• 제목/요약/키워드: 순이론적 계산

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향상된 결합 파라미터를 도입한 순이론적 탄화수소 생성엔탈피 결정 (Hydrocarbon Enthalpies of Formation from ab initio Calculations Improved Through Bond Parameters)

  • Duchowicz, P.;Castro, E.A.
    • 대한화학회지
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    • 제43권6호
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    • pp.621-627
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    • 1999
  • 순이론적인 계산으로부터 얻은 전체 에너지로부터 탄화수소의 생성 엔탈피를 계산하는 새로운 방법을 제안하여였다. 이 방법은 결합 파라미터를 도입하여 원자의 전체 갯수에 근거를 두는 과거의 방법론을 개선한 것이다. 현 방법론의 결과는 우수하며 생성 엔탈피 계산의 평균오차는 실험 오차보다 작은 것으로 나타났다. 제안하는 방법론을 확실히 하기 위한 몇 가지 가능한 확장법도 제시하였다.

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단백질의 구조연구 : ACE의 기질 HHL을 이용한 신규 살충제 표적 AnCE에 대한 약리단 연구 (Protein structure analysis : Pharmacophore study for new insecticide target AnCE using the substrate of ACE, HHL molecule)

  • 이정경;김경이
    • 농약과학회지
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    • 제9권3호
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    • pp.191-198
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    • 2005
  • 신규 살충제 표적 단백질인 AnCE의 활성부위 잔기들과 상호작용 가능한 약리단 (pharmacophore)을 세 개의 펩타이드로 이루어진 ACE 기질 Hippuryl-L -histidyl-L-leucine (Hip-L-His-L-Leu, HHL) 분자의 구조를 모델로 하여 예측하였다. HHL의 분자구조, 용액장 내에서의 구조변화 그리고 약리단을 구성하는 원자들의 전하밀도 분석을 위해 순이론적인 양자화학 계산방법을 이용하여 구조 최적화, NMR 화학적 이동 및 NPA 계산을 수행하였다. 이론적인 NMR 화학적 이동 값들은 실험 결과와 잘 일치함을 보였고 전하밀도 계산 결과는 해당원자의 약리단을 분석하는데 사용되었다. 결과적으로 HHL 분자 구조를 통해 소수성(aromatic, aliphatic), 수소결합 주게, 수소결합 받게, 금속 아연 결합부위의 5개 약리단을 추출할 수 있었다.

유공Caisson식 방파제에 작용하는 파력에 관한 연구

  • 안수한;편종근
    • 한국수자원학회:학술대회논문집
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    • 한국수자원학회 1980년도 제22회 수공학 연구발표회 논문초록집
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    • pp.44-46
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    • 1980
  • 파의 에너지 감쇠기구의 관점에서 볼 때 분류손실방식인 유공벽식 방파제 중에서 원형공이 벽 전체에 균일하게 분포되어 있고 구멍 직경에 비해 벽 두께가 얇은 삼중 유공벽형 Caisson의 각 벽에 작용하는 파력에 고나해 이론적 접근과 실험을 통한 실증을 시도해 보았다. 이론적인 방법으로는 토굴구효남의 이론을 응용하였으며 주어진 파랑조건에 대해 각 유공벽 전 후면에 연속방정식과 Bernoulli 방정식을 이용하여, 각 영역별 연속 Potential의 진폭과 위상각에 대한 비선형 12원 연립방정식을 만들었고 Computer를 이용하여 반복법으로 각 속도 Potential을 확정하였다. 이렇게 구한 속도 Potential을 압력방정식에 대입하여 각 벽별 파력을 계산하였으며 동일한 파랑조건하의 실험에서 각 벽별 파력을 측정하여 양자를 서로 비교검토하였다. Bernoulli의 방정식중 에너지 손실항은 의사비선형으로 처리하였다. 유공율조합 0.25-0.3-0.2이고, 판두께가 1cm인 모형의 실험결과, 각 벽별 최대파력치의 특성으로서는 첫때, S-2, S-3등 간벽에 작용하는 파력이 전벽 및 후벽에 비해 두드러지게 작다는 사실과, 둘째 작용파력의 크기 순이 파형경사가 작을 때는 대략 S-4, S-1, S-2, S-3순이고 파형경사가 클 때에는 대략 S-1, S-4, S-2, S-3순이라는 점 등을 들 수 있겠다. 굴구효남이 가정한 f의 치 1.5를 사용하여 계산한 각 벽별 최대파력을 실험치와 비교해 본 결과, 파가 각 유공벽을 통과할 때의 손실수두를 실험에서의 양만큼 fr=1.5를 가정한 수학적 model이 설명해 주지 못한다고 볼 수 있으므로 두가지 방법에 의하여 본 실험에서 사용한 유공판의 손실계수를 근사적으로 추정하여 보았다. 추정한 f를 사용하여 다시금 각 벽별 최대파력을 계산하고 실험치와 비교해 보면 훨씬 서로 근접함을 알 수 있었다. 결국 본 논문의 이론을 사용하면 유공Caisson문제의 전체적인 윤곽 및 각 변수들의 파력에 대한 영향을 파악할 수 있겠다.

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응축상 물 분자의 OH 수축 진동수 계산을 위한 전자밀도 범함수 비교 (Assessing Density Functional Theories to Compute the OH Stretching Frequencies of Water Molecules in Condensed Phases)

  • 전기영;양민오
    • 대한화학회지
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    • 제67권1호
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    • pp.13-18
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    • 2023
  • 응축상에 존재하는 물 분자들의 OH 국소 수축 진동에 관한 0-1과 1-2 전이 에너지 계산을 위한 전자 밀도 범함수들을 평가하였다. 열세 개의 범함수와 아홉 개의 기저 함수 집합을 조사하여, 순이론적 coupled cluster 이론 CCSD(T)가 예측하는 진동수와 상관성이 매우 높게 예측되는 밀도 범함수와 활용된 기저 함수 집합은 Head-Gordon 연구진의 혼성 범함수인 ωB97X(D)/6-31+G* 계산법임을 확인하였다.

약한 결합을 갖는 $H^+_{2n+1}$(n=1-6) complex들에 대한 순 이론 양자역학적 연구 (The ab Initio Quantum Mechanical Investigation for the Weakly Bound $H^+_{2n+1}$(n=1-6) Complexes)

  • 인은정;서현일;김승준
    • 대한화학회지
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    • 제45권5호
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    • pp.401-412
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    • 2001
  • $H_{2n+1}^+$ (n=1~6) cluster들에 대하여 높은 수준의 순 이론적(ab initio) 양자역학적 방법을 사용하여 분자 구조, 진동 주파수(vibrational frequency), 그리고 해리 에너지 등을 계산하였다. 분자구조는 $H^+_g$까지는 TZ2P+ d CCSD(T) 수준에서 그리고 $H_{11}^+$$H_{13}^+$에 대해서는 TZ2P CCSD(T) 수준까지 최적화하였다. 진동 주파수는 여러 basis set에서 SCF 방법으로 계산하였으며, 본 연구에서 최적화된 모든 분자구조들이 local minimum 구조임을 확인하였다. $H_{2n+1}^+$로부터 $H_2$ 의 해리 에너지($D_e$)는 각각의 최적화된 분자구조에서의 에너지 차로부터 계산하였으며, 영점 진동에너지(ZPVE)를 고려하여, 지금까지의 이론 및 실험결과($D_0$)와 비교하였다.

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1,2-, 1,3-dioxetanes, 그리고 1,3-cyclodisiloxane의 분자구조, 에너지와 진동주파수에 대한 순 이론 양자 역학적 연구 (Ab Initio Quantum Mechanical Studies of 1,2-, 1,3-Dioxetanes and 1,3-Cyclodisiloxane; Energetics, Molecular Structures, Vibrational Frequencies)

  • 최근식;김승준
    • 대한화학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.325-333
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    • 2003
  • 1,2-와 1,3-dioxetane$(C_2O_2H_4)$, 그리고 1,3-cyclodisiloxane$(Si_2O_2H_4)$에 대하여 높은 이론 수준에서 분자구조, 진동주파수, 그리고 에너지 등을 계산하였다. 위의 모든 분자들에 대하여 TZ2P CCSD(T)의 이론 수준까지 분자구조를 최적화 하였으며. 진동주파수는 여러 basis set에서 SCF 방법으로 계산하였다. 본 연구에서 최적화된 분자구조들에 대한 진동주파수가 모두 실수(real number)로 예측됨으로서, 제안된 모든 분자구조가 local minimum 구조임을 확인하였다. 1,2- 및 1,3-dioxetane들과 cyclodisiloxane이 두 분자의 aldehyde와 silanone으로 해리 될 때의 중합에너지를 zero-point vibrational energy(ZPVE)를 고려하여 계산하고, 안정성을 비교하였다.

수소 결합한 물 분자에서 OH 신축 진동의 국소모드와 정규모드 (Local and Normal Modes of OH Stretching Vibration in Hydrogen-Bonded Water Molecules)

  • 권세은;양민오
    • 대한화학회지
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    • 제64권6호
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    • pp.350-353
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    • 2020
  • 물 분자내의 OH 신축진동(stretching vibration) 운동을 나타내는 정규모드(normal mode)와 국소모드(local mode) 진동수들을 비교하여 수소결합한 물 분자에 대한 국소모드에 기반한 계산의 타당성을 조사하였다. 물 분자의 단량체, 이합체, 삼량체에 대한 계산을 수행하여 분자 클러스터 크기가 커짐에 따라 국소모드 진동수, 국소모드의 비조화성, 그리고 국소모드와 정규모드 진동수들의 유사성이 어떤 경향성을 보이는지 순이론적 양자화학 계산 방법으로 연구하였다. 단량체에서 삼량체로 분자의 갯수가 증가할수록 OH 결합의 비조화성은 증가하며 국소모드와 정규모드 진동수 간의 차이는 줄어드는 것으로 나타났다. 따라서, 응축상에 존재하는 물 분자들의 OH 신축 진동수의 이론적 계산은 비조화성을 쉽게 다룰 수 있는 국소모드에 기반한 방식이 적절할 수 있음을 확인하였다.

에디공분산 방법 기반의 플럭스 타워 순 복사에너지 검증: 설마천, 청미천 유역 (Validation of Net Radiation Measured from Fluxtower Based on Eddy Covariance Method: Case Study in Seolmacheon and Cheongmicheon Watersheds)

  • 변규현;신지예;이연길;최민하
    • 한국수자원학회논문집
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    • 제46권2호
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    • pp.111-122
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    • 2013
  • 최근 들어 기후변화로 인해 물과 에너지 순환에 관한 정확한 이해가 요구되고 있다. 현재 미기상학적 플럭스 타워 네트워크는 수문학적, 생태학적 분석에 있어서 주춧돌역할을 하고 있다. 하지만 플럭스 타워의 에디공분산 방법을 활용한 잠열 플럭스 측정은 여러 가정사항에 따른 시스템적 오류를 내포하고 있고 이에 따라 과소평가된 잠열 플럭스 원시자료의 보정이 필요하다. 몇몇의 보정방법 중 보엔비를 활용한 방법이 가장 유용한 방법 중 하나로서 여기에는 플럭스타워에서 측정한 순 복사에너지 및 기타 플럭스(현열, 지열) 등이 요구되며 이러한 자료에 대한 정확한 측정 및 검증이 필요하다. 본 연구에서는 설마천, 청미천 유역의 플럭스타워에서 측정된 순 복사에너지를 검증하기 위해 두 가지 형태의 이론적으로 계산된 순 복사에너지와의 비교검증을 실시하였다-(1) FAO 56 기반의 일평균 순 복사에너지 (2) Bastiaansen (1995)가 제안한 순간 순 복사에너지. 본 연구의 결과는 플럭스타워에서 측정된 순 복사에너지는 이론적으로 계산된 순 복사에너지와 상당히 비슷한 경향성을 보인다는 것을 제시했다. 또한, 측정된 순 복사에너지를 이용하여 관측된 잠열플럭스를 보엔비 보정방법에 적용시킨 결과 에너지수지에 더욱 부합하는 것을 알 수 있었다.

탄소나노튜브의 전계방출 특성에 관한 이론적 연구

  • 한승우;임지순
    • 한국진공학회:학술대회논문집
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    • 한국진공학회 2000년도 제18회 학술발표회 논문개요집
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    • pp.208-208
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    • 2000
  • 본 연구에서는 다양한 끝 모양을 지닌 (n,n) 나노튜브에 대한 전자구조를 외부 전기장이 걸려있을 때와 없을 때에 대해 제일 원리적 (ab-initio) 방법을 써서 연구하였다. 계산한 모델들 중 비스듬히 잘린 지그재그 형태의 끝 모양을 가진 나노튜브가 가장 좋은 전계 방출 효과가 있음을 알아냈다. 이것은 페르미 레벨 근처에 존재하는 짝지어지지 못한 전자들로 인한 것이다. 다음으로 유리한 구조는 캡 모양의 끝을 가진 나노튜브로서 이것은 캡에 국소적으로 존재하는 파이 상태의 전자가 전기장 방향으로 향하고 있기 때문이다. 이외에 유도된 전기장이 튜브의 종횡비에 비례하는 법칙이 있음을 발견하였다.

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용액상 색소분자의 흡수스펙트럼에 대한 이론적 연구 (Theoretical Study on the Absorption Spectrum of a Chromophore in Liquid)

  • 우정문;양민오
    • 대한화학회지
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    • 제52권1호
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    • pp.7-15
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    • 2008
  • 분자들의 전자 흡수스펙트럼에 영향을 주는 분자 핵 운동은 이론적으로 양자동역학적 시간상관함수로 표현된다. 본 연구에서는 분자동역학 전산모사와 양자화학적 계산등의 순 이론적 계산을 이용해 고전역학적 시간상관함수를 구하고 두 가지의 준고전역학적 근사방법으로 양자동역학적 시간상관함수를 얻었다. 또한 이차 축적전개 근사식을 이용하여 액체상에 있는 nile blue 색소분자의 전자전이 흡수스펙트럼을 얻었다. 계산 결과는 실험에서 얻은 스펙트럼과 비교적 잘 일치하였으며, 실험 결과와의 비교를 통해, 본 계의 용매화 동역학의 시간 척도는 1ps 보다 길며 색소분자에 인접한 용매분자들이 용매화에 영향을 주는 주 성분임을 확인하였다.