여부를 검정한 결과, 생산균주의 발생빈도는 분리 및 배양에 사용한 배지의 종류에 따라서 $0{\sim}32.8%$로 많은 차이를 보였다. 세 종류의 검정균에 대하여 동시에 항균활성을 나타내는 10개 균주 중에서 pH 안정성과 열 안정성이 비교적 높은 물질을 생산하는 BL106Ba균주를 선택하여 등정한 결과, Streptomyces속에 속하며 S. albosporeus와 가장 유사한 것으로 추정되었다. B1106Ba의 배양액을 양이온 교환수지(AG MP-50)통과와 3차의 분자량 분획(Sephadex G-10)으로 정제하여 얻은 백색의 결정은 그람 음성균 및 양성균에 대해서는 강한 항균활성을 나타내었으나, 효모에 대해서는 약한 활성을 나타내었다. 이 결정 물질을 TLC와 HPLC로 분석한 결과 네 종류의 서로 다른 항균성 화합물이 혼합되어 있는 것으로 나타났다.

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폭약 2,4,6-Trinitrotoluene에 노출된 분해세균 Stenotrophomonas sp. OK-5의 세포반응 (Cellular Responses of the TNT-degrading Bacterium, Stenotrophomonas sp. OK-5 to Explosive 2,4,6-Trinitrotoluene (TNT))

  • 장효원;송승열;김승일;강형일;오계헌*
    • 미생물학회지
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    • 제38권4호
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    • pp.247-253
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    • 2002
  • 환경오염원으로서 폭약 2,4,6-trinitrotoluene (TNT)에 대한 TNT 분해세균 Stenotrophomonas sp. OK-5의 세포반응에 대하여 조사하였다. 아치사조건의 TNT농도와 노출시간에 따른 균주 OK-5의 생존율을 분석한 결과, 이 세균의 생존율은 스트레스 충격 단백질의 생성과 비례하였다. 총세포 지방산 조성분석에서 균주 OK-5는 tryp-ticase soy agar에서 자랄 때보다 TNT 배지에서 자랄 때 여러 가지 종류의 지방산이 생성되거나 사라지는 것이 밝혀졌다. 주사전자현미경하에서 TNT에 노출된 세포는 쭈글쭈글하고 불규칙적인 간상형으로 나타났다. Anti-DnaK와 anti-GroEL을 이용하여 SDS-PAGE와 Western blot을 통한 분석으로 균주 OK-5는 70 kDa DanK와 60 kDa GroEL을 포함하는 몇가지 스트레스충격단백질을 생성하는 것으로 밝혀졌다. TNT에 노출된 OK-5 배양에서 수용성 단백질 분획에 대하여 2-D PAGE를 실시하였으며, pH 3에서 pH 10의 범위에서 약 300여 개 spot들이 silver로 염색된 gel상에서 관찰되었다. 이들 가운데 TNT의 반응으로 현저하게 유도되고 발현된 10개의 spot들을 확인하였으며, 2개의 단백질, spot #1과 spot #10에 대한 내부아미노산 서열을 ESI-Q TOF로 분석한 결과, Xylella fastidiosa의 DnaK protein XF2340와 Mesorhizobium loti의 스트레스 유도단백질로 각각 밝혀졌다.

폭약 Hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine(RDX)에 노출된 분해세균 Pseudomonas sp. HK-6의 세포반응과 형태변화 (Cellular Responses and Morphological Changes of RDX-degrading Bacterium, Pseudomonas sp. HK-6 Exposed by Explosive Hexahydro-1,3,5-triaitro-1,3,5-triazine (RDX).)

  • 장효원;강형일;김치경;오계헌
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제31권1호
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    • pp.75-82
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    • 2003
  • 환경 오염원으로서 폭약 hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine(RDX)에 대한 RDX 분해세균 Pseudomonas sp. HK-6의 세포반응과 형태변화에 대하여 조사하였다. 아치사조건의 RDX농도와 노출시간에 따른 균주 HK-6의 생존율을 분석한 결과, 이 세균의 생존율은 스트레스 충격 단백질의 생성과 비례하였다. 총세포 지방산 조성분석에서 균주 HK-6는 trypticase soy agar(TSA)에서 자랄 때 보다 RDX배지에서 자랄 때 여러 가지 종류의 지방산이 생성되거나 사라지는 것이 밝혀졌다. Anti-DnaK와 anti-GroEL을 이용하여 SDS-PAGE와 Western blot을 통한 분석으로 균주 HK-6는 70 kDa DanK와 60 kDa GroEL을 포함하는 몇가지 스트레스 충격단백질을 생성하는 것으로 밝혀졌다. RDX에 노출된 HK-6배양에서 수용성 단백질 분획에 대하여 2-D PAGE를 실시하였으며, pH 3에서 pH 10 범위에서 약 300 spots가 silver로 염색된 gel상에서 관찰되었다. 그 결과, RDX에 대한 반응으로 10여개의 spots가 현저히 유도 발현되었다. RDX(0.135mM, 12시간)에 노출된 세포는 구멍이 나타나고 표면의 불규칙적인 형태 변화가 일어나 죽게되는 것이 주사 전자현미경을 통하여 관찰되었다.

개의 Hemoglobin, Albumin 및 Transferrin의 형(型)에 관(關)한 연구(硏究) (Studies on Types of Hemoglobin, Albumin and Transferrin in Dogs)

  • 김우권
    • 대한수의학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.191-200
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    • 1974
  • Hemoglobin, albumin and transferrin phenetypes observed in a population of 255 dogs of various breeds by agar gel electrophoresis for hemoglobin and albumin, and by starch gel electrophoresis, for transferrin. The results obtained were as follows: 1. The hemoglobin phenotypes were classified as HbAA, HbAB and HbBB and the frequencies of appearence were 91.77, 6.27 and 1.96%, respectively. Gene frequency studies of $Hb^A$ and $Hb^B$ showed the $Hb^A$ gene to have a frequency of 94.9% and $Hb^B$ gene to have a frequency of 5.1. The frequency of hemoglobin phenotypes of the Korean Jindo dog (ylelow) was HbAA 76.19%, HbAB 17.46% and HbBB 6.35% and HbBB was recognized only in the Korean Jindo dogs. 2. The albumin phenotypes were calssified as AlbAA, AlbAB and AlbBB and the frequencies of appearence were 28.71, 43.57 and 27.72% respectively. Gene frequency stduies of $Alb^A$ and $Alb^B$ showed the $Alb^A$ gene to hate a frequency of 50.50% and $Alb^B$ gene to have a frequency of 49.50. The frequency of albumin phenotypes of the Korean Jindo dog was 26.32% for AlbAA, 34.21% for AlbAB and 39.47% for AlbBB. The frequency of albumin phenotypes of the Korean Jindo dog was slightly different from others and gene frequency of $Alb^B$ was 56.58. 3. Transferrin studies resulted in findings of 10 different phenotypes and frequencies of transferrin phenotype were 30.08% for $TfA_1A_1$, 8.02 for $TfA_2A_2$, 2.11 for TfBB, 4.64 for $TfC_1C_1$, 1.69 for $TfA_1B$, 41.35 for $TfA_1C_1$, 5.49 for $TfA_2C_1$, 0.84 for $TfA_2C_2$ and 3.79 for $TfBC_1$. Gene frequency studies of $Tf^A$, $Tf^B$ and $Tf^C$ showed the gene to have a frequency of 63.08% for $Tf^A$, 4.85 for $Tf^B$ and 32.07 for $Tf^C$ 4. Transferrin studies revealed two different band patterns on starch gels with a strong and weaker stained one. The $TfC_2C_2$ and $TfA_2A_2$ which were found in the Korean Jindo dog only showed a weaker stained band and the gene frequency of $TfA_1A_1$ was highly recognized in this dog.

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대두에서 발생한 알파파 모자이크 바이러스의 분류동정에 관한 연구 (Identification of Alfalfa Mosaic Virus from Soybean)

  • 이순형;최용문;김정수;정봉조
    • 한국식물병리학회지
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    • 제1권1호
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    • pp.33-37
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    • 1985
  • 황록색줄무늬모자익과 줄기 정단부가 구부러지는 증상을 보이는 대두 이병주를 채집하여 지표식물검정, 충매전염, 물리적 성질 조사, 항혈청검정 및 전자현미경검경을 하였다. 지표식물검정결과 T. expansa와 Scotia에 국부병반반응, 동부, 완두, 명아주 등에 전신감염 증상을 일으켰다. 복숭아혹진딧물에 의한 전염율은 $90\%$였다. 물리적 성질은 내열성이 $60^{\circ}C$, 내희석성이 1,000배였고, 내보존성이 2일이었다. 바이러스를 순화하여 항혈청제조결과 1:1024의 역가를 보였으며 일본 바이러스연구소에서 분양 받고 AMV 항혈청과 양성반응을 보였다. 전자현미경검경 결과 대부분 길이가 60nm인 박테리아 모양의 바이러스 입자가 검경되었다.

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cis-Diamminedichloroplatinum(II)에 의한 pBR322 DNA의 변성과 구조 변화 (cis-Diamminedichloroplatinum (II) induces denaturation and conformational changes in pBR322 DNA)

  • 구자춘;임창수;한태룡;양재명
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제33권4호
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    • pp.343-348
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    • 1990
  • CDDP를 처리한 pBR322 DNA로 형질변환된 대장균 LE392를 ampicillin이 포함된 한천평판배지위에 도말시켰다. Ampicillin을 함유하고 있는 평판배지위에 형성된 집락수는 13.3 ${\mu}M$의 CDDP를 처리한 뒤에는 검출되지 않을 정도로 감소하였다. CDDP를 처리한 pBR322 DNA는 외가닥 DNA에 특이성이 있는 S1 핵산분해호소에 의해 전달되었고 아가로즈 겔 전기영동상에서 이동 유형이 변했다. 이러한 결과에 의하면 CDDP가 pBR322 DNA에 반응하여 이증나선의 변성과 궁극적으로는 ampicillin 저항성 유전자를 불활성화시키는 구조변화를 일으키는 것 같다.

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그라디오러스에 발생하는 BYMV와 CMV에 관한 연구 (Bean Yellow Mosaic Virus and Cucumber Mosaic Virus Causing Mosaic Disease on Gladiolus in Korea)

  • 이순형;김정수;최용문
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.198-202
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    • 1983
  • 그라디오러스에 발생하는 바이러스병을 포장에서 조사한 결과 이 병율이 $43.3\%$이었다. BYMV는 명아주에 엽맥괴사병징, 강남콩에 심한 모자익 병징 그리고 잠두에 모자익 병길을 일으켰다. CMV는 명아주에 국부병반, 담배와 오이에 모자익 병징을 일으켰다. 분류 동정된 두 바이러스는 모두 복숭아 혹진딧물에 의하여 전염되었다. 바이러스를 순화하여 흡광도를 측정한 결과 두 바이러스 모두 260nm에서 최고의 흡광도를 나타내었다. 한천내확산법을 이용한 항혈청과의 반응 결과 SDS를 처리한 BYMY와 CMV는 각각 그 바이러스의 항혈청과 뚜렷한 반응대를 형성하였다. 바이러스 입자의 진자현미경검경 과파 BYMV는 길이가 750nm였으며, CMV는 직경이 30nm이었다.

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Dot-immunoassay를 이용한 Aujeszky's disease virus항원 및 항체 검출 (Detection of antibodies and antigens of Aujeszky's disease virus using dot-immunoassay)

  • 전무형;조용성;장경수
    • 대한수의학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.529-536
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    • 1994
  • To establish more specific and simple diagnostic methods for detection of the antibodies and antigens of Aujeszky's disease virus(ADV), we designed indirect dot-immunoassay(IDI) and double sandwich dotimmunoassay(DSDI) using the solid phases of nitrocellolose paper and polystyrene plate. The diagnostic efficacy of these methods was investigated. As the sensitivity of IDI was tested by various virus concentration, the specimens with the virus titer above $10^{4.0}TCID_{50}/0.2ml$ showed positive reaction, but that below $10^{1.0}TCID_{50}/ml$ revealed negative. Tonsil emulsion at the virus titer of $10^{4.5}TCID_{50}/0.2ml$ showed the highest sensitivity as diluted by 1/100. In detection of ADV antigens from the various tissues of the rats and pigs infected with ADV, IDI using monoclonal antibody showed the higher specificity as compared with IDI using polyclonal antibody and virus isolation method. The efficacy of the DSDI for detection of ADV antibody was compared with other tests. The sensitivity of DSDI was higher than virus neutralization(VN) and agar gel immunodiffusion test(AGID). Meanwhile, specificity of DSDI was lower than AGID, but similar to IDEA. In comparison with VN test, DSDI showed 96.9% agreement to VN test that is the highest of three tests. In general, application of polyclonal antibody in both tests caused the higher sensitivity but the lower specificty.

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Molecular Characterization of the α-Galactosidase SCO0284 from Streptomyces coelicolor A3(2), a Family 27 Glycosyl Hydrolase

  • Temuujin, Uyangaa;Park, Jae Seon;Hong, Soon-Kwang
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권9호
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    • pp.1650-1656
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    • 2016
  • The SCO0284 gene of Streptomyces coelicolor A3(2) is predicted to encode an α-galactosidase (680 amino acids) belonging to glycoside hydrolase family 27. In this study, the SCO0284 coding region was cloned and overexpressed in Streptomyces lividans TK24. The mature form of SCO0284 (641 amino acids, 68 kDa) was purified from culture broth by gel filtration chromatography, with 83.3-fold purification and a yield of 11.2%. Purified SCO0284 showed strong activity against p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside, melibiose, raffinose, and stachyose, and no activity toward lactose, agar (galactan), and neoagarooligosaccharides, indicating that it is an α-galactosidase. Optimal enzyme activity was observed at 40℃ and pH 7.0. The addition of metal ions or EDTA did not affect the enzyme activity, indicating that no metal cofactor is required. The kinetic parameters Vmax and Km for p-nitrophenyl-α-D-galactopyranoside were 1.6 mg/ml (0.0053 M) and 71.4 U/mg, respectively. Thin-layer chromatography and mass spectrometry analysis of the hydrolyzed products of melibiose, raffinose, and stachyose showed perfect matches with the masses of the sodium adducts of the hydrolyzed products, galactose (M+Na, 203), melibiose (M+Na, 365), and raffinose (M+Na, 527), respectively, indicating that it specifically cleaves the α-1,6-glycosidic bond of the substrate, releasing the terminal D-galactose.

재조합 Alkaline Protease를 대량 생산하는 Aspergillus oryzae 균주개발 (Breeding of Aspergillus oryzae for the Alkaline Pretense Overproducing Strain.)

  • 이병로;유기원;최원균;최동성;임한진;성창근
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제26권5호
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    • pp.450-455
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    • 1998
  • Alkaline protease를 대량생산하는 Aspergillus oryzae를 만들기 위하여 A. oryzae의 alkaline pretense 유전자 alpA를 고발현시키는 plasmid pTAalp를 제조하고 이 plasmid로 A. oryzae M-2-3 균주를 형질전환시켰다. 16개의 형질전환체를 얻어 이들의 protease생산성을 skim milk 분해에 의한 halo 형성능에 의하여 확인하였다. 또한 protease 생산성이 증가한 형질전환체는 pTAalp가 multi-copy로 염색체 안에 integration되어 있음을 Southern blot에 의하여 확인하였고, 이들의 배양액을 polyacrylamide gel전기영동에 의하여 분석한 결과, 형질전환체 No. 14에서는 전체 분비단백질의 80-90%가 alkaline protease 임을 알 수 있었다. 간장원료 분해실험의 결과 No. 14에 의한 원료분해액은 간장 양조용 대조균에 의한 분해액보다 TN이 증가하였으며 원료분해율도 1.4-1.5배로 증가되었다.

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