• Korean Journal of Poultry Science
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• v.17 no.4
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• pp.275-280
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• 1990

Comosomal polymorphism involving constitutive heterochromatin has been reported in mu, pigs, mouse, horse, chicken and so on. The chromosomal polymorphism of Japanese quail which includes constitutive heterochromatin as well the chromosomes without banding treatment has now been found. Through the use of a general technique that permits visualization of chromosome morphology and heterochromatin, three chromosomal variants have been found among birds ； ＋/＋ homozygous from, ＋/－ heterozygous form and －/－ homozygous form in chromosome 4. This variants appear to be common in the randombred population and stably inherited in a Mendelian fashion. These results suggest that the variants would be useful as chromosomal markers for various types of cytogenetic studies.

• Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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• 2013.02a
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• pp.464-464
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• 2013

그래핀 옥사이드(Graphene Oxide)는 그래핀과 마찬가지로 많은 분야로의 응용 가능성을 보이는 소자중 하나로 각광받고 있다. 그래핀 옥사이드가 가지는 유전체 특징은 전하 트랩층(charge trap layer)으로 사용을 가능하게 하고 또한 물에 녹는 수용성 특징은 스핀코터(spin coator)를 이용한 간단한 도포과정을 통하여 저비용으로 간단하게 소자를 제작 가능하게 한다. 이 연구에서 우리는 금속-절연체-반도체 구조를 가지는 메모리 소자를 제작하여 0.4 mg/ml의 농도로 DI에 용해된 그래핀 옥사이드가 플로팅게이트(floating gate)로써 사용되었을 때의 특성을 알아보기 위해 Boonton 720를 사용하여 C-V (hysteresis) 커브와 C-T(Capacitance-Time)를 측정하여 그래핀 옥사이드의 유무에 따른 메모리 윈도우 폭의 증가 및 저장된 정보가 손실되지 않고 얼마나 길게 유지 되는지를 살펴봄으로 플로팅게이트로써 그래핀 옥사이드의 특성을 살펴보았다. 먼저 터널링층으로 쓰이는 SiO2가 5 nm 증착된 P타입 Si기판위에 플로팅게이트로 쓰이는 그래핀 옥사이드층을 쉽게 쌓기 위하여 APTES 자기조립 단분자막 코팅을 한 후 그래핀 옥사이드를 3,000 rpm으로 40초간 스핀코팅을 하였다. 그 후 블로킹층으로 쓰이는 400 nm 두께의 폴리비닐페놀(PVP)를 3,000 rpm으로 40초간 스핀코팅을 하고 $130^{\circ}C$에서 열처리를 하였으며 $10^{-5}$ Torr의 압력에서 진공 열증착으로 알루미늄 게이트 전극을 증착했다.

• Journal of Life Science
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• v.31 no.4
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• pp.410-417
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• 2021

Next-generation sequencing (NGS) is a high-throughput technique for sequencing large numbers of DNA fragments that are prepared from a genome. This sequencing technique has been used to elucidate whole genome sequences of living organisms and to analyze complementary DNA (cDNA) or chromatin immunoprecipitated DNA (ChIPed DNA) at the genome level. After NGS, the use of proper tools is important for processing and analyzing data with reasonable parameters. However, handling large-scale sequencing data and programing for data analysis can be difficult. The Galaxy platform, a public web service system, provides many different tools for NGS data analysis, and it allows researchers to analyze their data on a web browser with no deep knowledge about bioinformatics and/or programing. In this study, we explain the procedure for preparing chromatin immunoprecipitation-sequencing (ChIP-seq) libraries and steps for analyzing ChIP-seq data using the Galaxy platform. The data analysis steps include the NGS data upload to Galaxy, quality check of the NGS data, premapping processes, read mapping, the post-mapping process, peak-calling and visualization by window view, heatmaps, average profile, and correlation analysis. Analysis of our histone H3K4me1 ChIP-seq data in K562 cells shows that it correlates with public data. Thus, NGS data analysis using the Galaxy platform can provide an easy approach to bioinformatics.

• The Korean Journal of Mycology
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• v.22 no.4
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• pp.378-385
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• 1994

Interspecific somatic hybrids were obtained by protoplast fusion between Pleurotus ostreatus and Pleurotus sajor-caju. The fusion products between incompatible strains did not form clamp connections. Fruiting body of the clampless fusants was induced by light-dark cycle on saw-dust-rice bran substrate in glass bottles. Out of them, seven somatic hybrids produced fruiting bodies of intermediate morphology of the two species. Light and low temperature were the initiating factors for the development of clamped hyphae from the clampless mycelial colonies. All of these basidiocarps had clamp connections. Eight fusants from the six crosses were analysed with the segregation of genetic characters by random spore isolates. In the three combinations, unexpected alleles were shown. Somatic hybrid between P188 (P. ostreatus 2-1 + P. sajor-caju 2-53) and P. florida 2-3 by triple cross produced fruiting bodies similar to those of fusant between P. ostreatus and P. florida. All the genetic charaters from the three strains were shown to segregate and recombine.

• Korean Journal of Veterinary Research
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• v.42 no.4
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• pp.505-512
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• 2002

대장균 K99 섬모의 생합성은 8개로 구성된 K99의 특이 유전자의 발현과 숙주유래 인자에 의해 조절되는 다른 유전자들의 발현에 의존된다. 본 연구에서는 K99섬모 유전자군중 제 3지역 발현에 유전조절자의 관련성 여부를 연구하였다. Gel retardation 분석 방법올 통하여 제3지역의 발현에 관련된 유전조절단위를 함유한 fanF 지역의 단백질 인자가 부착됨을 암시하였다. 이 분석방법을 이용한 결과는 또한 이 단백질 인자가 K99 유전자에서 유래되지 않고 대장균 염색체에서 유래됨을 지적하였다. 이를 보다 더 조사하기 위하여 대장균 염색체에 Tn10 transposon 유전자 변이 실험을 수행하였다. K99 유전자군으로부터 제 1지역과 제2지역의 유전자를 제거시키고, 제 3지역의 유전자인 fanG에 transposon TnlacZ를 삽입한 pTL65-1 plasmid을 제작하였다. 이 pTL65-1는 다시 Tn10으로 염색체가 변이된 대장균에 주입하였다. 3개의 pTL65-1 주입된 Tn10 대장균 변이체 내에서 fanG의 발현이 증가되었다. 이들 변이대장균으로부터 Tn10이 어떤 염색체 유전자 부위를 변이 시켰는지 확인하기 위해서 변이부위 유전자를 cloning하여 염기서열을 분석하였다. 이중 2개의 clone이 동일하였으며 지금까지 알려지지 않은 유전자였다. 이들 2개의 변이체 내에서 fanG의 발현은 대조군과 비교해 약 4.2배 증가 되였다. 결론적으로 이들 2개의 clone으로부터 유래된 인자는 지금까지 알려지지 않은 제 3지역의 억제 조절자임을 나타내었다.

• Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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• 2017.05a
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• pp.299-300
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• 2017

세포사멸(Apoptosis)은 유전자에 의해 일어나는 세포의 능동적인 죽음을 의미한다. 본 연구에서는 식물의 세포사멸과 동물의 세포사멸을 진화적 관점에서 접근함으로써 세포사멸이라는 기작을 분석하고자하였다. 먼저 인간에서는 세포사멸에 관여하는 단백질이지만 식물과 효모에서는 다른 기능을 하는 단백질 정보를 확인하였다. 확인한 단백질 정보를 바탕으로 다른 생물종과의 유전체 비교분석을 통해 해당 단백질과 세포사멸기작에 대한 정보를 확인 할 수 있었다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2012.11a
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• pp.1158-1161
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• 2012

식물 염기 서열 분석은 동물에 비해 유전체가 길고 데이터 양이 많아 특별한 전략을 요구하고 있다. 본 논문은 FCLA 전략을 지원하기 위한 데이터 분석 플랫폼의 개발에 대해 서술한다.

• The Proceeding of the Korean Institute of Electromagnetic Engineering and Science
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• v.5 no.4
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• pp.40-46
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• 1994

Design and microwave absorbing properties of ferrite plate are investigated for the application to the radiowave absorbers used in anechoic chamber. The required frequency-dependence of complex permeability is determined on the basis of wave-impedance-matching relationship. The plate thickness and matchingfrequency are determined from the complex permeability and dielectric constant, and then compared with the directly measured reflection loss. A systematic variation of material constants and their influence on the microwave absorbing properties are demonstrated.

• Journal of Plant Biotechnology
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• v.40 no.3
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• pp.135-140
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• 2013

A less simple approach developed for generation of marker-free transgenic plants is to select transformants without the use of selective marker genes. Some results about development of marker-free transgenic plants were obtained using a non-selective approach in several crops such as rice, potato and tobacco. However, the study did not provide evidence on detailed characterization of introduced gene on genome, a critical step for confirming the stable integration and transmission of a foreign gene. In this study, we evaluated structure and integration sites of transgene (mCry1Ac) in the transgenic Bt rice plants which were made via conventional Agrobacterium-mediated transformation by non-selective method. Structure and integration sites of transgene in these transgenic plants had similar fashion as those recovered under selection.

• Journal of Genetic Medicine
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• v.8 no.2
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• pp.135-138
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• 2011

The authors of the present study report the prenatal detection of a chromosomal abnormality with additional satellites on the distal short arm of chromosome 8. A 35-year-old woman was referred for amniocentesis because of her advanced maternal age and positive result for maternal serum screening test. Cytogenetic analysis of cultured amniocytes showed a satellite 8p chromosome. The satellite 8p chromosome was positive for nucleolus organizer region (NOR) staining. The parents' karyotypes were normal. Fluorescence in situ hybridization (FISH) study for metaphases of fetal amniocytes revealed a cryptic translocation of chromosomes 8p and 22p. The fetal karyotype was described as 46,XY,8ps.ish t(8;22)(p23.3;p11.2) (D8S504-;D8S504+)dn. The parents decided to continue the pregnancy and a phenotypically normal boy was born at 38 weeks of gestation. In case of de novo terminal NORs detected prenatally, more accurate cytogenetic and molecular analysis should be performed in order to rule out cryptic chromosomal rearrangement among other chromosomes.