• Title/Summary/Keyword: 핵산

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해양퇴적물의 핵산추출물에서 humic substances의 효율적인 제거방법 (Efficient Removal of Humic Substances in Preparing DNA Extract from Marine Sediments)

  • 이정현;신현희;이홍금;권개경;김상진
    • 미생물학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.132-136
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    • 1998
  • 자연환경의 미생물군집을 분자생태학적 방법으로 분석하기 위해서는 오염되지 않은 순수한 핵산의 분리가 필요하다. 해양퇴적물에서 핵산을 추출할 때 같이 추출되는 부식물질(humic substances)은 핵산중폭반응을 저해하기 때문에, 이를 제거하기 위한 네 가지의 방법, 아가로즈젤 전기영동후 용출, Sephadex G-75 젤, Hydroxyapatite 젤, 그리고 PVPP(poluvinylpolypyrrolidone) microspin column 방법에 대해 그 효율성을 비교하였다. 조산된 방법 중에서 PVPP microspin column을 이용하면 건조 퇴적물 1g당 $4.8{\mu}g$의 순수한 DNA를 신속하고 간편하게 얻을 수 있었고, 이 방법으로 분리된 DNA를 PCR의 주형으로 사용한 결과 16S rRNA 유전자의 거의 전 범위에 해당하는 1.5 kb 크기의 PCR 산물을 얻을 수 있었다.

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PCR을 이용한 지하수 내의 탈질화 세균의 검출 (Detection of Denitrifying Bacteria in Groundwater by PCR)

  • 신규철;서미연;한명수;최영길
    • 환경생물
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    • 제19권4호
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    • pp.321-324
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    • 2001
  • 일반적으로 지하수환경은 세균의 수가 적기 때문에 세균의 핵산을 추출하기 위해서는 지하수 시료의 여과를 통하여 대량의 세균을 획득하는 것이 우선적으로 요구되어왔다. 그러나 이러한 여과법은 많은 시간과 인력의 낭비 뿐만 아니라 실험 과정의 특수성으로 인하여 오염의 위험성이 높다. 따라서 본 논문에서는 구아니딘 열탕법을 이용하여 소량의 지하수 시료로부터 핵산증폭실험에 적용할 수 있는 충분한 양의 핵산의 추출을 시도하였다. 지하수 시료는 서울시 내의 질소화합물 요염지역, 오염 예상지역, 청정지역으로 구분하여 각각 2개의 정점을 선별하여 총 6개의 정점으로부터 채수하였다. 구아니딘 열탕법을 이용하여 얻은 핵산으로 지하수에서 탈질화세균의 존재 여부를 검정한 결과 청정지역을 제외한 4개의 정점에서 탈질화 세균의 존재를 확인하였다.

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대두 및 옥수수 가공식품에서 유전자재조합체(GMO)의 정성 PCR분석을 위한 핵산 추출방법별 비교 (Comparative Evaluation on Qualitative PCR using Different Extraction Methods for Nucleic Acids on Soybean and Corn Processed Foods)

  • 김영찬;이철수;황순욱;김성조;이영옥;윤성원;서정화;남용석
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제18권1호
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    • pp.6-13
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    • 2003
  • PCR법은 특정 유전자를 증폭하는 기술로 작물 및 식품에서 유전자 변형체 함유 여부를 가리는 효과적인 방법이다. 그러나 핵산의 추출법에 따라 PCR의 감도가 크게 달라지므로 정확한 추출법의 선정이 매우 중요하다. 본 연구는 현재 컬럼형 상용화 키트와 기존의 용매 추출방법을 이용하여 콩과 옥수수가공식품에 대한 각 유전자 부위의 검출감도를 비교 분석하였다. 핵산의 추출효율과 도입유전자의 증폭효율면 모두 상용화 키트인 Wizar$d^{TM}$, DNeasy$^{TM}$ 추출법이 우수하였다. DNeasy법은 대부분의 식품에서 우수한 추출효율을 보였으나, 옥수수가공식품에서 수율이 감소하는 단점을 나타내었다. Wizard법은 모든 가공식품에서 고른 추출효율을 보였으며, PCR반응에 의한 증폭산물도 잘 보존되어 가공식품의 GMO 검출에 적합한 것으로 나타났다. 한편 CTAB법은 콩가공식품에서 약간 효율이 좋은 것으로 나타났으나 대부분의 경우 효율이 낮았으며, 식품의 종류에 따라 편차가 심하게 나타났다. phenol/chloroform법은 대부분의 식품에서 핵산의 분리가 어려운 방법으로 나타나 GMO분석에는 적합하지 않은 방법으로 확인되었다.

수족관 저장기간에 따른 횟감생선의 핵산관련성분 변화 (Changes of Nucleotides in the Raw Fishes during the Aquarium Storage)

  • 홍철희;이정민;김경수
    • 한국식품과학회지
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    • 제36권3호
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    • pp.379-384
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    • 2004
  • 횟감생선으로 주로 이용되고 있는 광어, 농어와 도미의 수족관 저장기간에 따른 핵산관련성분의 변화, 신선도 및 품질 평가를 위한 선도 지수를 확인하였다. 핵산관련성분 중 ATP, ADP, AMP는 수족관 저장기간에 따라 서서히 감소하였고, IMP, HxR, Hx는 서서히 증가하였다. 특히 IMP가 가장 높은 함량을 차지하였는데, 여름 도미에서 $16.59{\mu}mol/g$으로 가장 높게 나타났고, 여름 농어에는 $9.54{\mu}mol/g$이 함유되어 어종간 차이가 확인되었다. 수족관 저장기간에 따른 증가범위는 $3-6{\mu}mol/g$으로 어종별 함량변화는 현저한 차이를 나타내지 않았다. 횟감생선의 사후 ATP에서 IMP로의 전환은 수족관 저장 초기에 거의 발생하였다. 광어, 농어 및 도미의 $K,\;K_{p}\;G,\;P,\;F_{r}\;value$에 의해 신선도를 판정한 결과 14일동안의 수족관 저장시 신선도는 현저한 변화론 나타내지 않았으며, 여름보다 겨울에 비교적 높은 선도를 보였다. 핵산관련성분 또한 어종 및 계절별 차이를 보였으나 수족관 저장 14일동안 변화가 크게 나타나지 않았다.