• Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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• 2006.02a
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• pp.11-18
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• 2006

바이오칩의 대표 주자인 DNA 칩은 점차 분자생물학의 주요 도구로 인식되고 있다. 쓰임새 또한 다양해져 기초 생물학, 기능 유전체학 연구뿐만 아니라 임상 현장에서의 적용을 위한 연구가 활발히 진행되고 있다. 임상분야에서 최근 주목 받고 있는 분야가 DNA 칩을. 이용한 질병진단 및 예후 측정이다. 개별 환자 세포의 분자유전학적 상태는 DNA 칩의 유전체 프로파일링(genome-wide profiling)으로 상세히 파악될 수 있으므로, DNA 칩은 질병의 세부아형 진단, 약물에 대한 개인 민감도 측정, 정확한 예후 측정을 통한 환자의 세심한 관리 등 미래 의료의 핵심이라 할 수 있는 개인별 맞춤 치료(personalized medicare)를 가능하게 하는데 지대한 역할을 할 것으로 기대되고 있다. 특히 수많은 질병 중에서 현대인의 난치병으로 손꼽히는 암은 DNA 칩 분석의 주요 적용 대상이다. 암에 연관된 복잡한 메커니즘을 기존의 단일 표지자로 진단하는 데는 한계가 있기 때문에, DNA 칩을 이용해 질병의 특정 phenotype과 관련 있는 암의 특이 패턴을 전사체 수준에서 분석하여 새로운 형태의 분자유전학적 표지자(transcriptional molecular signature)를 발굴하는 것이다 본 발표에서는 이러한 연구에 쓰이는 DNA 칩 분석 방법들과 실제 위암 데이터에 적용한 사례에 대해 논의하고자 한다. 연세의대 암전이 연구센터의 17K cDNA 칩을 이용하였으며, 진단 및 예후 측정을 위한 여러 분석 방법을 수행하였다.

• Journal of Gastric Cancer
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• v.9 no.3
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• pp.136-142
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• 2009

Purpose: This clinical study was conducted to evaluate the predictive value of tumor markers for recurrence and the clinical significance of false positive findings after curative gastrectomy in patients with gastric cancer. Materials and Methods: Two hundred ninety patients with gastric cancer who underwent gastrectomy with curative intent were evaluated retrospectively. We analyzed the correlations between changes in tumor markers (CEA, CA 19-9, AFP, and CA-125) and clinicopathologic data, and basis for changes in tumor markers without recurrence during the follow-up period. Results: The sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value, and accuracy of tumor markers for recurrence were 75.0%, 64.6%, 23.1%, 94.8%, and 65.9% respectively. Among 36 patients with recurrences, 10 patients (27.8%) had elevated tumor markers prior to positive findings on imaging studies, while 13 patients (36.1%) had concomitant elevation in tumor markers. At least 1 of the 4 tumor markers increased in 90 of 290 patients during the follow-up period; however, there was no evidence of tumor recurrence. Twenty patients had persistently elevated tumor markers, while the tumor marker levels in 70 patients returned to normal level within $9.08\pm7.2$ months. The patients with pulmonary disease, hepatobiliary disease, diabetes, hypertension, or herbal medication users had elevated tumor markers more frequently than patients without disease (P<0.001). Conclusion: Although detecting recurrence of gastric cancer with tumor markers may be useful, false positive findings of tumor markers are common, so surgeons should consider other chronic benign diseases and medical conditions when tumor markers increase without evidence of recurrence.

• Proceedings of the Korean Institute of Navigation and Port Research Conference
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• 2022.06a
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• pp.83-84
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• 2022

항로표지는 다양한 장비들이 복합적으로 구성되는 장치이다. 이러한 복합적 장비의 유연하고 안정적 운영을 위해서는 주 운영체제의 안정성을 보장해야 한다. 모든 SW는 주 운영체제에 영향을 줄 수 있다. 이러한 문제를 최대한 예방하기 위해 마이크로서비스 아키텍처가 필요하다. 서비스 마다 독립된 자원공간을 활용하는 마이크로 서비스 아키텍처는 리눅스 컨테이너 기법을 활용하여 구현된다. 제안하는 스마트 항로표지의 운영을 담당하는 통합플랫폼의 마이크로 서비스 아키텍처의 주요 서비스로 센서 데이터 스트리밍 서비스, 임베디드 고장진단 서비스, 데이터베이스 서비스, 원격 통신 서비스, 컴퓨팅 리소스 모니터링 서비스, 시각화 서비스로 구성된다. 본 연구에서는 전체 마이크로서비스 아키텍처를 제안하고 그중에서도 주요 서비스들의 구현 방법을 기존 오픈소스 활용을 통해 제안한다. 제안하는 구조를 통해 각 서비스가 컨테이너화 되어 관리됨으로써 에러대처와 업데이트 관리에 용이한 마이크로서비스아키텍처를 구현할 수 있다.

• Proceedings of the Korean Institute of Navigation and Port Research Conference
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• 2023.05a
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• pp.303-305
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• 2023

수집된 데이터의 품질을 진단하고 개선하는 것은 품질 관리 측면에 있어 중요하다. 본 연구에서는 항로표지 수집정보의 품질을 개선하기 위해 새로운 알고리즘을 개발하고 이를 시험하는 방안에 대해 분석하였다. 개발된 알고리즘은 기존의 알고리즘보다 더욱 정확하고 신뢰성이 높으며, 항로표지 수집정보의 오류율을 크게 감소시킨다. 이에 따라, 개발된 알고리즘을 적용함으로써 항로표지 수집정보의 품질을 향상시킬 수 있으며, 해상 안전성을 높이는 데 기여할 것으로 기대된다.

• Journal of Convergence for Information Technology
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• v.10 no.12
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• pp.146-155
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• 2020

This study was to evaluate the usefulness of gamma glutamyl transferase (GGT) as a surrogate marker predicting metabolic syndrome. 7,155 non obese men over the age of 20 were studied as subjects. The criteria for diagnosing MetS were the National Cholesterol Education Program - Third Adult Treatment Panel (NCEP-ATP III). The risk of developing MetS according to GGT was conducted logistic regression analysis, and the ROC (receiver operating characteristic) curve was obtained to confirm GGT ability to predict the risk of MetS. Regardless of age and body mass index, MetS had a 7.09 times higher risk of onset in the fourth quartile than in the first quartile of GGT (p<0.001). The AUC (area under the curve) of GGT for the diagnosis of MetS was 0.715, and the cutoff value of GGT was 40.0 U/L, the sensitivity was 65.0%, and the specificity was 70.2%. Therefore, GGT is considered to be a useful diagnostic index for diagnosing MetS.

• Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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• v.42 no.3
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• pp.201-208
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• 2008

Purpose: We aimed to assess the role of positron emission tomography using fluorodeoxyglucose (FDG-PET) in the diagnosis of recurrence or the assessment of therapeutic response in cervical and ovarian cancer patients through making a comparison between FDG-PET, abdominal computed tomography (CT) and serum tumor marker. Materials and methods: We included 103 cases (67 patients) performed FDG-PET and abdominal CT. There were 42 cervical cancers and 61 ovarian cancers. We retrospectively reviewed the interpretations of PET and CT images as well as the level of tumor marker. We calculated their sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value for these three modalities. And then we analyzed the differences between these three modalities. Results: Tumor recurrences were diagnosed in 37 cases (11 cervical cancers and 26 ovarian cancers). For PET, CT and tumor marker, in cervical cancer group, sensitivity was 100% (11/11), 54.5% (6/11) and 81.1% (9/11), respectively. And specificity was 93.6% (29/31), 93.6% (29/31) and 100% (31/31). In ovarian cancer group, sensitivity was 96.2% (25/26), 84.6% (22/26) and 80.8% (21/26), and specificity was 94.3% (33/35), 94.3% (33/35), 94.3% (33/35), PET was highly sensitive to detect the intraperitoneal and extraperitoneal metastasis with the help of the CT images to localize the lesions. However, CT had limitations in differentiation of the recurrent tumor from benign fibrotic tissue, identification of viable tumors at the interface of tissues, and detecting extraperitoneal lesions. Conclusion: FDG-PET can be an essential modality to detect the recurrent or residual tumors in gynecologic cancer patients because of its great field of the application and high sensitivity.

• Journal of Digestive Cancer Research
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• v.6 no.2
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• pp.59-63
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• 2018

Over the past decade, circulating tumor cell have received tremendous attention as new biomarkers and basic research subjects.In recent years, research on circulating tumor DNA, exosomes and microRNAs has also been actively conducted.These circulating tumor markers have the potential to become the basis of precision medicine, such as determining the genome / immune profile, monitoring response and tolerance, and selecting therapeutic agents beyond the early diagnosis and prognosis prediction.In this article, we introduce the diagnostic methods, efficacy, meaning, and applicability of various circulating tumor markers.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• v.14 no.2
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• pp.359-369
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• 1997

We studied the expression of the cell surface antigen associated with myeloid and lymphoid leukemias on bone marrow or peripheral blood blast cells from 153 leukemic patients including 61 cases of acute myelogenous leukemias(AML), 46 of acute lymphocytic leukemias(ALL) and 12 of acute leukemias. They were analyzed by direct or indirect immunofluorescence method for reactivity with the monoclonal antibodies to B cells(CD10, CD19, SmIg), T cells(CD2, CD5, CD7, CD3, CD4, CD8), myeloid antigen(CD13, CD14, CD33, CD61) and a nonspecific antigen, HLA-DR. Lymphoid associated markers detected on AML is CD7 32.8%, CD10 14.8%, CD5 13.1%, CD2 6.6% and CD19 1.6%. TdT was positive in 4.9% of AMLs. Hybrid leukemias were 8 cases out 61 AML cases and were mainly composed of monocytic lineage, M4 and M5a. Myeloid markers detected in ALL were CD13 2.2% and CD33 2.2%. In this study, immunologically classified ALLs were composed of 65.2% of CALLA (+) B precursor type, 10.9% of CALLA (-) B precursor pattern, 8.7% of T cell type, 2.2% of B cell type, 4.5% of mixed lymphoid lineage(B&T), 2.2% of undifferentiated leukemia, and 6.5% of hybrid leukemia. Twelve cases of acute leukemias ware finally diagnosed to be 5 cases of hybrid leukemia, 3 cases of B lineage, 3 case of T lineage and 1 case of mixed lymphoid(B&T) leukemia. In summary, we think the best method for typing acute leukemias is by using a combination of FAB classification and immunophenotying.

• Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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• 2012.02a
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• pp.106-106
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• 2012

인체 내 소량의 생체성분을 감지하는 바이오센서 기술은 질병 진단뿐만 아니라 예방 및 관리로 의료서비스 확대 및 의료비 감소 효과를 가져올 수 있는 기술이다. 광 바이오센서는 광학적인 측정방법을 이용하여 다양한 생화학물질들의 상호 반응을 검출해 낼 수 있는 바이오센서로 현재 활발하게 연구가 진행되고 있다. 일반적으로 형광물질, 발색물질 등의 발광물질을 인식물질에 표지하여 인식물질과 분석물질과의 반응 유무를 표지된 발광물질의 광 신호를 감지하여 분석물질을 검출해내는 표지식 광 바이오센서 기술이 상용화되고 있다. 그러나 이러한 분석 방법은 민감도는 우수하지만 분석 시간이 매우 느리고, 고가의 분석 장비를 필요로 하는 단점들을 가지고 있다. 이러한 단점들을 극복하기 위하여 생화학 반응 유무를 표지물질 없이 광학적 방식으로 직접 측정해내는 비 표지식 광 바이오센서 기술이 최근 들어 많이 연구되고 있다. 본 논문에서는 비표지식이면서 분광기 없이 분석 가능한 공진 반사광 바이오센서 기술에 관한 내용을 소개하고자 한다. 공진 반사광 바이오센서는 광파장 이하의 주기를 가진 주기적 공진 격자 표면에서 일어나는 항원-항체 반응에 대한 공진 반사 파장을 측정하여 원하는 바이오물질을 고감도로 검출할 수 있는 바이오센서이다. 또한, 인체 내장을 위하여 플렉시블 기판 상에 GaN LED를 집적하여 전립선암 바이오 마커 검출에 대한 결과를 소개하고자 한다.

• Electronics and Telecommunications Trends
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• v.28 no.5
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• pp.57-71
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• 2013

바이오센서 산업은 국민 삶의 질을 향상시키고 미래 국가 경쟁력을 증진시킬 수 있다는 기대 속에 고부가가치 산업 육성을 제고할 수 있는 분야로 주목 받고 있는 가운데, 실시간 진단, 고감도화, 소형화를 위한 집적화, 저가격화, 다기능화 등에 대한 이슈가 지속적으로 제기되고 있다. 이러한 이슈들을 해결할 수 있는 대안 기술로써, 높은 Q 지수를 갖는 광 마이크로 공진기에 대한 관심이 높아지고 있으며, 최근의 성공적인 연구 결과들은 차세대 미세 바이오 센서 시스템 구현과 실용화의 가능성을 높여주고 있다. 특히, 단일 분자 및 나노 입자까지도 측정 가능한 고감도의 무표지 센서 기술은 특성은, 각종 감염성 질환 및 암표지자의 실시간 조기 진단과 개인별 맞춤 치료, 환경 유해물질 검출, 신약물질 발굴 등 새로운 시장창출에 대한 기대감을 증폭시키고 있다.