• 환경생물
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• 제21권2호
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• pp.87-100
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• 2003

환경오염이 심각해짐에 따라 국내외적으로 환경에 대한 관심이 고조되고 인체에 해를 끼치는 환경요인으로부터 방어하기 위한 많은 노력들이 기울여지고 있다. 특히 내분비계장애물질이 생식기능과 면역기능을 약화시키고, 행동 이상을 일으키며, 암 발생률을 높인다는 점이 밝혀지기 시작하면서 많은 연구들이 발표되고 여러 가지 방법들이 내분비계장애물질과 더불어 환경분야연구에 응용되어왔지만 단백질을 대상으로 연구하여 유전자기능을 연구하는 프로테오믹스(proteomics) 연구를 접목시키려는 시도가 아직까지는 빈약하다. 프로테오믹스는 기능을 갖는 단백질들의 발현을 종합적이고 정량적으로 측정하는 가장 직접적인 수단이고, 질병, 약물투여, shock 등 생물학적인 동요(perturbation)에 의하여 변하는 단백질들의 발현양상의 변화를 정확하게 관찰할 수 있으며, 생체내 유전자발현의 궁극적인 양상을 규명할 수 있고, 또한 유전자, 단백질 및 질병간의 연결고리를 제공한다. 기존의 biomarker는 다른 질병 표지자와 연관성이 높아 직접적인 유해물질 노출 위험도를 정확히 판정하기 어렵다. 따라서 대량발굴탐색(high-throughput screen-ing)이 가능한 2차원 전기영동 분석과 MALDI-TOF 또는 protein chip array와 SELDI-TOF에 의한 단백질 분자구조 분석기술 및 이들을 지원하는 생물정보학(bio-informatics)의 발전을 이용하여 환경독성 연구에 이용 할 수 있는 표적단백질(biomarker)발굴에 적절한 이용이 가능할 것이다.

• 한국식품저장유통학회지
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• 제30권5호
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• pp.885-895
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• 2023

본 연구에서는 참치 부산물을 활용한 항산화 신소재 개발의 가능성을 탐색하기 위해 부산물을 이용한 단백가수분해물 제조 및 항산화 활성을 평가하였다. 5종의 단백질 분해효소(alcalase, bromelain, flavourzyme, neutrase 및 papain)를 이용한 단백가수분해물 제조 시 12시간을 최적의 가수분해 시간으로 선정하였으며, 특히 alcalase, flavourzyme, neutrase의 가수분해도가 높게 나타났다. 이를 각 가수분해물의 수율과 비교하였을 때 유사한 경향임을 확인하였다. 각 효소제를 12시간 처리하여 제조한 단백가수분해물의 항산화 활성을 비교한 결과, TPF가 다른 가수분해물에 비해 유의적으로 높은 ROS(ABTS radical 및 H₂O₂) 소거 활성을 보이는 것으로 확인되었다. 또한 TPF는 hydroxyl radical에 의한 2-deoxy-D-ribose의 산화 및 linoleic acid의 과산화에 대해서도 우수한 억제 활성을 나타내었으며, 참치 가공부산물로부터 제조한 추출물, 밀웜 단백가수분해물 및 대두 단백가수분해물과의 ROS 소거 활성 비교 실험에서도 TPF가 상대적으로 우수한 활성을 보였다. 본 연구를 통해 참치 가공부산물을 이용한 항산화 소재개발 가능성을 확인할 수 있었으며, 본 연구 결과들은 수산가공부산물을 이용한 신규 생리활성 소재 개발용 기초연구자료로 활용될 수 있을 것으로 예상된다.

• 농업과학연구
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• 제25권1호
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• pp.79-88
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• 1998

본 연구는 축협중앙회 한우개량부에서 사육중인 한우의 혈액으로부터 genomic DNA를 추출하여 한우의 면역체계에 중요한 역할을 담당하고 있는 BoLA DRB3 exon2 유전자를 PCR기법을 이용하여 증폭하고 친자확인을 위한 이들 대립유전자들의 염기서열을 분석하여 한우의 효율적인 육종에 분자유전수준에서의 접목을 위한 기초자료를 얻고자 실시하였던바, 얻어진 결과를 요약하면 다음과 같다. 1 한우의 혈액에서 추출된 genomic DNA를 1.5% agarose gel에서 전기영동한 결과, 12.2kb이상의 단일밴드로 나타나, genomic DNA는 아주 잘 분리된 것으로 판단되었으며, 한편 genomic DNA로부터 PCR기법을 이용하여 BoLA DRB3 exon2 유전자를 증폭한 결과 284kb의 단편이 증폭 되었음을 확인하였다. 2. PCR 증폭산물을 pCR 2.1 vector를 사용하여 cloning 하고, 균주에 형질전환을 시켜 재조합 plasmid를 추출한 후, EcoR 1으로 처리한 결과 300bp 단편이 확인되어 증폭되어진 BoLA DRB3 exon2 유전자가 vector 내에 잘 삽입되었음을 확인하였다. 3. 부와 모의 BoLA DRB3 exon2 대립유전자의 염기서열을 분석한 결과 염기서열의 상동성은 부의 대립유전자간에는 82.0% 이었고, 모의 대립유전자간에는 90.1%이었다. 4. 친자를 확인하기 위해 부와 모 그리고 자손간의 가계에 대한 BoLA DRB3 exon2 대립유전자의 염기서열을 분석한 결과 Mendel 의 법칙에 따라 유전된다는 사실을 확인 할 수 있었다. 5. 이상의 결과를 종합하여보면 한우의 BoLA DRB3 exon2 유전자의 부와 모, 그리고 자손의 대립유전자에 대한 염기서열 수준에서의 친자확인이 가능하였으며, 이들 연구결과는 축우의 유전적 능력개량에 중요한 분자유전학적 기초 자료가 될 것으로 판단되었다.

• 대한바이러스학회지
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• 제26권2호
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• pp.215-225
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• 1996

Aseptic meningits, an acute inflammation of the meninges, is a common illness during childhood. Virus is the most important cause of aseptic meningitis. Especially enterovirus causes approximately above 85% of all cases of aseptic meningitis. In 1993, there was a big epidemic of aseptic meningitis by ECHO 9 and ECHO 30 viruses. And ECHO 3 virus was isolated as a causative agent of aseptic meningitis in 1994. This study was aimed to detect the causative agent of aseptic meningitis in 1995 and to analyze the 5'-noncoding region which was used to detect virus. Virus was isolated from 87 stools and cerebrospinal fluid specimens of the patients by cultured RD and HEp-2 cell. Neutralizing antibody tests using enterovirus serum pool were performed on the specimens with cytopathic effect. 3 of ECHO 7 viruses and 5 of Coxsackie B3 viruses were isolated from stool specimens and 1 of ECHO 7 and Coxsackie B3 mixed type was confirmed from cerebrospinal fluid specimens. RNA was isolated from the culture supernatants of infected cells and general primers were selected in highly conserved part of the 5'-noncoding region of the enteroviral genome for RT-PCR. PCR product from this virus showed a 152bp band on gel electrophoresis. Sequence of obtained DNA was compared with prototype sequences by accessing to the Genebank database. 5'-noncoding region of isolated Coxsackie B3 virus, which has point mutations in nucleotide sequence positions 493, 497, 502, 523, was closely related to that of polio virus type 1, Mahoney strain. In case of isolated ECHO 7 virus, nucleotide has been changed from cytosine to thymine at position 581 and from thymine to cytosine at position 583. We concluded the causative agents of the outbreak of aseptic meningitis during June to July in 1995 were both ECHO 7 and Coxsackie B3 virus, and the primer used in this study could allow a rapid diagnosis of enteroviruses by PCR.

• 한국잡초학회지
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• 제12권4호
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• pp.368-373
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• 1992

귀리에 alachlor를 처리(處理)할 때 변화(變化)되는 단백질(蛋白質)을 분석(分析)한 결과요약(結果要約)하면 다음과 같다. Alachlor 처리시(處理時) 단백질(蛋白質) 합성(合成)은 $1{\times}10^{-4}$M에서 5.8%, $1{\times}10^{-3}$M에서는 86.5% 억제(抑制)되는 현상(現象)을 보였지만 $1{\times}10^{-5}$M 이하(以下)의 농도(濃度)에서는 증가(增加)되는 현상(現象)을 보였다. 귀리의 근단분열조직(根端分裂組織)에서 추출(抽出)된 단백질(蛋白質)은 100 kd 이하(以下)의 polypeptide로 구성(構成)되어 있으며, alachlor 처리시(處理時) 47kd 이상(以上)의 고분자(高分子) 단백질(蛋白質)들은 억제(抑制)되었지만 23kd 이하(以下)의 저분자(低分子) 단백질(蛋白質)들은 오히려 증가(增加)되는 현상(現象)을 보였다. 이차원적(二次元的) 전기영동(電氣泳動) 결과(結果) alachlor 처리시(處理時) 83kd의 1, 2 spot, 70kd의 3, 4 spot, 47.5kd의 5, 6 spot의 polypeptide가 억제(抑制)된 반면(反面), 20kd의 7 spot, 16kd 의 8, 9, 10 spot는 증가(增加)되는 현상(現象)을 보였다. 또한 귀리 근단(根端) 분열조직(分裂組織)은 산성(酸性) 단백질(蛋白質)로서, 주(主)로 중성(中性) 부위(部位)에 큰 polypeptide spots들이 존재(存在)하고 있으며, 작은 spots을은 산성(酸性)쪽에 분리(分離)되어 나타났다.

• Restorative Dentistry and Endodontics
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• 제20권2호
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• pp.645-654
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• 1995

Porphyromonas endodontalis is a black-pigmented anaerobic Gram negative rod which is associated with endodontal infections. It has been isolated from infected dental root canals and submucous abscesses of endodontal origin. DNA probe is an available alternative, offering the direct detection of a specific microorganism. Nucleic-acid probes can be off different types: whole different: whole-genomic, cloned or oligonucleotide probes. Wholegenomic probes are the most sensitive because the entire genome is used for possible hybridization sites. However, as genetically similar species of bacteria are likely to be present in specimences, cross-reactions need to be considered. Cloned probes are isolated sequences of DNA that do not show cross-reactivity and are produced in quantity by cloning in a plasmid vector. Cloned probes can approach the sensitivity found with whole-genomic probes while avoiding known cross-reacting species. Porphyromonas endodontalis ATCC 35406 (serotype $O_1K_1$) was selected in this experiment to develop specific cloned DNA probes. EcoR I-digested genomic DNA fragments of P. endodontalis ATCC 35406 were cloned into pUC18 plasmid vector. From the E. coli transformed with the recombinant plasmid 4 clones were selected to be tested as specific DNA probes. Restriction-digested whole-genomic DNAs prepared from P. gingivalis 38(serotype a), W50(serotype b), A7A1-28(serotype C), P. intermedia 9336(serotype b), G8-9K-3(serotype C), P. endodontalis ATCC 35406(serotype $O_1K_1$), A. a Y4(serotype b), 75(serotype a), 67(serotype c), were each seperated on agarose gel electrophoresis, blotted on nylon membranes, and were hybridized with digoxigenin-dUTP labeled probe. The results were as follows: 1. Three clones of 1.6kb(probe e), 1.6kb(probe f), and 0.9kb(probe h) in size, were obtained. These clones were identified to be a part of the genomic DNA of P. endodontalis ATCC 35406 judging from their specific hybridization to the genomic DNA fragments of their own size on Southern blot. 2. The clones of 4.9kb(probe i) was identified to be a part of the genomic DNA of P. endodontalis ATCC 35406. but not to specific for itself. It was hybridized to P. gingivalis A7A1-28, P. intermedia G89K-3.

• 한국식품영양과학회지
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• 제42권7호
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• pp.1115-1124
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• 2013

한국산 꽃소금의 특성을 알아보기 위하여 국내에서 생산된 꽃소금 3종과 천일염 1종의 이화학적 및 미생물 분석을 실시하였다. 수분함량은 $10.54{\pm}0.10{\sim}13.82{\pm}0.12%$, 나머지 조단백, 조지방, 조섬유는 거의 존재하지 않았다. NaCl은 신의도산 꽃소금이 $78.81{\pm}0.28%$, 비금산 꽃소금이 $81.67{\pm}0.34%$, 도초산 꽃소금 $84.61{\pm}0.21%$, 도초산 천일염이 $80.82{\pm}0.17%$로 나타났다. 불용분, 사분은 각각 0.01~0.05%, 0.01~0.03%로 낮게 검출되었다. 미네랄 분석은 도초산 꽃소금에서 K과 Mg 함량이 2,975.23 mg/kg, 9,886.72 mg/kg으로 비교적 낮게 나타났다. Ca은 도초산 소금 2종이 945.53 mg/kg, 942.43 mg/kg으로 낮은 함량을 보였다. 중금속 As, Cd, Pb, Hg은 모두 규격 이하로 검출되었다. 소금결정을 관찰한 결과로 천일염과 꽃소금 모두 핵이 중복되어 겹으로 적층된 것을 확인하였으며 크기는 비금산 꽃소금이 $0.067{\times}0.067mm$로 가장 작고 도초산 천일염이 $0.112{\times}0.124mm$로 꽃소금에 비해 크게 나타났다. 소금의 색도는 꽃소금의 L값이 천일염에 비해 높아 밝게 확인되었다. 관능검사 결과로 짠맛은 NaCl 함량과 유사하며, 쓴맛은 K과 Mg 함량이 적은 도초산 꽃소금이 낮게 나타났다. 천일염에 비해 꽃소금의 단맛과 기호도가 더 높은 것으로 확인되었다. 호염균 동정 결과 19종 모두 Firmicutes로 꽃소금에서 Marinibacillus, Paenibacillus, Bacillus 속이 12종으로 확인되며, 천일염은 Planococcus, Staphylococcus, Bacillus 속 3종으로 검출되었다. DGGE 실험 결과로 도초산 꽃소금에서 16개의 band와 도초산 천일염에서 15개의 band를 확인하였다. 동정 결과 도초산 꽃소금에서 Cupriavidus sp. ATHA3(14.43%), Cupriavidus sp. TSA5(10.41%), Maritimibacter sp. YCSD61-2(8.13%), uncultured bacteria(68%)로 확인되었고, 도초산 천일염에서는 Dunaliella salina(4.76%), Cupriavidus sp. ATHA3(15.80%), uncultured Mycoplasmataceae bacteria(51.72%), uncultured bacteria(27%)로 확인되었다.

• 생명과학회지
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• 제22권1호
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• pp.31-35
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• 2012

비육 전(12개월령) 후(27개월령)기 한우 등심육을 대상으로 단백체 연구를 통하여 succinate dehydrogenase (SDH) 및 triosephosphate isomerase (TPI) 단백질의 발현 차이가 관찰되었다. 따라서 본 연구는 근내지방함량의 차이를 보이는 비육 전 후기 한우 등심육 내 차등발현을 보이는 SDH 및 TPI 유전자를 대상으로 근내지방함량과의 관련성 규명을 위하여, 비육 전 후기 및 한우 동기우 집단 50두를 대상으로 유전자 발현분석 및 통계분석을 수행하였다. 비육 전 후기 시료를 대상으로 유전자 발현분석을 수행한 결과 SDH 유전자는 12개월령에서 27개월령보다 4배 발현이 높은 것으로 확인되었으며, 한우 동기우 집단 50두 등심육을 대상으로 유전자 발현량과 근내지방함량과의 관련성을 분석한 결과에서도 근내지방함량과 고도의 통계적 유의성(p<0.001)이 있음을 확인하 다. 그러나 TPI의 경우 근내지방함량과의 관련성은 확인되지 않았다. 이러한 결과로 볼 때 SDH 유전자는 한우 등심육 내에서 근내지방함량과 관련된 유전자로 판단되며, 지속적으로 유전자구조 변이연구 등을 통한 유전자 마커로의 개발이 필요할 것으로 생각된다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제16권17호
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• pp.7959-7965
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• 2015

Background: Identification of predictive markers for the efficacy of platinum-based chemotherapy is necessary to improve the quality of the life of cancer patients. Materials and Methods: We detected proteins recognized by autoantibodies in pretreated sera from patients with lung adenocarcinoma (AC) evaluated as showing progressive disease (PD) or a partial response (PR) after cisplatin-based chemotherapy by proteomic analysis. Then, the levels of the candidate autoantibodies in the pretreated serum were validated by dot-blot analysis for 22 AC patients who received platinum-based chemotherapy, and the expression of identified proteins was immunohistochemically analyzed in 40 AC biopsy specimens. Results: An autoantibody against galectin-3 (Gal-3) was detected in pretreated sera from an AC patient with PD. Serum IgG levels of anti-Gal-3 autoantibody were significantly higher in patients evaluated with PD than in those with PR and stable disease (SD) (p = 0.0084). Furthermore, pretreated biopsy specimens taken from patients evaluated as showing PD following platinumbased chemotherapy showed a tendency to have a higher positive rate of Gal-3 than those with PR and SD (p = 0.0601). Conclusions: These results suggest that serum IgG levels of anti-Gal-3 autoantibody may be useful to predict the efficacy of platinum-based chemotherapy for patients with lung AC.

• 폴리머
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• 제38권1호
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• pp.43-48
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• 2014

본 논문은 저분자량의 폴리에틸렌이민을 폴리디아세틸렌 리포좀 표면에 연결하여 유전자를 세포 내로 전달할 수 있는 새로운 양이온성 고분자 리포좀 유전자 전달체 개발에 대한 결과이다. 폴리디아세틸렌 리포좀 제조 후에 자외선을 조사하여 고분자성 리포좀을 제조한 후, 유전자의 전달 효율을 높이기 위해 폴리에틸렌이민을 리포좀 표면에 커플링제를 이용하여 공유결합시켜서 PCDA-PEI 리포좀을 합성하였다. 제조한 고분자 리포좀을 이용하여 동물세포 내에서의 유전자 전달 및 발현 효율과 그에 따른 독성을 확인하는 연구를 수행하였다. 사용한 폴리에틸렌이민은 가지형이고 분자량은 2 kD인 것을 사용하였다. DNA와의 복합체 형성을 알아보기 위하여 전기영동 방법과 피코그린 형광 염색 시약을 사용하였으며 효율적으로 복합체를 형성하는 것을 확인하였다. 전달체의 효율과 독성을 확인하기 위하여 HEK 293 및 HeLa 세포를 사용하여 확인하였다. 실험 결과 PCDA-PEI 리포좀은 세포 내에서 비율이 높아질수록 유전자 전달 효율이 증가하는 경향을 보였고, 세포에 대한 독성도 상대적으로 낮음을 확인하였다. 이러한 결과는 PCDA-PEI 리포좀이 효율적인 유전자 혹은 약물 전달체로 사용될 수 있음을 보여주었다.