• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
• /
• 2011.06a
• /
• pp.37-40
• /
• 2011

선택 스플라이싱 (alternative splicing)은 mRNA (messenger RNA)의 전구체인 pre-mRNA가 mRNA로 전사될 때 pre-mRNA의 엑손 영역들 (exons)이 여러 가지 유형 (pattern)으로 다시 연결되는 과정을 말한다. 선택 스플라이싱에 의해 하나의 유전자로부터 서로 다른 mRNA가 만들어 지고 서로 다른 이소형의 단백질 (protein isoforms)이 생성된다. 현재까지 알려진 선택 스플라이싱의 유형은 약 7가지 종류가 있으며, 유전자의 돌연변이 및 질병과 밀접한 연관성을 가지고 있는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 차세대 시퀀싱 (Next Generation Sequencing : NGS) 기술로 생성된 RNA-Seq 데이터로부터 각 유전자 영역에 대한 선택 스플라이싱 유형을 분류/추출하는 새로운 알고리즘을 제안한다. 제안된 알고리즘에서는 RNA-Seq 데이터를 DNA 시퀀스와 mRNA 트랜스크립트 시퀀스에 동시 매핑하고, 각 엑손 영역에 정렬된 RNA-Seq 데이터의 커버리지 정보 및 엑손의 접합 (junction) 정보를 이용하여 발현된 트랜스크립트 (transcript)의 종류와 양을 측정한다. 알고리즘의 유효성을 보이기 위하여 시뮬레이션 데이터를 이용한 인간 유전자 영역에서의 선택 스플라이싱 유형 추출 실험을 수행하였으며, 검증된 선택 스플라이싱 DB와 비교, 검증하였다.

• Annual Conference on Human and Language Technology
• /
• 1998.10c
• /
• pp.239-246
• /
• 1998

확률적 언어모델링은 일련의 단어열에 문장확률값을 적용하는 기법으로서 음성인식, 확률적 기계번역 등의 많은 자연언어처리 응용시스템의 중요한 한 요소이다. 기존의 접근방식으로는 크게 n-gram 기반, 문법 기반의 두가지가 있다. 일반적으로 n-gram 방식은 원거리 의존관계를 잘 표현 할 수 없으며 문법 기반 방식은 광범위한 커버리지의 문법을 습득하는데에 어려움을 가지고 있다. 본 논문에서는 일종의 단순한 의존문법을 기반으로 하는 언어모델링 기법을 제시한다. 의존문법은 단어와 단어 사이의 지배-피지배 관계로 구성되며 본 논문에서 소개되는 의존문법 재추정 알고리즘을 이용하여 원시 코퍼스로부터 자동적으로 학습된다. 실험 결과, 제시된 의존관계기반 모델이 tri-gram, bi-gram 모델보다 실험코퍼스에 대해서 약 11%에서 11.5%의 엔트로피 감소를 보임으로써 성능의 개선이 있었다.

• Proceedings of the Korean Institute of Information and Commucation Sciences Conference
• /
• 2008.10a
• /
• pp.369-372
• /
• 2008

무선 센서 네트워크(WSN)는 소규모, 저비용, 저전력 지능형의 센서 노드로 구성되고, 원격 환경 감시와 군사작전 및 재난 상황 등에 응용 될 수 있는 기술이다. 이러한 센서 네트워크에서 구성된 노드의 에너지 공급은 독립된 소형배터리를 통해 이루어진다. 따라서 각 노드에서의 에너지의 효율적인 관리가 무선 센서 네트워크의 최대 쟁점이 되고 있다. 본 논문에서는 이러한 노드의 제한된 배터리 자원을 보다 효율적으로 유지 관리하기 위한 방법으로 ASIT(Advanced Sensing Interval Time) 알고리즘을 제안한다. 제안된 ASIT란 입력된 센싱 값의 변화와 센서 노드의 에너지 잔여량에 따라 센싱 주기를 제어 관리하는 방법으로 이에 대한 모델링을 수립하고, 실제 노드 관리 결과와 모델링 된 결과의 오차를 관찰하여 적중율을 향상하는 기법을 제안한 것이다. 제안된 ASIT의 알고리즘으로부터 센서 노드의 수명을 향상 시켜 궁극적으로는 무선 센서 네트워크 전체의 망 접속의 신뢰성과 노드 관리 수명을 연장시키며, 망의 토폴로지 구성의 측면에서는 전체적인 영역의 커버리지를 향상시키는 동시에 제한된 배터리 자원을 효율적으로 관리 할 수 있는 걸과를 얻게 된다.

• Proceedings of the Korean Institute of Information and Commucation Sciences Conference
• /
• 2013.10a
• /
• pp.517-518
• /
• 2013

모바일 에드 혹 네트워크(Mobile Ad hoc Network)는 이동성을 가진 노드로 구성된 네트워크로서, 통신기반 시설의 지원이 없어도 스스로 통신망을 구축하여 통신한다. 하지만 노드의 이동성으로 인한 토폴로지의 변화가 빈번하여, 라우팅 경로 재설정으로 인한 오버헤드가 생성된다. 오버헤드 생성을 줄이기 위하여 클러스터링을 이용한 연구가 진행되어 왔다. 클러스터가 형성된 MANET에서 클러스터 헤드 노드가 이동함에 따라 클러스터 영역을 벗어나게 되었을 경우, 클러스터 그룹에 속하는 멤버 노드들은 패킷을 보내지 못하며, 클러스터 헤드노드를 선출하지 못하여 사용할 수 없는 노드가 된다. 본 논문에서는 클러스터 헤드 노드가 클러스터 영역을 벗어날 경우, 클러스터 멤버노드의 상황인자 속성 벡터 정보가 유사한 클러스터 헤드노드를 이웃한 주변 클러스터 헤드로부터 검색 및 선택하여, 우회경로를 제공하는 알고리즘을 제안한다. 제안된 알고리즘에서 각 노드는 상황정보 매트릭스를 가지고 있어, 전송 커버리지 영역이 2홉 이내 반경에 있는 노드의 벡터 정보를 저장하게 된다. 클러스터 헤드 노드와의 연결이 끊어 졌을 경우, 클러스터 멤버 노드는 상황정보 매트릭스를 이용하여, 벡터정보가 유사한 클러스터 헤드 노드를 선택하여, 노드 간의 연결성 및 패킷의 전달성이 향상 된다.

• Journal of KIISE:Software and Applications
• /
• v.35 no.3
• /
• pp.149-161
• /
• 2008

As Programmable Logic Controllers(PLCs) are frequently used to implement real-time safety critical software, testing of PLC software is getting more important. We propose a structural testing technique on Function Block Diagram(FBD) which is one of the PLC programming languages. In order to test FBD networks, we define templates for function blocks including timer function blocks and propose an algorithm based on the templates to transform a unit FBD into a flowgraph. We generate test cases by applying existing testing techniques to the generated flowgraph. While the existing FBD testing technique do not consider infernal structure of FBD to generate test cases and can be applied only to FBD from which the specific intermediate model can be generated, this approach has advantages of systematic test case generation considering infernal structure of FBD and applicability to any FBD without regard to its intermediate format. Especially, the proposed method enables FBD networks including timer function blocks to be tested thoroughly. To demonstrate the effectiveness of the proposed method, we use trip logic of bistable processor of digital nuclear power plant protection systems which is being developed in Korea.

• Journal of the Korean Institute of Intelligent Systems
• /
• v.16 no.6
• /
• pp.683-690
• /
• 2006

Reducing power consumption to extend network lifetime is one of the most important challenges in designing wireless sensor networks. One promising approach to conserving system energy is to keep only a minimal number of sensors active and put others into low-powered sleep mode, while the active sensors can maintain a connected covet set for the target area. The problem of computing such minimum working sensor set is NP-hard. In this paper, a centralized Voronoi tessellation (CVT) based approximate algorithm is proposed to construct the near optimal cover set. When sensor's communication radius is at least twice of its sensing radius, the covet set is connected at the same time; In case of sensor's communication radius is smaller than twice of its sensing radius, a connection scheme is proposed to calculate the assistant nodes needed for constructing the connectivity of the cover set. Finally, the performance of the proposed algorithm is evaluated through theoretical analysis and extensive numerical experiments. Experimental results show that the proposed algorithm outperforms the greedy algorithm in terms of the runtime and the size of the constructed connected cover set.

• Journal of the Korea Institute of Information Security & Cryptology
• /
• v.23 no.2
• /
• pp.231-242
• /
• 2013

Recently, automated software testing methods such as fuzzing have been researched to find software vulnerabilities. The purpose of fuzzing is to disclose software vulnerabilities by providing a software with malformed data. In order to increase the probability of vulnerability discovery by fuzzing, we must solve the test suite reduction problem because the probability depends on the test case quality. In this paper, we propose a new method to solve the test suite reduction problem which is suitable for the long test case such as file. First, we suggested the length of test case as a measure in addition to old measures such as coverage and redundancy. Next we designed a test suite reduction algorithm using the new measure. In the experimental results, the proposed algorithm showed better performance in the size and length reduction ratio of the test suite than previous studies. Finally, results from an empirical study suggested the viability of our proposed measure and algorithm for file fuzzing.

• The Journal of Korean Institute of Communications and Information Sciences
• /
• v.41 no.7
• /
• pp.789-798
• /
• 2016

In this paper, we propose a cache algorithm based on user's context for enterprise/urban smallcell environments. The smallcell caching method is to store mobile users' data traffic at a storage which is equipped in smallcell base station and it has an effect of reducing core networks traffic volume. In our algorithm, contrary to existing smallcell cache algorithms, the cache storage is equipped in a edge server by using a concept of the Mobile Edge Computing. In order to reflect user's characteristics, the edge server classifies users into several groups based on user's context. Also the edge server changes the storage size and the cache replacement frequency of each group to improve the cache efficiency. As the result of performance evaluation, the proposed algorithm can improve the cache hit ratio by about 11% and cache efficiency by about 5.5% compared to the existing cache algorithm.

• The Journal of Korean Institute of Communications and Information Sciences
• /
• v.36 no.8A
• /
• pp.691-701
• /
• 2011

In rotatable directional sensor networks, maximizing network lifetime while covering all the targets and forwarding the sensed data to the sink is a challenge problem. In this paper, we address the Maximum Directional Cover Tree (MDCT) problem of organizing the directional sensors into a group of non-disjoint subsets to extend the network lifetime. Each subset in which the directional sensors cover all the targets and forward the sensed data to the sink is activated at one time. For the MDCT problem, we first present an energy consumption model which mainly takes into account the energy consumption for rotation work. We also develop the Directional Coverage and Connectivity (DCC)-greedy algorithm to solve the MDCT problem. To evaluate the algorithm, we conduct simulations and show that it can extend the network lifetime.

• The Journal of the Institute of Internet, Broadcasting and Communication
• /
• v.18 no.1
• /
• pp.47-58
• /
• 2018

The heterogeneous cellular network (HCN) is most significant as a key technology for future fifth generation (5G) wireless networks. The heterogeneous network considered consists of randomly macrocell base stations (MBSs) overlaid with femtocell base stations (BSs). The stochastic geometry has been shown to be a very powerful tool to model, analyze, and design networks with random topologies such as wireless ad hoc, sensor networks, and multi- tier cellular networks. The HCNs can be energy-efficiently designed by deploying various BSs belonging to different networks, which has drawn significant attention to one of the technologies for future 5G wireless networks. In this paper, we propose switching off/on systems enabling the BSs in the cellular networks to efficiently consume the power by introducing active/sleep modes, which is able to reduce the interference and power consumption in the MBSs and FBSs on an individual basis as well as improve the energy efficiency of the cellular networks. We formulate the minimization of the power onsumption for the MBSs and FBSs as well as an optimization problem to maximize the energy efficiency subject to throughput outage constraints, which can be solved the Karush Kuhn Tucker (KKT) conditions according to the femto tier BS density. We also formulate and compare the coverage probability and the energy efficiency in HCNs scenarios with and without coordinated multi-point (CoMP) to avoid coverage holes.