• 미생물학회지
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• 제51권4호
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• pp.448-452
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• 2015

효모의 생육을 억제하는 세균을 배추의 근권 토양에서 분리하였다. API 20NE test와 16S rRNA 유전자 염기서열 분석 결과 Pseudomonas fluorescens BB2로 동정되었다. P. fluorescens BB2 균주는 3%의 glucose가 포함된 YM 배지에서 $20^{\circ}C$로 배양하였을 때 효모에 대한 항생물질을 2차 대사산물로서 효과적으로 생산하였다. BB2 균주의 단백질성 항생물질은 ammonium sulfate에 의한 침전과 N-butanol 추출에 의해 농축되었으며, 효모의 생육을 억제하는데 Candida albicans KCTC 7965에 대한 minimal inhibitory concentration은 $10{\mu}g/ml$이었고, $80{\mu}g/ml$ 농도에서는 완전히 억제하였다. N-butanol 추출에 의한 친수성 분획은 Bacillus cereus ATCC 21366의 생육을 억제하였으며, chrome azurol S 평판배지에서 주황색 halo를 생성하므로 철과 결합하는 siderophore를 포함한다. 세포막을 통한 crystal violet의 흡수를 조사한 결과 효모 C. albicans에 대한 소수성 항생물질 $60{\mu}g/ml$의 농도에서는 대조군에 비해 막 투과성이 약 9% 증가하였다. P. fluorescens BB2 균주가 생산하는 항생물질은 효모 Candida의 생육을 억제하는 antimicrobial peptide의 일종으로 보이며, 이는 Pseudomonas 속에서는 처음으로 보고되는 것이다.

• 한국환경과학회지
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• 제19권11호
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• pp.1391-1396
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• 2010

Three biphenyl-degrading microorganisms were isolated from polluted soil samples in Sasang-gu, Busan. Among them, isolate DS-94 showing the strong degrading activity was selected. The morphological, physiological, and biochemical characteristics of DS-94 were investigated by API 20NE and other tests. This bacterium was identified as the genus Pseudomonas by 16S rDNA sequencing and designated as Pseudomonas sp. DS-94. The optimum temperature and pH for the growth of Pseudomonas sp. DS-94 were $25^{\circ}C$ and pH 7.0, respectively. This isolate could utilize biphenyl as sole source of carbon and energy. Biphenyl-degrading efficiency of this isolate was measured by HPLC analysis. As a result of biological biphenyl-degradation at high biphenyl concentration (500 mg/L), biphenyl-removal efficiency by this isolate was 73.5% for 7 days.

• Journal of Microbiology
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• 제41권2호
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• pp.165-168
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• 2003

We report a new PCNB-degrading strain (PCNB-2) that is able to utilize and grow on PCNB (100 ppm) as a sole carbon source. This strain was identified as Alcaligenes xylosoxidans based upon 16S rDNA sequence analysis, API 20 NE tests and cell membrane lipid analysis. The new PCNB degrader Alcaligenes xylosoxidans PCNB-2 could find use in bioremediation of PCNB, which is environmentally persistent.

• 식물병연구
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• 제16권1호
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• pp.41-47
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• 2010

고추 역병이 발생한 충주, 안면, 태안, 안동, 음성 그리고 괴산지역의 고추밭 토양에서 전체 10,753균주의 저영양 미생불을 분리하였다. 이들 중 Phytophthora capsid를 포함하여 식불체의 주요 병원성 곰팡이에 대해 길항작용을 보이는 균주들을 일차적으로 선발하였다. 최종적으로는 온실 고추유묘 검정을 통해 고추 역병에 대해 탁월한 방제가를 보이는 7F 균추가 선발되었다. 이 균주는 16SrDNA염기서열 분석과 API20 NE 키트를 통한 생리, 생화학적 분석을 통하여 Bacillus subtilis로 동정 되었다. 고추 역병균 포자를 처리한 고추 유묘 화분 검정에서, 처리25일 후 대조구는 고추 역병 이병 비율이 87%에 이르는 반면에 7F 균주를 처리한 처리구에서는 단지 6%의 이병율을 보였다.

• 한국환경농학회지
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• 제30권4호
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• pp.424-431
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• 2011

본 연구에서 우리는 광양만의 해수와 표층 퇴적물에서 TBTCl 내성세균의 개체수를 조사하였다. 광양만에서 TBTCl 내성세균의 개체수는 해수에서 $2.5{\times}10^3-3.8{\times}10^3$ cfu/mL 범위였으며, 표층 퇴적물에서 TBTCl 내성세균의 개체수는 $3.2{\times}10^5-9.1{\times}10^5$ cfu/g 범위였다. 광양만에서 TBTCl 내성세균의 종조성은 Vibrio spp. (19.2%)가 가장 높은 우점종으로 나타났고, Bacillus spp. (16.2%), Aeromonas spp. (15.2%), Pseudomonas spp. (13.1%), Klebsiella spp. (11.1%), Alteromonas spp. (9.1%), Pantoea spp. (6.1%), Proteus spp. (3.0%), Listeria spp. (2.0%), unidentified (5.0%)의 순으로 우점하였다. 또한 11개의 대표적인 TBTCl 내성균주는 여러 중금속들(Cd, Cu, Hg 및 Zn)에도 내성을 나타내었다. 이들 중에서 가장 강한 TBTCl 내성을 보이는 T7 균주를 선별하여, API 20NE등을 이용하여 본 균주의 형태학적, 생리학적 및 생화학적 특성들을 조사하였다. T7 균주는 16S rRNA gene 염기서열 분석에 의해 Pantoea 속으로 동정되어 Pantoea sp. T7으로 명명되었다. 또한 본 균주는 $500{\mu}M$의 TBTCl 농도에서도 60시간 배양 후에 정상 균주 성장의 50.7%까지 증식하였다. Pantoea sp. T7의 생물학적 TBTCl 분해활성은 GC-FPD 분석에 의해 측정되었는데, $100{\mu}M$의 TBTCl 농도에서 배양 40시간 후에 TBTCl 제거 효율은 62.7%로 나타났다.

• 한국수산과학회지
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• 제51권3호
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• pp.254-261
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• 2018

From 2014 to 2017, mortalities of seawater-cultured rainbow trout Oncorhynchus mykiss, were observed in the Goheung and Jeju areas of Korea, with Vibrio anguillarum (seven strains: RT1, 2, 3, 4, 5, 6, and 7) identified as the etiological agent. The phenotypic (based on API 20NE, API ZYM, and E-test kits), serotypic (slide agglutination tests with O1, O2, O3, O4, and O7 antisera), and genotypic (16S rRNA and ompU sequencing) characteristics of the seven RT strains were analyzed and compared to those of seven additional V. anguillarum stains (SF, isolated from sweet fish; FM, isolated from flathead mullet; ATCC43305; ATCC43311; ATCC43307; ATCC43308; and KCTC2711). The phenotypes of the RT strains showed variance, while the slide agglutination tests of the RT1-7, SF, and FM strains all showed positive reactions with serotype O1 antiserum. The 16S rRNA and ompU sequences of the RT1-7, SF, and FM strains were affiliated with V. anguillarum ATCC43305 (Serotype O1), but the ompU sequence of the SF strain differed from those of the RT1-7, FM, and ATCC43311 strains, including one amino acid substitution. We thus confirmed that serotype O1 V. anguillarum, with multiple phenotypes, continues to infect seawater-cultured rainbow trout in Korea.

• 미생물학회지
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• 제45권1호
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• pp.86-90
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• 2009

식용얼음은 식품의 제조 가공 조리 등에 직접 사용하거나 그대로 먹기 위해 먹는 물을 얼린 얼음을 뜻하며 얼음의 제조 및 판매 과정에서 미생물이 교차 오염되면 식중독 및 장염을 유발한다. 또한 식용얼음 뿐만 아니라 상수계통, 약수물, 상수와 냉온수기의 정수된 물에서도 여러 가지 원인에 의해서 세균이 증식하는 것으로 나타났다. 이런 이유로 대구시 북구지역에서 생산되는 식용얼음의 위생 상태를 살펴보고자 무작위로 15곳을 선정하여 Brain Heart Infusion 배지에서 세균을 배양한 결과 1곳을 제외한 14곳의 검체에서 균이 증식 되었고 그람염색 결과, 그람음성간균이 80% 차지하였고 그람양성구균 17% 그리고 그람음성구균 3%의 분포를 나타냈다. 그람음성간균의 잠정적인 동정방법으로 API 20E kit와 API 20NE kit를 이용한 결과 Enterobacter cloacae, Chryseomonas luteola, Pantoea spp., Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter calcoaceticus, Providencia rettgeri 등이 검출 되었다. 5곳에서 분리된 그람양성구균을 API Staph kit를 이용한 잠정적 동정결과 L업소에서 분리된 균은 식중독을 일으키는 병원성이 강한 Staphylococcus aureus로 동정되었다. 본 연구에서는 대구시 북구 지역의 식용 얼음류에 존재하는 일반세균 및 병원성 세균의 분포를 조사함으로 식용얼음의 위생 상태에 대한 주의를 부각시키고 나아가 대구시 타지역의 식용얼음에 대한 세균분포 조사 및 위생상태 점검에 대한 필요성을 시사한다.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제58권4호
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• pp.349-354
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• 2015

Brown blotch disease in cultivated mushrooms is caused by Pseudomonas tolaasii, which secretes a lipodepsipeptide, tolaasin. Tolaasin is a pore-forming toxin in the cell membranes, thus destroying the fruiting body structure of mushroom. In this study, we isolated pathogenic bacteria from mushrooms that had symptoms of brown blotch disease. In order to identify these bacteria, their 16S rRNA genes were sequenced and analyzed. Pathogenic bacteria identified as Pseudomonas species were thirty five and classified into five subgroups: P1 to P5. Each subgroup showed different metabolic profile measured by API 20NE kit. Fifty percent of the bacteria were identified as P. tolaasii (P1 subgroup). All five subgroups caused the formation of brown blotches on mushroom tissues and the optimum temperature was 25oC, indicating that they may be able to secrete causal factors, such as tolaasin and similar peptide toxins. These results show that there are at least five different pathogenic Pseudomonas species as blotch-causing bacteria and, therefore, strains from the P2 to P5 subgroups should be also considered and studied as pathogens in order to improve the quality and yield of mushroom production.

• 미생물학회지
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• 제38권4호
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• pp.235-240
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• 2002

식품폐수처리장의 활성슬러지와 논, 밭의 토양에서 우수한 protease 생성 균주을 분리 선별하였다. 이 중 효소활성이 우수한 PB16은 그람 음성, 간균이며 protease activity는 6.49 U/ml이었다. 생리, 생화학적 특성 및 16S rRNA 염기서열분석을 실시한 결과, Aeromonas hydrophila (99.0%) 인 것으로 확인 되었다. Bioscreen C를 사용한 최적 성장조건 평가는 합성폐수에 vitamin과mineral을 첨가한 배지의 중식속도(0.26 $h^{-1}$)가 무 첨가배지(0.21 $h^{-1}$)보다 높았으며, 분리균주의 합성폐수 유기물 제거능 실험에서는 초기 soluble-CODcr 2,472 mg/l인 고농도 합성폐수를 1일, 3일 반응 후 각각 59, 87%의 제거율을 나타내었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제12권2호
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• pp.279-285
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• 2002

Phytase (myo-inositol hexakisphosphate phospho-hydrolase, EC 3.1.3.8) catalyzes the hydrolysis of phytate (myo-inositol hexakisphosphate) to release inorganic phosphate. A bacterial strain producing phytase was isolated from soil around a cattle shed. To identify the strain, cellular fatty acids profiles, the GC contents, a quinine-type analysis, and physiological test using an API 20NE kit were carried out. The strain was identified to be a genus of Pseudomonas sp. and named as Pseudomonas sp. YH40. The optimum culture condition for the maximum productivity of phytase by Pseudomonas sp. YH40 were attained in a culture medium composed of $1.0\%$ (w/v) glycerol, $2.0\%$ (w/v) peptone, and $0.2\%$ (w/v) $FeSO_4{\cdot}7H_2O$. Within the optimal medium condition, the production of phytase became highest after 10 h of incubation, and the maximal phytase production by Pseudomonas sp. YH40 was observed at $37^{\circ}C$ and pH 6.0.