• 한국응용약물학회:학술대회논문집
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• 한국응용약물학회 1994년도 춘계학술대회 and 제3회 신약개발 연구발표회
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• pp.265-265
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• 1994

본 연구는 간염 바이러스의 X 및 elongated X 유전자를 클로닝하여 E. coli에서 대량 발현시진 후, 그 기능을 여러 측면에서 연구하교 지금까지 알려진 oncogene products, tumor suppressor, 그리고 그 밖의 다른 암 유발인자와의 interaction에 대해 분석함으로써 간암 생성의 분자적 기작을 이해하고 더 나아가 간암의 예방 및 치료제의 개발을 목표로 하였다. 그 일차적 연구로서 이전에 플로닝된 mutant hepatitis Bvirus genome으로부터 X 및 elongated X 유전자를 클로닝하였으며, E. coli에서 대량 발현시키기 위하여 T7 bacteriophage promoter아래에 재 클로닝하였다. 이러한 X 및 ebngated X 유전자를 E. coli에서 대량 발현시킨 후, rabbit anti-X antibody를 이용하여 western blotting을 수행함으로서 이를 확인하였으며 DEAE-cellulose와 heparin-agarose chromategraphy를 이용하여 순수분리하였다. 순수분리된 X 및 etongated X 단백질을 highly differentiated hepatoma cell인 HepG$_2$ cell에 처리하여 transactivation activity를 측정하였다. 그 결과 순수분리된 단백질들이 SV4O promoter를 transactivation 함을 할 수 있었으며, 이로부터 클로닝된 유전자들이 모두 정상적인 기능을 가짐을 확인하였다. 그러고 X 유전자의 작용기작을 규명하기위하여 restriction endonuclease를 이용하여 5 개의 mutant X 유전자를 구성하였으며 현재 이를 HepG2 cell에 transfection 하여 그 기능을 연구하고 있다.

• Journal of Periodontal and Implant Science
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• 제37권sup2호
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• pp.339-351
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• 2007

Cytolethal distending toxin(CDT)은 세포 주기 중 G2에서 M 기로의 전환을 막아 세포의 증식을 억제할 수 있는 세균 단백 독소의 일종이다. 구강 미생물 중 유일하게 Actinobacillus actinomycetemcomitans (A. actinomycetemcomitans)만이 이 CDT를 생성 할 수 있는 것으로 알려져 있다. A. actinomycetemcomitans는 localized aggressive periodontitis (LAP)의 원인균으로 여겨지며 비 운동성의 그람 음성 구간균이고 $37^{\circ}C$, 5% $CO_2$ 하에 성장이 왕성하다. A. actinomycetemcomitans의 CDT는 3개의 인접한 유전자인 cdtA, cdtB, cdtC에 의해 형성 되며 각각의 유전자에 대한 단백질의 기능은 아직 완전히 밝혀지지 않았다. 현재까지 연구에 의하면 cdtA는 CDT의 세포부착과 관련이 있는 것으로 여겨지며 이 유전자의 기능 이상 시 CDT의 독성 효과가 현저히 감소한다고 알려져 있다. 따라서 본 연구는 A. actinomycetemcomitans의 cdtA 유전자를 클로닝, 단백질 발현하여 향후 치주질환의 발병 과정에서 CdtA의 역할을 규명하고 질환의 예방 및 치료법에 도움을 주고자 하였다. A. actinomycetemcomitans Y4균주를 cdtA 유전자 클로닝을 위해 사용하였다. A. actinomycetemcomitans의 genomic DNA는 genomic DNA 추출 kit를 사용하여 분리하고 cdtA에 특이적인 primer를 이용하여 PCR을 통해 cdtA 유전자를 증폭하였다. 증폭된 cdtA 유전자를 T-vector에 클로닝 하였으며, 클로닝 된 cdtA 유전자는 단백질 발현을 위해 pRSET Avector에 서브클로닝 한 후 발현 균주인 BL21(DE3)를 이용하여 발현시켰다. 발현 후 Ni-NTA AP conjugate를 이용한 Western blot을 통해 pRSET-CDTA를 확인하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제19권6호
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• pp.575-582
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• 1991

글루타치온 생산증대를 도모하기 위하여 글루타치온 합성에 관여하는 효소들인 GSH-I 및 GSH-II 유전자들 pBR322 벡터에 클로닝하였다. gshI 유전자를 클로닝하기 위하여 GSH-I 효소활성이 결여된 GS903 균주를 분리하였다. E. coli K-12 염색체 DNA로부터 분리된 3.6Kb PstI DNA 절편을 pBR322 벡터에 클로닝하였다. gshII 유전자는 2.2Kb PstI-BamHI DNA 절편내에 존재하며 이 절편을 pUC13 벡터에 클로닝하였다. 플라스미드의 copy number와 gsh 유전자들을 포함하고 있는 삽입 DNA의 크기의 차이에 의한 gsh 유전자들의 발현 정도를 조사하기 위하여 pGH1090, pGH101, pGH200, pGH201, pLF4, pLF6 그리고 pGH300같은 여러 플라스미드를 사용함으로써 gshI 유전자의 발현이 의해 2배이상 증가하였다. 그러나 벡터 플라스미드내에 존재하는 gsh 유전자들을 포함하는 삽입 DNA의 크기의 차이에 의해서는 gsh 유전자들의 발현이 영향을 받지 않았다.

• 한국산학기술학회:학술대회논문집
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• 한국산학기술학회 2007년도 춘계학술발표논문집
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• pp.270-272
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• 2007

본 연구는 서산 6쪽 마늘로부터 완전장 유전자 은행의 제작과 이를 통해서 확보된 1,000여개 재조합 클론에 대한 염기서열 결과를 web-based database를 통한 상동성 분석으로 부터 서산 마늘의 발현 유전자에 대한 생물정보학적 분석에 관해 것이며 본 연구로 부터 마늘의 대표적 생리활성 물질인 allicin의 생성에 관여하는 효소인 allinase의 cDNA를 클로닝 및 완전 염기서열을 해석하였으며 allinase 유전자의 genomic structure 에 대한 일부의 결과를 확보하였다. 또한 다양한 생물종에서 연구 되어지고 있는 생리활성 단백질인 lectin 유전자 cDNA를 클로닝하여 완전 염기서멸을 분석하고, 6xHis Tag올 통한 재조합 단백질을 대장균에서 E.coli에서 발현시켰다.

• 미생물학회지
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• 제40권3호
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• pp.226-229
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• 2004

염색질을 구성하는 histone 단백질 lysine 잔기에 histone acetylase에 의하여 결합된 acetyl기를 제거하는 histone deacetylase (HDAC)는 진핵세포 생물의 염색질 안정 파 및 유전자 발현에 매우 큰 영향을 미친다. 국내에서 분리된 영지의 HDAC 유전자를 클로닝 하고자 cDNA 및 genomic DNA를 대상으로 PCR을 수행한 결과 470bp의 cDNA유전자와, 585 bp, 589 bp 및 630 bp길이의 genomic DNA유전자 조각을 클로닝 하였다. 이들의 염기서열을 근거로 아미노산 서열을 다른 균류의 HDAC와 비교한 결과 59-72％의 상동성을 보였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제44권2호
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• pp.140-144
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• 2016

사람의 분변으로부터 분리한 Bacteroides stericoris HJ-15로부터 chondroitinase ABC 유전자를 클로닝하였다. 클로닝한 chondroitinase ABC 유전자는 3,090 bp, 1,029 아미노산으로 구성되어 있었다. B. stercoris chondroitinase ABC 유전자는 이미 보고된 chondroitinase ABC 유전자들과 호몰로지가 없었으나, 아미노산서열에서는 82% 호몰로지를 보였다. T7 promoter를 가진 pET-26b+ expression vector에 클로닝한 chondroitinase ABC 유전자를 Escherichia coli BL21 (DE3)에서 발현하여 정제한 재조합 chondroitinase ABC는 chondroitin sulfate A, B 및 C를 모두 분해하였다.

• 미생물학회지
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• 제30권5호
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• pp.410-414
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• 1992

난분해계 물질을 분해할 수 있는 균주 개발에 유용한 클로닝백터를 개발하기 위하여, Pseudomonas putida 로부터 유래한 R 플라스미드 pKU10 을 HindIII 로부터 부분소화하여 약 8.5 kb 의 새로운 플라스미드 pKU11 을 조립하고, 여러 숙주세포에서의 안정성 및 catechol 2, 3-dioxygenase 유전자의 클로닝 을 통해 난분해계 유전자클로닝 백터로의 유용성을 조사하였다. pKU11 은 높은 농도의 ampicilin 과 tetracyclin 에 대해서 내성을 나타내었고, P. putida TN1307 에 도입되었을 때 수세대 동안 안정되게 발현되었지만, Pseudomonas 이외의 숙주세포로서 E. coli 와 Achromobacter gr. D. V. 에 도입되었을 낮은 형질전환빈도와 불안정성을 나타내었다. pKU11 의 copy 수는 8 개로 조사되었고, pKU11 에 xylene 분해에 관련된 catechol 2, 3-dioxygenase 유전자를 클로닝 하였을 때 P. putida TN 1307 에서 잘 발현하였다. 따라서 pkU11 은 난 분해계 유전자를 클로닝하는에 Pseudomonas 에서 유용한 벡터로서 쓰일 수 있을 것으로 사료된다.

• Journal of Plant Biology
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• 제35권2호
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• pp.165-171
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• 1992

rbcL 유전자 발현조절에 관한 연구의 일환으로 Cp DNA로부터 분리한 rbcL 유전자를 클로닝하였다. 옥수수의 엽록체로부터 DNA를 분리한 후 제한효소 BamHI으로 절단하여 rbcL 유전자가 포함된 BamHI 9 절편을 pUC19에 클로닝하여 재조합 플라스미드 pRLYS1을 만들었다. 쌀의 rbcL 유전자 일부를 probe로 사용하여 pRLYS1과 Southern hybridization한 결과와 제한효소 BamHI, HindIII, 그리고 PstI으로 절단된 pRLYS1 절편의 전기영동 결과로부터 재조합 플라스미드의 내부에 완전한 rbcL 유전자의 존재를 확인하였고 삽입방향을 결정하였다.

• 한국동물번식학회:학술대회논문집
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• 한국동물번식학회 2003년도 학술발표대회 발표논문초록집
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• pp.40-40
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• 2003

형질전환체 제작 시 발현벡터가 삽입되는 위치에 따라 발현 또는 억제되는 현상인 ‘position effect(위치효과)’를 극복하기 위해 Matrix Attachment Region(MAR)을 포함하는 발현벡터를 제작하였다 MAR는 핵 기질(nuclear matrix) 부착 부위로 발현조절에 관여하는 전사인자 등이 존재하는 핵 기질 부착부위로, 삽입된 발현벡터가 전사활성을 할 수 있는 게놈 환경을 제공해 주어 형질전환 유전자 발현을 향상시켜 준다고 보고되고 있다. 본 연구에서는 사람에서 이미 분리되어 염기서열이 밝혀진 MAR를 PCR로 증폭하였다. 증폭된 1,270 bp의 human alpha-1-antitrypsin MAR와 1,080 bp human corticosteroid binding globulin promoter MAR를 T vector에 클로닝하여 염기서열을 확인했으며 발현벡터 클로닝에 사용하였다. 유용 유전자와 세포 형질전환에 사용할 선별 유전자로 neo를 포함하며, 그 외 벡터골격은 pGL3 control vector를 사용하여 기본 발현벡터를 제작하였다. 이 벡터에 MAR를 5', 3' 양쪽 또는 한쪽만 포함하도록 클로닝하였다. 이는 MAR의 위치에 따른 게놈내 삽입 및 발현효과를 확인하여 형질전환동물 생산용 발현벡터로 활용하고자 한다.

• 생명과학회지
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• 제24권1호
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• pp.1-7
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• 2014

진핵세포의 유전자 발현은 genomic DNA 부위의 프로모터라고 불리우는 지역에 전사인자와 RNA 중합효소가 자리하면서 시작되는 기작이다. 유전자 내의 프로모터를 동정하는 여러종류의 실험 방법들이 있지만, 많은 시간과 노동력이 요구되어진다. 본 연구에서는 Ensembl, NCBI, CpG plot 등과 같은 생물정보학 관련 프로그램들을 활용하여 SETDB1 유전자의 프로모터를 동정하여 클로닝하고자 하였다. PCR 증폭을 수행한 후 얻은 약 2 kb DNA 조각을 SETDB1-P1이라 명명하였으며, PCR 산물은 TA 벡터로 클로닝 후 확인하였으며, 이를 다시 제한 효소 절단을 통하여 pGL3-luc 벡터로 클로닝하였다. 클로닝된 pGL3-SETDB1-P1-luc 플라스미드를 H1299 폐암세포주에 transfection 시킨 후 여러 가지 항암제를 처리하였을 때, taxol, 5-FU, doxorubicin 처리군에서 SETDB1 프로모터 활성이 감소하는 것을 확인하였다. 이러한 결과는 웨스턴 블롯 및 RT-PCR 실험을 통해 항암제 처리 후 SETDB1 유전자 발현이 조절됨을 확인하였다. 그러므로 bioinformatics 프로그램을 통한 프로모터 동정 및 클로닝 방법을 다른 유전자들에도 적용시킨다면, 유전자 발현 연구에 매우 유용할 것으로 사료된다.