The purpose of our study is to compare the adhesion and biofilm formation abilities of isolates from water discharged from dental unit waterlines (DUWLs). Bacteria were isolated from a total of 15 DUWLs. Twelve isolates were selected for the experiment. To confirm the adhesion ability of the isolates, each isolate was attached to a glass coverslip using a 12-well plate. Plates were incubated at $26^{\circ}C$ for 7 days, and the degree of adhesion of each isolate was scored. To verify the biofilm formation ability of each isolate, biofilms were allowed to form on a 96-well polystyrene flat-bottom microtiter plate. The biofilm accumulations of all isolates formed at $26^{\circ}C$ for 7 days were identified and compared. A total of 56 strains were isolated from 15 water samples including 12 genera and 31 species. Of the 56 isolates, 12 isolates were selected according to the genus and used in the experiment. Sphingomonas echinoides, Methylobacterium aquaticum, and Cupriavidus pauculus had the highest adhesion ability scores of +3 among 12 isolates. Among these three isolates, the biofilm accumulation of C. pauculus was the highest and that of S. echinoides was the third-most abundant. The lowest biofilm accumulations were identified in Microbacterium testaceum and M. aquaticum. Most isolates with high adhesion ability also exhibited high biofilm formation ability. Analysis of adhesion and biofilm formation of the isolates from DUWLs can provide useful information to understand the mechanism of DUWL biofilm formation and development.
The purpose of this study was to investigate Staphylococcus epidermidis contamination on hands of 20 dental hygienists and 140 equipment surface of 20 dental clinics in a local area, from July to August 2017. The degree of S. epidermidis contamination was measured using a hand plate and a rodac plate and then cultured at $35^{\circ}C$ for 24 hours. Based on hand plate criteria, hand contamination was classified into low, middle, and high groups. Analysis of the variance (ANOVA) of the contamination level of the hand parts of the group surface contamination level of the dental clinic equipment was descriptive statistics after clustering lock count. S. epidermidis contamination was moderate in 55% of the hands of dental hygienists. The area of contamination was 29.45 colony-forming units (CFU) on the palm, followed by the middle finger 7.8 CFU, ring finger 6.4 CFU, and thumb 6 CFU. Medical equipment surface contamination was showed that 3-way handle 4.45 CFU, computer mouse 3.37 CFU, mirror handle 1.60 CFU were higher than other areas. The group with high hand contamination had a high positive correlation with the S. epidermidis contamination of the hand. S. epidermidis contamination level was higher on hands than on the medical equipment surface contamination. Therefore, medical staff should recognize the importance of hand hygiene which should be practiced in the manner suggested by World Health Organization. In addition, the medical team needs to be responsible for performing infection control tasks, implementing infection management guidelines and providing systematic education on infectious disease management.
Disposable contact lenses, which are one type of soft contact lenses, provide convenience in use, but also cause various ocular infectious diseases. Microorganisms that cause eye diseases include Acanthamoeba, bacteria, Fungi, and so on. It is impossible to prevent microorganism contamination completely due to the use of hands as wearing contact lenses. The contamination by various microorganisms leads to infectious keratitis, but it is not well known for the exact microorganisms that affect the disease. For this reason, to identify the microorganisms, two groups that are commonly used for disinfection of lenses were divided: normal saline solution and multiple purpose solution. Using these solutions the degree of microorganism contamination was observed according to the days of 1, 3, 5, 10, and 15. Twenty students by two groups from Ophthalmic Optics department at D college in Daegu Metropolitan city participated in the experiment after their ocular health conditions were checked. During they wore one-day disposable lenses for 1, 3, 5, 10, and 15 days, bacteria were cultured in media. The results, which were Gram stained by selecting the cultured colonies, show as followings: Gram positive cocci 33%, Gram-negative cocci 2%, Gram positive bacilli 34%, and the Gram negative bacilli 31%, respectively. As for the identification of potential pathogens, VITEK system and API kit methods were used. Keratitis caused by bacteria known as Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa were detected as a result of wearing contact lenses. This study examined the distribution of bacteria as wearing one-day disposable contact lenses and pathogenic bacteria according to the duration of wearing them. In conclusion, the importance of hygiene when using contact lenses is suggested.
The temple and family or private owner have managed the storage space of movable cultural properties. Thus they lack the ability to manage professionally and systematically, movable cultural properties are in a poor environment and have been damaged by abundant dust and airborne fungi in the storage. In this study, we investigated microbes distribution in 10 storage or exhibition hall housing the movable cultural properties. As a results, concentration of collected microorganisms exhibited a large difference according to a storage and the D Relic Museum in Yeongam is the most contaminant storage, in which detected $2,000m^3$ or more. More than $166m^3$ of the fungi were detected in most storages of the other. We identified so many varieties of fungi such as Aspergillus sp., Penicillium sp., Alternaria sp. and Cladosporium sp. existing commonly in 10 storages including wood rot fungi such as Ceriporia lacerata, Ganoderma carnosum, Myrothecium gramineum and Bjerkandera sp.. This airborne fungi may damage cultural heritages. The Guideline on a concentration of airborne fungi should be estimated and management system to the preservation environment must be provided.
You, Young-Hyun;Park, Jong Myong;Nam, Yoon-Jong;Kim, Hyun;Lee, Myung-Chul;Kim, Jong-Guk
Journal of Life Science
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v.25
no.2
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pp.189-196
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2015
Bacterial diversity was studied in the rhizosphere of Suaeda japonica Makino, which is native to Suncheon Bay in South Korea. Soil samples from several sites were diluted serially, and pure isolation was performed by subculture using marine agar and tryptic soy agar media. Genomic DNA was extracted from 29 pure, isolated bacterial strains, after which their 16S rDNA sequences were amplified and analyzed. Phylogenetic analysis was performed to confirm their genetic relationship. The 29 bacterial strains were classified into five groups: phylum Firmicutes (44.8%), Gamma proteobacteria group (27.6%), Alpha proteobacteria group (10.3%), phylum Bacteriodetes (10.3%), and phylum Actinobacteria (6.8%). The most widely distributed genera were Bacillus (phylum Firmicutes), and Marinobacterium, Halomonas, and Vibrio (Gamma proteobacteria group). To confirm the bacterial diversity in rhizospheres of S. japonica, the diversity index was used at the genus level. The results show that bacterial diversity differed at each of the sampling sites. These 29 bacterial strains are thought to play a major role in material cycling at Suncheon Bay, in overcoming the sea/mud flat-specific environmental stress. Furthermore, some strains are assumed to be involved in a positive interaction with the halophyte S. japonica, as rhizospheric flora, with induction of growth promotion and plant defense mechanism.
In order to establish in vitro infection model for research of plant pathogen based on tissue softening disease in napa cabbage, eighty independent bacterial strains were isolated from the softened napa cabbage tissues. Eight bacterial isolates were primarily screened with the generation of reproducible tissue softening disease to fresh napa cabbages within 24${\sim}$48 hours after inoculation. Through various microbiological biochemical and morphological examinations, three Gram (-) isolates which harbor independent biological properties were finally chosen, and named as RBI, RB2 and RB6. Collective results obtained from API 20E test and analyses of VITEK 2 COMPACT and nucleotide sequences of 165 rRNA of each isolate proposed that isolates RBI and RB2 are close to the Erwinia carotovora subsp. odorifera, and RB6 is close to the Erwinia carotovora subsp. carotovora. These isolates grew optimally at $30^{\circ}C$ with neutral pH culture condition. The isolates caused softening tissue disease with dose-dependent manner regardless of pre-surface damages of napa cabbage. Minimum dose to cause soft rot disease for RBI, RB2 or RB6 were $8.0{\times}10^8$ CFU/mt $10^9$ CFU/ml or $4.7{\times}10^6$ CFU/ml respectively. These isolates caused tissue softening disease to eggplant, paprika and napa cabbage out of 14 different tested vegetables, indicating that these isolates damages specific plant tissues. The bacterial isolates obtained in this research and in vitro plant infection model will be adapted in the understanding of the mechanism of pathogenesis by plant pathogen.
Lee Na-Young;Jo Cheorun;Kang Ho-Jin;Hong Sang-Pill;Kim Young-Ho;Lee Kyong-Haeng;Byun Myung-Woo
Food Science of Animal Resources
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v.25
no.1
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pp.13-19
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2005
The radio-sensitivity of pathogens and the effect of irradiation on microbiologican safety and mutagenicity of meat products such as seasoned and cooked beef and ham were investigated. Samples were radiation-sterilized and inoculated at 10/sup 7/ cfu/g with each of the four pathogens including Salmonella typhimurium, Escherichia coli, Staphylcoccus aureus, and Listeria ivanovii. No viable cells of pathogens were observed in the sample irradiated with 3 kGy. The D/sub 10/ value of inoculated pathogens in seasoned and cooked beef and ham were 0.24∼0.48 and 0.39∼0.45, respectively. Results of Ames test performed with non-irradiated and irradiated seasoned and cooked beef and ham were both negative at the level of 625, 1,250, 2,500, 50,000, and! 10,000 ㎍ sample/plate, respectively. Results indicate that low dose (2∼3 kGy) irradiation is effective to ensure safety for seasoned and cooked beef and ham with toxicological wholesomeness.
In order to provide a quality index of Korean folk sojues, physicochemical properties of Korean folk sojues (Andong soju, Moonbaesul, Leekangju, Jindo Hongju, Chebiwon soju, Yethyang (rice) and Yethyang (barley)), Paekrosul, Chinese kaoliangchiews (Moutaichiew, Ergoutoutiu, Chuyehchingchiew, Zhikukaoliangchiew and Paigal), Japanese Senbatanuki shochu and two whiskies were determined. The pH of sojues ($3.43{\sim}5.85$) were mainly influenced by total acidity which was described as acetic acid. The conductivities of Paekrosul and Leekangju showed relatively high value of $246\;and\;122.7{\mu}S/cm$, respectively. Korean folk sojues and Paekrosul showed maximum absorption at 274 or $278{\sim}280nm$ in the spectrometric study. We performed principal components analysis (PCA) of physicochemical properties and spectrometric data to extract representative characteristics and to compare the similarity or the dissimilarity. The PCA plot showed the distinguished cluster of Korean folk sojues comparing with Chinese kaoliangchiew or Paekrosul etc.
Fermented skate is a traditional Korean food popular in Southwestern area of Korea. It has a characteristic flavor and alkaline pH. In this study we tried to determine the microbial flora in fermented skate using two different approaches. In culture-independent method, we amplified V2 region of 16S rRNA gene by PCR and cloned them into pUC18 plasmid to construct 16S rDNA fragment library. BLAST searches for the sequences obtained from this library revealed that uncultured bacterium clone 054E11.b was the most dominant flora in this fermented fish. In culture-dependent method, we diluted suspension of skate and spreaded on MRS, PCA, and MacConkey plates. We identified colonies grown on those plates by using PCR amplification of V2 region of 16S rRNA and DNA sequencing. BLAST searches of those DNA sequences resulted in totally different species with the observations from the 16S rDNA library analysis. Discrepancies of results obtained from both approaches suggest that the agar plates used in culture-dependent method may be different from the real condition of fermented skate. Therefore, results from culture-independent approach using 16S rDNA fragment library analysis may reflect real microbial flora in fermented skate.
Korea National Forest Inventory System has been adopting different cluster plot design and new equations to estimate growing stock volumes since 2006. These changes have resulted in volume estimations which show some difference from previous ones. This study is to find out the source of such difference. For this, relevant data was collected from 80 plots of 20 cluster samples according to the cluster plot design applied to 4th and 5th National Forest Inventory. Then growing stock volumes were estimated by using current and previous individual tree volume equations respectively. An investigation was made to detect whether such difference in volume estimates was originated from the changes in cluster plot design or from using different volume equations. T-test results showed that the difference from changes in cluster plot design was negligible. Instead, changes in volume equations had statistically significant effects in volume estimation. Since the volume estimation by the 5th National Forest Inventory would bring overestimation by applying different volume equations, all the volume estimations made prior to 2006 would require necessary modifications for international reporting.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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