• Korean Journal of Plant Taxonomy
• /
• v.39 no.3
• /
• pp.193-198
• /
• 2009

Chromosome analysis using karyotyping and bicolor FISH were carried out for two Maackia species (M. fauriei and M. amurensis) found in Korea. The somatic metaphase chromosome number was 2n = 2x = 18 in both, and the size of these chromosomes ranged from 3.58 to $5.82{\mu}m$. The chromosome complements consisted of two pairs of metacentric (chromosomes 1 and 7), four pairs of submetacentrics (chromosomes 4, 6, 8 and 9) and three pairs of subtelocentrics (chromosomes 2, 3 and 5) in M. fauriei but, chromosomes 4 (subtelocentric) and 7 (submetacentric) of M. amurensis have different morphology. Using bicolor FISH, a pair of 45S rDNA loci were observed for both M. fauriei and M. amurensis, but the number and site of the 5S rDNA signal were different in the two species. M. fauriei has two pairs of 5S signals on chromosomes 7 and 8 but, M. amurensis has four paris on chromosomes 3, 4, 7 and 7. Hence, the 5S rDNA is a useful FISH for Maackia species.

• Proceedings of the KSAR Conference
• /
• 2003.06a
• /
• pp.24-24
• /
• 2003

Fluorescence in situ Hybridization(FISH)는 특정 염기서열을 이용하여 염색체나 염색체상의 DNA위치를 확인하는 기술로서, 면역세포화학 기술과 결합되어져 현미경으로 이들의 유전적 활성도를 직접 확인할 수 있는 방법으로 지금까지의 radioisotopes 대신 non-radioactive labeling 방법으로서 fluorescence을 이용한 분자세포유전학적 검정 방법이다. 따라서 특정 염색체의 FISH probe의 개발은 FISH 기법을 이용하여 조직 또는 세포내 특정 염색체나 DNA의 존재나 이상 유무를 신속하고 정확하게 파악할 수 있다. 본 연구는 소와 사람을 대상으로 Y-염색체 특이 DNA probe를 개발하고 이를 이용하여 FISH를 시행함으로서 본 probe의 신뢰성을 확인하고 임상적 적용 가능성을 제시 하고자 하였다.

• The Korean Journal of Zoology
• /
• v.19 no.3
• /
• pp.101-112
• /
• 1976

1. It has been found in the karyotype of Apodemus agrarius coreae that No. 1 chromosome pair is subtelocentric and this is the new chromosome type in comparison with acro-telocentric No. 1 pair of the other subpecies. 2. It was reported in the Karyotype of Microtus fortis from USSR that the autosome consisted of 2 submetacentric, 10 metacentric and 38 acrocentric chromosomes, and that X is acrocentric and Y is small acrocentric one. In the present study, however, the autosome of M. fortis pelliceus in Korea is composed of three groups; 4 subtelocentric, 10 meta-submetacenric, and 36 acrocentric one. And X is the largest metacentric chromosome of the complement. Y is smaller acrocentric one. Thus, it has been found that the karyotype of M. fortis in Korea differs from that of the same species in USSR. In the karyotype of this red vole, two pairs of heteromorohic chromosome with respect to the size of their secondary constrictions have been shown in the acrocentric group. 3. The diploid number of Cricetulus triton nestor was found to be 28, and its chromosome size ranges from 7.5 $\\mu$ to 1.5 $\\mu$. Autosomes contains 11 large acrocentric pairs and two pairs of very small metacentric ones. This feature is simillar to that of Tscherskia triton found USSR.

• Korean Journal of Plant Resources
• /
• v.10 no.4
• /
• pp.292-299
• /
• 1997

The somatic chromosome numbers among the various taxonomic characters about 17 taxa in Korean Aster and its allied taxa were investigated to review accurate scientific name and taxonomic rank. The somatic chromosome numbers of the treated taxa were invariable in same taxa, but variable among different taxa. The treated taxa were divided into two types by basic chromosome numbers, one type was x=9, the other x=8 and x=9 type was subdivided by polyploidy. The somatic chromosome numbers of Aster altaicus var. uchiymae, A. hyatae, Kalimeris chejuensis were reported firstly in this study, and based upon somatic chromosome numbers and leaf morphology, the plants, idenified as Aster pinnatifidus in Korea was considered variant of Kalimeris incisa.

• Korean Journal of Plant Taxonomy
• /
• v.43 no.1
• /
• pp.22-26
• /
• 2013

We report somatic chromosome numbers 2n = 12 for three Carex sect. Siderostictae Franch. ex Ohwi (Cyperaceae) from Korean populations: Carex ciliatomarginata Nakai, C. okamotoi Ohwi, and C. siderosticta Hance. This study is the first chromosome number report for the species C. ciliatomarginata from Korean populations. As found in other Carex species, all the chromosomes examined in the section exhibit nonlocalized centromere (polycentric or holocentric) and large (more than ca. $1{\mu}m$ long) chromosomes. Considering the basal phylogenetic position of the section in tribe Cariceae Pax, small numbers of large chromosomes have been hypothesized as primitive characters in Cariceae, and our observation supports the hypothesis. Further investigations of chromosomes in Carex are needed for a better understanding of species richness in the genus.

• Korean Journal of Plant Taxonomy
• /
• v.39 no.4
• /
• pp.247-253
• /
• 2009

Somatic chromosome numbers for 20 taxa of Korean Artemisia L. were investigated for the purpose of classification. Somatic chromosome numbers of treated taxa were 2n = 16, 18, 34, 36, 50, 52, 54, and therefore their basic chromosome numbers were x = 8, 9, 10, 13, 17. The chromosome number of A. japonica var. angustissima is being reported for the first time in this study. The chromosome numbers of 13 taxa were the same as in previous reports; A. capillaris (2n = 18), A. japonica var. hallaisanensis (2n = 36), A. japonica subsp. littoricola (2n = 36), A. annua (2n = 18), A. carvifolia (2n = 18), A. fukudo (2n = 16), A. keiskeana (2n = 18), A. stolonifera (2n = 36), A. sylvatica(2n = 16), A. selengensis (2n = 36), A. montana (2n = 52), A. lancea (2n = 16), A. sieversiana (2n = 18); however, the chromosome numbers of 6 taxa were different; A. japonica var. japonica (2n = 18, 36 vs 2n = 36), A. sacrorum (2n = 18, 54 vs 2n = 54), A. rubripes (2n = 16, 34 vs 2n = 16), A. indica (2n = 34, 36 vs 2n = 34), A. codonocephala (2n = 18, 50, 54 vs 2n = 50), A. argyi (2n = 34, 36, 50 vs 2n =34). The somatic chromosome numbers of Korean Artemisia are thought to be good characteristics for classifying some taxa such as A. japonica var. japonica, A. sacrorum, A. codonocephala, A. argyi, A. montana, A. sylvatica.

• Korean Journal of Ichthyology
• /
• v.1 no.1_2
• /
• pp.64-72
• /
• 1989

Karyological characteristics were investigated in 3 species of the genus Liobagrus from Korea. The diploid chromosome number in L. andersoni was found to be 28, with 9 pairs of metacentrics and 5 pairs of submetacentric chromosomes, and arm number (AN) was 56. L. mediadiposalis was found with 2n of 42, consisting of 13 pairs of metacentrics and 8 pairs of submetacentric chromosomes (AN=84). In the case of L. obesus 2n was 20, with 20 metacentric chromosomes (AN=40), which was the lowest among the species of the order Siluriformes. Sexual dimorphism or intraspecific polymorphism of the chromosomes was not observed in any species examined.

• Journal of KIISE:Software and Applications
• /
• v.27 no.11
• /
• pp.1115-1122
• /
• 2000

기존의 블록 정합 알고리즘인 FS(Full Search) 알고리즘은 정확한 움직임 벡터를 구할 수 있으나 요구되는 계산량이 많다. 반면에 국부 탐색을 하는 고속 블록 정합 알고리즘은 FS보다 빠른 탐색을 할 수 있으나 FS 보다 정합 오차가 크다. 본 연구는 전역탐색을 하는 유전자 알고리즘에 빠른 탐색을 하는 블록 정합 알고리즘인 NTSS(New Three Ste Search)알고리즘을 제안한다. 제안한 방법에서 각 염색체는 움직임 벡터를 표현하며 초기 염색체는 탐색 공간의 중심 탐색점 가까이에 고정적으로 발생시키고 각 염색체는 MSE(Mean Square Error)값으로 평가된다. 평가된 염색체 중 작은 MSE값을 가지는 염색체가 NTSS의 탐색점 수만큼 다음 세대의 탐색점으로 선택된다. 선택된 염색체는 세대를 거치면서 돌연변이 연산과 교배연산이 행해지고 이 때 돌연변이 연산의 크기는 NTSS의 탐색 단계 크기가 된다. 제안한 세대 수 만큼 반복 후 최소의 MSE 값을 가지는 유전자가 해당 블록의 움직임 벡터가 된다. 시뮬레이션 결과 제안한 방법을 가장 우수한 성능을 가지는 FS와 유사한 MSE 값을 얻을 수 있었고 동시에 FS에서 요구되는 계산량에 비해 많은 계산량을 줄일 수 있었다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
• /
• 2010.06c
• /
• pp.226-229
• /
• 2010

본 연구에서는 다양한 density profile 특징추출에 기반한 염색체 자동분류방법들의 성능을 비교분석하였다. density profile은 염색체의 밴드패턴을 가장 잘 표현한 특징으로 염색체의 중심축을 구성하는 화소들의 밝기 값을 추출하는 방법이다. 염색체의 밴드패턴은 염색체의 끝단까지를 잘 표현해주어야만 정확한 염색체번호를 확인할 수 있다. 따라서 염색체의 중심축을 추출하여 염색체 끝단까지 확장 처리한 방법에 대한 성능을 확인하였다. 염색체 중심축에 위치한 화소만을 이용한 프로파일은 잡음에 민감할 수 있으므로 이를 해결하기 위하여 염색체의 중심축에 대한 화소 값 대신 주변 밝기 값들에 대한 평균을 이용한 국소평균방법과 중심축의 수직라인 상에 존재하는 화소 값들에 대한 평균을 구한 수직평균방법을 비교하였다. 분류알고리즘은 k-NN을 사용하였고, 실험데이터는 (주)Gendix 로부터 제공받은 임상적으로 정상인 100명(남자 50명, 여자 50명)으로부터 추출한 4600개의 염색체 영상을 훈련데이터와 테스트데이터로 각각 50%씩 랜덤하게 분리하여 실험하였다. 실험결과 중심축을 확장하고 수직평균에 대한 프로파일을 특징으로 추출하여 분류한 경우가 가장 좋은 성능을 보였다.

• Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
• /
• 2002.11b
• /
• pp.36-37
• /
• 2002

율무(Coix lacryma-jobi)의 핵형 분석을 한 결과 1번 염색체는 short arm과 long arm의 크기가 같은 metacentric chromosome이었으며, 전체의 염색체에 대한 상대적인 길이가 12.8로 가장 길었다. 1번 염색체는 단완과 장완의 양쪽 터미널에 각각 하나씩의 밴드를 나타냈으며 단완과 장완 각각에 interstitial band가 나타났다. 또한 1번 염색체는 단완 끝에 부수체를 갖는 NOR 염색체임을 알 수 있었다. 2번 염색체는 Short arm에 비해 long arm이 길었으며, 전체의 염색체에 대한 상대적인 길이는 11.8로 1번 염색체 다음으로 길었다. 2번 염색체 단완 끝에 하나의 터미널 밴드와 양완의 중간에 각각 interstitial 밴드를 나타냈다. 3번 염색체는 2번 염색체 보다 short arm의 길이보다 더 짧았으며, 상대적인 길이는 10.8로 2번 염색체보다 짧았다. 3번 염색체는 단완 끝에 하나의 terminal 밴드와 centromere 밴드를 나타냈다.(중략)