• Journal of Life Science
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• v.20 no.4
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• pp.614-617
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• 2010

We sequenced a 522 bp fragment including the $tRNA^{Thr}$, $tRNA^{Pro}$ gene and the first half of the control region from 29 wild and cultured olive flounder specimens from Korea. Out of 522 nucleotide sites, 49 (9.4%) were variable, 23 haplotypes being found. Most haplotypes are unique in the wild population and only four were shared by cultured specimins. The nucleotide diversity and differences between wild and cultured populations were $0.025{\pm}0.013$ and $0.015{\pm}0.008$, and $12.94{\pm}6.00$ and $7.83{\pm}3.75$, respectively. Haplotype diversity was $0.98{\pm}0.02$ and $0.49{\pm}0.09$ in the wild and cultured populations, respectively. These results show that marked reductions of genetic variability in the hatchery strains were observed in the number of mitochondrial DNA haplotypes and haplotype diversity when compared to the wild populations. Furthermore, we detected significant population differentiation between both populations. The mtDNA sequencing technique used to evaluate the genetic variability of hatchery strains compared to that of the wild population is potential for genetic monitoring of olive flounder hatchery stocks.

• Journal of Aquaculture
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• v.3 no.1
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• pp.31-37
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• 1990

Ten strains of tilapiine species from genus Oreochromis were cytogenetically studied for genetic stock identification. Both the chromosome numbers(2n=44) were identical in all 10 strains. Heteromorphic sex chromosome pair were not found in any strains. Nuclear volumes vary between O. niloticus(21.0 $\mu$ $m^3$) and O. aureus(22.4 $\mu$ $m^3$)

• Proceedings of the Korean Aquaculture Society Conference
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• 2003.10a
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• pp.33-33
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• 2003

Lipoprotein lipase (LPL)은 지방축적과 대사에 있어 중요한 효소로서 지방조직과 근육 내로의 지방산 유입을 조절하며, 여러 조직에서 합성되고, 조직 특이적인 방법으로 동물의 생리상태, 영양상태 및 발달단계에 따라 유전자 발현이 조절되는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 어류의 체지방 축적과 대사과정을 이해하고 성장 및 경제형질 관련 DNA marker를 확보하기 위한 1차적인 연구로서, 한국산 선발계통 및 일본산 양식계통과 이들 두 계통간 잡종 참돔 집단을 이용하여 LPL 유전자 내의 다형성을 탐색하고 분석하였다. PCR-RFLP 분석을 실시하여 참돔 LPL 유전자 exon 2번을 포함하는 영역에서 3개의 (Msp I, Alu I 및 Hsp92II) 다형성을 확인하였고, 각 집단간 대립유전자의 빈도를 분석하였다. Exon 2번에서 관찰된 Msp I 다형성은 염기치환 (C$\longrightarrow$G)이 일어난 형태로서 아미노산 서열에는 변화가 없는 silent mutation 이었으며, 대립유전자의 빈도를 분석한 결과, 각 집단간 뚜렷한 차이는 없었다. Alu I 및 Hsp92II 다형성은 intron 영역에서 발견되었으며, Alu I 다형성으로 인한 4개의 대립유전자형 중 D 대립유전자는 한국산 선발 계통과 한국산 선발계통을 포함하는 교배집단에서만 검출되었다. 이 후의 연구에서는 참돔 LPL 유전자의 exon 영역에 존재하는 다형성을 탐색하고, 형질과의 연관성 및 지방축적 기능과의 관련성 등을 분석하고자 한다.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.55 no.2
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• pp.174-176
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• 2019

A novel bacterium, designated strain RR4-38 (= KCTC 52651 = DSM 108068), belonging to the family Flavobacteriaceae was isolated from a biofilter in the seawater recirculating aquaculture system in South Korea. A single complete genome contig which is 3,182,272 bp with 41.9% G+C content was generated using PacBio RS II platform. The genome includes 2,829 protein-coding genes, 6 rRNA genes, 38 tRNA genes, 4 non-coding RNA genes, and 9 pseudogenes. The results will provide insights for understanding microbial activity in the seawater recirculating aquaculture system.

• Journal of Aquaculture
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• v.21 no.4
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• pp.346-350
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• 2008

RAPD analysis was examined to estimate the availability as a genetic marker. The availability was evaluated in terms of genetic divergence and relationships among Haliotis discus hannai, H. rufescens, H. rubra and H. midae in both hemispheres of the world. In results, RAPD analysis showed a clear genetic divergence between every pair of species. However, genetic relationships among the four species estimated by RAPD analysis unreflected to geographical distribution and morphological characteristics. In conclusion, RAPD is suitable genetic markers for estimates of genetic divergence and differences among abalone species.

• Proceedings of the Korean Aquaculture Society Conference
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• 2003.10a
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• pp.117-117
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• 2003

다시마(Laminaria japonica) 생태육종 연구의 일환으로 완도산과 백령도산 품종의 재배시험을 전남 고흥군 명천어장과 계도어장에서 2001년부터 2002년까지 실시하였다. 시험기간 중 어장의 수온, 염분농도, 유속, 용존산소농도는 구간별로 유의차가 없었으며 수온은 1월부터 7월까지 점차 상승하였고, 염분농도는 5월까지 상승하다가 6월과 7월에 낮아졌다. 유속은 저층에서보다 표층에서 빨랐고, 용존산소농도는 1월부터 7월까지 점차적으로 낮아졌다. 어장의 영양염 변화는 구간별로 1월부터 7월까지 유의차가 없었으며 암모니아염이 5월에 다소 증가하였다. 일반적으로 전장과 엽폭은 4월까지 증가하다가 끝녹음으로 인하여 4월이후에는 다소 감소하였으나, 엽두께, 전중량, 비대도는 7월까지 계속적으로 증가하였다. 형질간의 상관관계는 모두 1%와 5% 수준에서 유의차가 있었다. 각형질에 있어서 품종과 환경간에 월별로 질적교호작용과 양적교호작용중 어느 한 쪽이 나타났다. 품종시험에 의한 유전력은 엽폭에서 가장 높았고, 엽두께에서 가장 낮았다. 표현형상관, 유전상관, 환경상관계수는 형질간에 대부분 높은 값을 보였으나 엽두께와 전중량간의 값이 일반적으로 낮았다. 부모와 자식간의 회귀에 의한 유전력은 계도어장의 엽두께에서 가장 높았으나 일반적으로 전중량에서 높았고, 육종가와 유전상관은 전중량에서 가장 높았다. 각 형질의 상대적 경제 가치를 고려한 선발 총점은 명천어장에서의 완도산 품종에서 가장 높았다.

• Journal of Aquaculture
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• v.18 no.4
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• pp.252-259
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• 2005

Isozyme and AFLP analyses were examined to estimate the utilities of them as a genetic marker. The utilities were evaluated by genetic divergence and relationships among the four distinct abalone species; Haliotis discus hannai collected from northeast coast of Japan and Yellow-Sea coast of China, H. rufescens collected from west coast of USA, H rubra collected from southeast coast of Australia and H midae collected from Cape Town of South Africa. Isozyme and AFLP analyses showed a clear genetic divergence between every pair of species. Genetic relationships among the low species estimated by isozyme and AFLP analyses reflected to geographical distribution and morphological characteristics. In conclusion, Isozyme and AFLP analyses are suitable genetic markers far estimates of genetic divergence and relationship among abalone species.

• Proceedings of the Korean Aquaculture Society Conference
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• 2006.05a
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• pp.425-426
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• 2006

• Proceedings of the Korean Aquaculture Society Conference
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• 2006.05a
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• pp.369-370
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• 2006

• Proceedings of the Korean Aquaculture Society Conference
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• 2005.05a
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• pp.124-125
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• 2005