• Title/Summary/Keyword: 중간생존시간

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Estimation of Survival Function and Median Survival Time in Interval-Censored Data (구간중도절단자료에서 생존함수와 중간생존시간에 대한 추정)

  • Yun, Eun-Young;Kim, Choong-Rak
    • The Korean Journal of Applied Statistics
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    • v.23 no.3
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    • pp.521-531
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    • 2010
  • Interval-censored observations are common in medical and epidemiologic studies; however, limited studies exist due to the complexity and special structure of interval-censoring. This paper introduces the imputation method and the self consistency method in the interval-censored data. We propose a new method of generating random numbers under an interval-censoring set-up. Through simulation studies we compare two methods under various simulation schemes in the sense of the mean squared error for estimating the median survival time and the mean integrated squared error for estimating the survival function. Under a moderate censoring percentage, the mean imputation method showed a better performance than the self-consistency method in estimating the median survival time and the survival function.

비단가리비 인공종묘 생산

  • 박기열
    • Korean Aquaculture
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    • v.14 no.2
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    • pp.52-65
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    • 2002
  • 비단가리비의 인공 종묘 생산을 목적으로 전라남도 신안군 대흑산도 주변에 서식하는 비단가리비를 대상으로 인공 종묘 생산을 위한 산란 유발, 수정란의 발생 과정, 유생 사육, 채묘 및 중간 육성 등 양식 생물학적 연구를 실시하였다. 어미의 각종 산란 유발 자극에 대한 반응은 Serotonin 주사, 온도 자극, 혼합 자극에서 반응율이 가장 높았으며, 자외선 조사 해수 자극은 수컷만 반응을 하였고 간출 자극은 반응이 없어 실효성이 없는 것으로 나타났다. 수정란의 크기는 $69.5{\mu}m$이었고, 수정 후 약 2시간에 2 세포기, 8시간 후에 8 세포기, 20시간 후에는 담륜자 유생으로 부화하였으며 40시간 후에는 D상 유생으로 되었다. 수온별 비단가리비 유생의 성장은 수온 $20^{\circ}C$에서 각장 $178.9{\mu}m$로 가장 좋았으며, 이 때의 생존율은 15.5%이었다. 그러나 수온 $15^{\circ}C$에서는 낮은 성장을 보여 각장 $135.9{\mu}m$로 성장하였으며, 생존율도 9.8%로 저조하였다. 수용 밀도별 사육 시험에서 $1m{\ell}$당 1개체와 5개체에서 성장 및 생존율이 양호하여 성장 및 생존율을 볼 때 적정 사육 밀도는 $1m{\ell}$당 5개체 이하로 나타났다. 먹이 생물 종류에 따른 유생의 성장을 알기 위하여 I, gal-baba, C, calcitrans, N, oculata를 단독 또는 혼합으로 공급하였을 때 실험 종료후 각장의 성장은 I, galbana+C. calcitrans+N. oculata구가 $194.2{\mu}$로 가장 좋았고 N. oculata구는 $162.2{\mu}m$로 가장 낮은 성장을 보였다. 생존율에서는 I. galbana+C. calcitransoculata구는 9.4%로 가장 낮은 생존율을 보였다. 채묘기별 유생의 부착률은 염화비닐판을 수평으로 놓은 것과 패각이 각각 3.43%와 3.17%로 가장 양호하였으나, 양파망과 염화비닐판을 수직으로 놓은 것은 각각 1.52%와 1.61%로 비교적 저조하였다. 수정 후 40일째부터 90일째까지 측정한 부착치패의 경과 일수에 따른 각장의 성장은 $SL=184.44e^{0.0335X}(r^2=0.9861)$의 회귀직선식으로서 나타났다. 중간육성 시험에서 수심별 성장을 분석한 결과, 비단가리비 치패는 저층보다 표층이 각장 5.92mm, 전중량 6.07g 정도 더 빨리 성장하였다.

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Analysis of Relative Breakage Hazard Rate of Water Mains Using the Proportional Hazards Model (비례위험모형을 이용한 상수관로의 상대적 파손위험율 분석)

  • Park, Su-Wan;Kim, Jung-Wook;Im, Gwang-Chae;Lee, Hyeong-Seok
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2008.05a
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    • pp.490-494
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    • 2008
  • 본 연구에서는 상수도 배수관로의 내 외부적 특성에 따라 개별관로를 정의하는 방법을 연구대상 지역의 배수관로 파손 데이터베이스에 적용하여 비례위험모형을 구축하였다. 연구에 사용된 자료는 연구대상지역의 배수관로의 제원 및 파손시기를 포함하는 관로 파손데이터베이스, 관로매설지역의 급수인구 및 수압범위에 관한 자료를 포함하는 GRID 데이터베이스와 관로매설지역의 토지개발 정도에 관한 자료를 포함한다. 이러한 자료를 이용하여 관로를 순차적 파손경험에 따라 7개의 생존시간군(STG I $\sim$ VII)으로 구분하고 각 생존시간군에 대한 비례위험모형(Model I $\sim$ VII)을 구축하였다. 이러한 모형을 이용하여 관로의 파손횟수가 증가하는 동안 파손에 영향을 미치는 인자의 변화와 그 효과를 파악하였으며, 또한 추정된 공변수의 위험비율을 분석함으로써 관로의 제원 혹은 매설환경, 급수인구 등에 따른 위험률의 상대적인 변화를 분석하였다. 또한 비례 위험모형의 구축과정에서 관로의 파손에 영향을 미치는 공변수의 비례성 가정을 검토하여 시간종속형 공변수를 모형화하였으며, 모형의 이탈잔차(deviance residual)를 분석하여 모형의 적합성을 검토하였다. 본 연구에서 구축된 비례위험모형에 대해 Shoenfeld 잔차를 이용한 스코어 잔차의 변화(score process)를 검토한 결과, Model I 과 Model II 에 대해서는 공변수의 시간종속 효과가 발견되었다. Model I에 대해서는 관로재질과 급수인구의 영향이 시간에 따라 변하며 Model II에서는 급수인구의 영향만이 시간에 따라 변하는 것으로 나타났다. 한편 Model III $\sim$ Model VII 들에 대해서는 공변수의 영향이 시간에 따라 변하지 않는 것으로 나타났다. 각 생존시간군에 대해 관로재질, 토지개발정도, 관로길이 및 급수인구의 변화가 관로의 상대적 누수위험률에 미치는 영향을 상대위험률의 95% 신뢰구간을 고려하여 정량적으로 산정하였고, 시간 종속형 공변수로 모형화된 공변수는 시간에 따른 공변수 영향의 변화를 분석하였다. 순차적 파손사건에 대한 비례위험모형의 구축 결과 생존시간군(STG) I의 기저위험률은 매설 후 대략 450개월까지는 파손 위험률이 '0'에 가까우나 그 이후로 급격히 증가하다가 매설 후 약 700개월에 이르러서는 약간 감소하고 약 850개월 이후에는 다시 급격히 증가한다. STG II의 기저위험률은 첫 번째 파손 후 약 300개월이 되면 위험률이 급격히 증가하는 것으로 나타났다. STG III $\sim$ STG VII의 기저위험률은 이차함수의 형태를 띄며, 특히 STG V, STG VI 및 STG VII의 기저위험률은 욕조형 곡선(bathtub curve)의 형태를 가진다. 각 생존시간군의 기저생존함수의 생존확률 '0.5'에 해당하는 기저중간생존시간에 대한 분석으로부터 파손횟수가 많아질수록 순차적 파손사건 사이의 경과시간은 감소하는 것으로 나타났다. 이러한 기저생존시간에 대한 경향은 관로의 파손횟수가 많아질수록 관로의 일반적은 내구성은 감소하기 때문인 것으로 분석된다.

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The Comprehensive Proportional Hazards Model Incorporating Time-dependent Covariates for Water Pipes (상수관로에 대한 시간종속형 공변수를 포함한 포괄적 비례위험모형)

  • Park, Su-Wan
    • Journal of Korea Water Resources Association
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    • v.42 no.6
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    • pp.445-455
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    • 2009
  • In this paper proportional hazards models for the first through seventh break of 150 mm cast iron pipes in a case study area are established. During the modeling process the assumption of the proportional hazards for covariates on the hazards is examined to include the time-dependent covariate terms in the models. As a result, the pipe material/joint type and the number of customers are modeled as time-dependent for the first failure, and for the second failure only the number of customers is modeled as time-dependent. From the analysis on the baseline hazard functions the failure hazards are found to be generally increasing for the first and second failure, while the hazards of the third break and beyond showed a form of a bath-tub. Furthermore, the changes in the baseline hazard rates according to the time and number of break reflect that the general condition of the pipes is deteriorating. The factors causing pipe break and their effects are analyzed based on the estimated regression coefficients and their hazard ratios, and the constructed models are verified using the deviance residuals of the models.

Resource Allocation of Cluster Inside using Kalman Filter in Ad-Hoc Network (애드혹 네트워크에서 칼만 필터를 통한 클러스터 내부의 자원 할당 최적화 기법)

  • Lee, Jangsu;Kim, Seungwook;Kim, Sungchun
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2007.11a
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    • pp.1006-1009
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    • 2007
  • 모바일 애드혹 네트워크는 기존의 셀룰러 네트워크와는 달리 고정된 기지국이 존재하지 않고 모바일 노드들만으로 구성된 네트워크이다. 모바일 애드혹 네트워크의 각각의 노드들은 제한된 자원과 한정된 용량을 가진 배터리로 동작한다. 만일 이 배터리를 모두 소모하게 된다면 중간 노드들이 다운이 되고, 결과적으로 전체 네트워크가 단절되는 문제가 발생할 수 있다. 이러한 문제점을 해결하기 위해서는 한정된 자원을 최대한 효율적으로 사용해야 한다. 이를 위해 본 논문에서는 클러스터 기반의 애드 혹 네트워크 환경에서 발생하는 경로 요청 시 클러스터 내부의 에너지 분산을 통한 네트워크 생존 시간을 연장시키고자 하였다. 효율적인 에너지 분산을 위해 칼만 필터를 통한 클러스터 내부의 트래픽 변화량을 예측하고, 예측값과 노드의 에너지 잔량을 기준으로 경로를 설정하도록 하였다. 실험 결과 생존 시간을 23% 증가시켰고, 칼만 필터를 통한 트래픽 변화량 예측값의 오차는 6.3%로 나타났다. 앞으로 칼만 필터의 관측값을 확장하여 예측값에 대한 오차를 줄이고, 보다 복잡한 네트워크 환경에 적용하는 연구가 필요하다.

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White Spot Baculovirus Infection of Shrimp Spawner, Inhabitant Organisms and Survival in Seawater (White Spot Baculovirus의 모하와 중간숙주 감염 및 해수생존)

  • Heo, Moon-Soo;Sohn, Sang-Gyu;Kim, Young-Jin
    • Journal of fish pathology
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    • v.13 no.1
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    • pp.15-20
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    • 2000
  • Infection rates with white spot baculovirus(WSBV) in wild-caught shrimp spawners appeared to be 52% in Penaeus chinensis and 20% in Penaeus japonicus when diagnosed by polymerase chain reaction (PCR). Infection rates of WSBV from inhabitant organisms in shrimp farm showed 37% in Upogebia major and 29% in Calliamassa japonica. The viruses maintained their survivorship in seawater at $4^{\circ}C$, but lost it at $25^{\circ}C$.

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$In$ $vitro$ MRI and Characterization of Rat Mesenchymal Stem Cells Transduced with Ferritin as MR Reporter Gene (페리틴 리포터 유전자를 발현하는 백서 중간엽 줄기세포의 특성과 자기공명영상 연구)

  • Shin, Cheong-Il;Lee, Whal;Woo, Ji-Su;Park, Eun-Ah;Kim, Pan-Ki;Song, Hyun-Bok;Kim, Hoe-Suk
    • Investigative Magnetic Resonance Imaging
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    • v.16 no.1
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    • pp.47-54
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    • 2012
  • Purpose : This study was performed to evaluate the characteristics of rat mesenchymal stem cells (RMSCs) transduced with human ferritin gene and investigate $in$ $vitro$ MRI detectability of ferritin-transduced RMSCs. Materials and Methods: The RMSCs expressing both myc-tagged human ferritin heavy chain subunit (myc-FTH) and green fluorescence protein (GFP) were transduced with lentiviurs. Transduced cells were sorted by GFP expression using a fluorescence-activated cell sorter. Myc-FTH and GFP expression in transduced cells were detected by immunofluorescence staining. The cell proliferative ability and viability were assessed by MTT assay. The RMSC surface markers (CD29+/CD45-) were analyzed by flow cytometry. The intracellular iron amount was measured spectrophotometically and the presence of ferritin-iron accumulation was detected by Prussian blue staining. $In$ $vitro$ magnetic resonance imaging (MRI) study of cell phantoms was done on 9.4 T MR scanner to evaluate the feasibility of imaging the ferritin-transduced RMSCs. Results: The myc-FTH and GFP genes were stably transduced into RMSCs. No significant differences were observed in terms of biologic properties in transduced RMSCs compared with non-transduced RMSCs. Ferritin-transduced RMSCs exhibited increased iron accumulation ability and showed significantly lower $T_2$ relaxation time than non-transduced RMSCs. Conclusion: Ferritin gene as MR reporter gene could be used for non-invasive tracking and visualization of therapeutic mesenchymal stem cells by MRI.

Group sequential testing methods for comparing cure rates (임상시험에서 치료율 비교를 위한 집단축차검정법에 관한 고찰)

  • 박경미;이재원
    • The Korean Journal of Applied Statistics
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    • v.9 no.2
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    • pp.95-108
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    • 1996
  • There are many clinical trials where a large portion of the patients are cured of disease. In such a case, one might be more interested in testing the differences in cure rates rather than other types of differences in failure distribution. For ethical and economic reasons, clinical trials must be repeatedly monitored for evidence of treatment benefit or harm. In this article, we examined by simulation the properties of nonparametric group sequential methods for comparing the cure rates between two treatment groups during the trial in a wide range of alternatives, censoring rates and cure rates.

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The Effect of Cutting Positions and Temperature on the Rooting of Bitter Gourd (여주 삽목 시 삽수절단 위치와 온도조건이 발근에 미치는 영향)

  • Lee, Hee Ju;Lee, Sang Gyu;Kim, Sung Kyeom;Choi, Chang Sun;Kim, Sang Beom
    • Journal of Bio-Environment Control
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    • v.25 no.3
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    • pp.162-167
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    • 2016
  • This study was carried out to investigate proper stem cutting position and air temperature to regenerate roots from cuttings of bitter gourd. 'NS454' (NS) and 'Dragon' (DR) cultivars were tested and the cutting position was cut at the 3rd node in the stem (treatment I) and cut at the central part (stem segment) between 3rd leaf and 4th leaf in the stem (treatment II). The air temperature was maintained at 18, 23, 28 and $35^{\circ}C$ in the growth chambers, respectively. The photosynthetic photon flux at the ground of a chamber was maintained in approximately $150-200{\mu}mol\;m^{-2}s^{-1}$ during the 16-hour photoperiod. The relative humidity in the chambers was maintained over 85%. After 10 days of cuttings, regardless of cutting position, DR and NS cultivars showed 100% the survival rate in the $18^{\circ}C$ or $23^{\circ}C$ treatments, however, most of plants $18^{\circ}C$ treatment had not rooting. In the $28^{\circ}C$ treatment, regardless of cutting position, DR and NS cultivars showed 100% of the rooting rate. In the $23^{\circ}C$ treatment, for DR cultivar, the node cutting showed 90% of rooting rate and the stem segment cutting showed 40% rooting rate. For NS cultivar, the node cutting showed 50% of rooting rate and the stem segment cutting showed 40% rooting rate. DR and NS cultivars have high rooting rate, while the rooting rate remarkably decreased in the $35^{\circ}C$ treatment. For DR cultivar, the stem segment cutting showed 5.3 of the highest rooting number and the node cutting showed 2.7 rooting number in the $28^{\circ}C$ treatment. NS cultivar was not significantly different the rooting regardless of cutting position. The results suggested that cutting at the stem segment cutting of bitter gourd is an effective cutting method for increasing survival rate and the air temperature should be maintained at $28^{\circ}C$.

Evaluation of Optimal Combination of Commercially Available Superparamagnetic Iron Oxide Nanoparticles and Transfection Agents for Labelling of Human Mesenchymal Stem Cells (인체 중간엽 줄기세포의 표지를 위한 상용화 된 Superparamagnetic Iron Oxide Nanoparticle과 Tansfection Agent의 적절한 병용을 위한 연구)

  • Kim, Sung-Hun;Oh, Soon-Nam;Park, Youn-Hee;Kang, Won-Kyung;Ahn, Kook-Jin;Chung, Soo-Kyo
    • Investigative Magnetic Resonance Imaging
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    • v.16 no.1
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    • pp.31-39
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    • 2012
  • Purpose : To determine the optimal combination of commercially available superparamagnetic iron oxide (SPIO) nanoparticles with transfection agents (TA). Materials and Methods: Protamine sulfate (Pro) and poly-L-lysin (PLL) were incubated with ferumoxide and ferucarbotran in human mesenchymal stem cells at various concentrations, and cellular viability were evaluated. Cellular iron uptake was qualitatively and quantitatively evaluated. Cell visibility was assessed via MR imaging and the T2-relaxation time was calculated. Results: The cellular viabilities with ferucarbotran were more significantly decreased than those with ferumoxide (p < 0.05). Iron uptake with ferumoxide was significantly higher than that for those with with ferucarbotran. The T2-relaxation time was observed to be shorter with ferumoxide in comparison to those with ferucarbotran (p < 0.05). Ferumoxide at a concentration of 25 ${\mu}g$/ml in combination with either Pro or PLL at a concentration of 3.0 ${\mu}g$/ml did not adversely impact cell viability, maximized iron uptake, and exhibited a lower T2-relaxation time in comparison to other combinations. Conclusion: Stem cells with ferumoxide exhibited a higher cellular viability and iron uptake in comparison to ferucarbotran-treated stem cells. A 25 ${\mu}g$/ml of ferumoxide with a 3.0 ${\mu}g$/ml of TA is sufficient to label mesenchymal stem cells.