• Title/Summary/Keyword: 유전체 분석

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Growth of $(Pb_{0.72}La_{0.28})Ti_{0.93}O_3$ thin film by pulsed laser deposition (펄스 레이저 증착법에 의한 $(Pb_{0.72}La_{0.28})Ti_{0.93}O_3$ 박막의 증착)

  • Eun, Dong-Seog;Park, Jeong-Heum;Lee, Sang-Yeol;Park, Chang-Yub
    • Proceedings of the KIEE Conference
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    • 1997.07d
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    • pp.1236-1238
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    • 1997
  • 유전체 PLT(28) ($Pb_{0.72}La_{0.28}Ti_{0.93}O_3$) 박막을 레이저 어블레이션 기법으로 Pt/Ti/$SiO_3$/Si기판을 $500^{\circ}C{\sim}700^{\circ}C$까지 가열한 상태에서 $O_2$분위기에서 증착시켰다. 증착된 박막은 SEM, XRD 등의 구조적 분석을 통하여 $600^{\circ}C$이상에서 증착된 경우, (111)방향으로 우세하게 성장한, 결정성이 양호한 박막임을 확인하였다. 박막의 전기적 특성은, 증착 온도가 $650^{\circ}C$일 때 약 1400정도의 높은 비유전율을 얻었으며, 전하저장밀도는 100[KV/cm]에서 약 9[${\mu}C/cm^2$]이었다.

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Design and Implementation of a Web-Based Search Engine for Single Nucleotide Polymorphism Data (웹기반의 Single Nucleotide Polymorphism 데이터 검색 시스템의 설계 및 구현)

  • 양진옥;김상수
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2002.04b
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    • pp.160-162
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    • 2002
  • SNP는 개인과 개인간의 DNA에 존재하는 한 염기 쌍의 차이(single base-pair variation)이다. SNP를 이용하면 사람마다 다른 유전병의 형태 등을 규명할 수 있다. 본 논문에서는 한국생명공학연구원의 유전체 사업단에서 개발해 오고 있는 웹기반 SNP데이터 검색 시스템의 설계와 구현에 대해서 설명한다. 본 시스템은 일반 속성(attribute)을 저장하고 검색하기 위해 PostgreSQL DBMS를 사용하고, DNA 시퀸스 검색을 위해 BLAST검색엔진을 사용한 약결합 아키텍쳐(loosely-coupled architecture)를 채택하고 있다. 즉, 일반 속성으로 저장될 수 있는 데이터들은 데이터베이스의 테이블들의 컬럼 값으로 저장하고 SQL 언어를 통해 검색할 수 있도록 하였으며, DNA 시퀸스 검색을 위해서는 BLAST에서 제공하는 인덱스를 구축하고 BLAST 명령어를 사용하여 검색할 수 있도록 하였다. 또한, 결과 분석 모듈을 구현하여 검색 결과들이 다른 웹 사이트의 데이터를 가리키도록 하였다.

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The Influence of the Electrical Conduction Characteristics in $SrTiO_3$ Ceramics for Composition and Diffusion Temperature ($SrTiO_3$계 세라믹에서 조성비와 입계 절연화제의 확산온도가 전기전도 특성에 미치는 영향)

  • Lee, S.S.;Lee, S.J.;Choy, T.G.;Cho, H.J.
    • Electronics and Telecommunications Trends
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    • v.8 no.4
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    • pp.49-54
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    • 1993
  • 최근의 정보 통신 기기들은 정보 통신 서비스에 대한 요구에 따라 다기능, 고속 및 대용량화로 비약적인 발전을 하고 있으며 휴대 통신 단말기의 경우 이용자의 편리를 위하여 소형화 및 경박 단소화를 지향하고 있다. 따라서 부품에 대한 요구 사항도 이들 추세에 따라 소형화, 다기능화 및 고신뢰화를 요구하고 있다. 따라서, 하나의 소자로 복합적인 기능을 갖는 다기능성 소자의 개발이 바람직하다. $SrTiO_3$를 모체로 하는 세라믹 유전체는 반도체화 세라믹의 결정입계에 산화물로 절연층을 형성하여 하나의 소자로 Capacitor 와 Varistor 기능을 동시에 갖는 다기능 소자용 소재로 이용되고 있다. 본 실험에서는 $SrTiO_3$조성비 및 입계절연화제의 확산 온도에 따라 이들이 전기전도 특성에 미치는 영향에 대하여 검토하였다.

A Study on the Propagation Characteristics in Double Metal Strip Waveguides (이중 금속선 곡선형 도파로에서의 전파특성에 관한 연구)

  • Lee, Sang-Jun;Kim, Sang-In;Song, Seok-Ho
    • Korean Journal of Optics and Photonics
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    • v.18 no.3
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    • pp.226-231
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    • 2007
  • In this paper, we analyze the characteristics of various curved waveguides composed of double metal strips using finite difference method (FDM). Our investigation reveals that the bending loss of the double metal strip waveguide can be improved with less degradation of the straight waveguide's propagation loss compared to the single metal strip structure. Optimization of the double metal strip waveguide structure has been conducted considering bending and propagation losses.

Formation of Au-ZnS Core-Shell nanoparticles using physical vapor deposition and their surface plasmon resonance properties (물리기상증착법에 의한 Au-ZnS 코어-쉘 나노입자 형성 및 표면 플라즈몬 공진특성)

  • Kim, Yun-Ji;Lee, In-Gyu;Kim, Won-Mok;Lee, Gyeong-Seok
    • Proceedings of the Korean Institute of Surface Engineering Conference
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    • 2011.05a
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    • pp.65-66
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    • 2011
  • 금속:유전체 나노복합체 박막에서 발현되는 국소 표면 플라즈몬 공진특성을 효과적으로 제어하기 위해 코어-쉘 구조를 갖는 나노입자 형성 공정이 물리기상증착법을 이용하여 시도되었다. 선택적 증착 현상에 착안하여 Au와 강한 결합력을 나타내는 sulphur를 포함하는 ZnS 반도체 재료를 모델시스템으로 선정하였다. 교번증착법의 상대적 순서를 변화시켜 가며 Au입자 및 Au-ZnS 코어-쉘 입자의 형성거동을 광흡수 곡선과 TEM 분석을 통해 관찰하였다. Au단일입자에 비해 Au-ZnS 코어-쉘 나노입자는 ZnS 층의 상대적 두께조절에 의해 공진파장의 광범위한 제어가 용이해지고 국부전기장 증폭현상도 강화되는 것으로 확인되었다.

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Entity-Relationship Modeling for Integrating Heterogeneous Bio-databases (이질형 바이오 데이터베이스 통합을 위한 개체-관련성 모델링)

  • Jung, Jin-Hee;Lee, Do-Heon
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2001.10a
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    • pp.69-72
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    • 2001
  • 유전체 연구를 위해 구축된 바이오 데이터베이스는 해당 프로젝트의 목적에 따라 서로 다른 주체에 의해 독립적으로 구축되어 왔다. 그러나 바이오 데이터의 효과적인 판용을 위해서는 그러한 이질적인 바이오 데이터베이스의 정보를 상호 연계하여 분석한 필요성이 높아지고 있다. 본 논문에서는 대표적인 핵산 데이터베이스인 GenBank와 단백질 데이터베이스인 SWISS-PROT, 문헌 데이터베이스인 PubMed의 데이터 구조를 개체-관련성 도표로 각각 모델링한 후 합병하여, 핵산-단백질-문헌자료로 연계되는 정보를 통합 서비스할 수 있는 모델과 시스템 구조를 제시한다.

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The LD based Haplotype Reconstruction System for Large scale Genotype dataset (대용량 유전자형 데이터에 대한 LD기반의 일배체형 재구성 시스템)

  • Kim Sang-Jun;Yeo Sang-Soo;Kim Sung-Kwon
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2005.07b
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    • pp.271-273
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    • 2005
  • 유전자 분석기술의 발전은 지놈 프로젝트(genome project)와 햅맵 프로젝트(hapmap project)를 가능하게 하였으며 이제는 맞춤형 진단 및 신약 개발 등 실제 사업의 구체화를 가져오게 하였다. 실제 사업에 적용시키기 위해서는 비용 절감의 문제를 해결해야 한다. 그래서 대용량의 유전자형(genotype)데이터를 정확하고 빠르게 일배체형(haplotype)으로 재구성해 줄 수 있는 시스템이 생물 산업 및 제약 산업에서 제기되어 지고 있다. 기존의 연구에서 비록 정확성이 높은 알고리즘들이 개발되어 있지만 기존의 방법들은 계산에 필요한 양이 크기 때문에 대용량 데이터에 대한 처리가 불가능하였다. 우리가 제안하는 시스템은 대용량 데이터를 유동적인 크기로 블록을 분할하여 대용량 데이터 처리 문제를 해결하였다. 또한 나누어진 블록에서 나타나는 모호한 이형접합체(heterozygote)의 위상(phase)의 결정 과정에 LD기반의 블록 분할 방법을 이용함으로써, 추론된 결과의 정확률을 높였다. 구현된 시스템의 성능평가는 ms로 구성한 인공데이터를 사용하여 수행하였다.

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Gene Set and Pathway Analysis of Microarray Data (프마이크로어레이 데이터의 유전자 집합 및 대사 경로 분석)

  • Kim Seon-Young
    • KOGO NEWS
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    • v.6 no.1
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    • pp.29-33
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    • 2006
  • Gene set analysis is a new concept and method. to analyze and interpret microarray gene expression data and tries to extract biological meaning from gene expression data at gene set level rather than at gene level. Compared with methods which select a few tens or hundreds of genes before gene ontology and pathway analysis, gene set analysis identifies important gene ontology terms and pathways more consistently and performs well even in gene expression data sets with minimal or moderate gene expression changes. Moreover, gene set analysis is useful for comparing multiple gene expression data sets dealing with similar biological questions. This review briefly summarizes the rationale behind the gene set analysis and introduces several algorithms and tools now available for gene set analysis.

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High Throughput Genotyping for Genomic Cohort Study (유전체 코호트 연구를 위한 대용량 염기서열 분석)

  • Park, Woong-Yang
    • Journal of Preventive Medicine and Public Health
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    • v.40 no.2
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    • pp.102-107
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    • 2007
  • Human Genome Project (HGP) could unveil the secrets of human being by a long script of genetic codes, which enabled us to get access to mine the cause of diseases more efficiently. Two wheels for HGP, bioinformatics and high throughput technology are essential techniques for the genomic medicine. While microarray platforms are still evolving, we can screen more than 500,000 genotypes at once. Even we can sequence the whole genome of an organism within a day. Because the future medicne will focus on the genetic susceptibility of individuals, we need to find genetic variations of each person by efficient genotyping methods.

The Design and Implementation of a Web-Based Search Engine for GenBank Patent Data (웹기반의 GenBank 특허 데이터 검색 시스템의 설계 및 구현)

  • 양진옥;김상수
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2001.10a
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    • pp.43-45
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    • 2001
  • NCBI 의 GenBank 데이터베이스는 전세계에서 수집된 염기 서열 데이터들의 집합이며, 그 중 특허로 등록되어 있는 데이터들을 GenBank 특허 데이터라 부른다. 본 논문에서는 한국생명공학연구원의 유전체 사업단에서 개발해 오고 있는 웹기반 GenBank 특허 데이터 검색 시스템의 설계와 구현에 대해서 설명한다. 본 시스템은 일반 속성(attribute)을 저장하고 검색하기 위해 DBMS 를 사용하고, DNA 시퀸스 검색을 위해 BLAST를 사용한 약결합 아키텍쳐(loosely-coupled architecture)를 채택하고 있다. 즉, 일반 속성으로 저장될 수 있는 데이터들은 데이터베이스의 테이블들의 컬럼 값으로 저장하고 SQL 언어를 통해 검색할 수 있도록 하였으며, DNA 시퀸스 검색을 위해서는 BLAST 에서 제공하는 인덱스를 구축하고 BLAST 명령어를 사용하여 검색할 수 있도록 하였다. 또한, 검색 결과들이 기존의 외부 특허 시스템과 연동하도록 하기 위해, 결과 분석 모듈을 구현하여 검색 결과들이 다른 웹 사이트의 데이터를 가리키도록 하였다. 마지막으로, 이러한 DNA 검색 시스템을 구현할 때에 고려해 되야 되는 이슈들을 설명한다.

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