• International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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• 제9권1호
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• pp.137-144
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• 2004

The diamondback moth, Plutella xylostella, is notorious because of its extensive potential and actual dispersal ability. Previously, the Korean populations of P. xylostella was extensively collected and analyzed for their genetic population structure using a portion of mitochondrial DNA (mtDNA). One of the postulated characteristics on population genetic structure of the species includes the presence of heterogeneous haplotypes, possibly possessed by some dispersed ones from neighboring countries. In this study, we sequenced ten P. xylostella collected from China (∼2,000 km away from the middle part of Korea) to know the genetic relationships of these to the Korean P. xylostella. Sequence analysis of the identical portion of COI gene resulted in five haplotypes with the sequence divergence ranging from 0.5% (two nucleotides) to 1.1 % (five nucleotides) among them and from 0.7% (three) to 2.5% (11) to the pre-existing 52 Korean haplotypes. Phylogenetic analysis showed that the Chinese P. xylostella were neither clearly separated from the Korean haplotypes nor clustered with one heterogeneous Korean haplotype. This result reinforces the significance of gene flow in this species and suggests to exclude the possibility that the heterogeneous Korean haplotypes may have emigrated from China, where our samples were obtained, although further extensive investigation is required.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제3권2호
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• pp.86-90
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• 1993

CMCase positive clones were screened from Cellulomonas sp. YE-5 and named pCE1, pCE2 and pCE3. Among the positive clones pCE1 was used for this study, because it has the smallest insert and the highest CMCase activity among the 3 clones, and its nucleotide sequence was determined. The CMCase gene in pCE1 was composed of 1071 bp of nucleotides coding 357 amino acids. Computer analysis showed that the pCE1 has 65% sequence homology with the endoglucanase from Cellulomonas fimi.

• 대한예방의학회:학술대회논문집
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• 대한예방의학회 1999년도 제51차 추계 학술대회 연제집
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• pp.1-15
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• 1999

In a case-control study to evaluate the factors involved in the development of hepatocellular carcinoma, polymorphisms of the p53 gene were compared in 68 cases mostly infected with hepatitis C virus (HCV) and 68 controls matched for sex and age: DNA from peripheral blood leukocytes was analyzed by the polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism method and direct sequencing. Polymorphisms analyzed were those in exon 4 (CCC vs. CGC, Pro vs. Arg at codon 72, Al allele vs. A2 allele), intron 2 (C vs. G at nucleotide 38, Al vs. A2), intron 3 (C vs. A at nucleotide 65, Al vs. A2; absence and presence of 16 base pair repeat at nucleotides 24 to 39, Al vs. A2), intron 6 (A vs. G at nucleotide 62, Al vs. A2) and intron 7 (C and T vs. T and G at nucleotides 72 and 92, Al vs. A2). A significantly higher frequency of the allele for CCC (Pro, Al) at codon 72 of exon 4 was found in cases (39%) than in controls (26%) (p<0.05). Highly significant linkage of the polymorphisms in exon 4, intron 2, intron 3 and intron 7, and between the intron 3-16 bp duplication and polymorphism in intron 6 also was found. Matched Fair analysis showed significantly higher frequencies of certain haplotypes (1-1-1-1-2-2 or 1-1-2-1-2-1 for exon 4, intron 2, intron 3, the intron 3-16 bp duplication, intron 6 and intron 7) in cases than in controls (p=0.014, OR=2.27, 95% CI= 1.08-5.12). No preference of specific p53 polymorphisms for specific HCV genotype was detected. These findings suggest that in hepatocarcinogenesis mainly due to HCV infection, genetic factors may be involved and that genetic markers can serve as predictors of a high-risk group for hepatocarcinogenesis.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제30권1호
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• pp.145-148
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• 2009

Nucleotides are the building blocks of nucleic acids and essential for many cellular functions. In this study, ultrasonic absorption spectra of $\beta$-cyclodextrin ($\beta$-CD) and adenosine 5'-monophosphate (AMP) in aqueous solution were measured over the broad frequency range 0.1-40 MHz with emphasis on the low-frequency range below 1 MHz. Here we show that the interaction of $\beta$-CD and AMP complies with a typical spectrum of a single relaxation process. We determined reliable rate (kb) and equilibrium (K) constants and a standard volume change ($\Delta$V) of the reaction. They are $k_b=2.3{\times}{{10^{-6}}_s}^{-1},\;K=89M^{-1},\;and\;{\Delta}V=13.8(10^{-6}m^3mol^{-1})$, respectively.

• Mycobiology
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• 제30권1호
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• pp.1-4
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• 2002

Genetic relatedness of medically important Exophiala species such as E. dermatitidis, E. mansonii, and three E. jeanselmei varieties: jeanselmei, lecanii-corni, and heteromorpha was examined using PCR-RFLP(restriction fragment length polymorphism) of ribosomal DNA, M-13, $(GTG)_5$ and nucleotide sequences of ribosomal ITS(internal transcribed space) II regions. Three E. jeanselmei varieties showing distinct band patterns for each DNA markers as well as different nucleotide sequences of ribosomal ITS II regions could be considered as a separate species. E. dermatitidis and E. mansonii demonstrated the identical band patterns of RFLP of ribosomal DNA, M-13, and $(GTG)_5$ markers. However, nucleotides sequences of ribosomal ITS II region were different between these two species.

• Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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• 제18권2호
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• pp.133-142
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• 1991

본 연구의 목적은 임신 초기 자궁 조직중의 cyclic nucleotide 의 변화 및 PAF 가 이들에 미치는 영향을 관찰함으로써 PAF 가 흰쥐의 초기 임신에 어떻게 관련하는지를 조사하기 위함이다. 시험구로써 임신 각 일에 $1{\mu}g$ 의 PAF 혹은 이것의 수용체 길항제인 1.25mg의 BN-52021이 근육내 조사되었고 비 임신구 및 대조구에 대하여는 PBS만이 주사되었다. 자궁 조직중의 cAMP 및 cGMP 농도는 분석용 test kit를 사용하여 분석되었다. 비 임신구 경우 자궁 조직중 cAMP 농도는 단백질 mg 당 $2.91{\pm}0.33$ pmol로서 임신 보다도 낮았고 cGMP 농도 또한 $0.39{\pm}0.20$ pmol로서 임신구보다 낮은 경향이 었다. 자궁 조직중 cAMP 의 최고농도는 임신 3일째 ($5.92{\pm}1.72$ pmol/mg protein) 였고 cGMP 경우는 임신 4일째($1.03{\pm}0.22$ pmol/mg protein) 이었다. 임신 각일에 PAF 는 PAF 처리하지 아니한 대조구에 비하여 증가된 cAMP 를 보여주었으나(임신 0, 2, 그리고 4 일째 경우 p<0.05) BN-52021은 감소된 경향을 나타내었다. cGMP에 대하여는 PAF나 BN-52021 공히 일정한 효과적 경향을 보이지 아니하였다. 따라서, 임신은 자궁 조직중 cyclic nucleotide에 영향을 미칠 수 있으며 흰쥐의 착상기동안 PAF는 cGMP에 대하여 보다는 cAMP에 영향을 미침으로써 착상에 관련된 일련의 반응에 영향을 미칠 것으로 사료된다.

• 생명과학회지
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• 제12권6호
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• pp.821-834
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• 2002

알렉산드륨 적조생물의 리보소옴 알엔에이 유전자의 ITS1, 2 및 5.8S부위를 대상으로 종간 혹은 종내의 유전적 다양도를 조사하기 위하여 지리적으로 격리된 33 스트레인 유전자의 염기서열를 비교했다. 진해만에서 분리된 AT-2, AT-6, AT-10, AT-A, AT-B 5클론은 일본종 OFX151-A과 동일한 유전자임을 발견했다. ITS부위에서 가장 짧은 종은 A. margalefi로 481 bp이며 가장 긴 종은 A. affine으로 528 bp로 나타났다. ITS1과 ITS2 염기서열에 대한 상호관계는 역으로 나타낸 반면에, G＋C 함량에 대한 상호관계는 플러스로 나타났다. 유전적 변이율은 0.3% (1 bp)에서 53% (305 bp)였다. A. tamarense과 가장 적게 유전적 변이율을 보인 종은 A. fundyense(1.2-2.3% ＝ 6-12 bp)인 반면에, A. catenella와는 큰 변이율 (19.8% ＝ 102 bp)을 보였고, A. catenella와 A. fundyense은 19.7% 상이하였다. 알렉산드륨 적조생물의 bootstrap은 약하게 지지되는 데도 불구하고, A. catenella 분리종은 독립적인 그룹으로 형성하여 상호간에는 강력한 bootstrap 값은 PAUP과 NJ 분석에서 보였다. A. cohorticula와 A. frateculus 적조생물은 항상 sub-group 내에서 높은 bootstrap을 가졌다. 결론적으로 ITS부위의 염기서열 분석은 알렉산드륨 적조생물의 집단내 혹은 집단간의 계통분류을 밝히는데 유용한 것으로 보였다.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제1권1호
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• pp.97-105
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• 1997

The regulatory role of cyclic nucleotides in the expression of neutrophil responses has been examined. fMLP-stimulated superoxide production in neutrophils was inhibited by dibutyryl adenosine 3',5'-cyclic monophosphate (DBcAMP), histamine, adenosine + theophylline, cAMP elevating agents, and 8-bromoguanosine 3' ,5' -cyclic monophosphate (8-BrcGMP) and sodium nitroprusside, cGMP elevating agents. Staurosporine, a protein kinase C inhibitor, genistein, a protein tyrosine kinase inhibitor and chlorpromazine, a calmodulin inhibitor, inhibited superoxide production by fMLP, but they did not further affect the action of DBcAMP on the stimulatory action of fMLP. DBcAMP, histamine, adenosine+theophylline and genistein inhibited myeloperoxidease release evoked by fMLP, whereas BrcGMP, sodium nitroprusside and staurosporine did not affect it. The elevation of $[Ca^{2+}]_i$ evoked by fMLP was inhibited by genistein and chlorpromazine but was not affected by staurosporine. DBcAMP exerted little effect on the initial peak in $[Ca^{2+}]_i$ response to fMLP but effectively inhibited the sustained rise. On the other hand, BrcGMP significantly inhibited both phases. fMLP-induced $Mn^{2+}$ influx was inhibited by either DBcAMP or BrcGMP. These results suggest that fMLP-stimulated neutrophil responses may be regulated by cAMP more than cGMP. cAMP and cGMP appear not affect stimulated responses by direct protein kinase C activation. Their regulatory action on the stimulated neutrophil responses may be not influenced by other activation processes.

• 한국식품영양과학회지
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• 제17권1호
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• pp.33-41
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• 1988

12종(種)의 활어(活魚) 또는 신선어(新鮮魚)의 근육(筋肉)에 있어서 K치(値)의 증가율(增加率) 및 IMP 분해효소(分解酪素)의 활성(活性)에 관(關)한 실험결과(實驗結果)는 다음과 같다. 1. K값은 붉은살어(魚)보다는 흰살어(魚)의 선도판정(鮮度判定) 지표(指標)로서 적당(適當)하나 적신어(赤身魚)라도 혈합육(血合肉)의 함량(含量)이 $0.5{\sim}31%$이므로 지장(支障)이 없을 것으로 사료(思料)된다. 2. K값의 변화속도(變化速度)와 IMP 분해효소(分解酪素) 활성간(活性間)의 상관계수(相關係數)는 0.77이며 고도(高度)의 유의성(有意性)이 인정(認定)된다. 3. 어육내(魚肉內)에는 IMP 분해효소(分解酪素) 활성(活性)의 저해제(沮害劑)가 내재(內在)할 것으로 사료(思料)된다 4. IMP에 대(對)한 PH 활성곡선(活性曲線)은 어종(魚種)에 따라 다른데, 이것은 5'-N tase나 P Mase의 양적(量的), 질적(質的), 존재양식(存在樣式)이 어종(魚種)에 따라 다르기 때문이라 생각된다.

• 생명과학회지
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• 제18권6호
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• pp.759-763
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• 2008

2007년 전라남도 여수시 남면 안도리에서 발견된 국내 미기록종 해오말은 지리적으로 열대부터 아열대까지 넓게 분포하는 식물로서 열매를 만든다. 잎의 모양은 계란형에 가깝고, 입꼭지는 견고하고 잎을 지지하고 있다. 뿌리는 불규칙적으로 뻗어있고, 뿌리 사이로 꽃이 형성되어 있다. 잎맥은 잎의 가장자리와 공간을 유지하고 있다. ITS1과 ITS2 부위은 한국산과 일본산 해오말은 100% 동일한 염기서열을 나타내고 있으나, 5.8S에서 한국산 해오말은 202 bp에서 206 bp까지 4개의 염기가 삽입된 것이 보였다. ITS 부위에 대한 한국산 해오말은 일본산과 동일한 유전적 clade을 나타내었으나, 필리핀, 호주, 베트남, 말레이시아산 해오말과는 유전적 분리를 보였다. 따라서 한국산 해오말은 일본에서 gene flow로 된 것으로 추정되며, 아열대성인 해오말이 우리나라 연안에 나타난 것은 기후변동에 의한 수온상승과도 밀접한 관계가 있는 것으로 보인다.