• The Korean Journal of Zoology
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• v.35 no.3
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• pp.287-294
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• 1992

배양 중의 골격근 세포는 증식을 거쳐 세포융합을 통해 다핵세포로 분화되므로 세포분화의 연구에 좋은 모델로서 이용되고 있다. 이전 실험에서 근원세포 융합을 억제하는 단일클론항체(MII-3J31)가 제작되었으며(Kim et al., 1992)이 항체에 대한 항원은 분자량이 약 35 kDa인 세포막 단백질로 추정되었다. 본 실험에서는 13일 계배와 성체의 근섬유 mRNA에서 CDNA라이브러리를 제작하여 근원세포 분화에 특이적으로 나타나는 유전자를 추적하였다. 근원세포 융합에 관여하는 단백질에 대한 CDNA는 계배 13일 째의 근원세포 CDNA라이브러리에서 단일클론항체를 사용한 immunoscreening 방법을 이용하여 확인하였다. 이 CDNA의 크기는 약 1.5 kb였다. 한편 13일 계배와성체 근섬유 CDNA 라이브러 리를 이용하여 13일 계배에만 특이하게 유전자 발현 이 일어 나고 성체에서는 나타나지 않는 약 0.8 kb의 CDNA플 찾았다.

• Korean Journal of Plant Tissue Culture
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• v.25 no.1
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• pp.37-43
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• 1998

The highest transformation frequency was observed when cotyledonary and hypocotyl explants of flowering cabbage (Brassica oleracea var. acephala DC) 'Eunbae' were cultured on shoot induction medium without kanamycin for 1 day, then cocultured with Agrobacterium tumefaciens LBA4404;;pGA1036 harboring tomato inhibitor II promoter and $\beta$-glucuronidae (GUS) fusion gene for 3 days. These explants were transferred to MS medium containing 20 mg/L kanamycin, 500 mg/L carbenicillin, and 1 mg/L BA. The explants were subsequently subcultured every 2 weeks. Incorporation of the GUS gene into flowering cabbage was confirmed by PCR analysis of DNA. Southern blot analysis showed that ECL-labeled GUS gene was hybridized to the expected amplified genomic DNA fragment of about 366 bp from transgenic flowering cabbage. Histochemical analysis based on the enzymatic activity of the GUS protein indicated that PI-II promoter activity was sysmatically associated with vascular tissue in wonded as well as in non-wounded leaves, petioles and stems, but not in roots. Partial wounding with razor blade showed not systemic induction but partial induction.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2008.05a
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• pp.407-409
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• 2008

생명체는 여러 가지 물질로 구성되어 있으며, 그 생명체의 분포지역에 따라 생물 종 특성도 다르게 나타난다. 그래서 연구자들이 생명체에 관한 정보를 확인하려면 그 생명체의 종 정보, 지역과 생태정보를 관련 생물다양성 데이터베이스에서 검색하며, 생명체를 구성하는 유전자 서열정보와 단백질 구조정보는 Genbank, PDB 등의 유전자/단백질 데이터베이스에서 검색하고 있다. 또한 그 생명체에 관한 학술적 내용이 수록된 학술 논문까지 별도로 검색해야만 그 생물체에 관한 정확한 정보를 획득할 수 있다. 이런 불편함을 해결하려면 하나의 생명체를 검색할 때, 생명체의 종 정보, 위치 정보, 생명체를 구성하고 있는 유전자 정보, 그리고 논문정보를 연계하여 검색할 수 있는 시스템이 필요하다. 이에, 본 논문에서는 하나의 생명체를 검색할 때 종 정보뿐만 아니라 GIS를 이용한 위치정보와 생명체를 구성하는 유전자 정보를 연계하고 그 생명체에 관한 논문 정보까지 검색 가능한 생명정보 연계검색 인터페이스를 설계하였다.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.31 no.1
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• pp.27-36
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• 1993

Rhizobium fredii USDA191 은 대기 중의 질소를 환원하여 식물체의 생육에 필요한 질소원을 공급해주는 세균으로 다량의 체외 다당류를 합성한다. 전위요소 Tn5의 삽입에 의한 돌연변이 유도로 다당류결핍 변이주 R. fredii YKL293 가 분리되었으며 이 변이주로부터 Tn5 에 인접한 DNA 단편이 pUC19 에 클로닝되었고(plyk5293),이 DNA 단편을 탐침으로 하여 .lambda.NM1149 에 구성되 USDA191 genomic library 로부터 야생형체외다당류 합성관련 유전자(exo) 를 함유한 클론 .lambda. NM1149 22E 를 plaque 혼성화에 의하여 분리하였다. 클론 NM1149.22E 에 들어있는 exo 유전자를 pBR322 에 옮겨서 pJW33을 만들고, 재조합체 pJW33 을 Escherichia coli POII734 에 도입시켜 lacZ 구조유전자를 함유한 MudI 1734 가 exo 유전자의 프러모토와 융합되어 lacZ 구조유전자의 전사가 이루어지도록 하였다. 위와 같이 만들어진 재조합체 플라스미드 pUM21을 함유한 E. coli JM83 은 .betha.-galactosidase 를 합성하였으며, 야생형 tacZ 유전자를 갖고 있는 E. coli LE392 에 비해서 14-25배 정도 낮은 역가를 보였다.

• Proceedings of the Korea Institute of Convergence Signal Processing
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• 2005.11a
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• pp.357-360
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• 2005

유전자 알고리즘(Genetic Algorithm, GA)은 자연적 진화과정에서 생존 경쟁 측면의 가장 적합한 메커니즘이다. GA를 소프트웨어로 수행하는데 큰 지연시간은 필수적이기 때문에 하드웨어 설계를 이용하여 알고리즘 실행 속도를 증가시키기 위한 많은 연구가 진행되어 왔다. 본 논문에서는 염색체의 임의의 유전인자를 기준으로 입력 받은 염색체에 대하여 GA 연산을 수행하는 유전 연산자를 설계한다. 설계된 디자인을 ARM 코어와 PLD로 구성된 Altera사의 Excalibur칩에 구현하여 동작을 검증하였다.

• Proceedings of the Korea Institute of Convergence Signal Processing
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• 2000.08a
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• pp.317-320
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• 2000

동영상 분할은 컴퓨터 비전 분야에서 중요한 단계로 많이 연구되고 있다 그러나 동영상 분할은 계산 복잡도에 의해 제약을 받는다. 이를 해결하기 위해, 본 논문은 분산 유전자 알고리즘에 기반한 계산 효율을 높일 수 있는 새로운 동영상 분할 방법을 제안한다. 일반적으로 동영상에서 연속한 두 프레임은 높은 상관관계를 가진다. 따라서, 한 프레임의 분할 결과는 이전 프레임의 분할 결과를 사용해서 연속적으로 얻어진다. 그리고 중복된 계산을 제거하기 위해 움직이는 객체에 대응되는 염색체만을 진화시킨다. 실험 결과는 제안한 방법의 효율성을 보여준다.

• Journal of Life Science
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• v.19 no.4
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• pp.549-552
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• 2009

Genetic mutations by gene fusion result from chromosomal rearrangement, trans-splicing, and intergenic splicing. Trans-splicing is a phenomenon in which two pre-mRNAs grow together into one. We analyzed the trans-splicing products in embryonic stem cells. By using bioinformatic tools, 70 trans-splicing transcripts were identified. They are classified into 6 types according to fusion pattern: 5'UTR-5'UTR, 5'UTR-3'UTR, 3'UTR-3'UTR, 5'UTR-CDS, 3'UTR-CDS, CDS-CDS. The fusion products are more abundant in CDS regions than in UTR regions, which contain multiple intron numbers. Chromosome analysis showing gene fusion via trans-splicing indicated that chromosomes 17 and 19 were activated. These data are of great use for further studies in relation to fusion genes and human diseases.

• Korean journal of applied entomology
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• v.36 no.4
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• pp.341-350
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• 1997

We have now constructed a novel recombinant baculovirus producing fusion protein with Autographa californica nuclear polyhedrosis virus (AcNPV) polyhedrin and Bacillus thuringiensis(Bt) cryIA(c) crystal protein. The fusion protein expressed by the recombinant baculovirus in insect cells was characterized. The N-terminal of cryIA(c) gene of Bt subsp. kurstaki HD-73 was introduced under the control of polyhedrin gene promoter of AcNPV, by fusion in the front of intact polyhedrin gene or by insertion into the HindIII site in polyhedrin gene. The recombinant baculoviruses were named as BtrusI or BtrusII, respectively. Although single transcript from the fusion protein gene was apparently observed. BtrusI was produced the two proteins, 92 kDa fusion protein and only polyhedrin. In addition, fusion protein produced by BtrusI did not form polyhedra. Interestingly, however, the cells infected with BtrusII did not show a 33 kDa polyhedrin band as a cells infected with BtrusI. Cells infected with BtrusII were only produced fusion protein, but the polyhedra formed by fusion protein was not observed. To determine the insecticidal toxicity of fusion protein, therefore, Sf9 cells infected with BtrusI were inoculated to Bombyx mori larvae. Sf9 cells infected with BtrusI that expressed the fusion protein caused larval mortality although the insecticidal toxicity was low. In conclusion, our results clearly demonstrated that the fusion protein with polyhedrin and Bt cryIA(c) crystal protein have a insecticida toxicity.

• The Korean Journal of Mycology
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• v.22 no.4
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• pp.378-385
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• 1994

Interspecific somatic hybrids were obtained by protoplast fusion between Pleurotus ostreatus and Pleurotus sajor-caju. The fusion products between incompatible strains did not form clamp connections. Fruiting body of the clampless fusants was induced by light-dark cycle on saw-dust-rice bran substrate in glass bottles. Out of them, seven somatic hybrids produced fruiting bodies of intermediate morphology of the two species. Light and low temperature were the initiating factors for the development of clamped hyphae from the clampless mycelial colonies. All of these basidiocarps had clamp connections. Eight fusants from the six crosses were analysed with the segregation of genetic characters by random spore isolates. In the three combinations, unexpected alleles were shown. Somatic hybrid between P188 (P. ostreatus 2-1 + P. sajor-caju 2-53) and P. florida 2-3 by triple cross produced fruiting bodies similar to those of fusant between P. ostreatus and P. florida. All the genetic charaters from the three strains were shown to segregate and recombine.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.33 no.2
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• pp.118-124
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• 1997

In the previous study(6), we constructed the CheY-OmpR hybrid, Chp, which affects the expressions of ompF and om pC genes. Here we further characterize these effects and present the regulatory mechanism based on in vivo and in vitro data. Although Chp retained the sequence-specific DNA-binding ability, it was not possible to enhance transcriptional activity, suggesting that it may act as a competitive inhibitor to OmpR. The DNA-binding affinity of Chp was not modulated by phosphorylation of its Che Y portion. Chp was able to increase ompR transcription. FurthemlOre, it was found that the wild-type OmpR also exerts the same effect, which is also eOlltrolled by changes in medium osmolarity and in EnvZ activity.