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벼(Oryza sativa L.)의 leuD 유전자 (Identification and expression of leuD Gene in Rice (Oryza sativa L.))

  • 이은탁;강상구
    • 생명과학회지
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    • 제17권6호통권86호
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    • pp.772-777
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    • 2007
  • 식물의 루이신 생합성에 관여하는 3-isopropylmalate isomerase (IPMI) (EC 4.2.1.33) 효소의 소단편을 암호화는 Leucine D유전자를 벼로부터 분리하고 OsLeuD유전자로 명명하였다. OsLeuD유전자는 257개의 아미노산을 암호화하고 있으며 cyanobacteria의 IPMI 단백질과는 약58% 그리고 green sulfur bacteria들의 IPMI 단백질과는 약48%의 상동성을 갖고 있었다. 벼의 OsLeuD 유전자는 japonica벼 (Oryza sativa L.)의 2번 염색체의 26.45 Mb의 위치로서 109.3 cM 거리에 좌위하고 있었다. OsLeuD유전자는 잎과 성숙하는 종자에 많이 발현이 되었으므로 대사가 급증하는 발생단계 에 발현이 조절되는 것으로 여겨진다. OsLeuD유전자와 단백질은 균류와 yeast 보다 광합성 박테리아의 유전자와 높은 동질성을 보이는 것으로 보아 OsLeuD유전자는 식물의 엽록체 유전자 genome 에서 기원하여 핵 genome으로 이동 진화된 유전자로 추측된다.

모바일 홈네트워크 컴포넌트 개발 (The Development of the Mobile HomeNetwork Components)

  • 김치수;김영태;공헌택;임재현
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제10권8호
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    • pp.1860-1868
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    • 2009
  • 모바일 단말기의 사용이 보편화되면서 홈 네트워크간 통합작업이 활발히 진행되고 있다. 홈네트워크의 대중화를 위해서는 인터페이스의 표준화하여 사용자의 이용에 편리성을 제공해야 하며, 개발자는 표준화된 인터페이스 환경을 바탕으로 개발 및 요구사항, 유지보수 등 향후 변화에 민감하게 대처할 수 있어야 한다. 홈 네트워크의 경우 하나의 홈 서버에 여러 개의 단말 정보기기들이 컨트롤 될 수 있으므로, 사용자 설치 및 제거가 용이해야 하며 요구사항 변경 및 유지보수에 따라 빠르게 적응해야 한다. 본 논문에서는 효율적인 정보전달 인터페이스를 적용하여 다양한 OSGi 플랫폼의 어플리케이션에 응용할 수 있는 모바일 홈 네트워크 컴포넌트를 설계 및 구현하였다. 이 컴포넌트는 사용자의 요구사항과 유지보수에 빠르게 대처할 수 있으며, 재사용 되거나 진화 할 수 있다.

Replacement of Thymidine Phosphorylase RNA with Group I Intron of Tetrahymena thermophila by Targeted Trans-Splicing

  • Park, Young-Hee;Jung, Heung-Su;Kwon, Byung-Su;Lee, Seong-Wook
    • Journal of Microbiology
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    • 제41권4호
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    • pp.340-344
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    • 2003
  • The group I intron from Tetrahymena thermophila has been demonstrated to employ splicing reactions with its substrate RNA in the trans configuration. Moreover, we have recently shown that the transsplicing group I ribozyme can replace HCV-specific transcripts with a new RNA that exerts anti-viral activity. In this study, we explored the potential use of RNA replacement for cancer treatment by developing trans-splicing group I ribozymes, which could replace tumor-associated RNAs with the RNA sequence attached to the 3' end of the ribozymes. Thymidine phosphorylase (TP) RNA was chosen as a target RNA because it is known as a valid cancer prognostic factor. By performing an RNA mapping strategy that is based on a trans-splicing ribozyme library, we first determined which regions of the TP RNA are accessible to ribozymes, and found that the leader sequences upstream of the AUG start codon appeared to be particularly accessible. Next, we assessed the ribozyme activities by comparing trans-splicing activities of several ribozymes that targeted different regions of the TP RNA. This assessment was performed to verify if the target site predicted to be accessible is truly the most accessible. The ribozyme that could target the most accessible site, identified by mapping studies, was the most active with high fidelity in vitro. Moreover, the specific trans-splicing ribozyme reacted with and altered the TP transcripts by transferring an intended 3' exon tag sequence onto the targeted TP RNA in mammalian cells with high fidelity. These results suggest that the Tetrahymena ribozyme can be utilized to replace TP RNAs in tumors with a new RNA harboring anti-cancer activity, which would revert the malignant phenotype.

Calcium Solubilization Ability and Anti-Inflammatory Effects of Hydrolyzed Casein

  • Kim, Da Young;Yoo, Jung Sik;Cho, Yoon Ah;Yoon, Ho Sik;Kim, Cheol-Hyun
    • 한국축산식품학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.687-700
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    • 2021
  • This study performed to evaluate the applicability of functional dairy food materials by comparing the calcium solubilization ability and anti-inflammatory effects of hydrolyzed casein protein. Commercial enzyme (Alcalase®; Neutrase®; Protamex®; Flavourzyme®) was added to the 10% casein solution to prepare the casein hydrolysates. Samples obtained every hour [1:200 (w/v)]. According to results of measuring the degree of hydrolysis (DH), all of four enzymatic hydrolysates increased rapidly from 30 to 40 min, and after 150 min, there were no change. Protamex® and Neutrase® had the highest DH compared to others enzymatic hydrolysates. After that, peptides obtained throughout a preparative liquid chromatography system. In the calcium solubility experiments, neutrase fraction (NF) 4 and NF7 showed similar activities with casein phosphopeptide (CPP). In vitro cell experiments showed that no cytotoxicity except for NF6. Also, the production of nitric oxide (NO) inhibited as the concentration of fraction samples increased. The cytokine (IL-1α, IL-6, and TNF-α) production was lower than lipopolysaccharide (+) group significantly. Therefore, the possibility of anti-inflammatory activity found in the hydrolyzed samples. According to the above experiments, NF3 and Protamex Fraction (PF) 3 selected. Amino acids selected throughout an AccQ-Tag system. As a result, 17 species of amino acids and several species of unknown amino acids identified. Both fractions had the highest content of phenylalanine. This study identified the potential of biologically active and functional peptides derived from casein that affect the food and dairy industry.

Development of a Magnetic Bead-Based Method for Specific Detection of Enterococcus faecalis Using C-Terminal Domain of ECP3 Phage Endolysin

  • Yoon-Jung Choi;Shukho Kim;Jungmin Kim
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제33권7호
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    • pp.964-972
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    • 2023
  • Bacteriophage endolysins are peptidoglycan hydrolases composed of cell binding domain (CBD) and an enzymatically active domain. A phage endolysin CBD can be used for detecting bacteria owing to its high specificity and sensitivity toward the bacterial cell wall. We aimed to develop a method for detection of Enterococcus faecalis using an endolysin CBD. The gene encoding the CBD of ECP3 phage endolysin was cloned into the Escherichia coli expression vector pET21a. A recombinant protein with a C-terminal 6-His-tag (CBD) was expressed and purified using a His-trap column. CBD was adsorbed onto epoxy magnetic beads (eMBs). The bacterial species specificity and sensitivity of bacterial binding to CBD-eMB complexes were determined using the bacterial colony counting from the magnetic separations after the binding reaction between bacteria and CBD-eMB complexes. E. faecalis could bind to CBD-eMB complexes, but other bacteria (such as Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Acinetobacter baumannii, Streptococcus mutans, and Porphyromonas gingivalis) could not. E. faecalis cells were fixed onto CBD-eMB complexes within 1 h, and >78% of viable E. faecalis cells were recovered. The E. faecalis recovery ratio was not affected by the other bacterial species. The detection limit of the CBD-eMB complex for E. faecalis was >17 CFU/ml. We developed a simple method for the specific detection of E. faecalis using bacteriophage endolysin CBD and MBs. This is the first study to determine that the C-terminal region of ECP3 phage endolysin is a highly specific binding site for E. faecalis among other bacterial species.

흰쥐에서 혈액지질 대사 및 항혈전작용에 관한 베타사이클로덱스트린의 생물학적 효과 (The Biological Effects of β-Cyclodextrin on Antithrombotic Activity and Plasma Lipid Metabolism in Rats)

  • 박병성
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제45권2호
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    • pp.199-210
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    • 2003
  • 일반사료, 고콜레스테롤사료 또는 포화지방함량이 높은 사료를 섭취한 흰쥐에서 항혈전작용과 혈액중성지방 및 콜레스테롤 수준에 관한 $\beta$-cyclodextrin($\beta$CD)의 급여효과를 조사하였다. 출혈시간은 일반사료, 고콜레스테롤 및 고지방사료 섭취군 모두에서 $\beta$CD 첨가구가 대조구에 비해서 각각 293%, 157% 및 218% 까지 유의적으로 연장되었다(p<0.05). 전혈응고시간은 일반사료, 고콜레스테롤 및 고지방사료섭취군에서 $\beta$CD 첨가구가 대조구와 비교할때 각각 202%, 168% 및 211%까지 유의적으로 높았다(p<0.05). $\beta$CD 첨가사료는 흰쥐 혈액내 총지질, 중성지방, 총콜레스테롤 및 저밀도지질단백질 콜레스테롤 함량을 현저하게 낮추는 원인이 되었다. 혈액내 총지질 함량은 일반사료, 고콜레스테롤 및 고지방사료 섭취군에서 $\beta$CD첨가구가 대조구에 비해서 각각 70%, 82% 및 87%까지 유의적으로 낮아졌다(p<0.05). 혈액내 중성지방함량은 일반사료, 고콜레스테롤 및 고지방사료 섭취군에서 $\beta$CD 첨가구가 대조구와 비교할 때 각각 89%, 43% 및 59%까지 유의적인 감소를 나타냈다(p<0.05). 혈액내 총콜레스테롤 함량은 일반사료, 고콜레스테롤 및 고지방사료 섭취군에서 $\beta$CD 첨가구가 대조구에 비해서 각각 28%, 62% 및 36%까지 유의적으로 낮아졌다(p<0.05). 혈액내 저밀도 지질단백질 콜레스테롤 함량은 일반사료, 고콜레스테롤 및 고지방사료섭취군에서 $\beta$CD 첨가구가 대조구에 비해서 각각 39%, 54% 및 25%까지 유의적인 감소를 나타냈다(p<0.05). 혈액내 총담즙산 함량은 일반사료, 고콜레스테롤 및 고지방사료섭취군에서 $\beta$CD 첨가구가 대조구에 비해서 각각 66%, 95% 및 97% 까지 유의적인 증가를 보였다(p<0.05). 일반사료 섭취군에서 $\beta$CD 첨가구의 HMG-CoA reductase 활성도는 대조구와 비교할 때 41%까지 유의적으로 낮아졌으며 분을 통한 스테로이드의 배설량은 167%까지 유의적인 증가를 나타냈다(p< 0.05). 이 결과는 $\beta$CD가 사람의 심장혈관계질환과 비만을 예방하는데 도움이 될 수 있는 혈액내 지질, 중성지방 및 콜레스테롤의 감소효과 그리고 항혈전작용에 관한 생리활성 기능을 갖는다는 것을 시사해 주고 있다.

GST 융합 시스템에서 나타나는 macrophage migration inhibitory factor의 tautomerase 활성 저해에 관한 연구 (Inhibitory Effort of the N-terminal GST on the Tautomerase Activity of Macrophage Migration Inhibitory Factor)

  • 김상수;김경희;박효진;허은혜;임향숙
    • 생명과학회지
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    • 제15권6호
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    • pp.961-967
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    • 2005
  • Cytokine으로 처음 밝혀진 macrophage migration inhibitory factor (MIF)는 다양한 생물학적 활성 및 효소적 활성을 지닌 단백질로 알려지고 있다. 아직까지 MIF의 서로 다른 활성간의 연관성 및 효소적 기능이 세포내에서 어떤 역할을 하는지는 명확하게 밝혀지지 않았다. 본 연구에서는 MIF가 지닌 효소적 활성 중 tautomerase활성에 대하여 좀더 자세하게 연구하였다. 먼저, GST 융합 시스템을 이용하여 MIF의 정제 조건을 확립하였다. 이를 통해서 얻어진 GST (glutathione S-transferase)-MIF와 MIF 간의 활성을 비교하여 N-말단의 GST에 의하여 MIF의 tautomerase활성이 완전히 저해되는 것을 확인하였다. 다음으로, GST 대신 N-말단에 존재하는 매우 짧은 아미노산 잔기가 MIF의 tautomerase 활성을 저해하는 지를 조사하고자, GST-MIF의 GST를 thrombin으로 제거한 tMIF를 사용하였다. 그 결과 tMIF도 GST-MIF와 마찬가지로 tautomerase 활성이 완전히 저해된다는 사실을 확인할 수 있었다. 추가로 N-말단 tag에 의한 MIF의 효소적 활성 저해가 단백질의 구조적인 변환에 의한 것인지를 조사하기 위하여 단백질 cross-linking 연구를 수행하였다. 단백질 cross-linking 결과 tMIF도 MIF와 같이 정상적으로 oligomer를 형성하는 것을 확인하였다. 이들 결과는 MIF의 N-말단 $P^{2}$를 중심으로 하는 소수성 활성부위의 노출이 tautomerase활성에 결정적인 역할을 한다는 것을 시사한다. 또한 본 연구결과는 세포내에서 MIF가 다른 단백질과의 상호결합에 의해서도 충분히 tautomerase활성이 저해될 수 있을 것이라는 가능성을 제시한다.lelopathy 효과가 있음을 밝혀냈다. 특히 화본과 사료작물의 경우 italian ryegrass, 콩과 사료작물의 경우는 purple alfalfa가 생장억제효과가 높게 나타났다. 영향을 미치지 못했다. 이상의 결과를 종합하면 현재의 체형, 체형에 대한 인식, 매스컴의 영향 등이 체형에 대항 불만족이라는 스트레스로 인지되고, 이러한 이지된 스트레스와 체중조절 행동에 대한 태도가 체중조절 행동의도를 갖도록 하는 것으로 보인다. 특히 다이어트 행동에 대한 태도는 행동결과에 대한 신념이 주요 변수였음을 감안할 때 체형에 대한 불만족을 유발하는 요인들과 감안할 때 체형에 대한 불만족을 유발하는 요인들과 다이어트 행동 결과에 대한 신념이 주요 변수였음을 감안할 때 체형에 대한 불만족을 유발하는 요인들과 다이어트 행동 결과에 대한 신념이 체중조절 행동을 유발하는 주요 요인인 것으로 판단된다. 따라서 과잉 체중조절의 확산을 억제하기 위해서 현재 자신의 체형과 바람직한 체형의 기준에 대한 바른 인식을 갖도록 하는 것이 필요하다. 그리고 체형에 대한 사회적 인식이 중용한 스트레스 요인임을 감안하여 사회 전반에 만연되어 있는 바람직한 체형에 대한 인식의 변화를 위한 노력이 행해져야 한다. 또한 신념이 행동의도에 큰 영향을 미친다는 결과에 따라 다이어트 행동 결과에 대한 신념이 올바른 지식에 근거한 바람직한 신념으로 변화될 수 있도록 하여야 할 것이다. 또한 본 연구에서는 영양지식이 다이어트 행동의도에 아무런 영향을 미치지 않은 것으로 나타났다. 그러나 단기간에 실시한 영양지식의 교육이 행동의 변화까지는 영향을 미치지 않았으나 태도에는 영향을 미친 것을 참고하여 장기적인 목표를 갖고 영양 지식의 보급에도 힘을 기울여야 하겠다.큰 것으로 보인다.의 경우 압흔과 함께 pitting 이 관찰되며, Ormco Stainless Steel의

철도차량 스마트 운영관리를 위한 RFID 기술현황 및 개발 필요성 (A case study on the RFID technology and the necessity of development for smart management of railway vehicle)

  • 이상학;차정훈;서봉진;박찬영;하병용;이은미;김창현;이학용;김재식;김관수;송정훈;박세영;황시원;여진경
    • 한국전자통신학회논문지
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    • 제9권2호
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    • pp.219-230
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    • 2014
  • 철도차량에 RFID 시스템을 도입함으로써 철도 부품관리 등을 포함한 철도차량의 스마트한 운영관리가 가능하도록 하는 것은 경제적, 산업적 뿐 아니라 사회적으로도 많은 필요성이 대두되고 있다. 본 논문에서는 해외의 RFID 연구 및 개발 활용사례를 조사 분석하였다. 철도 뿐 아니라 다양한 산업분야에 RFID 기술이 적용된 사례에 관해서도 조사하였다. 철도분야에서는 주로 차량위치 검지, 차량인식 등에 RFID 시스템이 사용된 경우가 거의 대부분이었고 부품의 단순이력 관리 등에 응용한 사례도 있었다. 본 연구를 통해, 세계적으로 이미 여러 산업분야에서 RFID 기술이 활용되고 있고 철도분야에서도 여러 국가에서 RFID 기술을 활용한 운영이 활성화되어 있으나 이러한 기술 활용은 주로 차량운행과 관련된 분야에 국한되어 있고 철도부품의 유지보수 등의 분야에서는 RFID 기술개발 및 활용이 미흡하다는 것을 알 수 있었다. 따라서 국내의 철도차량의 스마트한 운영관리를 위해서는 RFID 기술을 철도부품의 유지보수 및 이력관리에 적용할 수 있는 시스템이 반드시 필요하다.

웹 2.0 기반 RSS 데이터 수집 엔진의 설계 및 구현 (A Design and Implementation of RSS Data Collecting Engine based on Web 2.0)

  • 강필구;김재환;이상준;채진석
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제10권11호
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    • pp.1496-1506
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    • 2007
  • 기존의 웹 서비스가 정적이고 수동적인데 반해 최근의 웹 서비스는 점차 동적이고 능동적으로 변화하고 있는데, 이러한 웹 서비스 변화의 흐름을 잘 반영하는 것이 웹 2.0이다. 웹 2.0의 특징은 사용자가 능동적으로 참여하여 정보를 생산하는 것인데, 이렇게 되면, 생산되는 정보의 양이 지속적으로 증가하게 되므로 더 빠르고 정확한 정보를 공유할 필요가 있다. 이러한 필요성을 충족시키는 기술이 웹 2.0의 웹 신디케이션 기술과 태그 기술이다. 웹 신디케이션은 웹 사이트의 내용을 다른 사이트나 사용자가 받아볼 수 있도록 피드를 만든다. 태그는 정보의 핵심이 되는 단어로, 여러 인터넷 사용자들이 태그를 통한 검색으로 좀 더 빠른 정보의 공유를 가능하게 한다. 이 논문에서는 웹 2.0의 핵심 기술인 웹 신디케이션과 태그의 활용을 높이기 위한 방법으로 데이터 수집 엔진을 만들어 데이터를 효율적으로 관리하는 기법을 제안하였다. 데이터 수집 엔진은 데이터베이스에 저장된 사용자의 웹 사이트 정보를 이용하여 사용자의 웹 사이트에 접속하여 업데이트된 데이터를 수집한다. 이 논문에서 제안한 데이터 수집 엔진을 사용하여 실험한 결과 기존의 기법에 비해 검색 속도가 최대 3.14배 향상되었고, 연관 태그를 구성하는데 사용되는 데이터 건수가 최대 66%까지 감소함을 확인할 수 있었다.

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2차원 바코드와 UCC/EAN-128을 이용한 생물자원 자동인식시스템 (An Automatic Identification System of Biological Resources based on 2D Barcode and UCC/EAN-128)

  • 주민석;류근호;김준우;김흥태;한복기
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제15D권6호
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    • pp.861-872
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    • 2008
  • 컴퓨팅 환경이 발전함에 따라 다양한 물리적 객체와 디지털 정보를 연동하는 자동인식 연구가 활발히 진행 중이다. 이러한 자동인식시스템은 다양한 산업분야에서 활용되고 있음에도 불구하고 보건의료와 관련한 자동인식 기술의 접목은 아직까지 다른 산업기술 전반에 미치지 못하고 있는 실정이다. 이에 따라 의료장비, 혈액, 인체조직 등 보건의료 용품의 자동인식에 관한 여러 연구가 진행 중이다. 이 논문은 인간 유전체 연구의 필수 연구재료인 생물자원을 대상으로 자동인식 기술의 적용 방안을 제안한다. 먼저, 자동인식기술 도입을 위해 사용 환경상의 고려사항을 정의하고, 조사과정 또는 실험을 통하여 적합한 형태의 태그 인터페이스로서 바코드를 선택하였다. 바코드 심볼로지는 2차원 바코드 심볼로지인 Data Matrix를 사용하고, 데이터 스키마는 국제적 범용성 추구를 위하여 UCC/EAN-128 기반으로 설계하였다. 제안된 기술들이 실제 환경에 적용되는지를 보이기 위한 어플리케이션을 개발하고, 이에 대한 실험 및 평가를 다음의 방법으로 수행하였다. 생물자원이 실제 보존되는 영하 $196^{\circ}C$, 영하 $75^{\circ}C$의 초저온 보존환경에서 바코드 인식실험을 한 결과 1.6초 내외의 평균 인식시간을 보이며, 데이터 스키마는 생물자원 활용 분야의 요구사항을 만족하는 것으로 평가되었다. 따라서 제안한 방법으로 생물자원의 정보처리 과정에서 정확성과 데이터 입력의 신속성이 제공될 수 있다.