Kim, Hyeong-Won;Sin, Mi-Yeong;An, Eun-Gyeong;Kim, In-Ho
한국생물공학회:학술대회논문집
/
2003.04a
/
pp.480-483
/
2003
Fusion ferritin$(F_H+F_L)$, an iron-binding protein, was purified from recombinant E. coli by two-step sonications with urea. Unfolded ferritin was refolded by gel filtration chromatography with various concentration of urea. 50 mM Tris-HCl(pH 8.0) buffers with 1 M to 4 M urea were used in GFC. Objective was to characterize the structure change with urea concentration. Molecular weight was determined using GF-HPLC and RP-HPLC was used to quantify the unfolded and refolded proteins.
Environmental DNA (eDNA) can exist in both intracellular and extracellular forms in natural ecosystems. When targeting harmful cyanobacteria, extracellular eDNA indicates the presence of traces of cyanobacteria, while intracellular eDNA indicates the potential for cyanobacteria to occur. However, identifying the "actual" potential for harmful cyanobacteria to occur is difficult using the existing sediment eDNA analysis method, which uses silica beads and cannot distinguish between these two forms of eDNA. This study analyzes the applicability of a density gradient centrifugation method (Ludox method) that can selectively analyze intracellular eDNA in sediment to overcome the limitations of conventional sediment eDNA analysis. PCR was used to amplify the extracted eDNA based on the two different methods, and the relative amount of gene amplification was compared using electrophoresis and Image J application. While the conventional bead beating method uses sediment as it is to extract eDNA, it is unknown whether the mic gene amplified from eDNA exists in the cyanobacterial cell or only outside of the cell. However, since the Ludox method concentrates the intracellular eDNA of the sediment through filtration and density gradient, only the mic gene present in the cyanobacteria cells could be amplified. Furthermore, the bead beating method can analyze up to 1 g of sediment at a time, whereas the Ludox method can analyze 5 g to 30 g at a time. This gram of sediments makes it possible to search for even a small amount of mic gene that cannot be searched by conventional bead beating method. In this study, the Ludox method secured sufficient intracellular gene concentration and clearly distinguished intracellular and extracellular eDNA, enabling more accurate and detailed potential analysis. By using the Ludox method for environmental RNA expression and next-generation sequencing (NGS) of harmful cyanobacteria in the sediment, it will be possible to analyze the potential more realistically.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
/
v.21
no.6
/
pp.725-730
/
1992
The internal invertase was purified from cell free extract of Rhodosporidium toruloides IFO 0559-M-919 by acid precipitation, ion-exchange chromatography and gel filtration to the unique enzyme protein on disc electrophoresis. We have found out that molecular weight of purified internal invertase was 90,000 by gel filtration and the purified enzyme was protein with 4 homogeneous subunits appearing as single band of 22,000daltons on SDS-polyacrylamide gel electrophoresis.
Chlorobium liimicola f. thiosulfatophilum NCIB 8327 was grown on modified Pfennig's medium using ammonium chloride. glutamine. glutamate, or dinitrogen gas as nitrogen sources. Except for the case of dinitrogen gas. the extent of gro\\1h was almost the s~me. The specific activity of glutamine synthetase in crude extracts is the highest in the cells which were grown on the medium containing glutamate. hut that of glutamate synthase is uniform for all four nitrogen sources. When the concentration of ammonium ions increases in the reaction mixture. the specific activity of glutamine synthetase in crude extract from the cells grown on glutamate decreases. hut that of glutamate dehydrogenase increases. whereas that of glutamate synthase remains unchanged. When the concentration of methionine sulfoximine increases, the activity of glutamine synthetases decreases rapidly. On the other hand. when the concentration of ammonium ions increases in the reaction mixture gradually. the activity of glutamine synthetase from the cells grown on higher concentration of ammonium ions less decreases. In the presence of light. the activity of glutamine synthetase increases. hut in the dark it decreases gradually. The production of hydrogen in intact cells depends on light. It is inhihited by adding ammonium ions. hut restores immediately hy adding methionine sulfoximine. The produclion of hydrogen in this strain can he mediated by nitrogenase only. and regulated hy glutamine synthetase.
Jo, Ji-Song;Nguyen, Do Quynh Anh;Yun, Jun-Ki;Kim, Yu-Na;Kim, You-Geun;Kim, Sung-Bae;Seo, Yang-Gon;Lee, Byung-Hak;Kang, Moon-Kook;Kim, Chang-Joon
Microbiology and Biotechnology Letters
/
v.37
no.3
/
pp.231-237
/
2009
This paper aimed to develop a solvent extraction and purification process to recover high-purified ${\beta}$-carotene from recombinant Escherichia coli. Cells harvested from the culture broth were treated through numerous steps: dehydration, solvent extraction, crystal formation and separation. To optimize the extracting condition, experiments were carried out to investigate the effect of cell disruption, temperature, organic solvents, solvent-biomass ratio on the yield of ${\beta}$-carotene extracted from cells. The result indicated that no significant differences of extraction yield were observed from cells with or without step of cell disruption. Among different extracting solvents, the highest extraction yield of ${\beta}$-carotene, 30.3 mg-${\beta}$-carotene/g-dry cells, was obtained with isobutyl acetate at solvent-biomass ratio 25 mL/g-dry cells at $50^{\circ}C$. Notably, in case of acetone, the extraction yield was quite low when using acetone itself, but increased almost up to the highest value when combining this solvent and olive oil. The purity of ${\beta}$-carotene crystals obtained from crystallization and separation was 89%. The purity degree was further improved up to 98.5% by treating crude crystals with additional ethanol washing.
Min Byoung-Sul;Lee Yoon-Bae;Lee Jong-Kwon;Ryoo Kun-Kul;Lee Mi-Young
Proceedings of the KAIS Fall Conference
/
2004.11a
/
pp.259-261
/
2004
일반 증류수로 제조된 완충용액으로 미세조류를 파쇄하였을 때 미세조류의 두꺼운 세포벽에 의해 단백질 추출이 효율적으로 이루어지지 않는다. 따라서 일차원 및 이차원 전기영동법을 사용하여 단백질 발현 양상을 분석할 때 효율이 떨어진다. 본 연구에서는 물의 클러스트가 작아 세포벽에 잘 흡수될 수 있다고 알려진 환원전리수를 사용하여 효율적으로 단백질을 추출하였고, 이차원 전기영동법으로 단백질 발현 양상을 확인하였다.
Ha, Yeon-Chul;Choi, Ki-Bong;Kim, Seong-Joo;Choi, Jung-Do
KSBB Journal
/
v.22
no.1
/
pp.48-52
/
2007
This study was carried out to establish the optimum disruption condition of a sonificator for the protein toxin for the purpose of developing automatic biological agent detector equipped a sonificator. One of the best-known collisional quenchers is molecular oxygen, which quenches almost all known fluorophores. The sonification does an excellent job of degassing, which decreased the quenching effect and increased the fluorescence quantity. The fluorescence measurement for the protein using 0.7 X fluorescent dye concentration and above must be done in 1 minute and the fluorescence measurement for the protein using 0.3 X fluorescent dye concentration and below has to be done between 2 and 3 minute. The fluorescence quantity of the sonificatied protein sample was much higher that of the non-sonificatied protein sample. Sonificating the sample turned out to be favorable for the fluorescence measurement when measuring at the low protein concentration.
A novel pre-purification method was developed for producing peroxidase to guarantee high purity and yield from plant cell cultures in large-scale process. This method was a simple and efficient procedure for the isolation and pre-purification of peroxidase from the biomass consisting of active clay treatment followed by cationic exchange chromatography. The use of active clay in the pre-purification process allows for rapid and efficient separation of peroxidase from interfering compounds and dramatically increases yield and purity of crude peroxidase for purification steps compared to alternative processes. This pre-purification process serves to minimize the buffer usage size and complexity of the HPLC operations for peroxidase purification. This process is readily scalable to a pilot plant and eventually to a production environment where mass production of material are expected to be produced.
Korean Lentinus edodes SR-1 was cultured to multiply the mycelia in the complete broth medium (C/N=13.1) for mushroom, and protein-bound polysaccharides were extracted from the cultured broth containing mycelia (The whole cultured broth was used to increase the yields: 80% of protein-bound polysaccharides were existed at the cell wall of mycelia and 20% of those were secreted extracellularily in this culture). Protein-bound polysaccharides in the cultured broth containing mycelia were extracted by using three different methods: 1) Extraction with hot water, 2) Disintegration of cell wall by glass bead mill treatment before extraction with hot water, and 3) Cellulase treatment before extraction with hot water. The highest yield was obtained (930 mg polysaccharides/100 mL culture broth) when protein-bound polysaccharides were extracted with 2) method. The extracted crude protein-bound polysaccharides were purified using protease, DEAE-cellulose and Sephadex G-100. The growth inhibition activity for $P_{388}$, mouse leukemic cell, increased (53.7, 62.2, 93.7% and 97.4%) as the purification level increased. Protein-bound polysaccharides contained 46.1% of polysaccharides, 7.3% of protein, and trace amounts of minerals. Polysaccharides contained glucose, galactose, xylose and mannose. The content of proline and glycine were high, however, methionine and leucine were not found. The major minerals were Na, K, Zn, and Ca.
The baculovirus-insect Drosophila melanogaster S2 cell system combines advantages of conventional baculovirus system and non-lytic S2 cell system because baculoviruses can infect non-permissive cells such as mammalian and Drosophila S2 cells but cannot replicate themselves inside the cells. In the present work, we investigated effects of infection conditions on production of green fluorescent protein (GFP) as a target protein using this baculovirus-S2 cell system. Even though higher MOI and longer baculovirus contact time showed better GFP expression yield during the shorter period, overall protein yield could be lower during the longer period due to the relatively higher cell detachment and lysis (lower cell viability). In addition, maintaining high MOI will be not practical for large-scale cell culture. Therefore, instead of maintaining high MOI, we found that high initial cell number and concentrated (10X) baculovirus volume can confer comparable protein expression even under the moderate MOI condition. Also, we found that the post-infection time that is connected to state of cells after infection was an important factor for production yield.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.