• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제53권4호
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• pp.225-231
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• 2010

기질분자로서 polyhydroxy 치환된 2-phenyl-l,4-benzopyrone 유도체(Flavones)(1-25)들의 hydroxyl 치환기($R_1-R_9$)가 변화함에 따른 Tyrosinase(PDB ID: oxy-form; 1WX2)에 대한 저해활성을 이해하기 위하여 분자도킹과 3차원적인 정량적 구조활성관계 (3D-QSARs: CoMFA 및 CoMSIA)가 연구되었다. 그 결과, 통계적으로 CoMFA 1 및 CoMSIA 1 모델이 가장 양호한 3D-QSARs 모델이었다. 또한, 순차 혼합화 분석결과로부터 CoMSIA 1 모델($dq^2'/dr_{yy'}^2$=1.009 및 $q^2$=0.511)이 우연상관성에 저촉되지 않는 최적화 모텔이었으며 최적화된 CoMSIA 1 모델의 tyrosinase에 대한 저해활성은 기질분자의 정전기장(51.4%)에 의존적이었다. Tyrosinase의 반응점에 대한 3D-QSAR 모델의 등고도는 수용체로서 tyrosinase과 저해제로서 2-phenyl-l,4-benzopyrone 기질분자 사이의 새로운 상호작용 관계를 이해하는 계기가 되었다. 그러므로 이 결과들은 새로운 잠재적인 tyrosinase 저해제의 최적화에 적용될 수 있을 것이다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제31권11호
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• pp.3297-3300
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• 2010

In this study, the 3D-QSARs (three-dimensional quantitative structure-activity relationships: CoMFA and CoMSIA) between structural changes of N-phenyl-O-phenylthionocarbamate analogues (1-30) and their fungicidal activities against the capsicum phytophthora (Phyophthora capsici) fungi were analyzed, then considered quantitatively in terms of minimum structural requirements for fungicidal evaluation. The statistical qualities ($r^2_{cv.}$ = 0.510 and $r^2_{ncv.}$ = 0.948) of the optimal CoMFA 1 model are improved over the other models in the conditions of field combinations, and the two alignments. In the optimal CoMFA 1 model, relative contribution percentages of the CoMFA field were: steric field, 52.3%; electrostatic field, 37.8%; hydrophobic field, 9.9%. Results were similar for the CoMFA 2 model. Therefore, the steric field of the analogues had the highest contribution ratio for fungicidal activity. Specifically, with the contour map of steric fields, the fungicidal activity increased when bulky steric Y-substituents were introduced to the meta-position on the N-phenyl ring and small steric Y-subsituents were introduced to its para-position.

• 대한화장품학회지
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• 제39권4호
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• pp.329-335
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• 2013

본 연구에서는 기질 화합물로써 일련의 4-hydroxybenzyl alchol (4-HBA) 유도체들의 치환기($R_1$ 및 $R_2$) 변화에 따른 tyrosinase 활성저해에 관한 3차원적인 구조-활성 상관관계(3D-QSARs) 모델을 유도하고 정량적으로 검토하였다. 그 결과, 입체장(S), 정전기장(E), 소수성장(Hy), 수소결합 받게장(HA) 및 수소결합 주게장(HD)의 조합조건에서 통계적으로 양호한 CoMSIA FF 모델(상관성; $r^2$ = 0.858 및 예측성; $q^2$ = 0.951)을 유도하였다. 등고도 분석결과에 의하면 기질분자의 $R_2$-치환기는 입체적으로 작고 음전하를 띄며, 소수성이면서 수소결합 주게장을 선호하지 않는 치환기가 올수록 tyrosinase 활성저해 작용이 용이하다. 그리고 $R_1$-치환기는 수소결합 주게장을 선호하는 치환기 이어서 $R_1$-치환체가 용이하게 탈 양성자화가 일어나야 tyrosinase 활성저해 작용을 용이하게 할 것이라고 예상되며, 이를 위해서는 $R_1$-치환기가 비 치환체(H)이어야 될 것으로 예상되었다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제27권11호
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• pp.1741-1746
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• 2006

3D-QSARs on the neuroblocking activities by 1-(6-chloro-3-pyridylmethyl)-2-nitroiminoimidazolidine analogues as agonist at the nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) were studied quantitatively using CoMFA and CoMSIA methodologies. The statistical results of CoMFA (A5: $r^2\;_{cv.}\;=\;0.707\;&\;r^2\;_{ncv.}$= 0.986) and CoMSIA model (A3: $r^2\;_{cv.}$ = 0.715 & $r^2\;_{ncv.}$ = 0.961) showed the best predictability and fitness for neuroblocking activity based on the cross-validated value and non-cross validated value. The steric and H-bond acceptor nature of a compound were essential for high activity. The study on 3D-QSARs between substrate molecules and their neuroblocking activities appears to be an useful approach for designing better neuroblocking drug development.

• Applied Biological Chemistry
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• 제51권2호
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• pp.119-123
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• 2008

3-치환된 5,5'-diphenylimidazolidine-2,4-dione 유도체(1-22)들의 fatty acid amide hydrolase (FAAH) 저해활성에 관한 3차원적인 정량적 구조와 활성과의 관계(3D-QSARs)를 비교 분자장 분석(CoMFA)과 비교분자 유사성 지수분석(CoMFA) 방법으로 각각 검토하였다. CoMFA A1 모델과 CoMSIA 2F 모델 모두 상관성과 예측성이 양호하였다. 두 모델의 정보에 의한 등고도에 따라 설계된 X=I, Y=$N_2{^+}$-치환체(P1: $Pred.pI_{50}$=6.55)는 FAAH에 대하여 가장 높은 저해활성을 나타내었다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제51권1호
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• pp.38-43
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• 2008

시들음병균(Fusarium oxysporum)의 살균활성에 관한 N-phenylbenzenesulfonamide 유도체들의 3차원적인 정량적 구조-활성관계(3D-QSARs)들을 비교 분자장 분석(CoMFA)과 비교분자 유사성 지수분석(CoMSIA) 방법으로 각각 검토하였다. 전반적으로 CoMFA 모델들이 CoMSIA 모델들 보다 좋은 통계값을 나타내었다. 그리고 최적의 CoMFA 2 모델($r^2\;_{cv.}=0.523$ 및 $r^2\;_{ncv.}=0.956$)의 정보에 따라 살균활성은 주로 정전기장에 의존적이었다. 또한 최적의 CoMFA 2 모델에 의한 등고도 분석결과로부터 N-phenyl 고리상 R4-치환기의 입체성과 양전하를 선호하는 성질이 시들음병균의 살균활성에 기여할 것으로 예상되었다.

• 농약과학회지
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• 제6권3호
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• pp.166-174
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• 2002

정량적인 분자 구조와 물리-화학적인 성질 사이의 상관관계(QSAR)식을 이용하여 약효성을 예측하고 새로운 농약을 탐색하거나 개발하는데 있어서 효율적인 수단으로 활용되는 QSAR 기법의 발전 과정과 자유 에너지 직선관계(LFER)에 관한 기본 개념을 위시한 QSAR 기법의 목적과 유용성 그리고 장단점과 활용 상 제한점 등에 관한 일반적인 내용에 대하여 간략하게 논의하였다.

• 농약과학회지
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• 제14권1호
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• pp.72-77
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• 2010

3차원적 정량적인 구조-활성관계(3D-QSARs: CoMFA 및 CoMSIA)에 기초하여 phytoene desaturase (PDS)에 대한 O-(2-phenoxy)ethyl-N-aralkylcarbamate 유도체(1-15)의 제초성 평가를 위한 R-phenoxy 치환기들의 구조적인 요건들을 정량적으로 검토하였다. CoMFA 1 모델의 예측성 및 상관성($r^2_{cv.}=0.753$ 및 $r^2_{ncv.}=0.964$)이 나머지 모델들보다 높았다. 최적화된 CoMFA 1 모델로부터 PDS 저해활성은 O-(2-phenoxy)ethyl-N-aralkylcarbamate 유도체들의 입체장(44.0%), 정전기장(36.3%) 및 소수성장(19.6%)에 의존적이었다. CoMFA 등고도 분석결과, phenoxy 고리상 meta-와 para-위치에는 입체적으로 큰 치환기, meta-위치는 음하전, para-위치의 바깥 부분에는 양하전, ortho- 및 para- phenoxy 고리 중앙의 바깥 부분에는 친수성 치환기가 그리고 meta-위치에 소수성 R-치환기가 각각 도입될 경우에 PDS에 대한 저해활성이 증가할 것으로 예측되었다.

• 대한화장품학회:학술대회논문집
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• 대한화장품학회 2003년도 IFSCC Conference Proceeding Book I
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• pp.225-231
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• 2003

To search and development a new material with superior melanogenesis inhibitory activity, the bioactivities (obs. pl$_{50}$) of alkyl-3,4-dihydroxybenzoyl esters and N-alkyl-3,4-dihydroxybenz-oyl amides as substrate molecules were measured in mouse melanoma cells. And also, we have studied that 3-D QSARs (3 dimensional Quantitative Structure-Activity Relationships) between molecular interaction field of substrates and the bioactivities were analyzed using CoMFA (Comparative Molecular Field Analyses) method. When cross-validation value (q$^2$) is 0.68 at 3 components, the Pearson correlation coefficient ($r^2$) is 0.900. From the basis on the findings, the model was appeared by the contour map such as steric field and electrostatic field relationships between quantitative structure and the bioactivity of the various substrate derivatives. Measured bioactivities (obs. pl$_{50}$) of unknown compounds are very similar to predicted activity (pred. pl$_{50}$) according to the CoMFA model. As the results of prediction, we could conclude that the bioactivities were increased by creation of R$_1$ substitution of 5,5-dime-thylhexoxy, 6,6-dimethylheptyl, 1-amino-6,6-dimethylheptyl group etc and R$_2$ substitution of hydroxy, methyl, methoxy group etc.p etc.

• 농약과학회지
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• 제12권1호
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• pp.9-17
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• 2008

일련의 새로운 cyclohexanone 유도체(5-benzofuryl-2-[1-(alkoxyimino)alkyl]-3-hy-droxycyclohex-2-en-1-ones)와 벼(Oryza sativa L.) 및 돌피(Echinochloa crus-galli)에 대한 제초활성과의 정량적인 구조-활성관계(QSARs)를 2D-QSAR 및 HQSAR 방법으로 검토하였다. 일반적으로 HQSAR 모델이 2D-QSAR 모델보다 예측성과 적합성이 좋았다. 2D-QSAR II 모델로부터 돌피의 제초활성은 분자의 Balaban 지수(BI)와 $R_1$ 및 $R_3$-기의 소수성에 의존적이었다. 또한, HQSAR IV 모델에 따라 $R_3=ethyl$ 기가 벼의 제초활성에 기여하는 반면에 5-(cyclohex-3-enyl)-2,3-dihydrobenzofuran 고리 부분은 두 초종의 제초활성에 기여하지 않았다.