Proceedings of the Korean Society of Soil and Groundwater Environment Conference
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1998.06a
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pp.87-90
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1998
본 연구의 목적은 방향족 화합물의 생분해능이 우수한 토양 방선균을 분리하여 방선균에 의한 방향족 화합물의 생분해 기작 및 생분해 특성을 연구하는 것이다. 본 연구실에서는 phenol을 model compound로 실험한 결과, 일반 토양에서 분리한 많은 방선균들이 비록 농노의 차이를 보이기는 하지만 phenol의 생분해능을 갖고 있었다. 그러나 이들 대다수의 방선균들을 낮은 농도의 phenol에서만 일정 기간 성장을 하며, morphological differentiation 및 포자의 형성과 같은 일반적인 방선균의 성장 특성은 전혀 관찰되지 않았다. 이들 중 몇 종류의 분리된 방선균들 낮은 농도에서의 우수한 성장은 물론이고 상당히 높은 농도 (7mM)에서도 phenol을 유일한 탄소 및 에너지원으로 사용하여 성장하며 정상적인 morphological differentiation을 진행시킴이 관찰되었다. 특히 PD001로 명명된 phenol 분해능이 우수한 방선균에서는 일반적인 방선균 성장 온도 (3$0^{\circ}C$) 보다 높은 45$^{\circ}C$의 고온에서 더 빠른 성장을 보이는 고온성 방선균의 특징도 관찰되었다.
Proceedings of the Korean Society of Soil and Groundwater Environment Conference
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1998.06a
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pp.91-95
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1998
본 연구의 목적은 산업활동에 많이 이용되고 환경학적으로 난분해성으로 알려졌으며, 특히 일반적인 미생물에 위한 생분해가 용이하지 않은 대표적인 방향족 화합물인 아조염료의 생분해능이 우수한 방선균을 토양에서 분리하여 그 분해특성을 연구하는데 있다. 본 연구실에서는 용인지역에서 무작위로 채취한 토양에서 방선균들을 분리하고, 이들중 아조계 화합물의 생분해능이 우수한 토양방선균 AD001을 대표적인 아조계화합물인 censored를 model compound로 이용하여 분리해 내었다. 방선균 AD001은 congored가 포함된 agar배지에서 censored를 아주 우수하게 decolorization 시킴이 관찰되었다. 이미 아조염료를 우수하게 분해한다고 알려져 있는 Streptomyces viridosporus T7A와 비교 실험을 수행한 결과, S. viridosporus는 cellulose를 탄소원으로 사용할 때 확실한 congored의 decolorization을 보인 반면 AD001의 경우 sucrose를 탄소원으로 사용할 때 더욱 뚜렷한 congored의 decolorization 현상이 관찰되었다. 또한 이런 분해특성의 특이성을 관찰하기 위해 구조적으고 상이한 new fuchsin으로 실험한 결과, 염료의 농도를 0.005% 주었을 때 S. viridosporus는 성장을 하지 못한 반면 AD001의 경우 배지에 포함된 new fuchsin을 확실하게 decolorization 시킴도 관찰할 수 있었다. 이러한 실험결과는 토양 방선균 AD001이 환경학적으로 아주 유용하게 이용될 수 있음을 제시하고 있다.
Proceedings of the Korean Society of Fisheries Technology Conference
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2000.05a
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pp.371-372
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2000
방선균은 생리활성물질의 탐색원으로서 많은 주목을 받고 있는 미생물이지만 현재까지 이용되어온 균주의 대부분은 육상의 토양에서 분리된 것들이고, 해양의 방선균에 관하여서는 아직까지 거의 연구되지 않은 분야이다. 미생물의 서식지로서 해양의 환경조건은 육상과 현저히 다르기 때문에 해양에 있어서 방선균의 microflora는 육상과는 상당히 다를 것으로 생각되어지며, 또한 연안해역에 존재하는 방선균 중에는 육상에서 유입된 담수 등으로 인하여 육상의 토양으로부터 유래된 방선균도 많은 것으로 알려지고 있다. (중략)
Cho Min-Hye;Han Sang-Mi;Baek Ha-Ju;Whang Kyung-Sook
Korean Journal of Environmental Biology
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v.24
no.1
s.61
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pp.38-45
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2006
Ecological characteristics of microbial populations inhabiting heavy metal polluted soil were investigated. The samples were collected from 293 sites around an factory and industry at Gyeoungsangbuk-do. We measured the contents of seven heavy metal elements (Cd, Cu, As, Hg, Pb, $Cr^{6+}$, CN), seven sites have been seriously contaminated by mercury and chrome. A quantitative evaluation of microbial populations in mercury and chrome contaminated soil was examined by using plate count method. Bacterial numbers in polluted soil samples ranged from $7.4X10^5\;to\;9.3X10^7\;cfu\;g^{-1}$, about $10\sim100$ fold less than the count for the unpolluted soil. Moulds were not detected in chrome polluted soil. The log values of actinomycetes of each contaminated soil samples were log ranged from 6.18 to 7.52. The ratio of actinomycetes was similar to unpolluted soil. The investigation showed actinomycetes to be the major microbial population inhabiting the mercury and chrome polluted soil. Thirty-one isolates among the total isolates were examined for antibacterial activity. These isolates were identified based on a phylogenetic analysis using 16S rRNA gene nucleotide sequences, they were categorized in three major phylogenetic groups, belong to the Streptomyces (6 strains), Saccharopolyspora (3 strains), Nocardiodes (1 strain). On the phylogenetic tree, the clade consisting of five isolates were distantly related to all of the established Streptomycetes genera, indicating the possibility as members of new species.
Waksman과 Heinrich(1943)에 의해 Streptomyces속이 기술되고 actinomycin, streptomycin등의 많은 항생물질이 발견되면서 방선균(actinomycetes)은 산업적으로 중요한 미생물이 되어 왔으며, 근래에는 항생물질 뿐만 아니라 효소, 효소저해제, 면역조절물질 등 소위 생리활성물질(bioactive compound)의 생산균으로서 주목을 받고 있다. 그러나 지금까지 대부분의 스크리닝이나 연구의 대상은 주로 중성 pH에서 잘 자라는 호중성 방선균(neutrophilic actionmycetes)이었지만 산성이나 알칼리성 토양, 고온, 고열, 고압 등과 같은 특수환경에서 분리된 균주나 희귀 방선균(rare actinomyces)에 대한 관심도 점점 높아지고 있다. 산성 토양에서 분리된 방선균에 관한 연구는 Jensen(1928)의 연구로부터 시작하였지만 Lonsdale(1985)이 침엽수림, 산성탄광 등에서 분리된 방선균을 수리분류할 때까지 활발하게 이루어지지 못하였다. 본 고에서는 호산성 방선균위 분포, 생리적 특성, 수리분류학적 연구, 화학적 분류(chemotaxonomy), 산업적 응용가능성 등을 살펴보고자 한다.
Park, Dong-Jin;Lee, Sang-Hwa;Park, Sang Ho;Kim, Chang-Jin
Korean Journal of Microbiology
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v.34
no.3
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pp.149-153
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1998
From soils seasonally collected at two depths (0~2 cm, $50{\pm}1cm$) of forest, field, grass land, or paddy field, distinct strains of actinomycetes were isolated and identified to the genus level. The genus-diversity of soil actinomycetes was revealed to be considerably different by seasonal change. It was also affected by soil depths, soil types, or actinomycete groups. At the soil depth of 0~2 cm, the seasonal distribution fluctuation (%) of streptomycete strains was higher in grass land (41%), field (39%) soil than paddy field (18%), or forest (18%), whereas that of streptomycete strains at the soil depth of $50{\pm}1cm$ was high in order of paddy field (36%), field (28%), grass land (26%), and forest (16%). On the other hand, the seasonal distribution fluctuation ratio of rare actinomycete strains at the soil depth of 0~2 cm was above 45% except for paddy field (26%). At the soil depth of $50{\pm}1cm$, the seasonal distribution of rare actinomycete strains exhibited high fluctuation (%) in order of forest (79%), paddy field (36%), field (24%), and grass land (10%).
To investigate a quantitative evaluation of the actinobacteria, we have collected samples from various kinds of bamboo forest soil. Each different layers contained $2.7{\times}10^6-2.7{\times}10^8$ CFU/g of actinobacteria which was the highest in litter layers of Sasa boreali forest soil. We obtained 330 actinobacteria from different layers of bamboo forest soil; litter (100 strains), humus (70 strains), and rhizosphere soil (160 strains). Based on the colony morphology (aerial mycelium, substrate mycelium, and soluble pigment), isolates were divided into thirty-six groups and we selected 50 representative isolates. 16S rRNA gene sequence analysis showed Streptomyces was major actinobacteria (94%) and they were categorized as cluster I (2 strains), II (35 strains), III (6 strains), and IV (7 strains), respectively. The diversity index of 50 Streptomyces collected from the bamboo forest soil was calculated with the Shannon-Wiener method. Bamboo litter showed higher diversity index level of 3.33 than that of humus and rhizosphere soil. Also, antibiotic activities of our isolates were investigated against Botrytis cinerea, Xanthomonas campestris, Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria, and Bacillus cereus and found in 74, 16, 25, and 24 strains, respectively.
In this study, a pyrosequencing was performed and analyzed to verify the phylogenetic diversity of actinomycetes in the bamboo (Sasa borealis) soil as a base study to obtain the genetic resources of actinomycetes. It was found that the rhizosphere soil had much various distribution in bacterial communities showing a diversity of 8.15 with 2,868 OTUs, while the litter layer showed a diversity of 7.55 with 2,588 OTUs. The bacterial community in the bamboo soil was composed of 35 phyla and the predominant phyla were Proteobacteria (51-60%), Bacteroidetes (16-20%), Acidobacteria (4-16%) and Actinobacteria (4-14%). In particular, Actinobacteria including Micromonosporaceae and Streptomycetaceae had a diverse distribution of actinomycetes within the six orders, 35 families and 121 genera, and it was characterized that about 83% of actinomycetes within Actinomycetales belonged to the 28 families. Among the dominant actinobacterial populations, Micromonosporaceae, Pseudonocardiaceae and Streptomycetaceae were representative family groups in the bamboo soils.
Proceedings of the Korean Society for Applied Microbiology Conference
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1975.07a
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pp.111.2-111
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1975
고온성 방연묘은 일반적으로 $50^{\circ}C$ 이상에서 생육하는 균을 말하며, 토양 퇴비 건초에 많이 생식하고, 부석토나 퇴비의 숙성에 중요한 역할을 하고 있으며 인간이나 가축에 해를 끼칠 때도 있다. 한편 이용면에 있어서는 내열성 효소의 생산 폐기물 처리 식품가공등 이용 가능성이 예상되므로 본 연구에서는 내열성 $\alpha-amylase를$ 생산하는 고온성 방선균의 이용성을 검토하기 위하여 전국각지의 토양으로부터 $\alpha-amylase$ 생산균주를 광범위하게 screening한 결과 128종의 분리균주 중에서 $\alpha-amylase를$ 생산능력이 월등히 우수한 한 균주를 분리하여 시험 균주로 선정, 본 균주에 대한 균학적諸 성질을 조사하였던 바 Thermoactionmyces 속의 방선균으로 동정되었다.(중략)
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[게시일 2004년 10월 1일]
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