• Title/Summary/Keyword: 염기가

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Korea Brassica Genome Project: Current Status and Prospective (배추 유전체열구의 현황과 전망)

  • Choi, Su-Ryun;Park, Jee-Yong;Park, Beom-Seok;Kim, Ho-Il;Lim, Yong-Pyo
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • v.33 no.3
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    • pp.153-160
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    • 2006
  • Brassica rape is an important species used as a vegetable, oil, and fodder worldwide. It is related phylogenically to Arabidopsis thaliana, which has already been fully sequenced as a model plant. The 'Multinational Brassica Genome Project (MBGP)'was launched by the international Brassica community with the aim of sequencing the whole genome of B. rapa in 2003 on account of its value and the fact that it has the smallest genome among the diploid Brassica. The genome study was carried out not only to know the structure of genome but also to understand the function and the evolution of the genes comprehensively. There are two mapping populations, over 1,000 molecular markers and a genetic map, 2 BAC libraries, physical map, a 22 cDHA libraries as suitable genomic materials for examining the genome of B. rapa ssp. pekinensis Chinese cabbage. As the first step for whole genome analysis, 220,000 BAC-end sequences of the KBrH and KBrB BAC library are achieved by cooperation of six countries. The results of BAC-end sequence analysis will provide a clue in understanding the structure of the genome of Brassica rapa by analyzing the gene sequence, annotation and abundant repetitive DHA. The second stage involves sequencing of the genetically mapped seed BACs and identifying the overlapping BACs for complete genome sequencing. Currently, the second stage is comprises of process genetic anchoring using communal populations and maps to identify more than 1,000 seed BACs based on a BAC-to-BAC strategy. For the initial sequencing, 629 seed BACs corresponding to the minimum tiling path onto Arabidopsis genome were selected and fully sequenced. These BACs are now anchoring to the genetic map using the development of SSR markers. This information will be useful for identifying near BAC clones with the seed BAC on a genome map. From the BAC sequences, it is revealed that the Brassica rapa genome has extensive triplication of the DNA segment coupled with variable gene losses and rearrangements within the segments. This article introduces the current status and prospective of Korea Brassica Genome Project and the bioinformatics tools possessed in each national team. In the near future, data of the genome will contribute to improving Brassicas for their economic use as well as in understanding the evolutional process.

산성과 염기성 혼합악취물질의 활성탄소섬유에 대한 흡착특성 분석

  • 김기환;김덕기;최봉각;신창섭
    • Proceedings of the Korean Institute of Industrial Safety Conference
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    • 1998.05a
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    • pp.125-128
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    • 1998
  • 최근 많은 문제가 되고 있는 피혁공장, 유지공장, 슬러지처리장 등에서 발생하는 악취물질은 크게 산성 악취와 염기성 악취로 나눌 수 있으며, 대표적인 산성악취에는 메틸머켑탄, 황화수소가 있고, 염기성 악취는 암모니아, 트리메틸아민이 있다. 이들 악취물질들은 ACF의 표면을 화학약품으로 처리, 표면을 개질하여 관능기를 부여하고, 또한 화학물질을 첨착시켜 특정악취물질에 대한 제거효율을 증가시킬 수 있다. (중략)

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Base analysis of deoxyribonucleic acid of several insects and spider testis (몇가지 곤충 및 지주의 정소 DNA 염기에 관한 연구)

  • Lee, Ki-Yung;Choe, Byong-Hee
    • Journal of Sericultural and Entomological Science
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    • v.6
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    • pp.39-41
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    • 1966
  • 가잠(용체), 멧뚜기 2종 및 지주 1종에서 각각 정소를 적출하여 DNA를 순수분리하고 DNA염기를 정량분석하여 다음과 같은 결과를 얻었다. (1) 가잠(용체) 및 멧뚜기 류의 정소 DNA의 A+T/G+C 비는 각각 1.72, 1.67로서 이 염기화는 게(해)정소 DNA의 그것과 거의 같고 새우의 것과는 다르다. (2) 지주정소 DNA의 A+T/G+C 비는 1.57로서 게(해)와 비슷하다. (3) 곤충 및 지주 정소 DNA에서 methylcystosine을 발견못하였다.

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First Discovery of Endogenous Retroviruses in Collared Peccaries (Tayassu Tajacu) (페카리 종 Tayassu tajacu에서 내인성 리트로 바이러스의 발견)

  • Lee, Jun-Heon
    • Korean Journal of Agricultural Science
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    • v.30 no.1
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    • pp.59-65
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    • 2003
  • To investigate the relationship of endogenous retroviruses in peccaries and pigs, a set of degenerate primers was used in this study to amplify peccary retroviral sequences. The sequences of two putative retroviral clones showed close homology to mouse and pig retroviral sequences. The peccary endogenous retroviral sequences are significant in that they are the first such sequences reported in peccary species and repudiate old claims in the literature that peccaries do not have C-type retroviral sequences.

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Modeling of Acid/Base Buffer Capacity of soils (토양의 산/염기 완충능의 모델링)

  • 김건하
    • Journal of Korea Soil Environment Society
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    • v.3 no.3
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    • pp.3-10
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    • 1998
  • Acid/Base buffer capacity of soil is very important in prediction of contaminant transport for its direct impact on pH change of the system composed of soil-contaminant-water, In this research, diffuse double layer theory as well as two layer electrostatic adsorption model are applied to develop a theoretical model of buffer capacity of soil. Model application procedures are presented as well. Buffer capacity of Georgia kaolinite and Milwhite kaolinite was measured by acid-base titration. Model prediction and experimental results are compared.

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Numerical Study of Flow Characteristics of Scramjet with a Cavity Flameholder (스크램제트 공동 화염 보염기 형상에 따른 유동 특성의 수치적 연구)

  • Jang, Won-Geun;Lee, Hak-Jin;Choe, Seong-Im
    • Proceeding of EDISON Challenge
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    • 2014.03a
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    • pp.603-609
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    • 2014
  • 차세대 제트 추진기관으로 주목받고 있는 스크램제트 엔진의 핵심은 연소기 내부에서의 성공적인 초음속 연소를 필요로 한다. 초음속 연소는 공기-연료 혼합(fuel-air mixing)의 정도에 따라 연소효율이 영향을 받게 된다. 공동형 화염 보염기(cavity flameholder)는 재순환 영역(recirculation zone)을 생성하여 연료 혼합의 효율을 높여 지속적인 초음속 연소가 진행될 수 있는 시간을 제공한다. 본 연구에서는 EDISON 전산유체역학 소프트웨어를 이용하여 공동형 화염 보염기를 지나는 초음속 유동의 재순환 영역과 전압력 변화에 대한 전산 해석을 수행하였다. 초기 형상을 생성하여 유동 해석을 수행한 후, 3개의 형상 변수에 대한 매개 변수 연구를 통하여 공동의 형상과 위치에 따른 재순환영역의 제어가 가능함을 확인하였다.

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Genetic Characterization based on Partial 28S rRNA Gene Sequence of Korean Two Scallops (한국산 가리비 2종의 28S rRNA 유전자 염기서열에 의한 유전적 특성)

  • Park, Gab-Man
    • The Korean Journal of Malacology
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    • v.13 no.1
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    • pp.1-7
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    • 1997
  • 한국산 가리비, 큰가리비(Patinopecten yessoensis)와 주문진가리비(Chlamys swifti), 2종에 대한 28S ribosomal RNA 유전자의 PCR- 산물을 이용 RFLP 및 염기서열을 밝히고, 이미 보고된 2과 3종의 염기서열과 상동성을 비교 분석하였다. 그 결과 28S rRNA유전자를 이용하여 7가지 제한효소를 처리한 PCR-RFLP의 종간 차이에서 Taq I 제한효소에서만 차이를 볼 수 있었다. 한편 두종간에 28S rRNA유전자의 D1 부위의 염기서열에서 231개 부위 중 14군데에서 변이를 보였다.

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Cloning and Sequence Analysis of the nodD1 Gene from Bradyrhizobium sp.(Cassia) CN9135 (Bradyrhizobium sp.(Cassia) CN9135의 nodD1 유전자의 크로닝과 염기서열 분석)

  • 최순용;고상균
    • Korean Journal of Microbiology
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    • v.36 no.4
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    • pp.267-272
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    • 2000
  • A 1.7-kb fragment containing the nodD1 genes of Bradyrhizobium sp. (Cassia) CN9135 was amplified by PCR with primers based on B. japonicum USDA110. This fragment was cloned and sequenced. Analysis of the sequence showed open reading frames highly homologous to nodD1 from other bradyrhizobial sources. The sequence showed higher homology to nodD1 gene of B. elkanii than to those from b. japonicum. Our results suggest that Bradyrhizobium sp. (Cassia) CN9135 may be more closely related to B. elkanii than to B. japonicum.

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The Recovery of Valuable Metals from LD-Slag by Smelting Reduction (용융환원법에 의한 LD제강 slag로부터 V의 회수(I))

    • Resources Recycling
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    • v.12 no.2
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    • pp.21-27
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    • 2003
  • Smelting reduction technique in arc furnace was applied for the recovery of valuable metal such as V from LD slag. In the present study, the parameters for increasing the reduction rate and the reduction efficiency were selected by changing the oxide additives, melting temperature and basicity. The optimum condition for LD-slag reduction was achieved by $Al_2$$O_3$ addition. The reduction ratio of V was increased in increasing the basicity.

Inference of Gene Phylogenetic Tree based on Decision Tree (결정트리 분류기법 기반 유전자 계통수 추론)

  • 김신석;황부현
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2001.10a
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    • pp.280-282
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    • 2001
  • 분자생물학의 급진적 발전은 현대 계통분류학에 큰 변혁을 가져왔다. 특히 유전의 근원물질인 DNA나 RNA를 분리.조작.분석하는 기술의 발전으로 이를 이용만 계통수 제작은 계통생물학의 중요한 실험방법으로 자리잡고 있다. 그 중 염기서열 비교 방법은 현재 유전자 계통수 제작에 가장 널리 이용되는 방법이다. 하지만 이러만 계통수는 각 객체간의 거리만을 표현하고, 객체군간의 차이는 설명하기 힘들다. 본 연구에서는 염기서열의 상대적인 특징(유사도)을 대신하는 염기서열의 총량과 염기 함량 등을 이용해 새로이 분류 기법 중 결정트리 방법에 적응하고, 종 분류의 유전적 모델을 설계한다. 또한 결정트리의 클래스인 종은 상위 클래스들을 포함하고 있어, 본 논문에서는 기존의 결정트리 분류자를 수정한 단계적 결정트기 분류자를 제안한다.

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