• 제목/요약/키워드: 하이퍼망

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마이크로어레이 기반 miRNA 모듈 분석을 위한 하이퍼망 분류 기법 (Hypernetwork Classifiers for Microarray-Based miRNA Module Analysis)

  • 김선;김수진;장병탁
    • 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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    • 제35권6호
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    • pp.347-356
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    • 2008
  • 마이크로어레이는 분자 생물학 실험에 있어 중요한 도구로 사용되고 있으며, 마이크로어레이 데이타 분석을 위한 다양한 계산학적 방법이 개발되어 왔다. 그러나, 기존 분석방법은 주어진 조건에 영향을 주는 개별 유전자를 추출하는 데 강한 방면, 유전자 간의 복합작용에 의한 영향을 분석하기 힘들다는 단점을 가지고 있다. 하이퍼망 모델은 생물학적인 네트워크 작용을 모방한 구조이며, 계산과정에서 요소간의 복합작용을 직접 고려하기 때문에 기존 방법에서 다루기 힘들었던 요소간 상호작용 분석이 가능하다는 장점을 가진다. 본 논문에서는 마이크로어레이 데이타를 기반으로 microRNA(miRNA) 프로파일 분석을 위한 하이퍼망 분류 기법을 소개한다. 하이퍼망 분류기는 miRNA 쌍을 기본 요소로 하여 진화 과정을 통해 miRNA 분류 데이타를 학습한다. 학습된 하이퍼망으로부터 유의하다.고 판단되는 miRNA 모듈을 쉽게 추출할 수 있으며, 사용자는 추출된 모듈의 유치미성을 직접 판단할 수 있다. 하이퍼망 분류기는 암 관련 miRNA 발현 데이타 분류 실험을 통해 91.46%의 정확도를 보임으로써 기존 기계학습 방법에 비해 뛰어난 성능을 보여주었으며, 하이퍼망 분석을 통해 생물학적으로 유의한 miRNA 모듈을 찾을 수 있음을 확인하였다.

유아 언어학습에 대한 하이퍼망 메모리 기반 모델 (Hypernetwork Memory-Based Model for Infant's Language Learning)

  • 이지훈;이은석;장병탁
    • 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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    • 제15권12호
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    • pp.983-987
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    • 2009
  • 유아들의 언어습득에 있어서 중요한 점 하나는 학습자에 대한 언어환경의 노출이다. 유아가 접하는 언어환경은 부모와 같은 인간뿐만 아니라 각종 미디어와 같은 인공적 환경도 포함되며, 유아는 이러한 방대한 언어환경을 탐색하면서 언어를 학습한다. 본 연구는 대용량의 언어 데이터 노출이 영향을 미치는 유아언어학습을 유연하고 적절하게 모사하는 인지적 기제에 따른 기계학습 방식을 제안한다. 유아의 초기 언어학습은 문장수준의 학습과 생성 같은 행동들이 수반되는데, 이는 언어 코퍼스에 대한 노출만으로 모사가 가능하다. 모사의 핵심은 언어 하이퍼망 구조를 가진 기억기반 학습모델이다. 언어 하이퍼망은 언어구성 요소들 간의 상위차원 관계 표상을 가능케 함으로써 새로운 데이터 스트림에 대해 유사구조의 적용과 이용을 도모하여 발달적이고 점진적인 학습을 모사한다. 본 연구에서는 11 개의 유아용 비디오로부터 추출한 문장 32744개를 언어 하이퍼망을 통한 점진적 학습을 수행하여 문장을 생성해 유아의 점진적, 발달적 학습을 모사하였다.

하이퍼망 모델을 이용한 MircoRNA Strand 선택 예측 (Prediction of MicroRNA Strand Selection using Hypernetwork Model)

  • 이지훈;하정우;이제근;장병탁
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2010년도 한국컴퓨터종합학술대회논문집 Vol.37 No.1(C)
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    • pp.235-239
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    • 2010
  • MicroRNA는 RNA로 전사된 유전자와의 상보결합을 통해 유전자 발현을 억제하는 조절인자이다. MicroRNA 생성과정에서 pre-microRNA의 3' 또는 5' 부근의 strand가 선택되어 mature 시퀀스가 되고 유전자 조절에 직접 작용하게 된다. 하지만 어떤 특징을 가진 strand가 선택 되는지에 대한 정확한 메커니즘은 아직 연구되어 있지 않다. 본 논문에서는 microRNA 시퀀스 정보를 바탕으로 하이퍼망을 구성하여 strand 선택 예측 모델을 구축하였다. 실험 결과 하이퍼망 학습을 통해 microRNA strand 선택에 중요한 영향을 미치는 시퀀스 특징을 찾을 수 있었고, strand 선택을 높은 정확도로 예측할 수 있음을 확인하였다.

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