Kim, Bo-Kyung;Lee, Sang-Rae;Lee, Jin-Ae;Chung, Ik-Kyo
The Sea:JOURNAL OF THE KOREAN SOCIETY OF OCEANOGRAPHY
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v.15
no.1
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pp.25-35
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2010
The biodiversity of eukaryotic plankton has commonly been used to evaluate the status of aquatic ecosystems. Therefore, an accurate and rapid method for species identification is needed to reveal the biodiversity of environmental water samples. To date, molecular methods have provided a great deal of information that has enabled identification of the hidden biodiversity in environmental samples. In this study, we utilized environmental polymerase chain reaction (PCR) and constructed the 18S nuclear ribosomal RNA clone library from environmental water samples in order to develop more efficient methods for species identification. For the molecular analysis, water samples were collected from the Seonakdong River (Gimhae Bridge) and the coast of Namhae,(Namhaedo). Colony PCR and restriction fragment length polymorphism of PCR (PCR-RFLP) were then adopted to isolate unique clones from the 18S rDNA clone library. Restriction fragment length polymorphism pattern analysis of the Gimhae Bridge sample revealed 44 unique clones from a total of 60 randomly selected clones, while analysis of the Namhae sample revealed 27 unique clones from 150 clones selected at random. A BLAST search and subsequent phylogenetic analysis conducted using the sequences of these clones revealed hidden biodiversity containing a wide range of taxonomic groups (Heterokontophyta (7), Ciliophora (23), Dinophyta (1), Chytridiomycota (1), Rotifera (1) and Arthropoda (11) in the Gimhae Bridge samples Ciliophora (4), Dinophyta (3), Cryptophyta (1), Arthropoda (19) in the Namhae samples). Therefore, the molecular monitoring method developed here can provide additional information regarding the biodiversity and community structure of eukaryotic plankton in environmental samples and helps construct a useful database of biodiversity for aquatic ecosystems.
Pyrosequencing of 16S rDNA tags was used to obtain the bacterial diversity and community structure in the uncultured seawaters as well as in the cultured seawaters, which were collected from the 7 ports (Cheonbu, Hyunpo, Taeha, Namyang, Sadong, Dodong, and Jeodong) and 1 seashore (Guam) around the Ulleng island, Korea. Alphaproteobacteria were the most abundant group in the clean seawaters such as seawaters of Taeha and Sadong ports. Gammaproteobacteria proportion increased depending upon the wastewater amounts mixed with the seawaters such as seawaters of Namyang, Dodong, and Jeodong ports. The genuses of Alteromonas (from samples of Cheonbu, Taeha, Guam, Namyang, Sadong), Shewanella (from sample of Jeodong), and Vibrio (from samples of Hyunpo and Dodong) were dominant group in each of the cultured seawaters incubated in marine broth (Difoco). The results suggest that the incoming wastewaters to the port seawaters contribute to the dynamic change of the marine bacterial community around the Ulleng island.
Stable isotope and biomarker analyses were carried out for the organic sediments from the exploratory wells in the Jeju Basin in order to understand the characteristics of organic matter. Organic matter in Geobuk-1, Okdom-1, JDZ VII-1 and VII-2 well is predominantly originated from land plants rather than marine algae according to carbon $({\delta}^{13}C_{org})$ and nitrogen $({\delta}^{15}N_{org})$ isotopic compositions. In the Geobuk-1, geochemical characteristics such as carbon $({\delta}^{13}C_{org})$, nitrogen ($({\delta}^{15}N_{org})$ and TOC contents are obviously changed by the depth 2,400 m, which is likely due to the change of origin of organic matter, sedimentary process or sedimentary environments. Analysis of the saturated fraction of the bitumen suggests the contribution of migrated oil to the indigenous bitumen from the samples 2,509, 2,833 and 3,163 m of the JDZ YII-1 and 3,253 m of the Geobuk-1 well. However, this characteristics can be derived from the contribution of the original organic matter. Based on the biomarker analysis, the samples from the Okdom-1 and Geobuk-1 appear to represent sedimentary organic matter of similar composition, that is rotatively immature, and which was probably deposited in the fluvio-deltaic setting with minor offshore marine influence. The samples from JDZ VII-1 appear to have been deposited in a more terrestrially dominated setting.
The Sea:JOURNAL OF THE KOREAN SOCIETY OF OCEANOGRAPHY
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v.28
no.1
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pp.41-50
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2023
Dissolved oxygen sensors have characteristics in which data drift occurs over time. Therefore, in-situ calibration of the dissolved oxygen sensor is essential to accurately measure the concentration of dissolved oxygen in seawater. In order to provide a method for in-situ calibration, appropriate number of samples for calibration, and laboratory calibration interval of the dissolved oxygen sensor, the dissolved oxygen sensor values were compared with the measured values by titration on a total of 133 samples from three different cruises in the Indian Ocean, Pacific Ocean, and East Sea over a period of about one year. As a result, it is preferable to calibrate the sensor value using the correlation of a straight line obtained by directly comparing the final concentration value given by the sensor and the measured value. For the accurate calibration, at least 30 samples must be used to enable in-situ calibration within an accuracy range of about 1%. In addition, it is recommended that a laboratory calibration should perform within 1 year for the membrane type dissolved oxygen sensor for CTD to achieve a performance of 70% or more.
Journal of the Korean Society of Marine Environment & Safety
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v.30
no.1
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pp.58-64
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2024
Approximately 250 marine oil spill accidents have occurred in Korea, with profound impact on local communities and the environment. The restoration process necessitates significant resources and costs to return affected areas to their pre-accident state. In accordance with the polluter pays principle, compensation is demanded from polluter, as stipulated in both international conventions and national laws. Consequently, investigations are conducted to determine civil and criminal liability. As the importance of investigation actors in oil spill accidents increases, standards such as CEN 15522-2 and ASTM D 3248 are employed to determine the similarity between the spilled oil and the oil of the suspected ship. Among these standards, CEN 15522-2, the most actively used European standard, underwent its third revision and is now known as EN 15522-2, as of 2023. This study used EN 15522-2 to analyze samples from marine oil spill accidents that occurred in Korea. The results indicated that, considering the characteristics of domestic spills where light fuel oil spills account for more than 40%, the application of EN 15522-2, which includes low-boiling point substances such as Adamantanes, was confirmed to be highly effective.
Detention basin is the temporary holding pond of treated water prior to flow out to the sea. It is very common to dredge the soil from the bottom of detention basin to keep up the water holding capacity. In this study, the amount of volume reduction of dredged soil from detention basin was estimated based on the laboratory test results. The percentage of soil particles in dredged organic soil is about 12.5∼21.9% by weight. The content of heavy metal and environmental effect for dredged soil itself and solidified dredged soil were analysed and the results are meet the standards of environmental requirement.
Journal of Korean Society of Coastal and Ocean Engineers
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v.21
no.6
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pp.437-443
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2009
Impact echo method estimating the soundness of concrete measures the dynamic elastic modulus of specimens which are different with static elastic modulus tested by uni-axial compression test. Thus, this paper investigates the relationships between dynamic and static elastic modulus based on in-situ concrete cores. Also, dynamic elastic modulus was compared with compressive strength. Concrete cores were obtained from about 20 to 70 years concrete structures at three different harbors which were Incheon, Wando, and Masan in Korea. In order to investigate the influence of exposure condition on the relationship, air zone, splash zone, and tidal zone were selected. Different harbors showed the different relationships between dynamic and static elastic modulus, but exposure conditions have no influence on the relationship between dynamic and static elastic modulus. Also, the relationship between dynamic elastic modulus and compressive strength has the same tendency as the relationship between dynamic and static elastic modulus. The relationship equations were proposed to estimate the relationships properly.
Journal of the Korean Society for Marine Environment & Energy
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v.14
no.3
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pp.163-175
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2011
Though polycyclic aromatic hydrocarbon compounds (PAHs) in marine sediment has been produced by many colleges and institution in Korea, it is difficult to compare PAHs data in a study area with those in other areas due to the lack of confidence for the quality of data from the other organization. Therefore, we suggested the protocol for PAHs analysis in marine sediment through examining the method of PAHs analysis described in over twenty scientific papers and reports. When a known amount of 23 PAHs were spiked into a sediment and anlyzed following this new protocol, very good recoveries were obtained. In addition, for college and institution with their own method to analyze PAHs can keep producing PAHs data without exchanging to this new PAHs protocol, the method to get a full confidence through the QA/QC for the PAHs data produced by these organization is included to the protocol.
The Sea:JOURNAL OF THE KOREAN SOCIETY OF OCEANOGRAPHY
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v.25
no.4
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pp.132-159
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2020
As multidisciplinary marine research is actively conducted, various types of marine research facilities and equipment are purchased every year. However, among marine research facilities and equipment, it is difficult to classify and manage various types of field observation equipment used for environmental data collection and sample collection under the current national research facility and equipment standard classification system. In the case of Korea Institute of Ocean Science and Technology, about 30% of research facilities and equipment are unclassified and not properly managed. In this study, marine research facilities and equipment are classified into 7 middle and 36 sub-classes according to their characteristics. It is proposed to add a large classification group called 'Environmental Observation/Analysis Equipment', to the national research facility equipment standard classification system. In addition, it is proposed to classify the equipment operated in the laboratory among marine research facilities and equipment according to the existing national research facility equipment standard classification system. Through this, it is expected that all of Korea's marine-related research facilities and equipment can be systematically classified and managed effectively.
Proceedings of the Korean Environmental Sciences Society Conference
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2002.05b
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pp.450-451
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2002
미래산업의 중요한 자원인 광합성세균(purple non-sulfur photosynthetic bacteria)은 해양에 대한 연구정도가 미비하기 때문에 이 연구를 수행하였다. 현재 총 47개의 mud 시료중에서 15개의 광합성세균으로 추정되는 strain을 분리하였다. 이후의 실험은 RAPD PCR을 이용하여 중복되는 strain의 유무를 확인하고, 165 rDNA의 염기분석을 통하여 분류학적인 위치를 연구할 계획이다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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