• 제목/요약/키워드: 전기 영동

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토폴로지를 반영한 단백질 반점 자동 정합 (Automatic Matching of Protein Spots by Reflecting Their Topology)

  • ;이정배;황영섭
    • 정보처리학회논문지B
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    • 제17B권1호
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    • pp.79-84
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    • 2010
  • 두 개의 이차원 단백질 전기영동 영상에서 한쪽 영상의 각 반점이 다른 영상의 어느 반점과 일치하는 지 알아내는 일은 단백질의 생성과 소멸, 변이 등을 알 수 있게 하는 중요한 일이다. 단백질 반점은 주로 2차원 전기영동에 의해 분리된다. 이 과정은 조직의 상태, 실험 조건 등에 따라 같은 단백질이라도 그 위치가 조금씩 다르게 된다. 각 반점을 정합하여 보면 균일하지 않은 비선형 변환 관계를 이룬다. 그러나 국지적으로 보면 반점 사이의 토폴로지가 유지되는 것을 볼 수 있다. 본 연구는 이러한 토폴로지의 유지에 착안하여 반점끼리 정합하는 방법을 제안한다. 토폴로지의 유사성을 비교하기 위하여 이웃한 반점과의 거리와 각도를 비교하였다. 실험을 통하여 제안한 방법이 우수함을 보였다.

곡물류의 형질전환 유도에 관한 연구 (IV) 벼 배발생 세포의 생화학적 특징 (Studies on the Transformation of Crop Plants. IV. Biochemical Characteristics of Embryogenic Callus in Rice)

  • 정병균
    • Journal of Plant Biology
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    • 제36권4호
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    • pp.377-382
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    • 1993
  • 벼(Oryza sativa L.) 캘러스는 2.0 mg/L 2,4-D와 0.5 mg/L kinetin이 첨가된 MS 배지에서 성숙종자로부터 유도되었으며 embryogenic callus(EC)와 nonembryogenic callus(NEC)는 색깔과 외부형태에 의해 경시적으로 선별되었다. EC와 NEC의 전체 단백질로부터 SDS-PAGE와 등전점 전기영동에 의한 전기영동적 분석은 EC와 NEC의 각각에 대해 특이적, 양적인 차이를 보여주었다. 또한 EC와 NEC의 2차원 전기영동 분석은 약 20여개 이상의 EC 특이단백질과 10여개의 NEC 특이 단백질 양상을 보여주었으며, 아울러 EC 특이적인 90, 65, 50 kD의 단백질은 microheterogeneity를 보여주는 반면, NEC에서는 분자량의 변이가 큰 일련의 산성 이질단백질군을 보여주었다.

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모세관 전기영동 장치용 Photodiode Array 다채널 검출기의 개발에 관한 연구 (Development of a Multi - channel Detector for Capillary Electrophoresis System)

  • 홍승국;김해동
    • 분석과학
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    • 제11권2호
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    • pp.96-104
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    • 1998
  • 수 많은 광검출기들이 직선으로 집적된 광다이오드 어레이를 이용한 모세관 전기영동장치용 다채널 검출기를 개발하였다. 본 연구에서 사용된 광다이오드 어레이는 1024개의 광검출소자를 가지고 있으며 275~675 nm 파장범위에서 시료의 흡수분광스펙트럼을 검출할 수 있다. 이 장치는 30 ms내에 전 파장영역의 스펙트럼을 얻을 수 있으며, PC에 의하여 시료분석에 필요한 여러 가지 조건들을 제어할 수 있도록 설계하였다. 개발된 검출기의 성능을 L-ascorbic acid와 alizarin yellow GG를 사용하여 시험하였다. 본 연구에서 개발한 모세관 전기영동장치용 다채널 검출기의 재현성 실험결과 상대 표준편차는 5.6%이었다.

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전자 종이 적용을 위한 $TiO_2$나노 입자의 분산 특성 제어 (Dispersion Characteristics Control of $TiO_2$ Nano Particles for Electronic Paper)

  • 권순형;김세기;홍완식;안진호;김선재
    • 한국재료학회:학술대회논문집
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    • 한국재료학회 2003년도 춘계학술발표강연 및 논문개요집
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    • pp.127-127
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    • 2003
  • 전자종이에 대한 관심이 높아지면서 전자잉크의 pigment 소재에 대한 연구가 최근 활발하게 이루어지고 있다. 많은 재료 중 TiO$_2$는 비표면적이 크고 열적안정성 및 명암도가 뛰어나 전자잉크 재료로 많은 장점을 지닌다. TiO$_2$ 나노 입자를 전자종이에 적용할 경우 우수한 디스플레이 구현을 위해 높은 전기영동 특성 및 분산 안정성이 요구되어진다 이를 위해 표면 개질된 나노 크기의 루틸상 TiO$_2$ 입자의 제조 및 분산에 대한 최적의 공정조건에 대해 연구하였다. 10$0^{\circ}C$ 이하의 저온에서 가열하여 균일하게 침전시키는 저온균일침전법(HPPLT)으로 루틸 결정상의 TiO$_2$ 나노입자를 제조하였다. 제조된 TiO$_2$ 나노 입자와 용매의 비중을 맞추기 위해 비중이 낮은 투명성 polymer로 코팅을 한 후 비중병을 이용해 비중을 확인하였다. 그 후 copolymer block을 가지는 분산제를 TiO$_2$ 입자 기준 0.5-5wt% 범위에서 저유전율을 가지는 다양한 유기용매에 첨가하여 최적의 분산 및 전기영동 조건을 찾았다. 실험을 통한 분산안정성 및 전기영동 특성 평가를 위해 ζ-potential analyzer와 입도 분석기를 이용하였고 코팅된 입자의 표면상태는 FT-IR을 통해 측정하였다.

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꿀벌부채명나방 종령유충에서 유약호르몬 결합단백질의 정제와 특성 (Purification and Characterization of a Juvenile Hormong Binding Protein from Whole Body Homogenates of the Wax Moth, Galleris mellonella Final Instar Larvae)

  • 안기흥;전상학;이경로
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제37권1호
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    • pp.59-64
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    • 1998
  • 꿀벌부채명나방 종령유충의 whole body에서 gel filtration 방법으로 유약호르몬 결합 단백질을 분리, 정제하였다. 분리된 단백질은 column chromatography법과 전기영동법에 의해 등가성을 확인하였다. 이 결합단백질은 전기 영동법에 의해 32K, gel filtration 에 의해 28K의 상대적 분자량을 나타냈다. 또한, JH III에 대한 해리도는 3.9$\times$${10}^{-7}$M로 확인되었다.

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한국산 느타리 버섯 (Pleurotus spp.)의 전기영동 Isozyme Band Pattern 비교 -II. 등전점 전기영동- (Comparison of Electrophoretic Isozyme Band Pattern of Pleurotus spp. in Korea -ll. Isoelectric Focusing-)

  • 박용환;변명옥;등정부
    • 한국균학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.95-100
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    • 1988
  • 한국에 자생하는 느타리버섯 균주중 지역별로 기주가 다른 균주들을 수집하여 Esterase 동위효소와 Leucine amino peptidase 동위효소를 등전점 전기영동으로 균사와 자실체 부위별로 비교하였다. Pleurotus ostreatus의 Esterase 밴드 패턴은 균사와 자실체가 많은 차이가 있었으나 자실체중 Primordia, 갓, 줄기 등의 isozyme 패턴은 유사하였다. P. ostreatus, P. cornucopiae, P. florida의 Esterase 밴드 패턴에 많은 차이가 있어 종간 균주구별이 가능하였다. Leucine Amino Peptidase 밴드는 P. ostreatus, P. cornucopiae, P. florida 간에 뚜렷이 구별지을 수 없었으며, 균사와 자실체 간에는 약간의 밴드 패턴의 차이가 있었다.

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다양한 정제방법에 의한 전기영동용 한천유래 아가로즈의 제조 및 DNA분리 특성 (Preparation of Agarose from Gelidium amansii for Gel Electrophoresis using Various Purification Methods and Its Resolution Characteristics for DNA)

  • 도정룡;오세욱
    • 한국식품과학회지
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    • 제31권1호
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    • pp.110-114
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    • 1999
  • 제주도산 우뭇가사리로부터 agar를 제조하여 분석용 등급의 agarose 제조를 위하여 cetylpyridium chloride (CPC), polyethylene glycol (PEG), chitosan을 처리하여 agaropectin을 제거하여 agarose를 분리, 정제하였다. 3가지 방법중 chitosan을 처리하여 정제한 agarose는 황산기 함량이 가장 낮았으며, electroendosomosis도 가장 낮은 수치를 나타내어 분석용 agarose 제조를 위한 가장 효율적인 방법으로 나타났으며 실제 DNA 전기영동 실험에서도 가장 우수한 resolution을 나타내었으며 교차면역 전기영동에서도 시판되고 있는 제품에 비하여 품질이 양호함을 알 수 있었다.

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토란 Isolectin의 분석 및 특성 (Analysis and Characterization of the Taro (colocasia antiquorum) lsolectin)

  • 서영주;삼호정만
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제23권2호
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    • pp.308-314
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    • 1994
  • 토란에서 정제한 lectin은 적혈구 응집활성이 서로 다른 4개의 획분 (Isolectin I, II, III, IV)으로 이루어진 당단백질로서, disk 전기영동 및 densitometric pattern 상에서 I, IV는 단일한 subunit의 단백질로서, 그리고 II, III는 I, IV는 단일한 subunit의 단백질로서, 그리고 I, II는 I, IV의 fabric 단백질로서 추정되었다. 그러나, 요소 함유 disk 전기영동에서는 I은 단일의, IV는 2종류의 subunit에서, II, III은 I, IV의 subunit에서 구성된 단백질임을 알앗다. 그래서 염소함유 초점전기영동에서도 isolectin IV는 2개의 peack가 될 것이라고 예상하였으나 실제로는 1개의 peak만이 나타났다. 또한 정제 lectin은 당, 가열, pH, 변성제, 금속에 대한 적혈구 응집저해는 거의 보이지 않았으나, pepsin에 의한 부분적인 활성 변화가 관찰되었다.

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면역학적 전기영동에 의한 층층나무속과 그 근연군의 계통학적 추가연구 (Further Systematic Studies on Cornus and Relatives by Immunoelectrophoresis)

  • Lee, Yoo-Sung
    • Journal of Plant Biology
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    • 제28권2호
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    • pp.95-104
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    • 1985
  • 층층나무속(Cornus) 식물 수종과 그 근연군의 계통학적 유연관계를 밝히기 위하여 종자단백질을 이중면역확산법, 사전포화처리법, 방사상면역확산법, 면역학적 전기영동법 등으로 분석함으로 혈청학적추가자료를 얻었다. Cornus florida 면역혈청을 사용한 침전반응에서 C. drummondi와 C. stolonifera는 혈청학적 유사도가 매우 높았고, C. amomum과 C. recemosa는 다음으로 높았다. Cornus와의 근연군에 해당하는 분류군 중에서 Nyssa(Nyssaceae)가 가장 가까운 근연성을 나타냈고, Corokia (Cornaceae 또는 Saxifragaceae)와 Griselinia는 매우 낮은 근연성을 보여서 Cornaceae에의 소속을 지지하고 있지 않다. 그러나 그들의 독립된 과로서 구분하기 위해서는 많은 다른 분류학적 증거가 필요할 것으로 본다. 면역학적 전기영동법과 사전포화처리법의 조합된 기술은 비교적 정교한 종자단백질 분석이 가능했다.

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전류법을 이용한 생체물질 DNA 검출 마이크로칩 (biomolecule DNA detection using Microchip with amperometry)

  • 주기성;;김용상
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 2009년도 제40회 하계학술대회
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    • pp.1553_1554
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    • 2009
  • 마이크로칩에서의 생체물질 분석에 있어서 재현성은 매우 중요한 사항이다. 이전부터 많은 연구자들에 의해서 분석시 재현성을 향상시키고자 많은 연구가 선행되었다. 재현성을 향상시킬 수 있는 한 방안으로 겔 전기영동이 이용되고 있다. 본 연구에서도 겔 전기영동을 마이크로칩에 접목시켜 재현성을 향상시키는 실험을 진행하였다. DNA 시료로 100bp부터 1500bp 길이의 DNA 단편들을 사용한 결과 인산완충식 염수 (PBS)만을 사용하였을 경우보다 인산완충식염수(PBS)와 5% 폴리아크릴아미드 겔 (5% polyacrylamide)과 같이 사용하였을 경우 더 향상된 재현성을 확보하였다.

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